Curso-Taller: Principios de Bioinformática

Objetivos:

1. Aprender buenas prácticas de bioinformática en proyectos de investigación.
2. Introducir a las herramientas necesarias para aplicarlas.

Ponentes:

• Joshua Ismael Haase Hernández (Subdirección de Bioinformática, INMEGEN).
• Cristóbal Fresno Rodríguez (Genómica Poblacional y Bioinformática, INMEGEN).
• Hugo Antonio Tovar Romero (Departamento de Servicios Bioinformáticos, INMEGEN).

Destinatarios:

Al público en general que requiera hacer bioinformática.

• Cupo:

  Alrededor de 55 personas.

Modalidad:

• Teórico/práctico
• 3 horas al día, 2 veces por semana (miércoles y jueves de 11 a 14 horas).
• Duración: 16 sesiones en 8 semanas.

Ediciones:

• 1a Edición: Del 13 de junio al 18 de julio de 2017
• 2a Edición: Del 27 de junio al 16 de agosto de 2018

Temas

• Línea de comandos
• Seguridad/Confidencialidad de la información
• Bioinformática automática y reproducible con mk
• Clúster del INMEGEN @ROGUE1
• Buenas Prácticas de desarrollo en investigación
• Herramientas en el clúster

(Más detalle en el Temario extendido)  

Requerimientos por alumno:

Laptop con los siguientes requerimientos:

• Sistema tipo UNIX (GNU/Linux o Mac, BSD).
• Cuenta en GitHub
• Si usan windows: instalar PuTTY y WinSCP.

Requerimientos técnicos de infraestructura:

• Espacio para 55 personas con sus computadoras personales.
• Cañón y pantalla para proyección.
• Conectividad para 55 personas por ssh desde el áula hasta el sitio del INMEGEN.