From bfad279120fee787fa73f3447dd15772f85491f1 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: rdmorin Date: Wed, 24 Apr 2024 15:40:17 -0700 Subject: [PATCH 1/2] add aSHM --- .../dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv | 564 ++++++++++-------- 1 file changed, 299 insertions(+), 265 deletions(-) diff --git a/resources/curated/dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv b/resources/curated/dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv index fb3a174b..7b223af7 100644 --- a/resources/curated/dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv +++ b/resources/curated/dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv @@ -1,265 +1,299 @@ -ensembl_gene_id Gene Chapuy Reddy LymphGen Hubschmann curated other_support Lacy aSHM earliest_support common_alias noncoding_driver_suspect GAMBL dlbcl_chapuy dlbcl_reddy dlbcl_schmitz -ENSG00000075624 ACTB TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE TRUE 22343534 NA NA 9.177820267686425 12.4 6.3 9.8 -NA ADAMTS1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.9120458891013383 NA NA NA -ENSG00000132466 ANKRD17 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.676864244741874 2.1 3.8 4.3 -NA ANKRD12 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 2.294455066921606 NA NA NA -NA ACTG1 FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE Arthur FALSE TRUE 33953289 NA NA 5.353728489483748 NA NA NA -ENSG00000117713 ARID1A FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 8.795411089866157 4.3 4.4 8.9 -ENSG00000049618 ARID1B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 5.162523900573614 2.1 3.3 6 -ENSG00000150347 ARID5B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 3.2504780114722753 2.6 4.3 4.3 -ENSG00000149311 ATM FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 6.8833652007648185 4.7 5.9 5.5 -ENSG00000175054 ATR FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.676864244741874 3.8 2.8 4.9 -ENSG00000166710 B2M TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 15.105162523900574 12 12.1 15.5 -ENSG00000142867 BCL10 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 6.4 3.1 7.7 -ENSG00000119866 BCL11A TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 4.015296367112811 3.4 1.6 4.5 -ENSG00000171791 BCL2 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 23.709369024856596 15.8 12.9 10.6 -ENSG00000113916 BCL6 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 11.663479923518164 5.1 6.4 9.8 -ENSG00000110987 BCL7A FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 7.648183556405353 6.4 8.4 10.6 -ENSG00000183337 BCOR FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE Unpublished TRUE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 2.6 2.5 7.7 -ENSG00000186716 BCR FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE possibly_aSHM_only FALSE FALSE NA NA NA 4.97131931166348 4.3 3.9 6.4 -ENSG00000115760 BIRC6 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE PMID: 32961552 FALSE FALSE 28985567 NA NA 7.265774378585086 4.7 6.4 10 -ENSG00000157764 BRAF TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 2.294455066921606 5.6 2 3.4 -ENSG00000162670 BRINP3 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 FAM5C NA 2.676864244741874 3 3.3 3.4 -ENSG00000132640 BTBD3 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 0.9 1.8 1.9 -ENSG00000133639 BTG1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 10.133843212237094 14.5 7.5 14.5 -ENSG00000159388 BTG2 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 13.38432122370937 6 9.2 17.2 -ENSG00000010671 BTK FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 6.8833652007648185 2.1 3.1 3.6 -NA CADPS2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 3.632887189292543 NA NA NA -ENSG00000198286 CARD11 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 11.281070745697896 8.1 7.8 15.3 -ENSG00000064012 CASP8 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.676864244741874 1.3 1.2 1.1 -ENSG00000114423 CBLB FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.7208413001912046 1.7 1.6 2.8 -ENSG00000129277 CCL4 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.19120458891013384 1.3 0.6 1.5 -ENSG00000112576 CCND3 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 7.45697896749522 4.7 3.8 9.8 -ENSG00000012124 CD22 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.147227533460803 3 2.8 1.7 -ENSG00000120217 CD274 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 21796119 NA NA 0.9560229445506692 2.6 1.3 2.3 -ENSG00000135218 CD36 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.294455066921606 3 2.8 4.9 -ENSG00000116815 CD58 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 7.839388145315487 6.8 2.8 10 -ENSG00000125726 CD70 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 5.544933078393881 7.7 6.9 9.4 -ENSG00000007312 CD79B TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 9.94263862332696 15.4 8.3 14.9 -ENSG00000112149 CD83 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 4.397705544933078 7.3 5.8 5.7 -ENSG00000134371 CDC73 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 1.3 0.7 0.6 -ENSG00000147889 CDKN2A FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.2504780114722753 1.7 1 6 -ENSG00000153922 CHD1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.1032504780114722 2.1 2.9 3 -ENSG00000100888 CHD8 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.9120458891013383 3 2.9 3.6 -NA CNOT2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.338432122370937 NA NA NA -ENSG00000175040 CHST2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.338432122370937 0.4 0.7 2.3 -ENSG00000179583 CIITA TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 2.8680688336520075 4.3 4.3 6.6 -ENSG00000167186 COQ7 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.3824091778202677 0.4 0.5 0.6 -ENSG00000005339 CREBBP TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 25.81261950286807 16.7 12.1 17.9 -ENSG00000213145 CRIP1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.19120458891013384 3 0.7 1.9 -ENSG00000121966 CXCR4 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 23131835 NA NA 2.8680688336520075 2.6 1.5 2.6 -ENSG00000160683 CXCR5 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 1.9120458891013383 1.7 2.1 4 -ENSG00000071626 DAZAP1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.9120458891013383 0.4 1.6 5.3 -ENSG00000143164 DCAF6 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.147227533460803 1.3 1.3 2.3 -ENSG00000178105 DDX10 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 1.7 0.8 1.5 -ENSG00000215301 DDX3X FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 29641966 NA NA 8.795411089866157 5.6 4.5 4.7 -NA DHX16 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.9120458891013383 NA NA NA -ENSG00000100697 DICER1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.338432122370937 2.6 1.1 2.3 -ENSG00000119772 DNMT3A FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 0.7648183556405354 1.3 1.4 2.1 -NA DNM2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 2.294455066921606 NA NA NA -ENSG00000150760 DOCK1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 3.8240917782026767 6 4.9 10.2 -ENSG00000135144 DTX1 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 10.707456978967496 11.5 5.9 13.6 -ENSG00000158050 DUSP2 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE 28985567 NA NA 10.133843212237094 4.3 9.7 12.6 -ENSG00000164330 EBF1 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 23174882 NA NA 8.98661567877629 12.8 8.8 10.9 -ENSG00000156508 EEF1A1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 33945543 NA NA 4.780114722753346 4.7 2.5 3 -ENSG00000100393 EP300 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 11.854684512428298 8.1 7.1 9.8 -ENSG00000134954 ETS1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE 21796119 NA NA 4.588910133843212 5.6 4.4 7.9 -ENSG00000139083 ETV6 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 4.97131931166348 10.3 5.8 10.4 -ENSG00000106462 EZH2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 20081860 NA NA 13.766730401529637 5.6 8.9 9.1 -ENSG00000026103 FAS TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 9.177820267686425 9 4.7 10.9 -ENSG00000138081 FBXO11 FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE GAMBL TRUE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 2.6 2.1 2.1 -ENSG00000109670 FBXW7 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.1032504780114722 1.7 1.3 3 -ENSG00000054598 FOXC1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 0.9560229445506692 0.9 1.2 4.5 -ENSG00000150907 FOXO1 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 10.133843212237094 2.1 2.4 7.2 -ENSG00000114861 FOXP1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE TRUE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 3 2.1 1.9 -ENSG00000162613 FUBP1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.1032504780114722 0.9 1.5 1.5 -ENSG00000130383 FUT5 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.3824091778202677 1.3 0.3 1.3 -ENSG00000151834 GABRA2 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 1.147227533460803 1.3 1.2 2.6 -NA GAK FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.9120458891013383 NA NA NA -ENSG00000120063 GNA13 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 11.663479923518164 10.3 11.9 8.5 -ENSG00000114353 GNAI2 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 5.353728489483748 3.8 1.9 6.4 -ENSG00000087460 GNAS FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.294455066921606 1.3 1.9 3.2 -ENSG00000066455 GOLGA5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 1.3 1.9 0.9 -ENSG00000179399 GPC5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 1.338432122370937 0.9 2.2 1.9 -ENSG00000177885 GRB2 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 3.2504780114722753 3 1.5 2.8 -ENSG00000137106 GRHPR TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 2.676864244741874 4.7 3.6 4.5 -ENSG00000177602 GSG2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 HASPIN NA 0.9560229445506692 2.1 1.5 4 -ENSG00000184357 HIST1H1B TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 8.413001912045889 9.8 7.3 8.5 -ENSG00000187837 HIST1H1C TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 9.94263862332696 12.4 9.4 9.8 -ENSG00000124575 HIST1H1D TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 6.118546845124283 7.7 6.1 5.7 -ENSG00000168298 HIST1H1E TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 18.54684512428298 11.5 14.5 17.9 -ENSG00000180573 HIST1H2AC TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5.162523900573614 6.4 3.4 6.2 -ENSG00000233224 HIST1H2AM TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5.927342256214149 6 4.8 5.7 -ENSG00000180596 HIST1H2BC TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 28985567 NA NA 4.588910133843212 5.6 4.3 5.5 -ENSG00000197903 HIST1H2BK TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 4.588910133843212 5.6 4.2 4.9 -ENSG00000124693 HIST1H3B TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 2.1032504780114722 2.1 2 1.7 -ENSG00000184678 HIST2H2BE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 2.48565965583174 3 2.6 3.2 -ENSG00000206503 HLA-A TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 7.45697896749522 9 0.2 11.1 -ENSG00000234745 HLA-B TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 9.177820267686425 10.7 1.2 16.4 -ENSG00000204525 HLA-C TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.632887189292543 4.7 NA 5.5 -ENSG00000204257 HLA-DMA TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 0.3824091778202677 1.7 NA 1.3 -ENSG00000242574 HLA-DMB FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 1.7 NA 5.1 -NA HLA-DQA1 FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 0.3824091778202677 NA NA NA -ENSG00000275410 HNF1B FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.19120458891013384 0.9 0.3 2.6 -ENSG00000138668 HNRNPD FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.1032504780114722 0.9 1.8 2.1 -ENSG00000169045 HNRNPH1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA TRUE 2.1032504780114722 3.4 1.4 3.2 -ENSG00000153187 HNRNPU FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.48565965583174 3.4 2.4 3.4 -ENSG00000174775 HRAS FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA NA 0.4 0.7 0.2 -ENSG00000122986 HVCN1 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.0592734225621414 3.4 2.3 1.9 -ENSG00000117318 ID3 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 1.5296367112810707 0.9 3.5 4.7 -ENSG00000254709 IGLL5 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE TRUE NA NA NA 41.491395793499045 9 16.1 36 -ENSG00000104365 IKBKB FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 3.4 1.1 3 -NA IKBKE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 0.7648183556405354 NA NA NA -ENSG00000161405 IKZF3 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 28479318 NA NA 4.780114722753346 4.3 3.9 4.5 -ENSG00000172349 IL16 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.294455066921606 5.1 2.8 3.8 -ENSG00000077238 IL4R FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE TRUE 33684939 NA NA 2.676864244741874 3.8 2.5 2.1 -ENSG00000136244 IL6 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.3824091778202677 1.7 1.2 2.8 -ENSG00000128908 INO80 FALSE TRUE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.8240917782026767 3.4 2.5 4.3 -NA IRF1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 2.294455066921606 NA NA NA -ENSG00000137265 IRF4 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 4.397705544933078 2.1 4.4 7 -ENSG00000140968 IRF8 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 8.030592734225621 10.3 7.6 10.4 -ENSG00000143772 ITPKB FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 6.692160611854685 9.4 6.7 6.8 -ENSG00000162434 JAK1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 2.48565965583174 2.1 2.2 1.9 -ENSG00000105639 JAK3 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 1.338432122370937 NA 1 1.3 -ENSG00000171223 JUNB FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 3.2504780114722753 2.1 3.5 3.2 -ENSG00000176407 KCMF1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9560229445506692 2.1 1 1.5 -ENSG00000127528 KLF2 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 8.604206500956023 3 2.1 7 -ENSG00000197705 KLHL14 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 4.588910133843212 7.3 4.6 6.6 -ENSG00000162413 KLHL21 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 3.8240917782026767 0.9 2.5 4.7 -ENSG00000172578 KLHL6 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 5.353728489483748 9 6.4 9.1 -ENSG00000055609 KMT2C FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 MLL3 NA 3.2504780114722753 6.4 7.3 8.3 -ENSG00000167548 KMT2D TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 MLL2 NA 33.460803059273424 26.1 22.3 34.5 -ENSG00000133703 KRAS TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 1.9120458891013383 2.6 1.7 3.6 -ENSG00000130702 LAMA5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 3.4416826003824093 5.6 4.7 12.1 -NA LRP12 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 2.48565965583174 NA NA NA -ENSG00000196233 LCOR FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 6.309751434034417 0.4 0.5 3.4 -ENSG00000189308 LIN54 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 0.9 0.9 2.1 -ENSG00000227507 LTB TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 9.369024856596559 9.8 NA 8.5 -ENSG00000254087 LYN TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.294455066921606 5.6 1.3 1.7 -ENSG00000102158 MAGT1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.5296367112810707 1.7 1.9 3 -ENSG00000169032 MAP2K1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 1.338432122370937 2.1 2.2 3.2 -ENSG00000071054 MAP4K4 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.147227533460803 1.3 2.1 2.1 -ENSG00000116141 MARK1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 0.4 1.3 1.9 -ENSG00000143384 MCL1 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.48565965583174 3.4 4.7 3.6 -ENSG00000085276 MECOM FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.1032504780114722 3.4 2.1 4 -ENSG00000213999 MEF2B TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 11.281070745697896 5.6 5.9 9.1 -ENSG00000081189 MEF2C TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 3.4416826003824093 3 1.7 1.9 -ENSG00000105976 MET FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.7648183556405354 2.6 1.7 3.8 -ENSG00000174197 MGA FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 4.015296367112811 3.4 4.7 7.2 -ENSG00000197629 MPEG1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.780114722753346 10.7 5.8 9.1 -ENSG00000156738 MS4A1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 32589730 FALSE TRUE NA NA NA 1.5296367112810707 0.4 1.3 1.5 -ENSG00000095002 MSH2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.7208413001912046 0.4 1.5 0.9 -ENSG00000116062 MSH6 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.9120458891013383 2.6 2.6 2.6 -ENSG00000198793 MTOR FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 4.015296367112811 2.1 2.4 4 -ENSG00000118513 MYB FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 0.9 1.1 2.1 -ENSG00000086967 MYBPC2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.5736137667304015 1.7 2.8 3.4 -ENSG00000136997 MYC FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 10.898661567877628 6.4 6.2 5.3 -ENSG00000172936 MYD88 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 21179087 NA NA 13.38432122370937 21.4 15.2 26.4 -ENSG00000036448 MYOM2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.2504780114722753 4.3 3.2 8.1 -ENSG00000111704 NANOG TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 0.4 0.4 0.2 -ENSG00000134369 NAV1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 2.48565965583174 1.3 2 2.8 -ENSG00000141027 NCOR1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.1032504780114722 2.1 2.7 4.5 -ENSG00000196498 NCOR2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.1032504780114722 4.3 3.6 5.7 -ENSG00000196712 NF1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 2.8680688336520075 2.1 2.5 4 -ENSG00000109320 NFKB1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.1032504780114722 3.4 1.6 1.3 -ENSG00000077150 NFKB2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.5296367112810707 2.6 1.4 1.5 -ENSG00000100906 NFKBIA TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.397705544933078 4.7 3.6 3.8 -ENSG00000146232 NFKBIE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 26647218 NA NA 3.8240917782026767 3.4 2.9 5.7 -ENSG00000144802 NFKBIZ FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 30275490 FALSE TRUE NA NA TRUE 1.5296367112810707 0.9 1.5 1.3 -ENSG00000140853 NLRC5 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.0592734225621414 3 3.7 8.3 -ENSG00000179709 NLRP8 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.3824091778202677 3.4 2.1 3.4 -ENSG00000162408 NOL9 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.97131931166348 2.1 1.3 6.8 -ENSG00000148400 NOTCH1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 3.4416826003824093 3 3.4 8.9 -ENSG00000134250 NOTCH2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 5.736137667304015 7.3 3.7 11.3 -NA N2RF2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA NA NA NA NA -ENSG00000144645 OSBPL10 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 8.795411089866157 2.6 2.3 14.3 -ENSG00000182162 P2RY8 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 22343534 TRUE FALSE 22343534 NA NA 6.8833652007648185 6 NA 7.2 -ENSG00000115421 PAPOLG FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.3824091778202677 1.3 1.2 0.9 -ENSG00000196092 PAX5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE TRUE 11460166 NA NA 3.632887189292543 3.4 1.9 3.2 -ENSG00000169564 PCBP1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.338432122370937 1.7 2.4 2.3 -ENSG00000186472 PCLO FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE PMID: 22343534 FALSE FALSE 22343534 NA NA 16.44359464627151 23.1 15.1 21.3 -ENSG00000178104 PDE4DIP TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 8.5 5.3 2.3 -ENSG00000156531 PHF6 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.48565965583174 0.9 1.4 1.5 -ENSG00000171608 PIK3CD FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 2.1 2.5 4.9 -ENSG00000145675 PIK3R1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 1.9120458891013383 4.7 2 2.1 -ENSG00000137193 PIM1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 11460166 NA NA 20.26768642447419 23.9 19.1 27.7 -ENSG00000102096 PIM2 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 3.4416826003824093 3.8 4 6.4 -ENSG00000110777 POU2AF1 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5.162523900573614 5.6 3.3 2.3 -ENSG00000028277 POU2F2 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 5.927342256214149 6.4 3.4 6.4 -NA PNPO FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 0.3824091778202677 NA NA NA -ENSG00000108819 PPP1R9B FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 0.3824091778202677 1.7 0.7 3.4 -ENSG00000057657 PRDM1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 6.8833652007648185 8.5 5.4 10.2 -ENSG00000166501 PRKCB TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.97131931166348 3.4 1.6 5.1 -ENSG00000253729 PRKDC FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.676864244741874 6.4 6.6 7.7 -ENSG00000147224 PRPS1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.7648183556405354 0.9 0.2 0.6 -ENSG00000171862 PTEN TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 4.7 3.1 4.3 -ENSG00000111679 PTPN6 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 2.676864244741874 5.1 2.9 4.5 -ENSG00000153707 PTPRD FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 5.544933078393881 5.6 5.2 7.7 -ENSG00000273993 PTPRK FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 4.2065009560229445 6.4 3.3 3.6 -NA RAC2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.147227533460803 NA NA NA -ENSG00000172613 RAD9A TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.19120458891013384 1.7 0.5 0.4 -ENSG00000131759 RARA FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.338432122370937 0.4 0.7 4 -ENSG00000139687 RB1 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.780114722753346 3.8 1.6 3.2 -ENSG00000181827 RFX7 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 4.015296367112811 4.7 3.4 1.9 -ENSG00000133111 RFXAP FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 1.338432122370937 NA 0.6 1.3 -ENSG00000067560 RHOA TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 11460166 NA NA 3.0592734225621414 5.1 3.3 3.6 -ENSG00000116954 RRAGC FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 26691987 NA NA 1.7208413001912046 0.4 2 3 -ENSG00000159216 RUNX1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9560229445506692 0.4 0.5 0.9 -ENSG00000267534 S1PR2 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 4.780114722753346 2.6 2.2 2.1 -ENSG00000139718 SETD1B FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 5.162523900573614 NA 5.8 12.8 -ENSG00000181555 SETD2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.632887189292543 0.4 4.6 6.4 -ENSG00000168137 SETD5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.48565965583174 2.1 3.2 5.3 -ENSG00000115524 SF3B1 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.8680688336520075 3 2 2.1 -ENSG00000118515 SGK1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 11.089866156787762 12.8 11.2 10.6 -ENSG00000169375 SIN3A TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.0592734225621414 3.8 3 2.8 -NA SIAH2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.7208413001912046 NA NA NA -NA SLC34A2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 0.7648183556405354 NA NA NA -ENSG00000127616 SMARCA4 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 3.2504780114722753 2.1 3.3 3 -ENSG00000100796 SMEK1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 3 0.9 NA -ENSG00000185338 SOCS1 FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 15.296367112810707 4.7 10.4 12.8 -ENSG00000065526 SPEN TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.780114722753346 9.8 7.4 10 -ENSG00000168610 STAT3 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 24837465 NA NA 7.074569789674952 7.3 3.6 9.4 -ENSG00000173757 STAT5B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 0.5736137667304015 0.4 1.6 0.4 -ENSG00000166888 STAT6 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 5.736137667304015 4.7 3.8 2.6 -ENSG00000165025 SYK FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.5296367112810707 0.4 0.8 2.3 -ENSG00000147133 TAF1 FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 4.780114722753346 3.8 4 4.9 -ENSG00000168394 TAP1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.5736137667304015 2.6 NA 3.6 -ENSG00000177565 TBL1XR1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 26608593 NA NA 8.604206500956023 8.1 5.7 12.8 -ENSG00000100721 TCL1A FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE TRUE NA NA NA 2.1032504780114722 3 2.8 3.8 -ENSG00000168769 TET2 FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 5.544933078393881 6 7.4 11.7 -ENSG00000163513 TGFBR2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.1032504780114722 1.3 1.9 1.9 -ENSG00000163659 TIPARP FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.19120458891013384 NA 0.9 1.3 -ENSG00000137462 TLR2 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 29713087 NA NA 2.8680688336520075 3 1.5 2.8 -ENSG00000112697 TMEM30A TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 4.780114722753346 5.6 2.8 7.7 -ENSG00000205542 TMSB4X TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE 28327945 NA NA 12.4282982791587 18.4 13.1 18.1 -ENSG00000118503 TNFAIP3 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 19412164 NA NA 6.692160611854685 12.4 8.1 16.6 -ENSG00000157873 TNFRSF14 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 20884631 NA NA 14.340344168260039 12.8 9.7 16.8 -ENSG00000198846 TOX TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.2065009560229445 5.1 4 5.5 -ENSG00000141510 TP53 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 27.533460803059274 21.4 10.9 22.3 -ENSG00000131323 TRAF3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE PMID: 25468570 FALSE FALSE NA NA NA 0.9560229445506692 0.4 0.9 1.5 -NA TRAF6 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.338432122370937 NA NA NA -ENSG00000153827 TRIP12 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.2504780114722753 3 3.2 6 -ENSG00000196367 TRRAP FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.8680688336520075 6 3.5 8.9 -ENSG00000077721 UBE2A TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.2065009560229445 4.7 3.9 7 -ENSG00000104517 UBR5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.632887189292543 5.1 3.2 5.5 -ENSG00000182168 UNC5C FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.4416826003824093 2.6 2.2 5.1 -NA UNC5B FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.5296367112810707 NA NA NA -ENSG00000156687 UNC5D FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.1032504780114722 2.6 1.8 1.9 -ENSG00000187555 USP7 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.338432122370937 3.8 1.1 3.2 -ENSG00000132549 VPS13B FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 4.2065009560229445 4.3 5.7 8.3 -ENSG00000095787 WAC FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.676864244741874 1.3 1.2 3.4 -NA WNK1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 4.588910133843212 NA NA NA -ENSG00000166483 WEE1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.015296367112811 1.7 1.6 2.8 -ENSG00000100219 XBP1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.147227533460803 NA 1.6 1.3 -ENSG00000082898 XPO1 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 26608593 NA NA 3.8240917782026767 1.3 1.4 2.3 -ENSG00000100811 YY1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.147227533460803 3.8 1.1 4.3 -ENSG00000178951 ZBTB7A FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.7208413001912046 1.7 1.3 1.5 -ENSG00000163874 ZC3H12A TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.676864244741874 4.7 3.1 6 -ENSG00000169554 ZEB2 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.8240917782026767 6 3.7 6.8 -ENSG00000066827 ZFAT FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.338432122370937 2.6 2.7 2.8 -ENSG00000185650 ZFP36L1 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 6.692160611854685 8.1 5.6 8.5 -ENSG00000005889 ZFX FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.3824091778202677 0.4 1.4 1.7 -ENSG00000188994 ZNF292 FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 5.353728489483748 6 4.3 6.4 -ENSG00000102935 ZNF423 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 1.9120458891013383 3.4 2.1 3.4 -ENSG00000168916 ZNF608 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 6.118546845124283 7.7 8.1 9.4 -NA ZNF217 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 2.1032504780114722 NA NA NA +Gene Chapuy Reddy LymphGen Hubschmann curated other_support Lacy aSHM earliest_support common_alias noncoding_driver_suspect GAMBL dlbcl_chapuy dlbcl_reddy dlbcl_schmitz +ACTB TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE TRUE 22343534 NA NA 9.177820267686425 12.4 6.3 9.8 +ADAMTS1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.9120458891013383 NA NA NA +ANKRD17 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.676864244741874 2.1 3.8 4.3 +ANKRD12 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 2.294455066921606 NA NA NA +ACTG1 FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE Arthur FALSE TRUE 33953289 NA NA 5.353728489483748 NA NA NA +AICDA FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE Arthur FALSE TRUE 30275490 NA NA +ARID1A FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 8.795411089866157 4.3 4.4 8.9 +ARID1B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 5.162523900573614 2.1 3.3 6 +ARID5B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 3.2504780114722753 2.6 4.3 4.3 +ATM FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 6.8833652007648185 4.7 5.9 5.5 +ATR FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.676864244741874 3.8 2.8 4.9 +B2M TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 15.105162523900574 12 12.1 15.5 +BCL10 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 6.4 3.1 7.7 +BCL11A TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 4.015296367112811 3.4 1.6 4.5 +BCL2 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 23.709369024856596 15.8 12.9 10.6 +BCL6 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 11.663479923518164 5.1 6.4 9.8 +BCL7A FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 7.648183556405353 6.4 8.4 10.6 +BCOR FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE Unpublished TRUE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 2.6 2.5 7.7 +BCR FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE possibly_aSHM_only FALSE FALSE NA NA NA 4.97131931166348 4.3 3.9 6.4 +BIRC6 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE PMID: 32961552 FALSE FALSE 28985567 NA NA 7.265774378585086 4.7 6.4 10 +BRAF TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 2.294455066921606 5.6 2 3.4 +BLK FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA +BRINP3 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 FAM5C NA 2.676864244741874 3 3.3 3.4 +BTBD3 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 0.9 1.8 1.9 +BTG1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 10.133843212237094 14.5 7.5 14.5 +BTG2 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 13.38432122370937 6 9.2 17.2 +BTK FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 6.8833652007648185 2.1 3.1 3.6 +CADPS2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 3.632887189292543 NA NA NA +CARD11 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 11.281070745697896 8.1 7.8 15.3 +CASP8 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.676864244741874 1.3 1.2 1.1 +CBLB FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.7208413001912046 1.7 1.6 2.8 +CCL4 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.19120458891013384 1.3 0.6 1.5 +CCND3 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 7.45697896749522 4.7 3.8 9.8 +CD22 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.147227533460803 3 2.8 1.7 +CD274 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 21796119 NA NA 0.9560229445506692 2.6 1.3 2.3 +CD36 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.294455066921606 3 2.8 4.9 +CD44 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA +CD58 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 7.839388145315487 6.8 2.8 10 +CD70 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 5.544933078393881 7.7 6.9 9.4 +CD74 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +CD79B TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 9.94263862332696 15.4 8.3 14.9 +CD83 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 4.397705544933078 7.3 5.8 5.7 +CDC73 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 1.3 0.7 0.6 +CDKN2A FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.2504780114722753 1.7 1 6 +CHD1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.1032504780114722 2.1 2.9 3 +CHD8 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.9120458891013383 3 2.9 3.6 +CNOT2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.338432122370937 NA NA NA +CHST2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.338432122370937 0.4 0.7 2.3 +CIITA TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 2.8680688336520075 4.3 4.3 6.6 +COQ7 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.3824091778202677 0.4 0.5 0.6 +CREBBP TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 25.81261950286807 16.7 12.1 17.9 +CRIP1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.19120458891013384 3 0.7 1.9 +CXCR4 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 23131835 NA NA 2.8680688336520075 2.6 1.5 2.6 +CXCR5 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 1.9120458891013383 1.7 2.1 4 +DAZAP1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.9120458891013383 0.4 1.6 5.3 +DCAF6 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.147227533460803 1.3 1.3 2.3 +DDX10 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 1.7 0.8 1.5 +DDX3X FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 29641966 NA NA 8.795411089866157 5.6 4.5 4.7 +DHX16 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.9120458891013383 NA NA NA +DICER1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.338432122370937 2.6 1.1 2.3 +DNMT3A FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 0.7648183556405354 1.3 1.4 2.1 +DNM2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 2.294455066921606 NA NA NA +DOCK1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 3.8240917782026767 6 4.9 10.2 +DTX1 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 10.707456978967496 11.5 5.9 13.6 +DUSP2 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE 28985567 NA NA 10.133843212237094 4.3 9.7 12.6 +EBF1 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 23174882 NA NA 8.98661567877629 12.8 8.8 10.9 +EEF1A1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 33945543 NA NA 4.780114722753346 4.7 2.5 3 +EIF2AK3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +EP300 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 11.854684512428298 8.1 7.1 9.8 +ETS1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE 21796119 NA NA 4.588910133843212 5.6 4.4 7.9 +ETV6 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 4.97131931166348 10.3 5.8 10.4 +EZH2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 20081860 NA NA 13.766730401529637 5.6 8.9 9.1 +EZR FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA +FAS TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 9.177820267686425 9 4.7 10.9 +FAM102A FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +FANK1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +FBXO11 FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE GAMBL TRUE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 2.6 2.1 2.1 +FBXW7 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.1032504780114722 1.7 1.3 3 +FCRL3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +FNBP1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +FOXC1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 0.9560229445506692 0.9 1.2 4.5 +FOXO1 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 10.133843212237094 2.1 2.4 7.2 +FOXP1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE TRUE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 3 2.1 1.9 +FUBP1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.1032504780114722 0.9 1.5 1.5 +FUT5 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.3824091778202677 1.3 0.3 1.3 +GABRA2 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 1.147227533460803 1.3 1.2 2.6 +GAK FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.9120458891013383 NA NA NA +GNA13 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 11.663479923518164 10.3 11.9 8.5 +GNAI2 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 5.353728489483748 3.8 1.9 6.4 +GNAS FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.294455066921606 1.3 1.9 3.2 +GOLGA5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 1.3 1.9 0.9 +GPC5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 1.338432122370937 0.9 2.2 1.9 +GRB2 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 3.2504780114722753 3 1.5 2.8 +GRHPR TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 2.676864244741874 4.7 3.6 4.5 +GSG2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 HASPIN NA 0.9560229445506692 2.1 1.5 4 +HIST1H1B TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 8.413001912045889 9.8 7.3 8.5 +HIST1H1C TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 9.94263862332696 12.4 9.4 9.8 +HIST1H1D TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 6.118546845124283 7.7 6.1 5.7 +HIST1H1E TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 18.54684512428298 11.5 14.5 17.9 +HIST1H2AC TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5.162523900573614 6.4 3.4 6.2 +HIST1H2AM TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5.927342256214149 6 4.8 5.7 +HIST1H2BC TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 28985567 NA NA 4.588910133843212 5.6 4.3 5.5 +HIST1H2BK TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 4.588910133843212 5.6 4.2 4.9 +HIST1H3B TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 2.1032504780114722 2.1 2 1.7 +HIST2H2BE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 2.48565965583174 3 2.6 3.2 +HLA-A TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 7.45697896749522 9 0.2 11.1 +HLA-B TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 9.177820267686425 10.7 1.2 16.4 +HLA-C TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.632887189292543 4.7 NA 5.5 +HLA-DMA TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 0.3824091778202677 1.7 NA 1.3 +HLA-DMB FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 1.7 NA 5.1 +HLA-DQA1 FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 0.3824091778202677 NA NA NA +HNF1B FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.19120458891013384 0.9 0.3 2.6 +HNRNPD FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.1032504780114722 0.9 1.8 2.1 +HNRNPH1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA TRUE 2.1032504780114722 3.4 1.4 3.2 +HNRNPU FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.48565965583174 3.4 2.4 3.4 +HRAS FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA NA 0.4 0.7 0.2 +HVCN1 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.0592734225621414 3.4 2.3 1.9 +ID3 FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 1.5296367112810707 0.9 3.5 4.7 +IGLL5 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE TRUE NA NA NA 41.491395793499045 9 16.1 36 +IKBKB FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 3.4 1.1 3 +IKBKE FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 0.7648183556405354 NA NA NA +IKZF3 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 28479318 NA NA 4.780114722753346 4.3 3.9 4.5 +IL16 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.294455066921606 5.1 2.8 3.8 +IL4R FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE TRUE 33684939 NA NA 2.676864244741874 3.8 2.5 2.1 +IL6 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.3824091778202677 1.7 1.2 2.8 +INO80 FALSE TRUE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.8240917782026767 3.4 2.5 4.3 +IRF1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE TRUE 33953289 NA NA 2.294455066921606 NA NA NA +IRF4 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 4.397705544933078 2.1 4.4 7 +IRF8 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 8.030592734225621 10.3 7.6 10.4 +ITPKB FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 6.692160611854685 9.4 6.7 6.8 +JAK1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 2.48565965583174 2.1 2.2 1.9 +JAK3 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 1.338432122370937 NA 1 1.3 +JUNB FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 3.2504780114722753 2.1 3.5 3.2 +KCMF1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9560229445506692 2.1 1 1.5 +KLF2 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 8.604206500956023 3 2.1 7 +KLHL14 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 4.588910133843212 7.3 4.6 6.6 +KLHL21 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 3.8240917782026767 0.9 2.5 4.7 +KLHL6 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 5.353728489483748 9 6.4 9.1 +KMT2C FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 MLL3 NA 3.2504780114722753 6.4 7.3 8.3 +KMT2D TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 MLL2 NA 33.460803059273424 26.1 22.3 34.5 +KRAS TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 1.9120458891013383 2.6 1.7 3.6 +LAMA5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 3.4416826003824093 5.6 4.7 12.1 +LAPTM5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +LRP12 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 2.48565965583174 NA NA NA +LCOR FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 6.309751434034417 0.4 0.5 3.4 +LIN54 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 0.9 0.9 2.1 +LTB TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 9.369024856596559 9.8 NA 8.5 +LPP FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +IRAG2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +MALAT1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +NEAT1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +LYN TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.294455066921606 5.6 1.3 1.7 +MAGT1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.5296367112810707 1.7 1.9 3 +MAP2K1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 1.338432122370937 2.1 2.2 3.2 +MAP4K4 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.147227533460803 1.3 2.1 2.1 +MARK1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 0.4 1.3 1.9 +MCL1 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.48565965583174 3.4 4.7 3.6 +MECOM FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.1032504780114722 3.4 2.1 4 +MEF2B TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 11.281070745697896 5.6 5.9 9.1 +MEF2C TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 3.4416826003824093 3 1.7 1.9 +MET FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.7648183556405354 2.6 1.7 3.8 +MIR155HG FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +MGA FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 4.015296367112811 3.4 4.7 7.2 +MPEG1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.780114722753346 10.7 5.8 9.1 +MS4A1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 32589730 FALSE TRUE NA NA NA 1.5296367112810707 0.4 1.3 1.5 +MSH2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.7208413001912046 0.4 1.5 0.9 +MSH6 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.9120458891013383 2.6 2.6 2.6 +MTOR FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 4.015296367112811 2.1 2.4 4 +MYB FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 0.9 1.1 2.1 +MYBPC2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.5736137667304015 1.7 2.8 3.4 +MYC FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 10.898661567877628 6.4 6.2 5.3 +MYD88 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 21179087 NA NA 13.38432122370937 21.4 15.2 26.4 +MYOM2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.2504780114722753 4.3 3.2 8.1 +MYO1E FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +NANOG TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 0.4 0.4 0.2 +NAV1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 2.48565965583174 1.3 2 2.8 +NCOA3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +NCOR1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.1032504780114722 2.1 2.7 4.5 +NCOR2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.1032504780114722 4.3 3.6 5.7 +NF1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 2.8680688336520075 2.1 2.5 4 +NFKB1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.1032504780114722 3.4 1.6 1.3 +NFKB2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.5296367112810707 2.6 1.4 1.5 +NFKBIA TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.397705544933078 4.7 3.6 3.8 +NFKBIE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 26647218 NA NA 3.8240917782026767 3.4 2.9 5.7 +NFKBIZ FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 30275490 FALSE TRUE NA NA TRUE 1.5296367112810707 0.9 1.5 1.3 +NLRC5 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.0592734225621414 3 3.7 8.3 +NLRP8 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.3824091778202677 3.4 2.1 3.4 +NOL9 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.97131931166348 2.1 1.3 6.8 +NOTCH1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 3.4416826003824093 3 3.4 8.9 +NOTCH2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 5.736137667304015 7.3 3.7 11.3 +N2RF2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA NA NA NA NA +OSBPL10 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 8.795411089866157 2.6 2.3 14.3 +P2RX5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +P2RY8 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 22343534 TRUE FALSE 22343534 NA NA 6.8833652007648185 6 NA 7.2 +PAPOLG FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.3824091778202677 1.3 1.2 0.9 +PAX5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE TRUE 11460166 NA NA 3.632887189292543 3.4 1.9 3.2 +PCBP1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.338432122370937 1.7 2.4 2.3 +PCLO FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE PMID: 22343534 FALSE FALSE 22343534 NA NA 16.44359464627151 23.1 15.1 21.3 +PDE4DIP TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 8.5 5.3 2.3 +PHF6 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.48565965583174 0.9 1.4 1.5 +PIK3CD FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 2.1 2.5 4.9 +PIK3R1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 1.9120458891013383 4.7 2 2.1 +PIM1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 11460166 NA NA 20.26768642447419 23.9 19.1 27.7 +PIM2 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 3.4416826003824093 3.8 4 6.4 +POU2AF1 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 5.162523900573614 5.6 3.3 2.3 +POU2F2 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 5.927342256214149 6.4 3.4 6.4 +PNPO FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 0.3824091778202677 NA NA NA +PPP1R9B FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 0.3824091778202677 1.7 0.7 3.4 +PRDM1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 6.8833652007648185 8.5 5.4 10.2 +PRKCB TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.97131931166348 3.4 1.6 5.1 +PRKDC FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.676864244741874 6.4 6.6 7.7 +PRPS1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.7648183556405354 0.9 0.2 0.6 +PTEN TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 4.7 3.1 4.3 +PTMA FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +PTPN6 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 2.676864244741874 5.1 2.9 4.5 +PTPRD FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 5.544933078393881 5.6 5.2 7.7 +PTPRK FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 4.2065009560229445 6.4 3.3 3.6 +PTPN1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +RAC2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.147227533460803 NA NA NA +RAD9A TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.19120458891013384 1.7 0.5 0.4 +RARA FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.338432122370937 0.4 0.7 4 +RB1 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.780114722753346 3.8 1.6 3.2 +RCC FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +RFX7 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 4.015296367112811 4.7 3.4 1.9 +RFXAP FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 1.338432122370937 NA 0.6 1.3 +RFTN1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +RHEX FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +RHOA TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 11460166 NA NA 3.0592734225621414 5.1 3.3 3.6 +RHOH FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +RRAGC FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 26691987 NA NA 1.7208413001912046 0.4 2 3 +RUNX1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9560229445506692 0.4 0.5 0.9 +RUBCNL FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +S1PR2 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 4.780114722753346 2.6 2.2 2.1 +SEL1L3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +SEPTIN9 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +SERPINA9 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +SETD1B FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 5.162523900573614 NA 5.8 12.8 +SETD2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.632887189292543 0.4 4.6 6.4 +SETD5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.48565965583174 2.1 3.2 5.3 +SF3B1 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.8680688336520075 3 2 2.1 +SGK1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 11.089866156787762 12.8 11.2 10.6 +SIN3A TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.0592734225621414 3.8 3 2.8 +SIAH2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.7208413001912046 NA NA NA +SLC34A2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 0.7648183556405354 NA NA NA +SMARCA4 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 3.2504780114722753 2.1 3.3 3 +SMEK1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 3 0.9 NA +SOCS1 FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 15.296367112810707 4.7 10.4 12.8 +SPEN TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.780114722753346 9.8 7.4 10 +ST6GAL1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +STAT3 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 24837465 NA NA 7.074569789674952 7.3 3.6 9.4 +STAT5B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 0.5736137667304015 0.4 1.6 0.4 +STAT6 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 5.736137667304015 4.7 3.8 2.6 +SYK FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.5296367112810707 0.4 0.8 2.3 +TAF1 FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 4.780114722753346 3.8 4 4.9 +TAP1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.5736137667304015 2.6 NA 3.6 +TBC1D4 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +TBL1XR1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 26608593 NA NA 8.604206500956023 8.1 5.7 12.8 +TCL1A FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE TRUE NA NA NA 2.1032504780114722 3 2.8 3.8 +TET2 FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 5.544933078393881 6 7.4 11.7 +TGFBR2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.1032504780114722 1.3 1.9 1.9 +TIPARP FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.19120458891013384 NA 0.9 1.3 +TLR2 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 29713087 NA NA 2.8680688336520075 3 1.5 2.8 +TMEM30A TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 4.780114722753346 5.6 2.8 7.7 +TMSB4X TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE 28327945 NA NA 12.4282982791587 18.4 13.1 18.1 +TNFAIP3 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 19412164 NA NA 6.692160611854685 12.4 8.1 16.6 +TNFRSF14 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 20884631 NA NA 14.340344168260039 12.8 9.7 16.8 +TOX TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.2065009560229445 5.1 4 5.5 +TP53 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 27.533460803059274 21.4 10.9 22.3 +TRAF3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE PMID: 25468570 FALSE FALSE NA NA NA 0.9560229445506692 0.4 0.9 1.5 +TRAF6 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.338432122370937 NA NA NA +TRIP12 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.2504780114722753 3 3.2 6 +TRRAP FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.8680688336520075 6 3.5 8.9 +TSPOAP1-AS1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +UBE2A TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.2065009560229445 4.7 3.9 7 +UBE2J1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +UBR5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.632887189292543 5.1 3.2 5.5 +UNC5C FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.4416826003824093 2.6 2.2 5.1 +UNC5B FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.5296367112810707 NA NA NA +UNC5D FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.1032504780114722 2.6 1.8 1.9 +USP7 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 1.338432122370937 3.8 1.1 3.2 +VPS13B FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 4.2065009560229445 4.3 5.7 8.3 +WAC FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.676864244741874 1.3 1.2 3.4 +WNK1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 4.588910133843212 NA NA NA +WEE1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.015296367112811 1.7 1.6 2.8 +XBP1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 1.147227533460803 NA 1.6 1.3 +XPO1 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 26608593 NA NA 3.8240917782026767 1.3 1.4 2.3 +YY1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.147227533460803 3.8 1.1 4.3 +ZBTB7A FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.7208413001912046 1.7 1.3 1.5 +ZC3H12A TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.676864244741874 4.7 3.1 6 +ZCCHC7 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +ZEB2 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.8240917782026767 6 3.7 6.8 +ZFAT FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.338432122370937 2.6 2.7 2.8 +ZFP36L1 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 6.692160611854685 8.1 5.6 8.5 +ZFX FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.3824091778202677 0.4 1.4 1.7 +ZNF292 FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 5.353728489483748 6 4.3 6.4 +ZNF423 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 1.9120458891013383 3.4 2.1 3.4 +ZNF608 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 6.118546845124283 7.7 8.1 9.4 +ZNF217 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 2.1032504780114722 NA NA NA From 5f7d1e061a202f3cb5aecea7bfca338a01a38220 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: rdmorin Date: Wed, 24 Apr 2024 15:42:29 -0700 Subject: [PATCH 2/2] add mutation frequencies for GAMBL --- .../dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv | 68 +++++++++---------- 1 file changed, 34 insertions(+), 34 deletions(-) diff --git a/resources/curated/dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv b/resources/curated/dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv index 7b223af7..74e92710 100644 --- a/resources/curated/dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv +++ b/resources/curated/dlbcl_genes_with_mutation_frequencies.tsv @@ -4,7 +4,7 @@ ADAMTS1 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.91204588910 ANKRD17 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.676864244741874 2.1 3.8 4.3 ANKRD12 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 2.294455066921606 NA NA NA ACTG1 FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE Arthur FALSE TRUE 33953289 NA NA 5.353728489483748 NA NA NA -AICDA FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE Arthur FALSE TRUE 30275490 NA NA +AICDA FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE Arthur FALSE TRUE 30275490 NA NA 0.3824091778202677 NA NA NA ARID1A FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 8.795411089866157 4.3 4.4 8.9 ARID1B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 5.162523900573614 2.1 3.3 6 ARID5B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 3.2504780114722753 2.6 4.3 4.3 @@ -20,7 +20,7 @@ BCOR FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE Unpublished TRUE FALSE NA NA NA 3.824091778202 BCR FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE possibly_aSHM_only FALSE FALSE NA NA NA 4.97131931166348 4.3 3.9 6.4 BIRC6 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE PMID: 32961552 FALSE FALSE 28985567 NA NA 7.265774378585086 4.7 6.4 10 BRAF TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 2.294455066921606 5.6 2 3.4 -BLK FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA +BLK FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 0.5736137667304015 NA NA NA BRINP3 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 FAM5C NA 2.676864244741874 3 3.3 3.4 BTBD3 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 0.9 1.8 1.9 BTG1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 10.133843212237094 14.5 7.5 14.5 @@ -35,10 +35,10 @@ CCND3 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 7.45697896749522 4 CD22 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.147227533460803 3 2.8 1.7 CD274 TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 21796119 NA NA 0.9560229445506692 2.6 1.3 2.3 CD36 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.294455066921606 3 2.8 4.9 -CD44 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA +CD44 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 0.19120458891013384 NA NA NA CD58 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 7.839388145315487 6.8 2.8 10 CD70 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 5.544933078393881 7.7 6.9 9.4 -CD74 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +CD74 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 2.294455066921606 NA NA NA CD79B TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 9.94263862332696 15.4 8.3 14.9 CD83 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 4.397705544933078 7.3 5.8 5.7 CDC73 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 1.3 0.7 0.6 @@ -66,19 +66,19 @@ DTX1 TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 29641966 NA NA 10.707456978967496 1 DUSP2 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE 28985567 NA NA 10.133843212237094 4.3 9.7 12.6 EBF1 TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 23174882 NA NA 8.98661567877629 12.8 8.8 10.9 EEF1A1 TRUE FALSE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 33945543 NA NA 4.780114722753346 4.7 2.5 3 -EIF2AK3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +EIF2AK3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 3.4416826003824093 NA NA NA EP300 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 11.854684512428298 8.1 7.1 9.8 ETS1 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE 21796119 NA NA 4.588910133843212 5.6 4.4 7.9 ETV6 TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 4.97131931166348 10.3 5.8 10.4 EZH2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 20081860 NA NA 13.766730401529637 5.6 8.9 9.1 -EZR FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA +EZR FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 1.338432122370937 NA NA NA FAS TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 9.177820267686425 9 4.7 10.9 -FAM102A FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA -FANK1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +FAM102A FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 2.48565965583174 NA NA NA +FANK1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 0.19120458891013384 NA NA NA FBXO11 FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE GAMBL TRUE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 2.6 2.1 2.1 FBXW7 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.1032504780114722 1.7 1.3 3 -FCRL3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA -FNBP1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +FCRL3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 2.48565965583174 NA NA NA +FNBP1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 0.9560229445506692 NA NA NA FOXC1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 0.9560229445506692 0.9 1.2 4.5 FOXO1 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 NA NA 10.133843212237094 2.1 2.4 7.2 FOXP1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE TRUE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 3 2.1 1.9 @@ -141,15 +141,15 @@ KMT2C FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 MLL3 NA 3.2504780114722 KMT2D TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 21796119 MLL2 NA 33.460803059273424 26.1 22.3 34.5 KRAS TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 1.9120458891013383 2.6 1.7 3.6 LAMA5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 3.4416826003824093 5.6 4.7 12.1 -LAPTM5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +LAPTM5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 3.0592734225621414 NA NA NA LRP12 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 2.48565965583174 NA NA NA LCOR FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 6.309751434034417 0.4 0.5 3.4 LIN54 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.5736137667304015 0.9 0.9 2.1 LTB TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 9.369024856596559 9.8 NA 8.5 -LPP FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA -IRAG2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA -MALAT1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA -NEAT1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +LPP FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 1.147227533460803 NA NA NA +IRAG2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA NA NA NA NA +MALAT1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA NA NA NA NA +NEAT1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA NA NA NA NA LYN TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.294455066921606 5.6 1.3 1.7 MAGT1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.5296367112810707 1.7 1.9 3 MAP2K1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 1.338432122370937 2.1 2.2 3.2 @@ -160,7 +160,7 @@ MECOM FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.1032504780114 MEF2B TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE NA TRUE TRUE 21796119 NA NA 11.281070745697896 5.6 5.9 9.1 MEF2C TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 3.4416826003824093 3 1.7 1.9 MET FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.7648183556405354 2.6 1.7 3.8 -MIR155HG FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +MIR155HG FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 0.19120458891013384 NA NA NA MGA FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 4.015296367112811 3.4 4.7 7.2 MPEG1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.780114722753346 10.7 5.8 9.1 MS4A1 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 32589730 FALSE TRUE NA NA NA 1.5296367112810707 0.4 1.3 1.5 @@ -172,10 +172,10 @@ MYBPC2 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.57361 MYC FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 10.898661567877628 6.4 6.2 5.3 MYD88 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 21179087 NA NA 13.38432122370937 21.4 15.2 26.4 MYOM2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.2504780114722753 4.3 3.2 8.1 -MYO1E FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +MYO1E FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 2.48565965583174 NA NA NA NANOG TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 0.4 0.4 0.2 NAV1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 2.48565965583174 1.3 2 2.8 -NCOA3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +NCOA3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 1.147227533460803 NA NA NA NCOR1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.1032504780114722 2.1 2.7 4.5 NCOR2 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.1032504780114722 4.3 3.6 5.7 NF1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 2.8680688336520075 2.1 2.5 4 @@ -191,7 +191,7 @@ NOTCH1 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 22343534 NA NA 3.44168260038240 NOTCH2 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 5.736137667304015 7.3 3.7 11.3 N2RF2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA NA NA NA NA OSBPL10 FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 8.795411089866157 2.6 2.3 14.3 -P2RX5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +P2RX5 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 1.147227533460803 NA NA NA P2RY8 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE PMID: 22343534 TRUE FALSE 22343534 NA NA 6.8833652007648185 6 NA 7.2 PAPOLG FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.3824091778202677 1.3 1.2 0.9 PAX5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE TRUE 11460166 NA NA 3.632887189292543 3.4 1.9 3.2 @@ -212,29 +212,29 @@ PRKCB TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.97131931166348 3.4 1 PRKDC FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.676864244741874 6.4 6.6 7.7 PRPS1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.7648183556405354 0.9 0.2 0.6 PTEN TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 3.8240917782026767 4.7 3.1 4.3 -PTMA FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +PTMA FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 0.3824091778202677 NA NA NA PTPN6 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA TRUE FALSE 28985567 NA NA 2.676864244741874 5.1 2.9 4.5 PTPRD FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 5.544933078393881 5.6 5.2 7.7 PTPRK FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 4.2065009560229445 6.4 3.3 3.6 -PTPN1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +PTPN1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 0.19120458891013384 NA NA NA RAC2 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.147227533460803 NA NA NA RAD9A TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA 0.19120458891013384 1.7 0.5 0.4 RARA FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.338432122370937 0.4 0.7 4 RB1 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.780114722753346 3.8 1.6 3.2 -RCC FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +RCC FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA NA NA NA NA RFX7 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 4.015296367112811 4.7 3.4 1.9 RFXAP FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 1.338432122370937 NA 0.6 1.3 -RFTN1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA -RHEX FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +RFTN1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 4.588910133843212 NA NA NA +RHEX FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA NA NA NA NA RHOA TRUE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 11460166 NA NA 3.0592734225621414 5.1 3.3 3.6 -RHOH FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +RHOH FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 1.147227533460803 NA NA NA RRAGC FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE 26691987 NA NA 1.7208413001912046 0.4 2 3 RUNX1 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 0.9560229445506692 0.4 0.5 0.9 -RUBCNL FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +RUBCNL FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 0.5736137667304015 NA NA NA S1PR2 FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE TRUE NA NA NA 4.780114722753346 2.6 2.2 2.1 -SEL1L3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA -SEPTIN9 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA -SERPINA9 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +SEL1L3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 5.162523900573614 NA NA NA +SEPTIN9 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA NA NA NA NA +SERPINA9 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 1.147227533460803 NA NA NA SETD1B FALSE TRUE TRUE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 5.162523900573614 NA 5.8 12.8 SETD2 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE NA NA NA 3.632887189292543 0.4 4.6 6.4 SETD5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 2.48565965583174 2.1 3.2 5.3 @@ -247,14 +247,14 @@ SMARCA4 FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE NA TRUE FALSE 23292937 NA NA 3.2504780114722 SMEK1 TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 29713087 NA NA NA 3 0.9 NA SOCS1 FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 15.296367112810707 4.7 10.4 12.8 SPEN TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 4.780114722753346 9.8 7.4 10 -ST6GAL1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +ST6GAL1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 1.147227533460803 NA NA NA STAT3 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 24837465 NA NA 7.074569789674952 7.3 3.6 9.4 STAT5B FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 0.5736137667304015 0.4 1.6 0.4 STAT6 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 5.736137667304015 4.7 3.8 2.6 SYK FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.5296367112810707 0.4 0.8 2.3 TAF1 FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 4.780114722753346 3.8 4 4.9 TAP1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE 29641966 FALSE FALSE 29641966 NA NA 0.5736137667304015 2.6 NA 3.6 -TBC1D4 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +TBC1D4 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 2.294455066921606 NA NA NA TBL1XR1 TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 26608593 NA NA 8.604206500956023 8.1 5.7 12.8 TCL1A FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE TRUE NA NA NA 2.1032504780114722 3 2.8 3.8 TET2 FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE NA TRUE FALSE NA NA NA 5.544933078393881 6 7.4 11.7 @@ -271,9 +271,9 @@ TRAF3 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE PMID: 25468570 FALSE FALSE NA NA NA 0.956022 TRAF6 FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.338432122370937 NA NA NA TRIP12 FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.2504780114722753 3 3.2 6 TRRAP FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 2.8680688336520075 6 3.5 8.9 -TSPOAP1-AS1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +TSPOAP1-AS1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA NA NA NA NA UBE2A TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 4.2065009560229445 4.7 3.9 7 -UBE2J1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +UBE2J1 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 0.7648183556405354 NA NA NA UBR5 FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.632887189292543 5.1 3.2 5.5 UNC5C FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE GAMBL FALSE FALSE NA NA NA 3.4416826003824093 2.6 2.2 5.1 UNC5B FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE NA FALSE FALSE 33953289 NA NA 1.5296367112810707 NA NA NA @@ -288,7 +288,7 @@ XPO1 TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE NA TRUE FALSE 26608593 NA NA 3.8240917782026767 1 YY1 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.147227533460803 3.8 1.1 4.3 ZBTB7A FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.7208413001912046 1.7 1.3 1.5 ZC3H12A TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE NA FALSE FALSE NA NA NA 2.676864244741874 4.7 3.1 6 -ZCCHC7 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA +ZCCHC7 FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE GAMBL FALSE TRUE NA NA NA 0.5736137667304015 NA NA NA ZEB2 TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 23292937 NA NA 3.8240917782026767 6 3.7 6.8 ZFAT FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE NA FALSE FALSE 28985567 NA NA 1.338432122370937 2.6 2.7 2.8 ZFP36L1 TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE NA TRUE TRUE NA NA NA 6.692160611854685 8.1 5.6 8.5