Este repositorio contiene códigos de programación en lenguaje R para identificar QTLs asociados al fenotipo de plantas.
El código fue desarrollado usando el paquete R/qtl. El set de datos proviene del trabajo de Cortijo et al (2014), y consiste en datos de una población de 123 líneas endocriadas recombinantes epigenéticas (epiRILs) de Arabidopsis (número haploide de cromosomas x=5). La población de mapeo se generó mediante la cruza de dos individuos isogénicos, pero que diferían considerablemente en sus niveles y patrones de metilación del ADN.
Referencia: Cortijo, S., R. Wardenaar, M. Colomé-Tatché, A. Gilly, M. Etcheverry, K. Labadie, E. Caillieux, F. Hospital, J.M. Aury, P. Wincker, F. Roudier, R.C. Jansen, V. Colot, y F. Johannes. (2014). Mapping the Epigenetic Basis of Complex Traits. Science 343:1145. https://doi.org/10.1126/science.1248127
