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Pressure sometimes doesn't change when the lid is compressing #354

Closed
phet-steele opened this issue May 19, 2021 · 20 comments
Closed

Pressure sometimes doesn't change when the lid is compressing #354

phet-steele opened this issue May 19, 2021 · 20 comments
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Comments

@phet-steele
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This is in the published sim! (1.2.1) But also, the version of this sim we are asked to test in phetsims/qa/issues/649 (https://phet-dev.colorado.edu/html/states-of-matter/1.2.2-rc.2/phet/states-of-matter_en_phet.html) no longer "produces" any change in pressure when collapsing the lid. It happens in both phet and phet-io brands. At least the Studio, Mirror Inputs, and State wrappers are buggy, but I don't see why not all of them would be buggy. There are times where this bug seems inconsistent, and if the bug doesn't occur it may help to refresh the web page and try again.

  1. Go to https://phet-dev.colorado.edu/html/states-of-matter/1.2.2-rc.2/phet/states-of-matter_en_phet.html
  2. Go to the second screen
  3. Drag the lid down all the way and notice sometimes the pressure gauge does not increase.

StOfMa

Seen on Win 10 Chrome.

@KatieWoe
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Contributor

KatieWoe commented May 19, 2021

May have something to due with platform (somehow) since I have not been able to recreate on my device. Win 10 Chrome. @phet-steele what were you on?
Edit: never mind, both are Win 10 Chrome

@phet-steele
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Author

When trying to drag the lid in master, I immediately see this error.

Uncaught Error: Assertion failed: no space left in moving time window
    at window.assertions.assertFunction (assert.js:25)
    at TimeSpanDataQueue.add (TimeSpanDataQueue.js:51)
    at MonatomicVerletAlgorithm.updatePressure (AbstractVerletAlgorithm.js:283)
    at MonatomicVerletAlgorithm.updateMoleculePositions (AbstractVerletAlgorithm.js:187)
    at MonatomicVerletAlgorithm.updateForcesAndMotion (AbstractVerletAlgorithm.js:201)
    at PhaseChangesModel.stepInTime (MultipleParticleModel.js:845)
    at PhaseChangesModel.step (MultipleParticleModel.js:940)
    at Sim.js:287
    at Action.execute (Action.js:227)
    at Sim.stepSimulation (Sim.js:1064)

@jbphet
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Contributor

jbphet commented May 20, 2021

I've added some debug code on master to try to help track this down.

@phet-steele - Can you please reproduce this on your system using master and capture the output on the console? It will be long, so I'd recommend putting it in a "details" section.

Also, is there any change the system you're testing with is using a faster-than-normal frame rate for the browser? If so, that would explain the problem.

@jbphet jbphet assigned phet-steele and unassigned jbphet May 20, 2021
@jbphet
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Contributor

jbphet commented May 20, 2021

Note to self: It's a little lame that TimeSpanDataQueue requires the client to specify both the length of the queue and the expected dt. Also, it shouldn't be called the "nominal" dt, it should be called the expected minimum. I should modify these things as part of the overall fix for this.

@phet-steele
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Author

phet-steele commented May 20, 2021

Also, is there any change the system you're testing with is using a faster-than-normal frame rate for the browser? If so, that would explain the problem.

Almost guaranteed! ?profiler has me running at 300 fps, which is expected on my device.

Output

=======
TimeSpanDataQueue.js:55 this.length = 793
TimeSpanDataQueue.js:56 this.maxTimeSpan = 12 seconds
TimeSpanDataQueue.js:57 this.head = 792
TimeSpanDataQueue.js:58 this.tail = 0
TimeSpanDataQueue.js:59 data queue contents:
TimeSpanDataQueue.js:69 -------
TimeSpanDataQueue.js:70 index: 791
TimeSpanDataQueue.js:71 dt: 0.016
TimeSpanDataQueue.js:72 value: 0
TimeSpanDataQueue.js:69 -------
TimeSpanDataQueue.js:70 index: 790
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TimeSpanDataQueue.js:72 value: 0
TimeSpanDataQueue.js:69 -------
TimeSpanDataQueue.js:70 index: 789
TimeSpanDataQueue.js:71 dt: 0.012
TimeSpanDataQueue.js:72 value: 0
TimeSpanDataQueue.js:69 -------
TimeSpanDataQueue.js:70 index: 788
TimeSpanDataQueue.js:71 dt: 0.016
TimeSpanDataQueue.js:72 value: 0
TimeSpanDataQueue.js:69 -------
TimeSpanDataQueue.js:70 index: 787
TimeSpanDataQueue.js:71 dt: 0.012
TimeSpanDataQueue.js:72 value: 0
TimeSpanDataQueue.js:69 -------
TimeSpanDataQueue.js:70 index: 786
TimeSpanDataQueue.js:71 dt: 0.012
TimeSpanDataQueue.js:72 value: 0
TimeSpanDataQueue.js:69 -------
TimeSpanDataQueue.js:70 index: 785
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TimeSpanDataQueue.js:72 value: 0
TimeSpanDataQueue.js:69 -------
TimeSpanDataQueue.js:70 index: 784
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TimeSpanDataQueue.js:69 -------
TimeSpanDataQueue.js:70 index: 783
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TimeSpanDataQueue.js:69 -------
TimeSpanDataQueue.js:70 index: 782
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TimeSpanDataQueue.js:69 -------
TimeSpanDataQueue.js:70 index: 781
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TimeSpanDataQueue.js:69 -------
TimeSpanDataQueue.js:70 index: 780
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TimeSpanDataQueue.js:69 -------
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TimeSpanDataQueue.js:70 index: 1
TimeSpanDataQueue.js:71 dt: 0.025
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TimeSpanDataQueue.js:69 -------
TimeSpanDataQueue.js:70 index: 0
TimeSpanDataQueue.js:71 dt: 0.025
TimeSpanDataQueue.js:72 value: 0
TimeSpanDataQueue.js:77

TimeSpanDataQueue.js:78 totalContainedTime = 10.843999999999978
TimeSpanDataQueue.js:79 minDt = 0.004
TimeSpanDataQueue.js:80 maxDt = 0.025

@jbphet
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Contributor

jbphet commented May 21, 2021

Almost guaranteed! ?profiler has me running at 300 fps, which is expected on my device.

@phet-steele - Color me skeptical on the 300 FPS bit. That's 5x the nominal rate of 60 FPS, and the data you collected does not seem to indicate that rate. The profiler may be running into the same problem that the sim is, which is that it was assuming a nominal frame rate of 60 FPS, and if it gets something different, things go south.

The data collected by @phet-steele in the previous comment seems to indicate that his system is running at a frame rate of around 75 FPS. @phet-steele - Can you check the refresh rate of your display and see if that is the value and report back with whatever you find?

That's part 1. Part 2 is to test with the current version of master and see if the problem has gone away. If it has, please also test that the behavior of the pressure gauge is the same or similar enough to the published version (you may have to test the previous version on a different machine if this problem prevents it from running it). And finally, check that the performance hasn't degraded significantly with this change. You'll have to use a built version to make an apples-to-apples comparison to the published sim.

Feel free to contact me on Slack if you have any questions on this. I'll write up an explanation of the problem and solution once we verify that this works (or come up with something else if it doesn't).

@jbphet jbphet assigned phet-steele and unassigned jbphet May 21, 2021
@jonathanolson
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Contributor

Can you keep me informed of whether a patch for this will go into the maintenance releases?

@jbphet
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jbphet commented May 24, 2021

@jonathanolson - It is very likely that a patch will go in for states-of-matter and states-of-matter-basics, but it dependent upon what we hear back from @phet-steele and when. If there is something specific that you'd like me to do differently versus the usual process for this, please let me know.

@jonathanolson
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If there is something specific that you'd like me to do differently versus the usual process for this, please let me know.

Release branches are still locked down to due the maintenance process, so let me know when it's ready to move to the branch.

@phet-steele
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Author

Can you check the refresh rate of your display and see if that is the value and report back with whatever you find?

My refresh rate is 300 hz and this site also says I am getting 300 fps 😁 https://www.testufo.com/refreshrate

Part 2 is to test with the current version of master and see if the problem has gone away.

Sure seems like the problem has gone away, and I don't see performance issues on the mac and win 10 I have either.

@jbphet
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Contributor

jbphet commented May 25, 2021

My refresh rate is 300 hz and this site also says I am getting 300 fps

Okay. I'd just never heard of a refresh rate that high, but looking around online I do see monitors that spec that rate, so I stand corrected. Based on the data that @phet-steele supplied above, we're not seeing animation frame requests that fast, so I'm curious about how high refresh rates and the standard browsers' window.requestAnimationFrame method works, but that's a question for another time.

Sure seems like the problem has gone away, and I don't see performance issues on the mac and win 10 I have either.

Cool, good to hear. I'll move forward with a maintenance release to fix the issue.

In summary, the problem was that the class that I had created to track and average the pressure data over time used pre-allocated memory to try to maximize its performance. This pre-allocation step assumed a standard rate for window.requestAnimationFrame of 60 FPS. Faster frame rates caused the buffer to overflow. In the non-built version, this hits an assertion. In the built version, it just stops putting pressure information into the buffer, so the pressure gets stuck. I've modified the code to pre-allocate much of the needed memory, and then to expand the allocation if necessary. I tested this by intentionally under-allocating the memory.

@jbphet
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jbphet commented May 25, 2021

@jonathanolson - I'm ready to do a maintenance release for this issue. How should we proceed?

@jbphet
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jbphet commented Jun 1, 2021

For the record, @kathy-phet told me that she and @KatieWoe discussed whether or not to add a step to the QA process to test faster frame rates and decided against doing so. @kathy-phet recommended that, for now, we add an item to the code review checklist to look for any code that assumes a certain frame rate. I added such an item in phetsims/phet-info@1f1c0af#diff-f89f7f6ce4981e08a13b7a7a07456365dc54b1d206f3ae36af5b82a4a5f72bb3.

@phet-steele
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@kathy-phet recommended that, for now, we add an item to the code review checklist to look for any code that assumes a certain frame rate.

My guess is phetsims/molecule-shapes/issues/180 another one of this class of issue.

@jbphet
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jbphet commented Jun 11, 2021

@jonathanolson - This is ready to go into an RC on the current release branch. I think it would be best if I did it myself, since I can verify it more easily and know what to look for. Is it okay for me to pull this onto the current release branch for states-of-matter and states-of-matter-basics? Also, should I do the RC, or is there an upcoming one that you would make this a part of?

@jonathanolson
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@jbphet depends on the priority, phetsims/qa#656 is the current maintenance QA task (so it could be integrated and re-RC'ed, and I wouldn't deploy it until it's tested).

If you're ready to patch and RC both of them now, go for it (I'll check with you before starting any RC deployments).

@jbphet
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jbphet commented Jun 14, 2021

This is being tested by QA at the moment in an RC, see phetsims/qa#656. If QA testing passes, we can close it. I'll unassign @jonathanolson, since it's pretty much up to me to follow up.

@jbphet
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jbphet commented Jun 15, 2021

Assigning @KatieWoe as an assignee so that she or another member of the QA team can update based on the testing of the current RC.

@jbphet jbphet assigned KatieWoe and unassigned jbphet Jun 15, 2021
@KatieWoe
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@phet-steele said in phetsims/qa#656 (comment)

I checked all the links in #656 (comment) for /issues/354, and they all correctly calculated pressure. I tried both Win 10 Chrome and FF.

@jbphet
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jbphet commented Jun 15, 2021

Excellent. Closing.

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