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MarkupPMC_pt
Markup PMC es un programa para generar el XML según la DTD de PubMed Central.
Actualmente la DTD está en la versión 3.0.
Lea Tag library: http://dtd.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/3.0/index.html.
- tener el artículo en un formato de archivo intercambiable y portable
- opcionalmente, tener la revista indizada en PubMed Central
Para una revista ser indizada en PubMed Central (PMC), además de seguir la DTD, hay otras especificaciones:
- nomenclatura
- imagenes
- elementos obligatorios en el XML
- licencia
- envio de los datos
- envio de correcciones
Recomendación: Cómo PMC especifica unas reglas de nomenclatura para los archivos: issn + - + acronym + - + volume + - + first page, seria recomendable usar para los archivos de SciELO esas reglas o por lo menos, añadir la primera página al nombre del archivo. Ej.: a01.htm -> a01-561.htm. De ese modo, queda más fácil las verificaciones. El programa Markup renombra los archivos según la especificación de PMC.
- tener junto a las carpetas img, markup, markup_pmc, body, pdf, una carpeta llamada img_src, donde deben estar las imágenes tiff o eps de acuerdo con Image File Requirements. Lo importante es que todas las imágenes en img (.jpg) tenga la correspondiente en img_src (.tif o .eps) con el mismo nombre. Ej.: f01.jpg y f01.tif
- marcar como recomienda el flujo normal de la Metodología SciELO de publicación.
- copiar la carpeta markup que ya contiene todos los archivos marcados, es decir, con todos los elementos de artículos identificados, según la Metodología SciELO
- pegarla en el mismo local, renombrándola como markup_pmc
- editar los archivos de la carpeta markup_pmc, siendo que:
- cada figura o tabla tiene que tener etiqueta (Figura 1) y título (Gráfico de ....), siendo que etiqueta y título deben estar centralizados, pues esto ayuda su identificación por el programa. Nota: Cuando hay una figura compuesta de varias partes (Ej.: Fig 1A, 1B, 1C), con una leyenda única, esa figura debe ser considerada como una única imagen. Cuando la figura es compuesta de varias partes, pero una cada de las partes tienen su propia leyenda, deben ser consideradas como figuras independientes y no como parte de una sola imagen.
- insertar licencia Creative Commons adotada pela revista al final de texto
- aplicar marcación PMC a los archivos de la carpeta markup_pmc. La carpeta markup se mantiene como está, siguiendo el flujo normal de publicación.
Use el programa Markup 4.0. En lugar de usar la etiqueta body, usase xmlbody.
Seleccionar lo que corresponde al texto completo (body).
Después, seleccionar xmlbody.
Hecho esto, serán identificados automáticamente en este trecho del texto:
- label y caption de las figuras o tablas. Se los identifica por estar centralizados
- p: párrafos
- section
- xref
- uri
Hecho esto, aún es necesario, identificar manualmente cada figgrp, tabwrap, equation.
Para esto:
- seleccione cada trecho del texto que contiene: image, label, caption, excepto para equation, que solo tiene image.
- seleccione o figgrp, o tabwrap, o equation.
- complete el formulario: id, type, filename (opcional. Es necesario solamente cuando archivo marcado no es HTML)
Para el campo id usase:
- f01, f02a, f02b.. para figuras
- t01, t02, t02a, t02b, ... para tablas
- e01, ... para ecuaciones
Nota: Si hay solamente una etiqueta/título para las figuras identificadas con número más letras (1A, 1B, etc), su id es solamente el número, sin letras. Los rid correspondientes tampoco tendrán letras. Ej.: f01. Pero si para cada figura identificada con letra hay su etiqueta/título entonces cada una debe ser identificada con su número y letra. Ej.: f01a.
Habiendo terminado el marcado, usar el parser.
No habiendo ningun error, y verificando si todas las figuras, tablas y ecuaciones han sido identificadas, clicar en "Generar XML".
Si fue exitoso, se presenta el archivo HTML generado a partir del XML.
Se presenta el archivo HTML generado a partir del XML.
Para visualizar desde HTML para Markup, clicar en "MKP".
Las carpetas pmc y pmc_work serán generadas, dentro de la carpeta del facículo, junto a las carpetas: markup, body, base, pdf, img, markup_pmc, img_src.
En pmc habrá los archivos listos para envío a PMC, nombrados de acuerdo con sus especificiones.
En pmc_work habrá:
- archivo rename_files.bat: script para renombrar los archivos de texto e imágenes de este facículo
- una carpeta por artículo, cuyo nombre es lo del archivo, y dentro de cada una habrá archivos:
- <nombre_original>.sgml.xml
- <nombre_original>.xml
- <nombre_original>.xml.html
- <nombre_de_acuerdo_con_especificaciones_PMC>.xml
- <nombre_de_acuerdo_con_especificaciones_PMC>_*.tif
- rename_files.bat: script para renombrar los archivos de texto e imágenes de este artículo