copy-edit german tree background narrative

trees-background_de.md

@@ -21,7 +21,7 @@ translatorLinks:
   - https://twitter.com/AstridGAGall
 date: "2020 March 13"
 dataset: "https://nextstrain.org/ncov/2020-03-11?d=tree&legend=open&c=country"
-abstract: "Dieses Narrativ erklärt, wie man phylogenetische Bäume lesen und interpretieren kann, welche die genetische Epidemiologie informieren. Diese Webseite ist für Desktop Browser optimiert."
+abstract: "Dieses Narrativ erklärt, wie man phylogenetische Bäume interpretiert und wie solche Analysen epidemiologische Untersuchungen unterstützen können. Diese Webseite ist für Desktop Browser optimiert."
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@@ -31,16 +31,16 @@ abstract: "Dieses Narrativ erklärt, wie man phylogenetische Bäume lesen und in
 <!-- This is left-side text -->
 # [Inhaltsverzeichniss](https://nextstrain.org/ncov/2020-03-11?d=tree&legend=open&c=country)
 
-* [Was verbindet die Übertragungs-Geschichte mit phylogenetischen Bäumen](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=2)?  
-* [Wie interpretiere ich einen Baum](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=3)?  
-* [Was verbindet das "diversity" Panel mit dem phylogenetischen Baum](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=4)?   
-* [Messung von Unterschieden in genetischer Divergenz](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=5).  
-* [Messung von Unterschieden in Zeiteinheiten](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=6).  
-* [Die Datierung des Beginns eines Ausbruches](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=7).  
-* [Wie soll ich die Farben in einem Baum interpretieren](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=8)?  
-* [Wie haengen die Karte und der phylogenetische Baum zusammen](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=9)?  
-* [Fortgeschritten: Unsicherheit in der Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=10).  
-* [Über den Datensatz](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=11).  
+* [Was verbindet die Übertragungs-Geschichte mit phylogenetischen Bäumen](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=2)?
+* [Wie interpretiere ich einen Baum](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=3)?
+* [Was verbindet das "diversity" Panel mit dem phylogenetischen Baum](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=4)?
+* [Messung von Unterschieden in genetischer Divergenz](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=5).
+* [Messung von Unterschieden in Zeiteinheiten](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=6).
+* [Die Datierung des Beginns eines Ausbruches](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=7).
+* [Wie soll ich die Farben in einem Baum interpretieren](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=8)?
+* [Wie haengen die Karte und der phylogenetische Baum zusammen](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=9)?
+* [Fortgeschritten: Unsicherheit in der Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=10).
+* [Über den Datensatz](https://nextstrain.org/narratives/trees-background/de?n=11).
 
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@@ -49,10 +49,11 @@ abstract: "Dieses Narrativ erklärt, wie man phylogenetische Bäume lesen und in
 
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 # [Was verbindet die Übertragungs-Geschichte mit phylogenetischen Bäumen](https://nextstrain.org/ncov/2020-03-11?d=tree&p=full)
-Krankheitserreger verbreiten sich durch eine schnelle Vermehrung im Inneren eines Wirtes, gefolgt von der Übertragung zum nächsten Wirt.
-Eine Epidemie kann sich nur verbreiten, wenn eine Infektion gefolgt wird von mehr als einer Infektion.
+Krankheitserreger verbreiten sich durch eine schnelle Vermehrung im Wirt, gefolgt von der Übertragung zum nächsten Wirt.
+Eine Epidemie kann sich nur dann exponentiell ausbreiten, wenn eine Infektion mehr als eine Folge-Infektion hervorruft.
 <br><br>
-Während ein Krankheitserreger vermehrt und verbreitet wird, wird sein Genom mehrere Male repliziert and zufällige Änderungen (oder Mutationen) akkumulieren sich in seinem Genom. Dies ist absolut normal und erlaubt es, dass die Verbreitung eines Krankheitserregers nachvollzogen werden kann und seine Übertragungsrouten und Dynamiken verstanden werden können.
+Während ein Krankheitserreger sich vermehrt und verbreitet, wird sein Genom häufig kopiert und während des Kopierens akkumulieren sich zufällige Änderungen (oder Mutationen) im Genom.
+Dies ist für RNA Viren nicht ungewöhnlich, aber es erlaubt uns die Verbreitungswege des Krankheitserregers nachzuvollziehen.
 
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 ```auspiceMainDisplayMarkdown
@@ -62,9 +63,10 @@ Während ein Krankheitserreger vermehrt und verbreitet wird, wird sein Genom meh
 <img width="500px" alt="cartoon showing how transmission tree and phylogenetic tree relate" src="https://github.com/nextstrain/nextstrain.org/raw/master/static-site/content/help/01-general/figures/infection_tree_combined.png"/>
 </p>
 <p>
-Diese Abbildung zeigt eine Skizze eines Übertragungs-Baumes. Jeder Kreis repraesentiert einen Fall (infizierte Person), wobei die horizontalen Linien die Dauer der Infektion darstellen. Verbundene Fälle repräsentieren Übertragungen von einer Person zur nächsten.
+Diese Abbildung zeigt eine Skizze eines Übertragungs-Baumes. Jeder Kreis repräsentiert einen Fall (infizierte Person), wobei die horizontalen Linien die Dauer der Infektion darstellen.
+Miteinander verbundene Fälle repräsentieren Übertragungen von einer Person zur nächsten.
 <br> <br>
-Hier sehen wir den kompletten Übertragungs-Baumes. In der Praxis sind aber nur ein Teil der Fälle getestet worden (blau); der komplette Übertragungs-Baum ist deshalb meist nicht bekannt und typischerweise ist nur eine ungefähre Abschätzung der Fallzahlen verfügbar. Genom-Sequenzen ermöglichen es uns, Teile des Übertragungs-Baumes abzuleiten. In diesem Beispiel sind drei Mutationen in dem Baum gezeigt (Rauten). Sequenzen, welche die gleichen Mutationen haben, sind eng miteinander verwandt, so dass diese Mutationen es uns ermöglichen, die Proben in Gruppen ('cluster') von verwandten Viren zu gruppieren, die zu der gleichen Übertragungskette gehören.
+Hier sehen wir den kompletten Übertragungs-Baumes. In der Praxis wird aber nur ein Teil der Fälle getestet und bestätigt (blau); der komplette Übertragungs-Baum ist deshalb meist nicht bekannt und typischerweise ist nur eine ungefähre Abschätzung der Fallzahlen verfügbar. Genom-Sequenzen ermöglichen es uns, Teile des Übertragungs-Baumes zu rekonstruieren. In diesem Beispiel sind drei Mutationen im Baum markiert (Rauten). Sequenzen, welche die gleichen Mutationen haben, sind eng miteinander verwandt. So ermöglichen uns diese Mutationen, die Fälle in Gruppen ('cluster') von verwandten Viren zu gruppiere. Diese Gruppen teil der gleichen Übertragungskette.
 </p>
 </div>
 ```
@@ -75,9 +77,9 @@ Hier sehen wir den kompletten Übertragungs-Baumes. In der Praxis sind aber nur
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 # [Wie interpretiere ich einen Baum?](https://nextstrain.org/ncov/2020-03-11)
 
-Die x-Achse respräsentiert das Ausmass der Unterschiede (in Zeiteinheiten oder genetischer Divergenz -- wir kommen darauf im naechsten Abschnitt zurück). Die y-Achse ist zu Darstellungszwecken hier und hat keine direkte Bedeutung und auch keine Einheit.
+Die x-Achse respräsentiert die Evolution der Viren mit der Zeit (in Zeiteinheiten oder genetischer Divergenz -- wir kommen darauf im naechsten Abschnitt zurück). Die y-Achse dient nur zur Darstellungs und hat keine direkte Bedeutung.
 <br><br>
-Die Spitzen des Baumes repräsentieren Proben (d.h. blaue Fälle in der vorherigen Abbildung). Die internen Verzweigungspunkte repraesentieren Fälle, die nicht getestet wurden (d.h. rote Punkte in der vorherigen Abbildung). Wir nehmen an, dass diese der Ursprung aller Fälle, die von ihnen ausgehen, waren. Diese Verwandtschaftsbeziehungen werden aus dem Muster der Mutationen in den Fällen abgeleitet.
+Die "Blätter" des Baumes repräsentieren Proben (d.h. blaue Fälle in der vorherigen Abbildung). Die internen Verzweigungspunkte repraesentieren Fälle, die nicht getestet wurden (d.h. rote Punkte in der vorherigen Abbildung). Wir nehmen an, dass diese der Ursprung aller Fälle waren, die von ihnen ausgehen. Diese Verwandtschaftsbeziehungen werden aus dem Muster der Mutationen in den Fällen abgeleitet.
 
 <!-- This is right-side text -->
 ```auspiceMainDisplayMarkdown
@@ -89,15 +91,15 @@ Die Spitzen des Baumes repräsentieren Proben (d.h. blaue Fälle in der vorherig
 <p>
 Oben sehen wir eine Abbildung mit dem phylogenetischen Baum auf der linken Seite, wobei die Mutationen als farbige Kreise dargestellt sind. Auf der rechten Seite sind die dazugehörigen Sequenzen zu sehen, in denen die Mutationen ebenfalls als farbige Kreise dargestellt sind. Wir können sehen, dass die Sequenzen, die die gleichen Mutationen gemeinsam haben, zusammen gruppiert sind. Wenn Sequenzen durch eine vertikale Linie verbunden sind, zum Beispiel A und B, bedeutet das, dass es zwischen ihnen keine Unterschiede gibt, heisst, sie sind identisch.
 <br><br>
-Wenn eine Sequenz sich alleine auf einer langen Linie befindet, zum Beispiel C oder E, bedeutet das, dass sie spezifische Mutationen hat, die nicht in anderen Sequenzen vorhanden sind. Je laenger die Linie, desto mehr spezifische Mutationen sind vorhanden.
+Wenn eine Sequenz sich alleine auf einer langen Linie befindet, zum Beispiel C oder E, bedeutet das, dass sie spezifische Mutationen hat, die nicht in anderen Sequenzen vorhanden sind. Je länger die Linie, desto mehr spezifische Mutationen sind vorhanden.
 A und B haben ebenfalls spezifische Mutationen (grüne Kreise), welche nicht in anderen Sequenzen vorhanden sind, jedoch sind A und B miteinander identisch.
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 Basierend auf diesem Baum können wir schlussfolgern, dass A und B eng miteinander verwandt sind, dass D und E eng miteinander verwandt sind und A und B sind enger verwandt mit C als mit D und E.
 </p>
 
 ### Weiterführende Literatur
-* [How to read a tree: tutorial from Arctic Network](https://artic.network/how-to-read-a-tree.html).  
-* [How to read a tree: video from Khan academy](https://www.khanacademy.org/science/high-school-biology/hs-evolution/hs-phylogeny/a/phylogenetic-trees).  
+* [How to read a tree: tutorial from Arctic Network](https://artic.network/how-to-read-a-tree.html).
+* [How to read a tree: video from Khan academy](https://www.khanacademy.org/science/high-school-biology/hs-evolution/hs-phylogeny/a/phylogenetic-trees).
 
 </div>
 
@@ -109,7 +111,8 @@ Basierend auf diesem Baum können wir schlussfolgern, dass A und B eng miteinand
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 # [Was verbindet das "diversity" Panel mit dem phylogenetischen Baum?](https://nextstrain.org/ncov/2020-03-11?d=tree,entropy&c=gt-ORF1b_314&legend=open)
 
-Lassen Sie uns einen Blick auf die ersten 169</tag> Isolate von SARS-CoV-2 (dem Virus, welches COVID-19 verursacht), die öffentlich gemacht wurden, werfen. Genau wie auf der letzten Seite haben wir ein Alignment der Virus-Sequenzen konstruiert (In diesem [GitHub](https://github.com/nextstrain/ncov) repo können Sie sehen, wie sämtliche hier erwähnte Analysen gemacht wurden).
+Lassen Sie uns einen Blick auf die ersten 169</tag> Isolate von SARS-CoV-2 (dem Virus, welches COVID-19 verursacht) werfen.
+Genau wie auf der letzten Seite haben wir ein Alignment der Virus-Sequenzen konstruiert (In diesem [GitHub](https://github.com/nextstrain/ncov) repo können Sie sehen, wie sämtliche hier erwähnte Analysen gemacht wurden).
 <br><br>
 Hier stellen wir den phylogenetischen Baum oberhalb eines Balkendiagrammes, welches die Unterschiede (d.h. Mutationen) im Genom zeigt, dar. Ohne diese Mutationen können wir den Baum nicht konstruieren; die beiden sind also eng verbuden.
 <br><br>
@@ -129,13 +132,13 @@ Es sind diese Mutationen, welche wir nutzen, um die Verwandtschaftsbeziehungen z
 # [Messung von Unterschieden in genetischer Divergenz](https://nextstrain.org/ncov/2020-03-11?c=num_date&d=tree&m=div)
 Dies ist eine Phylogenie der ersten 169</tag> Isolate von SARS-CoV-2 (dem Virus, das COVID-19 verursacht), die öffentlich gemacht wurden.
 <br><br>
-Hier stellt die horizontale Achse die Divergenz dar, also die Anzahl der Veraenderungen (Mutationen) in dem Genom, relativ zur 'Wurzel' des Baumes, d.h. dem Beginn des Ausbruches.
+Hier stellt die horizontale Achse die Divergenz dar, also die Anzahl der Veränderungen (Mutationen) in dem Genom, relativ zur 'Wurzel' des Baumes, d.h. dem Beginn des Ausbruches.
 Manche Sequenzen haben keine Mutationen, was bedeutet, dass sie identisch mit der 'Wurzel' des Baumes sind.
-Andere Sequenzen haven zwischen einer und elf Mutationen.
+Andere Sequenzen haben zwischen einer und elf Mutationen.
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 Im Moment sieht die Abbildung noch nicht wirklich wie ein 'Baum' aus. Viele Sequenzen sind identisch, liegen also zusammen auf vertikalen Linien wie A und B (einige liegen zusammen auf dem ganz linken Teil des Baumes).
-Andere Sequenzen haben spezifische oder gemeinsame Mutationen und liegen auf Linien oder 'Aesten', die nach rechts abgehen.
-Sie koennen sehen, wie viele Mutationen ein 'Ast' hat, indem Sie mit dem Mauszeiger darüberfahren.
+Andere Sequenzen haben spezifische oder gemeinsame Mutationen und liegen auf Linien oder 'Ästen', die nach rechts abgehen.
+Sie können sehen, wie viele Mutationen ein 'Ast' hat, indem Sie mit dem Mauszeiger darüberfahren.
 
 <!-- There is NO right-side text -->
 
@@ -163,7 +166,7 @@ Wenn Sie den Mauszeiger über die vertikale Linie ganz links bewegen, sehen Sie,
 <!-- ############ SLIDE BREAK ############# -->
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 # [Wie soll ich die Farben in einem Baum interpretieren?](https://nextstrain.org/ncov/2020-03-11)
-Phylogenetische Baueme enthalten oft zusätzliche Informationen, zum Beispiel die Orte der Probennahmen. Mittels dieser können wir die Orte für die internen Verzweigungspunkte (hypothetische, intermediaere, aber nicht beprobte Faelle) mittel mathematischer Modelle schätzen. Das kann uns helfen zu verstehen, wie das Virus sich von einem Ort zum nächsten bewegt hat.
+Phylogenetische Bäume enthalten oft zusätzliche Informationen, zum Beispiel die Orte der Probennahmen. Mittels dieser können wir die Orte für die internen Verzweigungspunkte (hypothetische, intermediäre, aber nicht beprobte Faelle) mittel mathematischer Modelle schätzen. Das kann uns helfen zu verstehen, wie das Virus sich von einem Ort zum nächsten bewegt hat.
 <br><br>
 Die Interpretation dieser Daten sollte jedoch mit Vorsicht erfolgen, da die Probenentnahme und Sequenzierung, oder das Fehlen derselben, einen entscheidenden Einfluss haben kann.
 
@@ -199,7 +202,7 @@ Wenn Sie auf ['Explore the data'](https://nextstrain.org/ncov) klicken, können
 
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 # [Fortgeschritten: Unsicherheit in der Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen](https://nextstrain.org/ncov/2020-03-11)
-In einem frueheren Abschnitt haben wir erklaert, wie die internen Verweigungspunkte _hypothetische_ unbeprobte Fälle repräsentieren. In der Tat repräsentieren alle Bäume _Hypothesen_, wie ein Pathogen sich entwickelt und über einen Zeitrahmen bewegt hat. Die Bäume auf nextstrain sind 'Punkt Schätzungen', d.h. die Versionen dieser Entwicklungsgeschichte, die die Wahrscheinlichkeit die Daten zu sehen, wie wir sie tatsächlich sehen, maximieren.
+In einem früheren Abschnitt haben wir erklaert, wie die internen Verweigungspunkte _hypothetische_ unbeprobte Fälle repräsentieren. In der Tat repräsentieren alle Bäume _Hypothesen_, wie ein Pathogen sich entwickelt und über einen Zeitrahmen bewegt hat. Die Bäume auf nextstrain sind 'Punkt Schätzungen', d.h. die Versionen dieser Entwicklungsgeschichte, die die Wahrscheinlichkeit die Daten zu sehen, wie wir sie tatsächlich sehen, maximieren.
 <!-- Not sure about the translation of the last sentence here -->
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 Nichtsdestotrotz gibt es immer Unsicherheiten in diesen Abschätzungen. Meist gilt, je kürzer der Zeitraum einer Rekontruktion, desto unsicherer die Rekonstruktion eines Baumes.