| title | authors | authorLinks | affiliations | translators | date | dataset | abstract | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
آنالیز ژنتیکی شیوع ویروس کووید-۱۹. شرح گزارش ۱۳ مارس ۲۰۲۰ |
|
Fred Hutch, Seattle, USA; Biozentrum, Basel, Switzerland; CZI, CA, USA |
|
سیزده مارس ۲۰۲۰ |
این گزارش از داده‌های کووید-۱۹ که در اختیار عموم گذاشته‌شده استفاده می‌کند. این گزارش‌ها هر هفته بروز رسانی می‌شود |
- منابع پیش‌زمینه.
- یادداشتی در مورد نمونه‌گیری.
- چرخش در اروپا.
- شیوع محلی در بریتانیا.
- شیوع سارس-کووید-۲ از ایران.
- ورود به ایالات متحده.
- شیوع سارس-کووید-۲ در ایالت واشنتگتن.
- شیوع سارس-کووید-۲ در کالیفرنیا.
- کارهایی که شما می‌توانید انجام دهید.
- سوالات متداول و تصورات غلط.
- اعتبار علمی.
# شرح اجرایی
در این‌جا، ما ۴۱۰ داده ژنتیکی کووید-۱۹ را که به اشتراک عموم گذاشته‌شده بررسی می‌کنیم.
برای مشاهده‌ی تعداد موارد ویروس کرونا در حال حاضر در سراسر جهان، به سایت مقابل نگاه کنید
[Our World In Data](https://ourworldindata.org/coronavirus).
در این گزارش، ما نشان می‌دهیم که این ویروس به طور گسترده‌ای در سراسر جهان در حال گردش است و شواهدی از انتقال محلی آن در قاره‌های مختلف وجود دارد
در این زمان، تأکید بر تمرکز برای کاهش سرعت پخش بیماری در اجتماعات داریم؛ ممنوعیت‌های مسافرتی در این راستا کمتر موثر است
:در به روزرسانی این هفته، ما گزارش می‌کنیم
* کووید-۱۹ در حال پخش گسترده بین کشورهای اروپایی با جابجایی‌های پیاپی بین کشورهاست
* ما حداقل ۴ ورود مستقل بیماری به انگلستان را شناسایی کردیم که برخی از آنها با پخش زنجیره‌ای در بین اجتماعات همراه بوده‌است
* چندین مورد در ارتباط با مسافرت‌های داخل/خارج ایران به اقصی نقاط جهان وجود داشته‌است
* تا به امروز ورودهای مستقل بسیاری در ایالات متحده انجام‌شده که منجر به ایجاد زنجیره‌های انتقال محلی در ایالات مختلف می‌شود
* نرخ شیوع این همه‌گیری در ایالت واشنگتن رو به افزایش است؛ برخی از موارد ابتلا مربوط به مسافران کشتی مسافرتی گرند پرینسس هستند
* شیوع محلی کووید-۱۹ در کالیفرنیا وجود دارد
* برای کاهش فشار بر سیستم های مراقبت بهداشتی و محافظت از افراد آسیب‌پذیر جامعه باید اقدامات فاصله‌گیری اجتماعی سریعاً عملیاتی شود
ما منابع گوناگون دیگری که ارزش خواندن برای آشنایی با کووید-۱۹ و ویروس ایجاد‌کننده‌ی آن یعنی سارس-کووید-۲ دارند آماده کرده‌ایم تا با آنها آشنا شوید این اطلاعات تفسیر داده‌های ارائه شده در این گزارش را آسان‌تر می‌کند. اگر با درختهای ژنتیکی آشنا نیستید، ما شما را تشویق می‌کنیم تا به این‌جا مراجعه کنید ( چگونه درختهای ژنتیکی را بخوانیم' روایت ) و پس از مطالعه به این‌جا بازگردید
## پیش‌زمینه
<div>
<a href="https://nextstrain.org/help/coronavirus/human-CoV"><img alt="microscopy image of coronaviruses" width="100" src="https://nextstrain.org/static/ncov_narrative-76cfd610d11ef708d213a3170de9519f.png"/> پیش‌درآمدی بر ویروس کرونا </a>
<a href="https://nextstrain.org/help/coronavirus/SARS-CoV-2"><img alt="illustration of a coronavirus" width="100" src="http://data.nextstrain.org/img_nCoV-CDC.jpg"/> همه‌گیری اخیر کووید-۱۹ </a>
<a href="https://nextstrain.org/narratives/trees-background"><img alt="cartoon of a phylogenetic tree" width="100" src="http://data.nextstrain.org/img_toy_alignment_mini.png"/> چگونه تبارزایش (فیلوژنتیک) را بخوانید</a>
</div>
## مطالعات بیشتر
* خلاصه‌ای از همه‌گیری سارس-کووید-۲ در
[ویکی‌پدیا](https://en.wikipedia.org/wiki/2019%E2%80%9320_Wuhan_coronavirus_outbreak).
* مطالب منتشر‌شده
[سی‌دی‌سی آمریکا](https://www.cdc.gov/coronavirus/index.html).
## Nextstrain شرح
صفحه‌ی ذیل حاوی آنالیزهای انجام شده توسط [Nextstrain](https://nextstrain.org) گروه نکست‌استرین هست:
این صفحه متن پاراگراف و تصویر داده‌های ژنتیکی را در بر دارد.
داشتن ژنوم کامل یک آ‌ان‌ای ویروس جدید و بزرگ به این سرعت یک موفقیت بزرگ است.
اشتراک‌گذاری سریع و آزاد داده‌های ژنتیکی و تفسیر آنها توسط دانشمندان در اقصی نقات دنیا این آنالیز را مسیر کرده‌است (به اسلاید آخر برای تصویر حق تالیف توالی یابی رجوع کنید.).
ما در حال حاضر از ۳۰ کشور در ۵ قاره نمونه‌های توالی ژنتیکی داریم. این یک شاهکار باورنکردنی است. نمونه‌گیری از توالی ژنتیکی یک ویروس بزرگ آر‌ان‌ای ناشناخته در وسط یک همه‌گیری جهانی دشوار است و فقط با تلاش باورنکردنی و به اشتراک‌گذاری به موقع داده‌ها توسط دانشمندان و پزشکان در سراسر جهان امکان‌پذیر است
در حالی که این داده‌ها به ما این امکان را می‌دهد که بسیاری از خصوصیات مهم این شیوع را استنباط کرده و موقعیت زمانی و مکانی آن را ردیابی کنیم، تأکید می‌شود که نتیجه‌گیری‌های ما محدود به داده‌های موجود است
به عنوان مثال، در نقشه‌ی روی این سایت نمونه‌های توالی ژنتیکی بسیار کمی از کشورهای با درآمد متوسط و کم وجود دارد. این دلیل آن نیست که کووید-۱۹ در این مناطق پخش نمی‌شود، یا این موارد برای درک ما از شیوع ویروس چندان مهم نیستند، بلکه نشان می‌دهد ما اطلاعات زیادی از این مناطق نداریم. اندازه‌ی هر دایره روی نقشه نشان می‌دهد که چه مقدار داده در حال حاضر از آن منطقه در دسترس است و به معنای گستره‌ی همه‌گیری نیست
در این‌جا، ما شاهد یک دسته بزرگ نمونه های توالی ژنتیکی از اروپا هستیم
به ویژه، توالی‌های بسیاری از کشورهای مختلف به هم متصل می‌شوند که نشان می‌دهد کووید-۱۹ در حال حاضر به‌طور کاملاً گسترده در سراسر اروپا در حال گردش است.
با بزرگ‌نمایی روی نقشه، می‌بینیم که بین ایتالیا و مناطق دیگر پیوندهای زیادی وجود دارد. با این حال، باید در نظر داشته باشید که جهت گیری این پیوندها همیشه نمی‌تواند با اطمینان استنباط شود. فرضیه‌های دیگر نیز می‌توانند این داده‌ها را توضیح دهند (به عنوان مثال، اگر یک فرد که از او نمونه‌گیری نشده شخص دیگری را در ایتالیا یا جای دیگر بیمار کرده باشد ما نمی‌توانیم آن ارتباط را پیدا کنیم).
به عنوان نمونه با نگاهی به جزایر انگلستان و ایرلند، می‌توان چندین نمونه ویروس‌هایی از کشورهای مختلف با تشابه ژنتیکی بالا را مشاهده کرد که در جزایر انگلیس و ایرلند وجود دارند.
این مشاهده با ورود ویروس از بیشتر از ۴ نقطه دیگر سازگار است.
ما همچنین مواردی را مشاهده می‌کنیم که پس از ورود ویروس، چندین نمونه مشابه توالی ژنتیکی در یک موقعیت جغرافیایی وجود دارد. این می‌تواند نشان دهنده‌ی انتقال زنجیره‌ای محلی در مناطق مختلف ناشی از چند ورود مستقل باشد.
تعدادی نمونه‌های ژنتیکی از بیمارانی که سابقه‌ی سفر به ایران را داشته‌اند گرفته شده است. این نمونه‌های توالی ژنتیکی مشابهت بسیار بالایی با یکدیگر دارند که نشان می‌دهد شیوع در ایران ممکن است نتیجه انتقال یک فرد باشد که متعاقباً به بسیاری از مناطق دیگر منتقل گردیده‌است.
توجه داشته باشید كه نمونه های توالی ژنتیکی از بیماران ایرانی در دسترس نیست.
در این‌جا، ما می‌توانیم ببینیم که این ویروس در چندین مورد مستقل به ایالات متحده وارد شده‌است.
بسیاری از این ورودهای مستقل با سایر نمونه‌های ژنتیکی گرفته‌شده از ایالات متحده مرتبط نیست، به همین جهت ما مطمئن نیستیم که این ورودها منجر به شیوع محلی شده یاشد.
با این حال، با توجه به اینکه هنوز ظرفیت نمونه‌گیری در اکثر مناطق افزایش نیافته‌است، انتظار داریم موارد گزارش نشده‌ی بسیار زیادی از شیوع ویروس وجود داشته‌باشد.
در واشنگتن و کالیفرنیا ، ما شاهد زنجیره‌ای از نمونه‌ها هستیم که مشابهت ژنتیکی بالایی با یکدیگر داند.
این نشان می‌دهد انتقال محلی در این دو ایالت در حال جریان است.
در این‌جا، ما یک گروه انبوهی از نمونه‌ها در واشنگتن را مشاهده می‌کنیم که همه به هم از نظر ژنتیکی نزدیک هستند.
از این رو نتیجه می‌گیریم که شیوع گسترده‌ی محلی در ایالت واشنگتن در جریان است.
جالب است که نمونه‌های واشنگتن با نمونه‌های گرفته‌شده از کشتی کروز گرند پرینسس مشابهت دارند.
ما هنوز مطمئن نیستیم که آیا ویروس از کشتی دریایی به واشنگتن منتقل شده و یا بالعکس. با گردآوری اطلاعات بیشتر، تحلیل خود را در این مورد به‌روز خواهیم کرد.
با نگاهی به نمونه‌های کالیفرنیا، شواهدی مبنی بر چندین ورود مستقل می‌بینیم.
مهم‌تر از همه، ما حداقل یک گروه از نمونه‌های ژنتیکی مشابه را مشاهده می‌کنیم که همگی در یک دوره زمانی کوتاه از کالیفرنیا نمونه برداری شدند.
(
بر روی
بررسی داده
کلیک کنید و عبارت 'CA9' را جستجو کنید.
)
این مواکداَ نشان می‌دهد که انتقال محلی در کالیفرنیا در حال جریان است.
- این ویروس در بسیاری از نقاط جهان چندین نوبت مستقلاً پخش شده است. همه این موارد منجر به شیوع محلی نمی‌شوند
- شواهدی دال بر گسترش شیوع ویروس در اروپا و مناطقی از آمریکا، چین و جنوب شرق آسیا می‌بینیم
- کنترل شیوع محلی ویروس از طریق فاصله گیری اجتماعی اهمیت فوق العاده‌ای برای دفاع از اقشار آسیب‌پذیر جامعه دارد
# چکار می‌توانیم بکنیم
فاصله‌گیری اجتماعی یعنی کاهش تعداد افرادی که در طی روز با آنها در ارتباط هستید و یا با آنها معاشرت کاری دارید. این کار سخت است اما برای سلامت عمومی بسیار موثر است
اگر همه ارتباطات خود را تنها ۲۵ درصد کاهش دهند، انتظار کاهش ۵۰ درصدی برای کل مبتلایان در ماه آتی می‌رود.
([Klein et al., 2020-03-13](https://institutefordiseasemodeling.github.io/COVID-public/reports/Working%20paper%20%E2%80%93%20model-based%20estimates%20of%20COVID-19%20burden%20in%20King%20and%20Snohomish%20counties%20through%20April%207.pdf)).
مطمئن نیستید که فاصله اجتماعی به چه معناست؟
[این راهنمای مفید را بررسی کنید](https://www.theatlantic.com/family/archive/2020/03/coronavirus-what-does-social-distancing-mean/607927/).
<div>
<img src="https://github.com/nextstrain/narratives/raw/master/figures/social-distancing-efficacy.png" width="70%">
</div>
## گام‌هایی که افراد عادی می‌توانند بردارند
* کاهش تعداد افرادی که در روز با آنها در ارتباط هستید خصوصاً اگر جزو گروه‌های آسیب‌پذیر هستید مانند افراد مسن و بیماران
* به یاد داشته‌باشید که حتی اگر شما در گروه آسیب پذیر نیستید بسیاری از افراد پیرامون شما ممکن است باشند، لذا از این توصیه‌ها برای مراقبت از دیگران استفاده کنید
* دست‌هایتان را بشورید، درست مانند زماتی که تسمه کولرتان را عوض کرده‌اید
* اگر مریض هستید در خانه بمانید، با مقداری آذوقه اضافی خود را برای قرنطینه شخصی آماده کنید
* اگر شما یک کارفرما هستید کارمندان خود را ترغیب کنید که در هنگام مریضی در خانه بمانند به عنوان مثال مرخصی با حقوق به آنها بدهید
## کارهایی که مقامات رسمی می‌توانند انجام دهند
* تست را به صورت رایگان در اختیار همگانی قرار دهید
* فاصله‌گیری اجتماعی را در دستور کار قرار دهید
* حمایت مالی از کسانی که به واسطه برقراری فاصله گیری اجتماعی تحت تاثیر قرار می‌گیرند مانند کارگران ساعتی، کسانی که از افراد مسن و کودکان مراقبت می‌کنند و کسب و کار های کوچک و غیره.
# مطالعات بیشتر
* "Don't believe the conspiracy theories you hear about coronavirus & HIV" [article](https://massivesci.com/notes/wuhan-coronavirus-ncov-sars-mers-hiv-human-immunodeficiency-virus/) _2020-01-31_
* "Baseless Conspiracy Theories Claim New Coronavirus Was Bioengineered" [article](https://www.factcheck.org/2020/02/baseless-conspiracy-theories-claim-new-coronavirus-was-bioengineered/) _2020-02-07_
* "No, The Wuhan Coronavirus Was Not Genetically Engineered To Put Pieces Of HIV In It" [article](https://www.forbes.com/sites/victoriaforster/2020/02/02/no-coronavirus-was-not-bioengineered-to-put-pieces-of-hiv-in-it/#5d339e8e56cb) _2020-02-02_
* "Busting coronavirus myths" [AFP Fact Check](https://factcheck.afp.com/busting-coronavirus-myths) _2020-02-19_
# تصورات غلط
<p dir="rtl">
تعدادی از تصورات غلط در مورد خاستگاه ویروس کرونای جدید منتشر شده‌است.
در حین شیوع بیماری همه‌گیر مانند این، انتشار اطلاعاتی که نادرست باشد می‌تواند موجب وحشت بیشتر در بین مردم شود طوری که به دانشمندان و دولت‌مردان اعتماد نکنند و از این رو کمتر دستور العمل‌ها و اقدماتی احتیاطی را جدی بگیرند.
در تلاش برای توضیح اینکه چرا این نظرات نادرست هستند، دانشمندان به این نظریه‌ها در صفحات زیر پرداخته‌اند:
</p>
<div>
<a href="http://virological.org/t/ncovs-relationship-to-bat-coronaviruses-recombination-signals-no-snakes-no-evidence-the-2019-ncov-lineage-is-recombinant/331"><img alt="picture of a snake" width="100" src="http://data.nextstrain.org/img_snake-freeToUse.jpg"/> مار سر منشأ سارس-کووید-۲ (فنی) </a>
<a href="https://twitter.com/trvrb/status/1223666856923291648"><img alt="illustration of HIV" width="100" src="http://data.nextstrain.org/img_HIV-wiki.jpg"/> ایده‌ی مهندسی اچ‌آیی‌وی (ویروس توییتر)</a>
</div>
ما می‌خواهیم از کار شگفت‌انگیز و به موقع انجام‌شده توسط همه‌ی دانشمندان در حال کار بر روی این همه‌گیری جهانی و به ویژه افرادی که در کشور چین کار می‌کنند قدردانی کنیم. که با به اشتراک‌گذاری سریع داده‌های ژنتیکی و داده‌های آماری خود اجازه‌ی تحلیل‌های این‌چنینی را برای ما ممکن می‌سازد.
با سپاس و قدردانی از GISAID برای در اختیار گذاشتن پلتفرم که از طریق آن داده‌ها می‌تواند بارگذاری و به اشتراک گذاشته‌شود.
ما قدردان داده‌های گردآوری شده توسط گروه‌های زیر هستیم:
* Arizona Department of Health Services
* Auckland Hospital
* BCCDC Public Health Laboratory
* Bamrasnaradura Hospital
* Bundeswehr Institute of Microbiology
* CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD
* CR&WISCO GENERAL HOSPITAL
* California Department of Health
* California Department of Public Health
* Center of Medical Microbiology, Virology, and Hospital Hygiene
* Center of Medical Microbiology, Virology, and Hospital Hygiene, University of Duesseldorf
* Centers for Disease Control, R.O.C. (Taiwan)
* Centre for Human and Zoonotic Virology (CHAZVY), College of Medicine University of Lagos/Lagos University Teaching Hospital (LUTH), part of the Laboratory Network of the Nigeria Centre for Disease Control (NCDC)
* Centre for Infectious Diseases and Microbiology - Public Health
* Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services
* Centro Hospital do Porto, E.P.E. - H. Geral de Santo Antonio
* Centro Hospitalar e Universitario de Sao Joao, Porto
* Charite Universitatsmedizin Berlin, Institute of Virology; Institut fur Mikrobiologie der Bundeswehr, Munich
* Department of Infectious Diseases, Istituto Superiore di Sanita, Roma , Italy
* Department of Infectious and Tropical Diseases, Bichat Claude Bernard Hospital, Paris
* Department of Internal Medicine, Triemli Hospital
* Department of Laboratory Medicine, National Taiwan University Hospital
* Department of Microbiology, Institute for Viral Diseases, College of Medicine, Korea University
* Department of Pathology, Toshima Hospital
* Department of Virology III, National Institute of Infectious Diseases
* Department of Virology and Immunology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Huslab Finland
* Department of microbiology laboratory,Anhui Provincial Center for Disease Control and Prevention
* Dept. of Pathology, National Institute of Infectious Diseases
* Dept. of Virology III, National Institute of Infectious Diseases
* Dienst Gezondheid & Jeugd Zuid-Holland Zuid
* Division of Infectious Diseases, Department of Internal Medicine, Korea University College of Medicine
* Division of Infectious Diseases, University Hospital Zurich
* Division of Viral Diseases, Center for Laboratory Control of Infectious Diseases, Korea Centers for Diseases Control and Prevention
* Dutch COVID-19 response team
* ErasmusMC
* Foundation Elisabeth-Tweesteden Ziekenhuis
* Foundation Pamm
* Fujian Center for Disease Control and Prevention
* General Hospital of Central Theater Command of People's Liberation Army of China
* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention; Guangdong Provincial Public Health
* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention; Guangdong Provinical Public Health
* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention;Guangdong Provincial Institute of Public Health
* Guangdong Provincial Institution of Public Health, Guangdong Provinical Center for Disease Control and Prevention
* HUS Diagnostiikkakeskus, Hallinto
* Hangzhou Center for Disease Control and Prevention
* Hangzhou Center for Disease and Control Microbiology Lab
* Harborview Medical Center
* Hong Kong Department of Health
* Hospital Israelita Albert Einstein
* IL Department of Public Health Chicago Laboratory
* INMI Lazzaro Spallanzani IRCCS
* Indian Council of Medical Research - National Institute of Virology
* Indian Council of Medical Research-National Institute of Virology
* Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College
* Institute of Viral Disease Control and Prevention, China CDC
* Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias
* KU Leuven, Clinical and Epidemiological Virology
* Klinik Hirslanden Zurich
* Korea Centers for Disease Control & Prevention (KCDC) Center for Laboratory Control of Infectious Diseases Division of Viral Diseases
* Laboratoire National de Sante
* Laboratoire de Virologie, HUG
* Laboratorio di Microbiologia e Virologia, Universita Vita-Salute San Raffaele, Milano
* Laboratory Medicine
* Lapland Central Hospital
* MHC Brabant Zuidoost
* MHC Drente
* MHC Flevoland
* MHC Gooi & Vechtstreek
* MHC Haaglanden
* MHC Kennemerland
* MHC Rotterdam-Rijnmond
* MHC Utrecht
* MHC West-Brabant
* MSHS Clinical Microbiology Laboratories
* Massachusetts Department of Public Health
* Monash Medical Centre
* NHC Key laboratory of Enteric Pathogenic Microbiology, Institute of Pathogenic Microbiology
* National Centre for Infectious Diseases
* National Influenza Center - National Institute of Hygiene and Epidemiology (NIHE)
* National Influenza Centre, National Public Health Laboratory, Kathmandu, Nepal
* National Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC
* National Public Health Laboratory
* National Public Health Laboratory, National Centre for Infectious Diseases
* Pathology Queensland
* Providence Regional Medical Center
* Public Health Ontario Laboratory
* RIVM
* Respiratory Virus Unit, Microbiology Services Colindale, Public Health England
* Seattle Flu Study
* Serology, Virology and OTDS Laboratories (SAViD), NSW Health Pathology Randwick
* Servicio Microbiologia. Hospital Clinico Universitario. Valencia.
* Shenzhen Key Laboratory of Pathogen and Immunity, National Clinical Research Center for Infectious Disease, Shenzhen Third People's Hospital
* Singapore General Hospital
* Sorbonne Universite, Inserm et Assistance Publique-Hopitaux de Paris (Pitie Salpetriere)
* State Health Office Baden-Wuerttemberg
* Taiwan Centers for Disease Control
* Texas Department of State Health Services
* The Central Hospital Of Wuhan
* The National Institute of Public Health Center for Epidemiology and Microbiology
* The University of Hong Kong - Shenzhen Hospital
* Tianmen Center for Disease Control and Prevention
* UCD National Virus Reference Laboratory
* University of Washington Virology Lab
* Union Hospital of Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology
* Valley Medical Center
* Virology Department, Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust
* Virology Unit, Institut Pasteur du Cambodge.
* Wales Specialist Virology Centre
* Washington State Department of Health
* Washington State Public Health Lab
* Weifang Center for Disease Control and Prevention
* West of Scotland Specialist Virology Centre, NHSGGC
* Wisconsin Department of Health Services
* Wuhan Fourth Hospital
* Wuhan Jinyintan Hospital
* Wuhan Lung Hospital
* Yongchuan District Center for Disease Control and Prevention
* Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention
* Zhongxian Center for Disease Control and Prevention
این داده‌ها از طریق GISAID به اشتراک گذاشته‌شد. ما از مشارکت آنها بسیار قدردانی می‌کنیم.
The SARS-CoV-2 genomes were generously shared by scientists at these submitting labs:
* Arizona Department of Health Services
* USA/AZ1/2020
* Auckland Hospital
* NewZealand/01/2020
* BCCDC Public Health Laboratory
* Canada/BC_37_0-2/2020
* Bamrasnaradura Hospital
* Nonthaburi/61/2020
* Nonthaburi/74/2020
* Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology
* pangolin/Guangdong/P2S/2019
* pangolin/Guangxi/P1E/2017
* pangolin/Guangxi/P2V/2017
* pangolin/Guangxi/P3B/2017
* pangolin/Guangxi/P4L/2017
* pangolin/Guangxi/P5E/2017
* pangolin/Guangxi/P5L/2017
* Bundeswehr Institute of Microbiology
* Germany/BavPat2/2020
* Germany/BavPat3/2020
* CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD
* France/RA739/2020
* CR&WISCO GENERAL HOSPITAL
* Wuhan/HBCDC-HB-05/2020
* California Department of Health
* USA/CA3/2020
* USA/CA4/2020
* USA/CA5/2020
* California Department of Public Health
* USA/CA-CDPH-UC1/2020
* USA/CA-CDPH-UC2/2020
* USA/CA-CDPH-UC3/2020
* USA/CA-CDPH-UC4/2020
* USA/CA-CDPH-UC5/2020
* USA/CA-CDPH-UC6/2020
* USA/CA-CDPH-UC7/2020
* USA/CA-CDPH-UC8/2020
* USA/CA-CDPH-UC9/2020
* USA/CA1/2020
* USA/CA2/2020
* USA/CA6/2020
* USA/CA7/2020
* USA/CA8/2020
* USA/CA9/2020
* USA/UC-CDPH-UC11/2020
* Center of Medical Microbiology, Virology, and Hospital Hygiene
* Germany/NRW-01/2020
* Germany/NRW-02-1/2020
* Germany/NRW-03/2020
* Germany/NRW-04/2020
* Center of Medical Microbiology, Virology, and Hospital Hygiene, University of Duesseldorf
* Germany/NRW-011/2020
* Germany/NRW-05/2020
* Germany/NRW-06/2020
* Germany/NRW-07/2020
* Germany/NRW-08/2020
* Germany/NRW-09/2020
* Germany/NRW-10/2020
* Centers for Disease Control, R.O.C. (Taiwan)
* Taiwan/2/2020
* Centre for Human and Zoonotic Virology (CHAZVY), College of Medicine University of Lagos/Lagos University Teaching Hospital (LUTH), part of the Laboratory Network of the Nigeria Centre for Disease Control (NCDC)
* Nigeria/Lagos01/2020
* Centre for Infectious Diseases and Microbiology - Public Health
* Australia/NSW10/2020
* Australia/NSW12/2020
* Australia/NSW13/2020
* Australia/NSW14/2020
* Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services
* Australia/NSW01/2020
* Australia/NSW05/2020
* Australia/NSW06/2020
* Australia/NSW07/2020
* Australia/NSW08/2020
* Australia/NSW09/2020
* Sydney/2/2020
* Centre for Infectious Diseases and Microbiology- Public Health
* Australia/NSW11/2020
* Centro Hospital do Porto, E.P.E. - H. Geral de Santo Antonio
* Portugal/CV62/2020
* Centro Hospitalar e Universitario de Sao Joao, Porto
* Portugal/CV63/2020
* Charite Universitatsmedizin Berlin, Institute of Virology; Institut fur Mikrobiologie der Bundeswehr, Munich
* Germany/BavPat1/2020
* Department of Infectious Diseases, Istituto Superiore di Sanita, Roma , Italy
* Italy/CDG1/2020
* Department of Infectious Diseases, Istituto Superiore di Sanita, Rome, Italy
* Italy/SPL1/2020
* Department of Infectious and Tropical Diseases, Bichat Claude Bernard Hospital, Paris
* France/IDF0372-isl/2020
* France/IDF0372/2020
* France/IDF0373/2020
* France/IDF0386-islP1/2020
* France/IDF0386-islP3/2020
* France/IDF0515-isl/2020
* France/IDF0515/2020
* France/IDF0571/2020
* Department of Internal Medicine, Triemli Hospital
* Switzerland/1000477102/2020
* Switzerland/1000477377/2020
* Department of Laboratory Medicine, National Taiwan University Hospital
* Taiwan/NTU01/2020
* Taiwan/NTU02/2020
* Taiwan/NTU03/2020
* Department of Microbiology, Institute for Viral Diseases, College of Medicine, Korea University
* SouthKorea/KUMC01/2020
* SouthKorea/KUMC02/2020
* SouthKorea/KUMC04/2020
* SouthKorea/KUMC06/2020
* Department of Pathology, Toshima Hospital
* Japan/TK/20-31-3/2020
* Department of Virology III, National Institute of Infectious Diseases
* Japan/AI/I-004/2020
* Department of Virology and Immunology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Huslab Finland
* Finland/FIN01032020/2020
* Finland/FIN03032020A/2020
* Finland/FIN03032020B/2020
* Finland/FIN03032020C/2020
* Department of microbiology laboratory,Anhui Provincial Center for Disease Control and Prevention
* Anhui/SZ005/2020
* Dept. of Pathology, National Institute of Infectious Diseases
* Japan/NA-20-05-1/2020
* Japan/OS-20-07-1/2020
* Dept. of Virology III, National Institute of Infectious Diseases
* Japan/KY-V-029/2020
* Japan/TY-WK-012/2020
* Japan/TY-WK-501/2020
* Japan/TY-WK-521/2020
* Dienst Gezondheid & Jeugd Zuid-Holland Zuid
* Netherlands/Hardinxveld_Giessendam_1364806/2020
* Division of Infectious Diseases, Department of Internal Medicine, Korea University College of Medicine
* SouthKorea/KUMC03/2020
* SouthKorea/KUMC05/2020
* Division of Infectious Diseases, University Hospital Zurich
* Switzerland/1000477796/2020
* Switzerland/1000477797/2020
* Switzerland/1000477806/2020
* Division of Viral Diseases, Center for Laboratory Control of Infectious Diseases, Korea Centers for Diseases Control and Prevention
* SouthKorea/KCDC05/2020
* SouthKorea/KCDC06/2020
* SouthKorea/KCDC07/2020
* SouthKorea/KCDC12/2020
* SouthKorea/KCDC24/2020
* Dutch COVID-19 response team
* Netherlands/Gelderland_1/2020
* Netherlands/Limburg_2/2020
* Netherlands/Limburg_3/2020
* Netherlands/Limburg_4/2020
* Netherlands/Limburg_5/2020
* Netherlands/Limburg_6/2020
* Netherlands/NoordBrabant_1/2020
* Netherlands/NoordBrabant_10/2020
* Netherlands/NoordBrabant_11/2020
* Netherlands/NoordBrabant_12/2020
* Netherlands/NoordBrabant_13/2020
* Netherlands/NoordBrabant_14/2020
* Netherlands/NoordBrabant_15/2020
* Netherlands/NoordBrabant_16/2020
* Netherlands/NoordBrabant_17/2020
* Netherlands/NoordBrabant_18/2020
* Netherlands/NoordBrabant_19/2020
* Netherlands/NoordBrabant_2/2020
* Netherlands/NoordBrabant_20/2020
* Netherlands/NoordBrabant_21/2020
* Netherlands/NoordBrabant_22/2020
* Netherlands/NoordBrabant_23/2020
* Netherlands/NoordBrabant_24/2020
* Netherlands/NoordBrabant_25/2020
* Netherlands/NoordBrabant_26/2020
* Netherlands/NoordBrabant_27/2020
* Netherlands/NoordBrabant_28/2020
* Netherlands/NoordBrabant_29/2020
* Netherlands/NoordBrabant_3/2020
* Netherlands/NoordBrabant_30/2020
* Netherlands/NoordBrabant_31/2020
* Netherlands/NoordBrabant_32/2020
* Netherlands/NoordBrabant_33/2020
* Netherlands/NoordBrabant_34/2020
* Netherlands/NoordBrabant_35/2020
* Netherlands/NoordBrabant_36/2020
* Netherlands/NoordBrabant_37/2020
* Netherlands/NoordBrabant_38/2020
* Netherlands/NoordBrabant_39/2020
* Netherlands/NoordBrabant_4/2020
* Netherlands/NoordBrabant_5/2020
* Netherlands/NoordBrabant_6/2020
* Netherlands/NoordHolland_1/2020
* Netherlands/NoordHolland_2/2020
* Netherlands/Overijssel_1/2020
* Netherlands/Overijssel_2/2020
* Netherlands/Utrecht_1/2020
* Netherlands/Utrecht_10/2020
* Netherlands/Utrecht_11/2020
* Netherlands/Utrecht_12/2020
* Netherlands/Utrecht_13/2020
* Netherlands/Utrecht_14/2020
* Netherlands/Utrecht_15/2020
* Netherlands/Utrecht_16/2020
* Netherlands/Utrecht_2/2020
* Netherlands/Utrecht_3/2020
* Netherlands/Utrecht_4/2020
* Netherlands/Utrecht_5/2020
* Netherlands/Utrecht_6/2020
* Netherlands/Utrecht_7/2020
* Netherlands/Utrecht_8/2020
* Netherlands/ZuidHolland_1/2020
* Netherlands/ZuidHolland_10/2020
* Netherlands/ZuidHolland_11/2020
* Netherlands/ZuidHolland_13/2020
* Netherlands/ZuidHolland_14/2020
* Netherlands/ZuidHolland_15/2020
* Netherlands/ZuidHolland_16/2020
* Netherlands/ZuidHolland_17/2020
* Netherlands/ZuidHolland_18/2020
* Netherlands/ZuidHolland_19/2020
* Netherlands/ZuidHolland_2/2020
* Netherlands/ZuidHolland_20/2020
* Netherlands/ZuidHolland_21/2020
* Netherlands/ZuidHolland_22/2020
* Netherlands/ZuidHolland_23/2020
* Netherlands/ZuidHolland_24/2020
* Netherlands/ZuidHolland_5/2020
* Netherlands/ZuidHolland_6/2020
* Netherlands/ZuidHolland_7/2020
* Netherlands/ZuidHolland_8/2020
* Netherlands/ZuidHolland_9/2020
* ErasmusMC
* Netherlands/Nieuwendijk_1363582/2020
* Netherlands/Rotterdam_1363790/2020
* Foundation Elisabeth-Tweesteden Ziekenhuis
* Netherlands/Tilburg_1363354/2020
* Netherlands/Tilburg_1364286/2020
* Foundation Pamm
* Netherlands/Berlicum_1363564/2020
* Fujian Center for Disease Control and Prevention
* Fujian/13/2020
* Fujian/8/2020
* General Hospital of Central Theater Command of People's Liberation Army of China
* Wuhan/WH01/2019
* Wuhan/WH02/2019
* Wuhan/WH03/2020
* Wuhan/WH04/2020
* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention; Guangdong Provincial Public Health
* Foshan/20SF207/2020
* Foshan/20SF210/2020
* Foshan/20SF211/2020
* Guangdong/20SF012/2020
* Guangdong/20SF013/2020
* Guangdong/20SF014/2020
* Guangdong/20SF025/2020
* Guangdong/20SF028/2020
* Guangdong/20SF040/2020
* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention; Guangdong Provinical Public Health
* Guangdong/20SF174/2020
* Guangzhou/20SF206/2020
* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention;Guangdong Provincial Institute of Public Health
* Guangdong/20SF201/2020
* Guangdong Provincial Institution of Public Health, Guangdong Provinical Center for Disease Control and Prevention
* Guangdong/2020XN4239-P0034/2020
* Guangdong/2020XN4243-P0035/2020
* Guangdong/2020XN4273-P0036/2020
* Guangdong/2020XN4276-P0037/2020
* Guangdong/2020XN4291-P0038/2020
* Guangdong/2020XN4373-P0039/2020
* Guangdong/2020XN4433-P0040/2020
* Guangdong/2020XN4448-P0002/2020
* Guangdong/2020XN4459-P0041/2020
* Guangdong/2020XN4475-P0042/2020
* Guangdong/DG-S2-P0054/2020
* Guangdong/DG-S41-P0056/2020
* Guangdong/DG-S6-P0055/2020
* Guangdong/DG-S9-P0045/2020
* Guangdong/FS-S29-P0051/2020
* Guangdong/FS-S30-P0052/2020
* Guangdong/FS-S34-P0015/2020
* Guangdong/FS-S42-P0046/2020
* Guangdong/FS-S48-P0047/2020
* Guangdong/FS-S50-P0053/2020
* Guangdong/GD2020012-P0022/2020
* Guangdong/GD2020016-P0011/2020
* Guangdong/GD2020080-P0010/2020
* Guangdong/GD2020085-P0043/2020
* Guangdong/GD2020086-P0021/2020
* Guangdong/GD2020087-P0008/2020
* Guangdong/GD2020115-P0009/2020
* Guangdong/GD2020134-P0031/2020
* Guangdong/GD2020139-P0007/2020
* Guangdong/GD2020227-P0029/2020
* Guangdong/GD2020233-P0027/2020
* Guangdong/GD2020234-P0023/2020
* Guangdong/GD2020241-P0013/2020
* Guangdong/GD2020246-P0028/2020
* Guangdong/GD2020258-P0018/2020
* Guangdong/GDFS2020052-P0025/2020
* Guangdong/GDFS2020054-P0005/2020
* Guangdong/GDFS2020056-P0044/2020
* Guangdong/GDFS2020127-P0026/2020
* Guangdong/GDSZ202004-P0004/2020
* Guangdong/GDSZ202008-P0020/2020
* Guangdong/GDSZ202009-P0032/2020
* Guangdong/GDSZ202013-P0014/2020
* Guangdong/GDSZ202015-P0019/2020
* Guangdong/GZ-S6-P0050/2020
* Guangdong/JM-S1-P0062/2020
* Guangdong/MM-S1-P0048/2020
* Guangdong/SZ-N128-P0057/2020
* Guangdong/SZ-N59-P0049/2020
* Guangdong/ZH-N22-P0059/2020
* Guangdong/ZH-S33-P0058/2020
* Guangdong/ZQ-S2-P0061/2020
* Guangdong/ZS-S6-P0060/2020
* HUS Diagnostiikkakeskus, Hallinto
* Finland/FIN-25/2020
* Hangzhou Center for Disease Control and Prevention
* Hangzhou/HZCDC0001/2020
* Hangzhou Center for Disease and Control Microbiology Lab
* Hangzhou/HZ-1/2020
* Harborview Medical Center
* USA/WA3-UW1/2020
* USA/WA9-UW6/2020
* Hong Kong Department of Health
* HongKong/VB20024950/2020
* HongKong/VB20026565/2020
* HongKong/VM20001061/2020
* HongKong/case42_VM20002493/2020
* HongKong/case48_VM20002507/2020
* HongKong/case52_VM20002582/2020
* HongKong/case78_VM20002849/2020
* HongKong/case85_VM20002868/2020
* HongKong/case90_VM20002907/2020
* canine/HongKong/20-02756/2020
* Hospital Israelita Albert Einstein
* Brazil/SPBR-01/2020
* Brazil/SPBR-02/2020
* Brazil/SPBR-03/2020
* Hospital Sao Joaquim Beneficencia Portuguesa
* Brazil/SPBR-04/2020
* Brazil/SPBR-05/2020
* Brazil/SPBR-06/2020
* IL Department of Public Health Chicago Laboratory
* USA/IL1/2020
* USA/IL2/2020
* INMI Lazzaro Spallanzani IRCCS
* Italy/INMI1-cs/2020
* Italy/INMI1-isl/2020
* Indian Council of Medical Research - National Institute of Virology
* India/1-27/2020
* Indian Council of Medical Research-National Institute of Virology
* India/1-31/2020
* Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College
* Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019
* Wuhan/IPBCAMS-WH-02/2019
* Wuhan/IPBCAMS-WH-03/2019
* Wuhan/IPBCAMS-WH-04/2019
* Wuhan/IPBCAMS-WH-05/2020
* Institute of Viral Disease Control and Prevention, China CDC
* Wuhan/IVDC-HB-envF13-20/2020
* Wuhan/IVDC-HB-envF13-21/2020
* Wuhan/IVDC-HB-envF13/2020
* Wuhan/IVDC-HB-envF54/2020
* Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias
* Mexico/CDMX/InDRE_01/2020
* Jingzhou Center for Disease Control and Prevention
* Jingzhou/HBCDC-HB-01/2020
* KU Leuven, Clinical and Epidemiological Virology
* Belgium/GHB-03021/2020
* Klinik Hirslanden Zurich
* Switzerland/1000477757/2020
* Korea Centers for Disease Control & Prevention (KCDC) Center for Laboratory Control of Infectious Diseases Division of Viral Diseases
* SouthKorea/KCDC03/2020
* Laboratoire National de Sante
* Luxembourg/Lux1/2020
* Laboratoire de Virologie, HUG
* Switzerland/AG0361/2020
* Switzerland/BL0902/2020
* Switzerland/GE3121/2020
* Switzerland/GE3895/2020
* Switzerland/GE5373/2020
* Switzerland/GE9586/2020
* Switzerland/TI9486/2020
* Switzerland/VD5615/2020
* Laboratorio di Microbiologia e Virologia, Universita Vita-Salute San Raffaele, Milano
* Italy/UniSR1/2020
* Laboratory Medicine
* Taiwan/CGMH-CGU-01/2020
* Lapland Central Hospital
* Finland/1/2020
* MHC Brabant Zuidoost
* Netherlands/Eindhoven_1363782/2020
* MHC Drente
* Netherlands/Dalen_1363624/2020
* MHC Flevoland
* Netherlands/Zeewolde_1365080/2020
* MHC Gooi & Vechtstreek
* Netherlands/Blaricum_1364780/2020
* Netherlands/Naarden_1364774/2020
* MHC Haaglanden
* Netherlands/Nootdorp_1364222/2020
* MHC Hart voor Brabant
* Netherlands/Oisterwijk_1364072/2020
* MHC Kennemerland
* Netherlands/Haarlem_1363688/2020
* MHC Rotterdam-Rijnmond
* Netherlands/Rotterdam_1364040/2020
* MHC Utrecht
* Netherlands/Utrecht_1363564/2020
* Netherlands/Utrecht_1363628/2020
* Netherlands/Utrecht_1364066/2020
* MHC West-Brabant
* Netherlands/Andel_1365066/2020
* Netherlands/Helmond_1363548/2020
* MSHS Clinical Microbiology Laboratories
* USA/NY1-PV08001/2020
* Massachusetts Department of Public Health
* USA/MA1/2020
* Monash Medical Centre
* Australia/VIC01/2020
* NHC Key laboratory of Enteric Pathogenic Microbiology, Institute of Pathogenic Microbiology
* Jiangsu/JS01/2020
* Jiangsu/JS02/2020
* Jiangsu/JS03/2020
* National Centre for Infectious Diseases
* Singapore/12/2020
* Singapore/13/2020
* Singapore/14/2020
* Singapore/3/2020
* Singapore/4/2020
* National Influenza Center - National Institute of Hygiene and Epidemiology (NIHE)
* Vietnam/VR03-38142/2020
* National Influenza Centre, National Public Health Laboratory, Kathmandu, Nepal
* Nepal/61/2020
* National Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC
* Beijing/IVDC-BJ-005/2020
* Chongqing/IVDC-CQ-001/2020
* Henan/IVDC-HeN-002/2020
* Jiangsu/IVDC-JS-001/2020
* Jiangxi/IVDC-JX-002/2020
* Shandong/IVDC-SD-001/2020
* Shanghai/IVDC-SH-001/2020
* Sichuan/IVDC-SC-001/2020
* Wuhan/IVDC-HB-01/2019
* Wuhan/IVDC-HB-04/2020
* Wuhan/IVDC-HB-05/2019
* Yunnan/IVDC-YN-003/2020
* National Public Health Laboratory
* Singapore/11/2020
* National Public Health Laboratory, National Centre for Infectious Diseases
* Singapore/10/2020
* Singapore/7/2020
* Singapore/8/2020
* Singapore/9/2020
* Pathology Queensland
* Australia/QLD01/2020
* Australia/QLD02/2020
* Australia/QLD03/2020
* Australia/QLD04/2020
* Australia/QLD09/2020
* Providence Regional Medical Center
* USA/WA1/2020
* Public Health Ontario Laboratory
* Canada/ON-PHL2445/2020
* Canada/ON-VIDO-01/2020
* RIVM
* Netherlands/Delft_1363424/2020
* Netherlands/Diemen_1363454/2020
* Netherlands/Loon_op_zand_1363512/2020
* Netherlands/Oss_1363500/2020
* NetherlandsL/Houten_1363498/2020
* Respiratory Virus Unit, Microbiology Services Colindale, Public Health England
* England/01/2020
* England/02/2020
* England/09c/2020
* England/200641094/2020
* England/200690245/2020
* England/200690300/2020
* England/200690306/2020
* England/200690756/2020
* England/200940527/2020
* England/200960041/2020
* England/200960515/2020
* England/200981386/2020
* England/200990002/2020
* England/200990006/2020
* England/200990660/2020
* England/200990723/2020
* England/200990724/2020
* England/200990725/2020
* England/200991076/2020
* England/201000003/2020
* England/201040081/2020
* England/201040141/2020
* Seattle Flu Study
* USA/WA-S2/2020
* USA/WA-S3/2020
* Second Hospital of Anhui Medical University
* Hefei/2/2020
* Serology, Virology and OTDS Laboratories (SAViD), NSW Health Pathology Randwick
* Sydney/3/2020
* Servicio Microbiologia. Hospital Clinico Universitario. Valencia.
* Spain/Valencia1/2020
* Spain/Valencia2/2020
* Shenzhen Key Laboratory of Pathogen and Immunity, National Clinical Research Center for Infectious Disease, Shenzhen Third People's Hospital
* Shenzhen/SZTH-002/2020
* Shenzhen/SZTH-003/2020
* Shenzhen/SZTH-004/2020
* Shenzhen Third People's Hospital
* Shenzhen/SZTH-001/2020
* Singapore General Hospital
* Singapore/1/2020
* Singapore/2/2020
* Singapore General Hospital, Molecular Laboratory, Division of Pathology
* Singapore/5/2020
* Singapore/6/2020
* Sorbonne Universite, Inserm et Assistance Publique-Hopitaux de Paris (Pitie Salpetriere)
* France/IDF0626/2020
* South China Agricultural University
* pangolin/Guandong/1/2019
* State Health Office Baden-Wuerttemberg
* Germany/Baden-Wuerttemberg-1/2020
* Taiwan Centers for Disease Control
* Taiwan/3/2020
* Taiwan/4/2020
* Texas Department of State Health Services
* USA/TX1/2020
* The Central Hospital Of Wuhan
* Wuhan/HBCDC-HB-02/2020
* The National Institute of Public Health Center for Epidemiology and Microbiology
* CzechRepublic/951/2020
* The University of Hong Kong - Shenzhen Hospital
* Shenzhen/HKU-SZ-002/2020
* Shenzhen/HKU-SZ-005/2020
* Tianmen Center for Disease Control and Prevention
* Tianmen/HBCDC-HB-07/2020
* UCD National Virus Reference Laboratory
* Ireland/COR-20134/2020
* UW Virology Lab
* USA/WA-UW15/2020
* USA/WA-UW16/2020
* USA/WA-UW17/2020
* USA/WA-UW18/2020
* USA/WA-UW19/2020
* USA/WA-UW20/2020
* USA/WA-UW21/2020
* USA/WA11-UW7/2020
* USA/WA12-UW8/2020
* USA/WA13-UW9/2020
* USA/WA14-UW10/2020
* USA/WA15-UW11/2020
* USA/WA16-UW12/2020
* USA/WA17-UW13/2020
* USA/WA18-UW14/2020
* Union Hospital of Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology
* Wuhan/HBCDC-HB-03/2020
* Wuhan/HBCDC-HB-04/2020
* Unknown
* Netherlands/Coevorden_1363618/2020
* Valley Medical Center
* USA/WA8-UW5/2020
* Virology Department, Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust
* England/Sheff01/2020
* England/Sheff02/2020
* Virology Unit, Institut Pasteur du Cambodge.
* Cambodia/0012/2020
* WA State Department of Health
* USA/WA1-A12/2020
* Wales Specialist Virology Centre
* Wales/PHW03/2020
* Wales/PHW05/2020
* Wales/PHW1/2020
* Wales/PHW2/2020
* Washington State Department of Health
* USA/WA1-F6/2020
* USA/WA2/2020
* Washington State Public Health Lab
* USA/WA4-UW2/2020
* USA/WA6-UW3/2020
* USA/WA7-UW4/2020
* Weifang Center for Disease Control and Prevention
* China/WF0001/2020
* China/WF0002/2020
* China/WF0003/2020
* China/WF0004/2020
* China/WF0006/2020
* China/WF0009/2020
* China/WF0012/2020
* China/WF0014/2020
* China/WF0015/2020
* China/WF0016/2020
* China/WF0017/2020
* China/WF0018/2020
* China/WF0019/2020
* China/WF0020/2020
* China/WF0021/2020
* China/WF0023/2020
* China/WF0024/2020
* China/WF0026/2020
* China/WF0028/2020
* China/WF0029/2020
* West of Scotland Specialist Virology Centre, NHSGGC
* Scotland/CVR01/2020
* Scotland/CVR02/2020
* Scotland/CVR03/2020
* Scotland/CVR04/2020
* Scotland/CVR05/2020
* Wisconsin Department of Health Services
* USA/WI1/2020
* Wuhan Fourth Hospital
* Wuhan/WH05/2020
* Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences
* bat/Yunnan/RaTG13/2013
* Wuhan Jinyintan Hospital
* Wuhan/HBCDC-HB-01/2019
* Wuhan/HBCDC-HB-02/2019
* Wuhan/HBCDC-HB-03/2019
* Wuhan/HBCDC-HB-04/2019
* Wuhan/WIV02/2019
* Wuhan/WIV04/2019
* Wuhan/WIV05/2019
* Wuhan/WIV06/2019
* Wuhan/WIV07/2019
* Wuhan Lung Hospital
* Wuhan/HBCDC-HB-06/2020
* Yongchuan District Center for Disease Control and Prevention
* Chongqing/YC01/2020
* Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention
* Zhejiang/WZ-01/2020
* Zhejiang/WZ-02/2020
* Zhongxian Center for Disease Control and Prevention
* Chongqing/ZX01/2020