From 3e46774bfbc2895adf44b7e95ca13eef87ee0683 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: farchaab Date: Mon, 7 Oct 2024 16:33:59 +0200 Subject: [PATCH 1/5] added accessions instead of taxons --- .../hmp_templates/buccal_mucosa/SRS013506.tsv | 819 +++++---- .../hmp_templates/buccal_mucosa/SRS019352.tsv | 353 ++-- .../hmp_templates/buccal_mucosa/SRS050029.tsv | 547 +++--- .../hmp_templates/buccal_mucosa/SRS054569.tsv | 738 ++++---- .../hmp_templates/buccal_mucosa/SRS056042.tsv | 323 ++-- mess/data/hmp_templates/gut/SRS1041031.tsv | 833 +++++---- mess/data/hmp_templates/gut/SRS1041129.tsv | 640 +++---- mess/data/hmp_templates/gut/SRS104912.tsv | 1500 ++++++++--------- mess/data/hmp_templates/gut/SRS105082.tsv | 1069 ++++++------ mess/data/hmp_templates/gut/SRS147088.tsv | 620 ++++--- mess/data/hmp_templates/throat/SRS014475.tsv | 218 +-- mess/data/hmp_templates/throat/SRS014689.tsv | 636 ++++--- mess/data/hmp_templates/throat/SRS065335.tsv | 426 +++-- mess/data/hmp_templates/throat/SRS143032.tsv | 82 +- mess/data/hmp_templates/throat/SRS144378.tsv | 232 ++- mess/data/hmp_templates/vagina/SRS097885.tsv | 44 +- mess/data/hmp_templates/vagina/SRS098585.tsv | 273 ++- mess/data/hmp_templates/vagina/SRS142957.tsv | 66 +- mess/data/hmp_templates/vagina/SRS143776.tsv | 88 +- mess/data/hmp_templates/vagina/SRS146847.tsv | 78 +- 20 files changed, 4699 insertions(+), 4886 deletions(-) diff --git a/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS013506.tsv b/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS013506.tsv index eba21ca..df922e5 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS013506.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS013506.tsv @@ -1,414 +1,405 @@ -taxon seq_abundance -28037 0.2393182781831039 -1313 0.1322917116450074 -735 0.0785482867410811 -729 0.0549046624341605 -1303 0.0520236891040456 -726 0.0471479779743572 -2819619 0.0317956462617778 -727 0.0303696706417491 -712310 0.0288330925443666 -257758 0.0283965224457552 -1433513 0.0233224347126848 -1379 0.0224563730740127 -2598453 0.0201078843108704 -9606 0.0197107771761789 -483 0.0097855763043836 -137732 0.0068327556049796 -43675 0.006046504713966 -3077584 0.0055676402280145 -113107 0.0049172976611734 -28132 0.0048297004991091 -1302 0.0046171667786258 -1305 0.0040540674459215 -652716 0.0037896832840547 -712435 0.0036919991760557 -712633 0.0036369633833244 -487 0.0036298848247738 -1304 0.0033971772124211 -490 0.0033269225188059 -1902136 0.0029298153841144 -2937985 0.0028884058165931 -1177574 0.0027227675465078 -1318 0.0023346855739684 -28131 0.0020764951508334 -84135 0.00198518174553 -28133 0.0019527973401608 -2576376 0.0018798881870891 -28449 0.0018052093943797 -712623 0.0017312384575254 -29391 0.0017207975836632 -3038077 0.0017138959890763 -1307 0.0016264757909758 -29466 0.0016057710072151 -2972784 0.0015245445478464 -486 0.0015192356289334 -2759692 0.0014387170254198 -718 0.0014314615029053 -732 0.0014303997191227 -45634 0.0013815576651233 -1311 0.0013794340975581 -68892 0.0013615607372177 -1759399 0.0013410329174208 -28125 0.0012304304400669 -1156431 0.0012139727914366 -189834 0.0012120261878352 -1328 0.0011221284942419 -2663009 0.0011146960077637 -34105 0.001112218512271 -470565 0.0010847890978872 -488 0.0010605450348512 -75985 0.001055413079902 -2047 0.0009407404313815 -85404 0.000916142440418 -39777 0.0008857046386502 -589437 0.0008458877468027 -485 0.0007910289180352 -738 0.0007837733955208 -2133944 0.0007740403775136 -837 0.0007612989721225 -2820817 0.00073440044963 -162156 0.0007294454586445 -715 0.0007241365397315 -1796613 0.0007121029901954 -747 0.0006967071253478 -76857 0.0006940526658913 -1334 0.0006894516028334 -1343 0.000685204467703 -199 0.0006836117920291 -423477 0.0006793646568987 -111844 0.000669277710964 -85402 0.0006689237830365 -544580 0.0006524661344062 -496 0.0006494577470222 -1308 0.000648042035312 -46124 0.0006462723956744 -739 0.0006406095488339 -1056807 0.0006365393776672 -157687 0.0006103487110298 -3098076 0.000607163359682 -28135 0.0006050397921168 -2030797 0.0006046858641893 -644007 0.0005873433957402 -33040 0.0005747789543128 -2770636 0.0005592061255014 -28129 0.0005471725759653 -589436 0.0005415097291248 -2382163 0.0005292992156249 -2866570 0.0004983305219658 -28127 0.0004923137471977 -712471 0.0004903671435963 -495 0.0004870048282847 -76123 0.0004827576931543 -28137 0.0004801032336979 -2610896 0.0004747943147849 -714 0.0004726707472197 -315405 0.0004675387922704 -46125 0.0004498423958938 -2682456 0.0004496654319301 -28111 0.0004447104409446 -712150 0.0004422329454519 -1234680 0.000430022431952 -1338 0.0004284297562781 -371601 0.0004238286932202 -1660 0.0004059553328798 -454154 0.0004056014049523 -3077723 0.0004025930175682 -817 0.0003962223148726 -197575 0.0003962223148726 -47735 0.0003953374950538 -249188 0.0003914442878509 -684066 0.0003914442878509 -254839 0.000378525918496 -851 0.0003756944950758 -823 0.0003636609455396 -387090 0.0003617143419382 -165179 0.0003610064860832 -728 0.0003571132788803 -76860 0.0003555206032064 -750 0.0003532200716774 -2972775 0.0003424252698877 -730 0.000332338323953 -821 0.0003295069005328 -2937774 0.0003284451167502 -12402 0.0003211895942357 -2682455 0.0003206587023444 -484 0.0003188890627068 -3098075 0.0002916366122868 -820 0.0002905748285042 -28119 0.0002900439366129 -51049 0.0002880973330114 -123824 0.0002817266303159 -1336 0.000280841810497 -1566990 0.0002803109186057 -33053 0.0002712857564536 -52227 0.0002705779005986 -28128 0.0002702239726711 -2518605 0.0002686312969972 -2691580 0.0002601370267364 -712116 0.0002571286393523 -1917441 0.0002521736483669 -716 0.0002519966844031 -36874 0.0002498731168379 -1624 0.0002461568735988 -230709 0.00024527205378 -712362 0.0002417327745047 -1351 0.0002380165312656 -1314 0.0002364238555917 -1432056 0.000233946360099 -860 0.0002309379727149 -157339 0.0002295222610048 -2913621 0.000229345297041 -3020829 0.0002215588826353 -1019 0.0002215588826353 -3059028 0.0002208510267803 -322095 0.0002192583511064 -2913616 0.0002185504952513 -818 0.0002128876484108 -39778 0.0002125337204832 -2841264 0.0002121797925557 -1785995 0.0002077556934616 -357276 0.0002061630177877 -2792859 0.0002054551619326 -2686210 0.0002052781979688 -1335 0.0002036855222949 -28116 0.0001962530358167 -376805 0.0001953682159979 -2913614 0.0001950142880704 -731 0.0001948373241066 -329854 0.0001943064322153 -76859 0.0001912980448313 -2563662 0.0001911210808675 -562 0.0001861660898821 -1796644 0.0001861660898821 -454155 0.0001851043060995 -28113 0.000182449846643 -2801997 0.0001812110988966 -47671 0.0001812110988966 -47678 0.0001803262790778 -1032623 0.000174840396201 -46506 0.000174132540346 -2913620 0.0001732477205271 -28901 0.0001725398646721 -28124 0.0001721859367445 -172042 0.0001705932610706 -1501662 0.0001656382700852 -839 0.0001647534502664 -2576606 0.0001636916664838 -246787 0.0001596214953171 -1701814 0.0001592675673896 -2715212 0.0001589136394621 -2789425 0.0001587366754983 -291644 0.0001583827475708 -3077590 0.0001566131079331 -1888195 0.0001564361439693 -712357 0.0001560822160418 -397865 0.0001557282881143 -1309 0.0001546665043317 -720 0.0001543125764041 -2778911 0.0001502424052375 -33033 0.0001502424052375 -2040624 0.0001486497295636 -1839799 0.0001482958016361 -1329 0.000147587945781 -82348 0.0001467031259622 -1573823 0.0001433408106506 -1871109 0.0001394476034478 -2712025 0.0001380318917376 -282402 0.0001371470719188 -34085 0.0001371470719188 -400065 0.0001371470719188 -46503 0.0001364392160637 -33038 0.0001325460088609 -291645 0.0001321920809334 -393921 0.0001291836935493 -762 0.0001265292340928 -77095 0.0001263522701291 -753 0.0001261753061653 -2899133 0.0001258213782378 -2827233 0.0001244056665276 -470 0.0001235208467088 -187101 0.0001192737115784 -2490855 0.0001192737115784 -505 0.0001178579998683 -754 0.000115026576448 -28118 0.000114318720593 -1583098 0.0001141417566292 -1017 0.0001137878287017 -2545799 0.0001134339007741 -28123 0.0001125490809553 -2911526 0.0001121951530278 -3028083 0.0001116642611365 -3059030 0.0001083019458249 -197614 0.0001081249818611 -1018 0.0001074171260061 -28112 0.0001074171260061 -387661 0.0001074171260061 -114527 0.0001049396305134 -1346 0.0001042317746583 -867595 0.0001042317746583 -328812 0.0001035239188032 -712710 0.0001033469548395 -51161 0.000101400351238 -1814128 0.0001010464233105 -1501392 9.963071160041254e-05 -1825069 9.768410799898352e-05 -78535 9.750714403521724e-05 -1280 9.679928818015217e-05 -2679995 9.662232421638589e-05 -477666 9.64453602526196e-05 -361101 9.609143232508704e-05 -712361 9.57375043975545e-05 -1345 9.343697286859291e-05 -338188 9.29060809772941e-05 -109472 9.29060809772941e-05 -1491 9.113644133963136e-05 -290053 8.989769359326744e-05 -674529 8.989769359326744e-05 -305719 8.88359098106698e-05 -1585976 8.724323413677333e-05 -267212 8.635841431794195e-05 -2767188 8.618145035417567e-05 -155615 8.582752242664313e-05 -248315 8.565055846287685e-05 -327575 8.511966657157803e-05 -2598457 8.441181071651293e-05 -97481 8.352699089768156e-05 -2709396 8.299609900638274e-05 -2487072 8.19343152237851e-05 -1340 8.175735126001882e-05 -1326 8.175735126001882e-05 -2781599 8.122645936872e-05 -43768 8.087253144118744e-05 -2488810 8.05186035136549e-05 -2840371 7.927985576729097e-05 -2829812 7.91028918035247e-05 -505341 7.874896387599215e-05 -2968490 7.874896387599215e-05 -2021971 7.804110802092705e-05 -328814 7.644843234703058e-05 -1628156 7.644843234703058e-05 -655307 7.62714683832643e-05 -626932 7.62714683832643e-05 -360422 7.520968460066666e-05 -1396 7.520968460066666e-05 -554406 7.450182874560156e-05 -2583584 7.432486478183528e-05 -1241978 7.36170089267702e-05 -2094151 7.308611703547136e-05 -285729 7.29091530717051e-05 -1502 7.255522514417254e-05 -2004710 7.220129721664e-05 -1382 7.167040532534117e-05 -617123 7.131647739780861e-05 -1852374 7.096254947027607e-05 -157673 7.007772965144469e-05 -1349 6.848505397754823e-05 -253 6.848505397754823e-05 -2490633 6.742327019495058e-05 -221402 6.636148641235294e-05 -28251 6.618452244858666e-05 -706438 6.529970262975528e-05 -29389 6.512273866598902e-05 -2713414 6.335309902832627e-05 -573 6.211435128196235e-05 -1760811 6.140649542689725e-05 -3028084 6.122953146313097e-05 -1310 6.122953146313097e-05 -2059264 6.10525674993647e-05 -2708117 6.052167560806588e-05 -1117645 6.0167747680533326e-05 -712538 5.9813819753000776e-05 -2496028 5.945989182546823e-05 -204 5.9282927861701954e-05 -884684 5.875203597040313e-05 -1243007 5.822114407910431e-05 -2664091 5.715936029650666e-05 -1655 5.627454047767529e-05 -258 5.6097576513909015e-05 -109328 5.574364858637647e-05 -587 5.556668462261019e-05 -157692 5.538972065884392e-05 -1316596 5.34431170574149e-05 -1811193 5.326615309364862e-05 -2650157 5.27352612023498e-05 -1348 5.238133327481725e-05 -2698458 5.2204369311050976e-05 -254955 5.20274053472847e-05 -1493872 5.167347741975216e-05 -1496 5.149651345598588e-05 -702113 5.13195494922196e-05 -1853278 5.043472967338823e-05 -1735111 5.025776570962195e-05 -1341 5.008080174585568e-05 -2920939 4.954990985455686e-05 -250 4.919598192702431e-05 -2707174 4.919598192702431e-05 -2173853 4.884205399949176e-05 -502 4.795723418066039e-05 -2949635 4.742634228936157e-05 -254785 4.7249378325595286e-05 -72 4.7249378325595286e-05 -2585118 4.707241436182901e-05 -2364787 4.707241436182901e-05 -516051 4.6718486434296464e-05 -632 4.565670265169882e-05 -1319 4.547973868793254e-05 -1448274 4.494884679663372e-05 -539 4.477188283286745e-05 -1196095 4.477188283286745e-05 -2497989 4.459491886910117e-05 -2666100 4.424099094156863e-05 -712368 4.388706301403608e-05 -158 4.3179207158970975e-05 -232259 4.3179207158970975e-05 -1796646 4.3179207158970975e-05 -1642646 4.30022431952047e-05 -2897181 4.2825279231438425e-05 -3058373 4.2825279231438425e-05 -188913 4.264831526767215e-05 -157691 4.247135130390588e-05 -2714926 4.247135130390588e-05 -1785996 4.247135130390588e-05 -149016 4.247135130390588e-05 -61592 4.194045941260705e-05 -2755405 4.194045941260705e-05 -1241981 4.15865314850745e-05 -653940 4.15865314850745e-05 -713030 4.15865314850745e-05 -996 4.140956752130823e-05 -546 4.087867563000941e-05 -1160795 4.052474770247686e-05 -651561 4.0347783738710586e-05 -3028082 4.0347783738710586e-05 -1642647 3.999385581117804e-05 -615 3.981689184741176e-05 -1307839 3.9639927883645486e-05 -1755100 3.9462963919879214e-05 -2830782 3.893207202858039e-05 -1940319 3.893207202858039e-05 -2545455 3.893207202858039e-05 -1218801 3.8755108064814114e-05 -2606626 3.8755108064814114e-05 -492 3.857814410104784e-05 -40542 3.857814410104784e-05 -1201031 3.822421617351529e-05 -2562892 3.787028824598274e-05 -2885633 3.769332428221647e-05 -668 3.769332428221647e-05 -185300 3.769332428221647e-05 -1747 3.751636031845019e-05 -2093856 3.751636031845019e-05 -850 3.751636031845019e-05 -1358 3.733939635468392e-05 -103810 3.716243239091764e-05 -1848904 3.698546842715137e-05 -1653831 3.698546842715137e-05 -54291 3.698546842715137e-05 -1701826 3.68085044633851e-05 -1727163 3.68085044633851e-05 -1405 3.645457653585255e-05 -2898187 3.627761257208627e-05 -150055 3.627761257208627e-05 -157688 3.574672068078745e-05 -2986834 3.574672068078745e-05 +accession reads +GCF_000722765.2 1255322 +GCF_008253725.1 730667 +GCF_008330025.1 443034 +GCF_004104465.2 309802 +GCF_016549395.1 274999 +GCF_900477945.1 262116 +GCF_037076355.1 202600 +GCF_012273215.1 195527 +GCF_002966695.1 179439 +GCF_024346585.1 165540 +GCF_002998595.1 161507 +GCF_000001405.40 130354 +GCF_000221985.1 128404 +GCF_003627155.1 125686 +GCF_009731465.1 105087 +GCF_900475315.1 55513 +GCF_020735385.1 38318 +GCF_001548235.1 34422 +GCF_032340315.1 29576 +GCF_900636505.1 26443 +GCF_026810185.1 25765 +GCF_020735905.1 23648 +GCF_900475505.1 22591 +GCF_018127745.1 20948 +GCF_001553685.1 20280 +GCF_008330925.1 20064 +GCF_017753665.1 18523 +GCF_943181435.1 16488 +GCF_002849795.1 16013 +GCF_002094955.1 15860 +GCF_002355895.1 15438 +GCF_037963785.1 13429 +GCF_002763715.1 11948 +GCF_018127845.1 11771 +GCF_032163505.1 11597 +GCF_029011355.1 11525 +GCF_001683375.1 10786 +GCF_024205685.1 10204 +GCF_006228325.1 9985 +GCF_029691405.1 9647 +GCF_013394695.1 9592 +GCF_016887735.2 8982 +GCF_946902905.1 8827 +GCF_002005185.1 8739 +GCF_003351565.1 8652 +GCF_940796315.1 8190 +GCF_900636745.1 8070 +GCF_001262035.1 8014 +GCF_900478185.1 7642 +GCF_001587175.1 7617 +GCF_021497965.1 7603 +GCF_019552345.1 7137 +GCF_030219305.1 6931 +GCF_003101015.1 6858 +GCF_000479315.1 6718 +GCF_002763695.1 6342 +GCF_018128125.1 6266 +GCF_002983685.1 6240 +GCF_013267835.1 5861 +GCF_009730295.1 5718 +GCF_013267735.1 5300 +GCF_003261035.1 5134 +GCF_002082765.1 5005 +GCF_037911965.1 4962 +GCF_020097435.1 4949 +GCF_011455695.1 4791 +GCF_007975365.1 4531 +GCF_000742795.1 4396 +GCF_003265305.2 4371 +GCF_017798005.1 4135 +GCF_023822465.1 4050 +GCF_963677685.1 4033 +GCF_010443215.1 3997 +GCF_011801285.1 3976 +GCF_038424135.1 3950 +GCF_023035175.1 3941 +GCF_016697125.1 3925 +GCF_001298465.1 3860 +GCF_026057735.1 3857 +GCF_027945475.1 3661 +GCF_009828705.1 3655 +GCF_016127115.1 3601 +GCF_019931005.1 3578 +GCF_900636445.1 3543 +GCF_022749515.1 3533 +GCF_034134805.1 3523 +GCF_900637655.1 3473 +GCF_018128205.1 3471 +GCF_007990545.2 3461 +GCF_002849775.1 3436 +GCF_900636525.1 3393 +GCF_014541205.1 3152 +GCF_000886415.1 3047 +GCF_003627135.1 3002 +GCF_920939465.1 2866 +GCF_001444445.1 2863 +GCF_020735565.1 2856 +GCF_018127805.1 2842 +GCF_032451715.1 2815 +GCF_018127765.1 2761 +GCF_008727815.1 2752 +GCF_013393365.1 2737 +GCF_008728395.1 2671 +GCF_013267415.1 2663 +GCF_024730685.1 2607 +GCF_019334785.1 2560 +GCF_018289135.1 2493 +GCF_018128305.1 2445 +GCF_003351545.1 2409 +GCF_027923645.1 2361 +GCF_035658435.1 2274 +GCF_005696695.1 2272 +GCF_020735865.1 2264 +GCF_032387735.1 2223 +GCF_018127725.1 2213 +GCF_900186995.1 2199 +GCF_002356055.1 2196 +GCF_019930905.1 2186 +GCF_026811325.1 2044 +GCF_030517085.1 2044 +GCF_029773625.1 2041 +GCF_018289295.1 2029 +GCF_016127875.1 1981 +GCF_008369705.1 1980 +GCF_900637315.1 1969 +GCF_963360645.1 1960 +GCF_035666155.1 1959 +GCF_037911955.1 1957 +GCF_018406505.1 1945 +GCF_946902045.1 1935 +GCF_016888945.1 1910 +GCF_023204875.1 1816 +GCF_005221285.1 1786 +GCF_019249725.2 1658 +GCF_034137685.1 1640 +GCF_002998435.1 1635 +GCF_004519515.1 1608 +GCF_021222645.1 1601 +GCF_019334725.1 1590 +GCF_011455495.1 1565 +GCF_028743775.1 1512 +GCF_016117815.1 1504 +GCF_001041795.1 1483 +GCF_000848885.1 1467 +GCF_004124015.1 1464 +GCF_013394715.1 1452 +GCF_019551475.1 1441 +GCF_024205305.1 1433 +GCF_029773605.1 1420 +GCF_024760065.1 1397 +GCF_028335765.1 1383 +GCF_018128245.1 1351 +GCF_900636465.1 1351 +GCF_033814055.1 1349 +GCF_900638305.1 1339 +GCF_030062915.1 1301 +GCF_029774155.1 1296 +GCF_021654515.1 1291 +GCF_000521605.1 1277 +GCF_022845615.1 1265 +GCF_030644365.1 1236 +GCF_002302595.1 1234 +GCF_900637515.1 1233 +GCF_037889265.1 1202 +GCF_013009555.1 1201 +GCF_022024015.1 1185 +GCF_020341675.1 1178 +GCF_022024035.1 1158 +GCF_000783815.2 1152 +GCF_020091485.1 1084 +GCF_017347605.1 1080 +GCF_009792335.1 1078 +GCF_010587025.1 1048 +GCF_024181185.1 1041 +GCF_009867035.2 1039 +GCF_022024075.1 1039 +GCF_900637555.1 1021 +GCF_002998535.1 1006 +GCF_013377275.1 1000 +GCF_009684715.1 979 +GCF_022024055.1 978 +GCF_020097375.1 976 +GCF_019334745.1 962 +GCF_001708305.1 948 +GCF_003019755.1 939 +GCF_037967965.1 918 +GCF_012113595.1 916 +GCF_032342915.1 913 +GCF_016694895.1 901 +GCF_018389405.1 891 +GCF_016415165.1 886 +GCF_020091345.1 877 +GCF_020091405.1 875 +GCF_032452855.1 870 +GCF_900635785.1 866 +GCF_001274535.1 854 +GCF_023161985.2 850 +GCF_032611355.1 837 +GCF_015356115.1 832 +GCF_018986875.1 822 +GCF_004803915.1 822 +GCF_963677565.1 816 +GCF_014596425.2 807 +GCF_900636575.1 801 +GCF_004803695.1 799 +GCF_037966635.1 795 +GCF_002073815.2 777 +GCF_018127985.1 769 +GCF_024759225.1 769 +GCF_008831345.1 768 +GCF_001884675.1 747 +GCF_900476255.1 744 +GCF_009670965.2 744 +GCF_900187175.1 736 +GCF_900635775.1 724 +GCF_020714665.1 723 +GCF_963693435.1 706 +GCF_025914175.1 688 +GCF_900187085.1 688 +GCF_001553915.1 673 +GCF_030008055.1 666 +GCF_000973085.1 665 +GCF_014054985.1 663 +GCF_020550085.1 661 +GCF_020181455.1 661 +GCF_022024195.1 655 +GCF_032594935.1 651 +GCF_900186835.1 646 +GCF_038630745.1 641 +GCF_009730375.1 623 +GCF_002302415.1 617 +GCF_030644385.1 615 +GCF_027474865.2 609 +GCF_037911825.1 605 +GCF_018289315.1 599 +GCF_001885145.1 598 +GCF_036320655.1 595 +GCF_003033925.1 586 +GCF_002998925.1 583 +GCF_020736165.1 573 +GCF_900638385.1 564 +GCF_900636365.1 557 +GCF_001598035.1 549 +GCF_902141225.1 548 +GCF_017750945.1 546 +GCF_018128225.1 541 +GCF_900475025.1 538 +GCF_023361095.1 536 +GCF_020091425.1 533 +GCF_025914115.1 522 +GCF_963967315.1 509 +GCF_013377195.1 509 +GCF_900187245.1 499 +GCF_029991125.1 494 +GCF_963666085.1 493 +GCF_016906085.1 488 +GCF_963360665.1 488 +GCF_038396755.1 485 +GCF_013377295.1 481 +GCF_014353055.1 480 +GCF_001921945.1 478 +GCF_018137985.1 478 +GCF_014055025.1 476 +GCF_002302615.1 468 +GCF_900187285.1 465 +GCF_030517105.1 462 +GCF_002073795.1 462 +GCF_014898075.1 461 +GCF_005473905.2 459 +GCF_011612265.2 457 +GCF_014844995.1 457 +GCF_003815955.1 451 +GCF_023611925.1 446 +GCF_001623565.1 441 +GCF_027474965.1 439 +GCF_027474505.1 438 +GCF_963664505.1 437 +GCF_003860605.1 435 +GCF_030064365.1 434 +GCF_902141215.1 434 +GCF_020138415.1 432 +GCF_025914295.1 430 +GCF_014844095.1 428 +GCF_023744375.2 428 +GCF_022267555.1 425 +GCF_030759015.1 424 +GCF_022404755.1 424 +GCF_014163495.1 419 +GCF_002237445.1 416 +GCF_024628805.1 416 +GCF_007990635.1 414 +GCF_023611905.1 406 +GCF_010320145.1 401 +GCF_900128725.1 398 +GCF_003595525.1 396 +GCF_026684175.1 395 +GCF_907163105.1 384 +GCF_032595075.1 381 +GCF_022354665.1 379 +GCF_030848225.1 372 +GCF_022532105.1 371 +GCF_900475595.1 364 +GCF_038269515.1 363 +GCF_017639855.1 362 +GCF_900475365.1 355 +GCF_029339075.1 350 +GCF_003589745.1 348 +GCF_025152665.1 347 +GCF_011058315.1 346 +GCF_008803015.1 346 +GCF_006770445.1 345 +GCF_036492635.1 343 +GCF_014702245.1 337 +GCF_024722395.1 335 +GCF_016127855.1 334 +GCF_900699785.1 334 +GCF_963667355.1 332 +GCF_009676955.1 332 +GCF_002209445.1 331 +GCF_001189555.1 330 +GCF_019551945.1 329 +GCF_963931395.1 325 +GCF_036323475.1 323 +GCF_900120165.1 316 +GCF_016127595.1 313 +GCF_007990505.1 310 +GCF_007990365.1 304 +GCF_009866825.1 304 +GCF_963667135.1 300 +GCF_034270385.1 299 +GCF_023674465.1 299 +GCF_928852565.1 298 +GCF_022488405.1 295 +GCF_011299335.1 294 +GCF_004355185.1 291 +GCF_036416795.1 290 +GCF_014879975.1 290 +GCF_002999135.1 290 +GCF_001642085.1 289 +GCF_003815835.1 285 +GCF_009193325.2 285 +GCF_009295945.1 284 +GCF_000963865.1 280 +GCF_036209505.1 280 +GCF_036322665.1 279 +GCF_002216145.1 278 +GCF_016725645.1 278 +GCF_010692925.1 274 +GCF_036511535.1 273 +GCF_019774635.1 272 +GCF_016127355.1 268 +GCF_009913235.1 267 +GCF_006542665.1 264 +GCF_002951025.1 260 +GCF_000011805.1 258 +GCF_021172165.1 253 +GCF_951229915.1 253 +GCF_900095795.1 253 +GCF_018866345.1 252 +GCF_003086355.1 249 +GCF_024181625.1 247 +GCF_019930845.1 246 +GCF_014334015.1 244 +GCF_003351945.1 242 +GCF_013357625.1 242 +GCF_030644325.1 240 +GCF_008327825.1 239 +GCF_004328965.1 238 +GCF_000921895.1 237 +GCF_030408675.1 236 +GCF_018866205.1 236 +GCF_001554015.1 234 +GCF_003963555.1 234 +GCF_032594915.1 229 +GCF_022430525.1 229 +GCF_009671065.1 229 +GCF_025947285.1 228 +GCF_002240055.1 228 +GCF_019702945.1 227 +GCF_018336895.1 227 +GCF_030166715.1 227 +GCF_034345625.1 226 +GCF_009936295.1 226 +GCF_900636885.1 224 +GCF_001553645.1 222 +GCF_900636515.1 221 +GCF_024722315.1 221 +GCF_027594765.1 219 +GCF_011455875.1 217 +GCF_003991565.1 217 +GCF_024652885.1 216 +GCF_005165545.1 215 +GCF_003390995.1 212 +GCF_004337365.2 209 +GCF_900095135.1 209 +GCF_030296935.1 209 +GCF_001593605.1 208 +GCF_003815875.1 208 +GCF_007197715.1 208 +GCF_007990525.1 205 +GCF_002302635.1 205 +GCF_024759285.1 203 +GCF_001443605.1 201 +GCF_020162275.1 200 diff --git a/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS019352.tsv b/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS019352.tsv index cad3b0e..278f932 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS019352.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS019352.tsv @@ -1,183 +1,170 @@ -taxon seq_abundance -729 0.2050193339812339 -1303 0.1482604362695761 -28037 0.0924280529432081 -726 0.0494885624107178 -1313 0.0373795799196965 -29466 0.0307769284729245 -712310 0.0280179928434182 -1305 0.0256102094631409 -727 0.024334191430731 -712116 0.0192597941390546 -544580 0.0187841724305917 -1302 0.014341189746684 -1019 0.0135078213805558 -9606 0.0122309790470914 -2819619 0.0120826048572763 -1547448 0.0116671571257941 -1379 0.0100671887789546 -1902136 0.0097869264204149 -1433513 0.0091373771894466 -47671 0.00901785353654 -76857 0.0089065728941787 -3038077 0.0085817982786945 -490 0.0083880875308803 -1017 0.0082158086104839 -257758 0.0068095510114586 -732 0.0066661226279706 -2598453 0.0064394398379753 -137732 0.0058401729713332 -712357 0.0058014308217704 -172042 0.005354659650216 -46125 0.0053332278227983 -2718 0.0049350904134611 -2789425 0.0047314880529926 -2576376 0.0046671925707394 -496 0.0045666278420869 -113107 0.0039690095775539 -851 0.0036425863599607 -29391 0.0033680941088027 -2663009 0.0031348169103712 -488 0.0030086988490284 -495 0.002836419928632 -2708117 0.0028100422948871 -712435 0.0026748569219444 -487 0.0026097371386367 -706438 0.0026089128375821 -1018 0.0024242694013678 -28132 0.002416850691877 -1655 0.0024094319823863 -28449 0.0023113401568974 -539 0.0022973270389704 -423477 0.0022791924157708 -2047 0.0022684765020619 -483 0.0021909922029363 -3077723 0.0021415341396646 -1583098 0.0021349397312283 -3077584 0.0019906870466859 -43675 0.0019313373707598 -1750 0.0018892980169789 -1658672 0.0015917253362942 -712633 0.0015257812519319 -46124 0.0014878634034236 -1056807 0.0013914201800438 -45634 0.0012718965271372 -821 0.0011325896489219 -357276 0.0011317653478674 -739 0.0010773614782685 -1304 0.0010674698656141 -712623 0.0010460380381964 -2820817 0.0010369707265966 -2759692 0.0010287277160513 -76859 0.001018836103397 -1660 0.000989161265434 -1318 0.0009776210506706 -485 0.000975148147507 -84135 0.0009652565348526 -1156431 0.0009504191158711 -1656 0.0009281629873989 -735 0.0009050825578721 -2972784 0.0008852993325634 -1316596 0.0008828264293998 -714 0.0008663404083092 -712710 0.000831719764019 -285729 0.0008094636355468 -46503 0.0007921533134017 -486 0.0007896804102381 -1311 0.0007847346039109 -1853278 0.0007633027764932 -28116 0.0007484653575117 -46506 0.0007163176163851 -1747 0.0007097232079489 -837 0.0007039531005672 -2937985 0.0007023044984581 -1307 0.0006882913805311 -155615 0.0006734539615496 -28131 0.0006668595531134 -2545799 0.0006149285866781 -78535 0.0006033883719147 -505 0.0005943210603149 -817 0.0005918481571513 -1328 0.0005803079423879 -820 0.0005597004160247 -68892 0.0005456872980977 -747 0.0005316741801707 -327575 0.000511890954862 -33053 0.0005110666538075 -249188 0.0005069451485349 -461393 0.0004879862242807 -197575 0.0004830404179536 -484 0.0004830404179536 -371601 0.0004747974074083 -712150 0.0004739731063537 -1334 0.0004640814936994 -39778 0.0004574870852632 -1759399 0.0004467711715543 -39777 0.0004442982683907 -1308 0.0004368795589 -157687 0.0004030832156643 -2866570 0.0003849485924647 -28133 0.0003816513882466 -492 0.0003775298829739 -2682456 0.0003767055819194 -43768 0.0003709354745377 -2420310 0.0003701111734832 -860 0.0003692868724286 -2912188 0.0003626924639924 -1871109 0.0003577466576652 -1177574 0.0003486793460654 -1931275 0.0003387877334111 -2490855 0.0003379634323566 -684066 0.0003379634323566 -1705617 0.000337139131302 -2682455 0.0003321933249749 -2528037 0.0003297204218113 -1338 0.0003272475186477 -502 0.0003223017123205 -1343 0.0003173559059934 -3077590 0.0003165316049388 -194197 0.0003148830028298 -248315 0.000307464293339 -328813 0.0003008698849028 -2972775 0.0002942754764666 -655307 0.0002926268743575 -2866573 0.0002860324659213 -47678 0.0002810866595941 -2382163 0.0002802623585396 -326522 0.0002720193479943 -2666100 0.0002711950469398 -652716 0.0002703707458852 -267212 0.0002695464448307 -28129 0.0002687221437762 -28125 0.0002580062300673 -2709396 0.0002538847247947 -1314 0.0002530604237402 -409322 0.0002522361226856 -2610896 0.000249763219522 -162156 0.000249763219522 -28111 0.0002464660153039 -712122 0.0002456417142494 -712471 0.0002415202089768 -1853276 0.0002398716068677 -1316593 0.0002382230047586 -157692 0.0002365744026496 -109328 0.0002357501015951 -322095 0.0002275070910498 -1815583 0.0002266827899952 -1234680 0.0002052509625775 -3059028 0.0002003051562503 -33040 0.0001978322530868 -818 0.0001937107478141 -1796644 0.0001895892425415 -1309 0.0001895892425415 -562 0.0001887649414869 -2133944 0.0001871163393779 -3098076 0.0001862920383234 -867595 0.0001821705330507 -199 0.0001780490277781 -2748316 0.0001780490277781 -28118 0.0001772247267235 -823 0.0001722789203964 -246787 0.0001698060172328 -2955582 0.0001689817161783 -61592 0.0001673331140692 +accession reads +GCF_004104465.2 247410 +GCF_016549395.1 148081 +GCF_000722765.2 109205 +GCF_900477945.1 59665 +GCF_008253725.1 43638 +GCF_002005185.1 38055 +GCF_002998595.1 34303 +GCF_900475505.1 31371 +GCF_002966695.1 30537 +GCF_013394715.1 23264 +GCF_027945475.1 22739 +GCF_001683375.1 19798 +GCF_012273215.1 18493 +GCF_026810185.1 17311 +GCF_002302595.1 16419 +GCF_037911965.1 15909 +GCF_000001405.40 15564 +GCF_024346585.1 14622 +GCF_019973735.1 14125 +GCF_002355895.1 12012 +GCF_003627155.1 11147 +GCF_900637555.1 10918 +GCF_037963785.1 10162 +GCF_002302415.1 9977 +GCF_029691405.1 9883 +GCF_037076355.1 8532 +GCF_001262035.1 8096 +GCF_009731465.1 7601 +GCF_000221985.1 7396 +GCF_017753665.1 7356 +GCF_020735385.1 7085 +GCF_001274535.1 7035 +GCF_013267415.1 6723 +GCF_019334745.1 6492 +GCF_900637305.1 5978 +GCF_016694895.1 5773 +GCF_006228325.1 5374 +GCF_900636505.1 5023 +GCF_020097435.1 3621 +GCF_002763695.1 3540 +GCF_002209445.1 3405 +GCF_018127745.1 3249 +GCF_016127855.1 3108 +GCF_020736165.1 2970 +GCF_020735905.1 2913 +GCF_013267735.1 2747 +GCF_032387735.1 2737 +GCF_005696855.1 2669 +GCF_026057735.1 2663 +GCF_013267835.1 2584 +GCF_019930845.1 2573 +GCF_900475315.1 2417 +GCF_001548235.1 2360 +GCF_032340315.1 2359 +GCF_024205685.1 2024 +GCF_003351545.1 1999 +GCF_008330925.1 1962 +GCF_037911955.1 1956 +GCF_001262075.1 1911 +GCF_016887735.2 1812 +GCF_001553685.1 1803 +GCF_019931005.1 1791 +GCF_013009555.1 1490 +GCF_019551945.1 1462 +GCF_008728395.1 1457 +GCF_900478185.1 1421 +GCF_002094955.1 1355 +GCF_016127115.1 1307 +GCF_013394695.1 1271 +GCF_017798005.1 1257 +GCF_940796315.1 1212 +GCF_000479315.1 1194 +GCF_005696695.1 1180 +GCF_946902905.1 1113 +GCF_008330025.1 1091 +GCF_037889265.1 1077 +GCF_900637975.1 1076 +GCF_002999135.1 1073 +GCF_022749515.1 1054 +GCF_032163505.1 1054 +GCF_024730685.1 1030 +GCF_003033925.1 1010 +GCF_019552345.1 988 +GCF_029011355.1 979 +GCF_020091485.1 953 +GCF_024759225.1 946 +GCF_023822465.1 874 +GCF_003390995.1 860 +GCF_002763715.1 810 +GCF_037911825.1 795 +GCF_009730375.1 748 +GCF_016117815.1 742 +GCF_016127595.1 715 +GCF_943181435.1 700 +GCF_021497965.1 688 +GCF_014054985.1 675 +GCF_010443215.1 654 +GCF_002302615.1 621 +GCF_900186995.1 616 +GCF_018289135.1 612 +GCF_009730295.1 608 +GCF_019930905.1 608 +GCF_030644185.1 589 +GCF_018128305.1 582 +GCF_003351565.1 580 +GCF_001587175.1 553 +GCF_900637515.1 502 +GCF_002082765.1 496 +GCF_007990545.2 485 +GCF_011801285.1 480 +GCF_008369705.1 478 +GCF_038424135.1 475 +GCF_003812445.1 470 +GCF_019334725.1 467 +GCF_920939465.1 466 +GCF_013393365.1 452 +GCF_018127845.1 451 +GCF_011612265.2 450 +GCF_018127725.1 419 +GCF_002849795.1 418 +GCF_005221285.1 415 +GCF_001278825.1 410 +GCF_030008055.1 407 +GCF_002356055.1 398 +GCF_022845675.1 388 +GCF_003627135.1 378 +GCF_018406505.1 375 +GCF_032452855.1 368 +GCF_900636445.1 363 +GCF_018128205.1 355 +GCF_008805035.1 348 +GCF_004124015.1 345 +GCF_035666155.1 343 +GCF_916618745.1 341 +GCF_014596425.2 336 +GCF_018289295.1 318 +GCF_008727815.1 315 +GCF_030219305.1 315 +GCF_016127355.1 308 +GCF_963360645.1 303 +GCF_900636365.1 295 +GCF_001278845.1 295 +GCF_018127805.1 292 +GCF_963677685.1 292 +GCF_002998835.1 290 +GCF_032342915.1 288 +GCF_003019755.1 287 +GCF_007990505.1 284 +GCF_007990365.1 283 +GCF_900187285.1 279 +GCF_022845615.1 278 +GCF_015219785.1 267 +GCF_022870885.1 261 +GCF_024760065.1 255 +GCF_019334785.1 249 +GCF_030644365.1 244 +GCF_009867035.2 244 +GCF_008831345.1 240 +GCF_034134805.1 234 +GCF_900636525.1 233 +GCF_946902045.1 225 +GCF_003265305.2 225 +GCF_036320655.1 224 +GCF_004115325.2 224 +GCF_010587025.1 223 +GCF_001298465.1 218 +GCF_013394735.1 216 +GCF_009734245.1 205 +GCF_030408675.1 203 diff --git a/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS050029.tsv b/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS050029.tsv index bf887fd..f5eca79 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS050029.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS050029.tsv @@ -1,279 +1,268 @@ -taxon seq_abundance -729 0.5975055204369542 -43675 0.0416283600298482 -28037 0.0388235583887226 -29466 0.0317346503099573 -1660 0.0194252572107652 -1303 0.0156330190894167 -727 0.0153422110648912 -1313 0.0139527597110693 -726 0.0125384665230914 -2972784 0.0111238562053157 -1318 0.010717507224481 -712623 0.0101157005783073 -2663009 0.0099562899999778 -2759692 0.0096595622192278 -1759399 0.0083214858926395 -113107 0.0075458921173054 -1156431 0.0071627993216382 -1379 0.0062133127072112 -2819619 0.0057276812769421 -490 0.0052147766840675 -732 0.0046701591114192 -712435 0.0045273449925046 -46124 0.0045167739992467 -712633 0.0044541937191597 -2382163 0.0040302968895169 -3077584 0.0038302936970769 -423477 0.003789066823371 -1433513 0.0036754286458483 -2598453 0.0035834610045044 -1234680 0.0031700294581869 -68892 0.0031077663078977 -712150 0.0030643195256076 -2610896 0.0028524768207188 -3098076 0.00241399202038 -9606 0.002300670972655 -28449 0.0022757234285663 -257758 0.0022109232398952 -2490855 0.0021103930940123 -3098075 0.0020419987676336 -249188 0.0018035171597347 -28132 0.0017929461664768 -652716 0.0016834306763247 -47671 0.0016663056672469 -1852377 0.0016528805058093 -739 0.0016435780317423 -84135 0.0015496019016794 -3059030 0.0015319483429386 -495 0.0015249714873884 -2576376 0.0015246543575906 -2820817 0.0014766620481997 -747 0.001464505405953 -3038077 0.0014583742298634 -684066 0.0014028765152593 -712310 0.0012518170216036 -3059028 0.0011771858092026 -718 0.001167037655675 -1902136 0.0011460013790917 -78535 0.0011332104772496 -1304 0.0010337374306926 -1305 0.0009317273457536 -544580 0.0008974773275979 -29391 0.0008717898139811 -1302 0.0008607959809929 -488 0.0008068839153775 -714 0.0007217874196512 -1796644 0.0007024425019891 -496 0.0006598413991597 -1311 0.0006588900097665 -33053 0.0006311940074307 -39778 0.0005811932093207 -860 0.0005639624903103 -1017 0.0005410234349406 -2972775 0.000534152289323 -2866570 0.0005298181820872 -172042 0.0005290782125592 -837 0.0005283382430311 -45634 0.0004723119787641 -2682456 0.0004576182981356 -487 0.0004571954584053 -2490633 0.0004335164335075 -1307 0.0004214655011935 -1328 0.000419562722407 -1871109 0.0004187170429464 -617123 0.0004026491331944 -712116 0.0003477856781857 -735 0.0003257980122092 -712357 0.0003219924546364 -2682455 0.0002950364218287 -1308 0.0002848882683011 -712710 0.000283408329245 -46125 0.0002789685120766 -76857 0.0002716745267287 -2047 0.0002697717479422 -1056807 0.0002640634115829 -851 0.0002559237467743 -1177574 0.0002479955018309 -539 0.0002413357760784 -1583098 0.000236155989382 -1334 0.0002315047523485 -484 0.000231399042416 -76859 0.0002237879272702 -3077590 0.0002215680186861 -2789425 0.0002119484148214 -1338 0.0001981004136535 -39777 0.0001944005660132 -2545799 0.0001848866720811 -52773 0.0001724129000367 -1655 0.0001652246246213 -12402 0.0001635332657001 -28133 0.0001590934485317 -562 0.0001586706088014 -327575 0.0001504252340602 -248315 0.0001442940579706 -28901 0.0001424969891168 -137732 0.0001416513096562 -197575 0.0001387971414765 -28124 0.0001324545455218 -3077723 0.0001286489879489 -28129 0.0001246320105109 -28123 0.0001230463615222 -1019 0.0001217778423313 -1343 0.0001210378728032 -738 0.0001179722847584 -28135 0.000110044039815 -483 0.0001097269100172 -706438 0.0001039128637254 -485 0.000101481535276 -254839 9.73588479055004e-05 -1656 9.513893932133588e-05 -28131 9.503322938875664e-05 -1501662 9.323616053490918e-05 -28188 8.795066390594607e-05 -730 8.763353410820828e-05 -328813 8.742211424304976e-05 -36874 8.678785464757418e-05 -2040624 8.583646525436083e-05 -199 8.499078579372673e-05 -1314 8.34051368050378e-05 -486 8.245374741182444e-05 -750 8.002241896250141e-05 -393921 7.917673950186731e-05 -1785995 7.822535010865396e-05 -1747 7.780251037833691e-05 -322095 7.780251037833691e-05 -33033 7.685112098512354e-05 -1448274 7.484263226611757e-05 -2937985 7.441979253580052e-05 -397865 7.420837267064199e-05 -728 7.272843361453233e-05 -2718 7.262272368195306e-05 -76860 7.082565482810561e-05 -28137 7.040281509778856e-05 -818 6.691438732267291e-05 -82348 6.511731846882546e-05 -753 6.458876880592914e-05 -75985 6.321453968239874e-05 -505 6.16288906937098e-05 -1309 5.866901258149047e-05 -111844 5.814046291859415e-05 -2133944 5.740049339053932e-05 -2781599 5.687194372764301e-05 -1336 5.6554813929905226e-05 -867595 5.422919541316146e-05 -165179 5.380635568284441e-05 -157673 5.264354642447253e-05 -1335 5.200928682899695e-05 -47678 5.200928682899695e-05 -716 5.1797866963838426e-05 -470565 5.084647757062507e-05 -1839799 4.9260828581936135e-05 -823 4.8626568986460566e-05 -34085 4.830943918872278e-05 -820 4.672379020003385e-05 -1585976 4.6406660402296063e-05 -155615 4.63009504697168e-05 -72 4.471530148102787e-05 -33040 4.397533195297304e-05 -505341 4.386962202039377e-05 -1018 4.376391208781451e-05 -454154 4.355249222265599e-05 -52227 4.344678229007672e-05 -28125 4.334107235749746e-05 -1310 4.302394255975968e-05 -204 4.217826309912558e-05 -2021971 4.207255316654632e-05 -712471 4.207255316654632e-05 -285729 4.196684323396705e-05 -2840371 4.175542336880853e-05 -589437 4.154400350365001e-05 -400065 4.1438293571070745e-05 -712361 4.122687370591222e-05 -1288 4.059261411043664e-05 -1280 4.027548431269886e-05 -328814 3.9641224717223286e-05 -28119 3.93240949194855e-05 -315405 3.921838498690624e-05 -589436 3.868983532400993e-05 -214856 3.763273599821731e-05 -1351 3.7527026065638046e-05 -339 3.699847640274173e-05 -230709 3.62585068746869e-05 -1888195 3.615279694210764e-05 -715 3.5624247279211325e-05 -2094151 3.488427775115649e-05 -1316596 3.477856781857723e-05 -76123 3.435572808826018e-05 -2778911 3.414430822310166e-05 -3028082 3.382717842536387e-05 -2792859 3.382717842536387e-05 -162156 3.31929188298883e-05 -2576606 3.287578903215052e-05 -28112 3.255865923441273e-05 -1750 3.213581950409568e-05 -2043170 3.2030109571516414e-05 -2913616 3.181868970635789e-05 -2770636 3.129014004346158e-05 -3003351 3.086730031314453e-05 -371601 3.0655880447986006e-05 -1243007 3.0444460582827484e-05 -2173853 2.981020098735191e-05 -61592 2.9493071189614127e-05 -1329 2.9493071189614127e-05 -2708117 2.9387361257034864e-05 -2030797 2.917594139187634e-05 -47735 2.875310166155929e-05 -762 2.864739172898003e-05 -299767 2.8435971863821504e-05 -1814128 2.822455199866298e-05 -2709396 2.811884206608372e-05 -1735111 2.7907422200925197e-05 -550 2.780171226834593e-05 -131111 2.769600233576667e-05 -2585118 2.769600233576667e-05 -821 2.7484582470608143e-05 -387090 2.727316260544962e-05 -817 2.70617427402911e-05 -2364787 2.70617427402911e-05 -103810 2.70617427402911e-05 -43768 2.6850322875132574e-05 -2937774 2.674461294255331e-05 -149016 2.663890300997405e-05 -46503 2.663890300997405e-05 -2664091 2.6216063279657e-05 -1348 2.6216063279657e-05 -2686210 2.600464341449848e-05 -157687 2.5898933481919213e-05 -282402 2.5898933481919213e-05 -839 2.558180368418143e-05 -2497989 2.558180368418143e-05 -2487072 2.515896395386438e-05 -3028084 2.505325402128512e-05 -2913614 2.505325402128512e-05 -28127 2.4841834156126596e-05 -1358 2.4313284493230283e-05 -674529 2.39961546954925e-05 -29389 2.3573314965175448e-05 -28113 2.31504752348584e-05 -361101 2.31504752348584e-05 -3028083 2.31504752348584e-05 -536441 2.3044765302279134e-05 -2794089 2.283334543712061e-05 -181487 2.283334543712061e-05 -221402 2.2516215639382828e-05 -573 2.2516215639382828e-05 -246787 2.2304795774224302e-05 -3020829 2.2304795774224302e-05 -2585119 2.2304795774224302e-05 -2528037 2.219908584164504e-05 -197614 2.219908584164504e-05 -1853278 2.198766597648652e-05 -502 2.1776246111327992e-05 -1382 2.1776246111327992e-05 -1260 2.1564826246169467e-05 -1217282 2.1459116313590208e-05 -1396 2.124769644843168e-05 -1404 2.124769644843168e-05 -470 2.124769644843168e-05 -2932252 2.114198651585242e-05 +accession reads +GCF_004104465.2 5640030 +GCF_001548235.1 397167 +GCF_000722765.2 345905 +GCF_002005185.1 304591 +GCF_005696695.1 183603 +GCF_002966695.1 151317 +GCF_012273215.1 146281 +GCF_016549395.1 137716 +GCF_008253725.1 128664 +GCF_900477945.1 119921 +GCF_946902905.1 105212 +GCF_032163505.1 100559 +GCF_002763695.1 96316 +GCF_013394695.1 95252 +GCF_940796315.1 91587 +GCF_001587175.1 78633 +GCF_900636505.1 71000 +GCF_000479315.1 67573 +GCF_024346585.1 51966 +GCF_017753665.1 49793 +GCF_001262035.1 44321 +GCF_019931005.1 42682 +GCF_018127745.1 42679 +GCF_001553685.1 41880 +GCF_003627135.1 38044 +GCF_032340315.1 35973 +GCF_026057735.1 34475 +GCF_003627155.1 33681 +GCF_009731465.1 32229 +GCF_037076355.1 30095 +GCF_019334785.1 29825 +GCF_018128305.1 29423 +GCF_021497965.1 29350 +GCF_008727815.1 26965 +GCF_000001405.40 23305 +GCF_034134805.1 22762 +GCF_024205685.1 21868 +GCF_030008055.1 19969 +GCF_034137685.1 19296 +GCF_000221985.1 18134 +GCF_900186995.1 17207 +GCF_020735905.1 16993 +GCF_016127115.1 15853 +GCF_900637555.1 15709 +GCF_900120245.1 15612 +GCF_010443215.1 15000 +GCF_006228325.1 14650 +GCF_030644385.1 14491 +GCF_017798005.1 13977 +GCF_029691405.1 13945 +GCF_018127725.1 13206 +GCF_002998595.1 12167 +GCF_900636745.1 11109 +GCF_030644365.1 10945 +GCF_900636365.1 10580 +GCF_037963785.1 10578 +GCF_002355895.1 10539 +GCF_003351545.1 9942 +GCF_002094955.1 9870 +GCF_900475505.1 8659 +GCF_026810185.1 8644 +GCF_027945475.1 8449 +GCF_013267835.1 7627 +GCF_009730295.1 7290 +GCF_024730685.1 6852 +GCF_001683375.1 6703 +GCF_010587025.1 6656 +GCF_019334725.1 6361 +GCF_019552345.1 5876 +GCF_946902045.1 5172 +GCF_002302415.1 5132 +GCF_920939465.1 5035 +GCF_900637515.1 5002 +GCF_019334745.1 5000 +GCF_023822465.1 4348 +GCF_900478185.1 4296 +GCF_013393365.1 4252 +GCF_029011355.1 4218 +GCF_003963555.1 4119 +GCF_014596425.2 4064 +GCF_037911965.1 3998 +GCF_016887735.2 3897 +GCF_003589745.1 3811 +GCF_003019755.1 3456 +GCF_013394715.1 3279 +GCF_037911955.1 3064 +GCF_008330025.1 3046 +GCF_001274535.1 3028 +GCF_013267415.1 2871 +GCF_008330925.1 2822 +GCF_003033925.1 2642 +GCF_018406505.1 2560 +GCF_013267735.1 2527 +GCF_011801285.1 2463 +GCF_022749515.1 2456 +GCF_002849795.1 2342 +GCF_019930845.1 2263 +GCF_005221285.1 2203 +GCF_032342915.1 2153 +GCF_016694895.1 2007 +GCF_002356055.1 1763 +GCF_016127855.1 1755 +GCF_009730375.1 1749 +GCF_020097435.1 1712 +GCF_009867035.2 1618 +GCF_019551945.1 1592 +GCF_001262055.1 1586 +GCF_037889265.1 1548 +GCF_019930905.1 1511 +GCF_000783815.2 1511 +GCF_018127845.1 1476 +GCF_036323475.1 1444 +GCF_002082765.1 1432 +GCF_002302615.1 1426 +GCF_018128205.1 1319 +GCF_018289315.1 1285 +GCF_020097375.1 1235 +GCF_037967965.1 1190 +GCF_032387735.1 1190 +GCF_002302595.1 1153 +GCF_020735385.1 1083 +GCF_035666155.1 1082 +GCF_900636445.1 1081 +GCF_900637655.1 1054 +GCF_900475315.1 1039 +GCF_014334035.1 935 +GCF_000848885.1 908 +GCF_038424135.1 884 +GCF_002763715.1 882 +GCF_900637975.1 868 +GCF_027474965.1 844 +GCF_022845675.1 823 +GCF_029773625.1 822 +GCF_900638305.1 820 +GCF_016127875.1 809 +GCF_001298465.1 807 +GCF_002302565.1 804 +GCF_018986875.1 799 +GCF_900637315.1 789 +GCF_900187285.1 786 +GCF_900476255.1 771 +GCF_003351565.1 760 +GCF_030517085.1 759 +GCF_004124015.1 748 +GCF_000742795.1 737 +GCF_022845615.1 735 +GCF_003390995.1 732 +GCF_032451715.1 700 +GCF_943181435.1 698 +GCF_026811325.1 694 +GCF_900637305.1 691 +GCF_024760065.1 664 +GCF_018127765.1 628 +GCF_032611355.1 622 +GCF_000921895.1 619 +GCF_020714665.1 614 +GCF_014054985.1 578 +GCF_009828705.1 557 +GCF_900636465.1 549 +GCF_018137985.1 545 +GCF_011455695.1 541 +GCF_003265305.2 528 +GCF_032452855.1 520 +GCF_018128125.1 503 +GCF_024205305.1 492 +GCF_036320655.1 491 +GCF_963931395.1 488 +GCF_029991125.1 447 +GCF_016117815.1 436 +GCF_900475365.1 423 +GCF_020162275.1 423 +GCF_007975365.1 421 +GCF_009670965.2 421 +GCF_003595525.1 419 +GCF_030517105.1 416 +GCF_030219305.1 412 +GCF_020736165.1 411 +GCF_027474865.2 410 +GCF_027923645.1 409 +GCF_900699785.1 406 +GCF_037911825.1 401 +GCF_018127805.1 397 +GCF_030758955.1 392 +GCF_900187085.1 375 +GCF_018128225.1 370 +GCF_038630745.1 368 +GCF_928852565.1 368 +GCF_002073815.2 366 +GCF_963360645.1 361 +GCF_900636525.1 358 +GCF_037966635.1 357 +GCF_005696855.1 351 +GCF_015356115.1 351 +GCF_030053635.1 350 +GCF_029773605.1 344 +GCF_022846055.1 341 +GCF_023035175.1 333 +GCF_030759015.1 330 +GCF_004801515.1 329 +GCF_001708305.1 328 +GCF_002999135.1 323 +GCF_902141225.1 321 +GCF_001444445.1 316 +GCF_016127595.1 308 +GCF_039519245.1 305 +GCF_006385135.1 302 +GCF_026967615.1 299 +GCF_014541205.1 298 +GCF_900636575.1 296 +GCF_963677685.1 295 +GCF_008831345.1 294 +GCF_022024035.1 287 +GCF_017639855.1 285 +GCF_002998435.1 284 +GCF_002209445.1 283 +GCF_002849775.1 281 +GCF_030408675.1 280 +GCF_963667135.1 277 +GCF_004803695.1 276 +GCF_006770445.1 274 +GCF_032594915.1 272 +GCF_900635775.1 269 +GCF_033814055.1 269 +GCF_001598035.1 268 +GCF_020550085.1 264 +GCF_016888945.1 262 +GCF_005848825.1 261 +GCF_004803915.1 256 +GCF_900636885.1 256 +GCF_011612265.2 255 +GCF_006542665.1 254 +GCF_008369705.1 253 +GCF_019380255.1 251 +GCF_030517065.1 250 +GCF_036209505.1 245 +GCF_007990545.2 241 +GCF_022024075.1 236 +GCF_020735565.1 235 +GCF_003860605.1 234 +GCF_951229915.1 233 +GCF_009792335.1 233 +GCF_008728395.1 232 +GCF_032595075.1 232 +GCF_035658435.1 230 +GCF_027594765.1 228 +GCF_028335765.1 226 +GCF_032594935.1 226 +GCF_013009555.1 225 +GCF_003860485.1 223 +GCF_018289135.1 223 +GCF_027474505.1 222 +GCF_025914295.1 220 +GCF_020091405.1 217 +GCF_023204875.1 209 +GCF_002998535.1 208 +GCF_016127355.1 207 +GCF_023361095.1 207 +GCF_003086355.1 205 +GCF_018986735.1 205 +GCF_018389405.1 204 +GCF_900095795.1 204 +GCF_008805035.1 204 +GCF_900604385.1 202 +GCF_019551475.1 202 +GCF_013377195.1 200 +GCF_022919455.1 200 +GCF_018127985.1 200 diff --git a/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS054569.tsv b/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS054569.tsv index c541a38..03e107e 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS054569.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS054569.tsv @@ -1,375 +1,363 @@ -taxon seq_abundance -28037 0.2695292247293513 -1313 0.1466584525540416 -729 0.0796890731953098 -1303 0.059429756869718 -1379 0.055191721859714 -257758 0.0344393008317004 -2819619 0.0311509330297608 -2598453 0.026567144351995 -1433513 0.0263234938811166 -726 0.021154707623734 -735 0.018012616085961 -28449 0.0154497183671398 -3077584 0.0119778872419583 -423477 0.0112404872063619 -2663009 0.009662724121891 -727 0.0091740259784925 -712633 0.0082642327557373 -113107 0.0063654357248553 -1305 0.0059204807405426 -2759692 0.0058842609749114 -712310 0.0048316307535688 -84135 0.004234380790326 -1902136 0.0040908989294426 -33053 0.0033804756332332 -9606 0.0033379147216903 -172042 0.0032592415215654 -2972784 0.0031937879985107 -490 0.0030918997557261 -712623 0.0029318664292426 -137732 0.0028679175848789 -47671 0.0028308380028528 -1660 0.0028277211684216 -652716 0.0028241744257931 -2972775 0.002703477699372 -1019 0.0026946645813253 -1304 0.0025764398270393 -29391 0.0025016358006911 -1302 0.002352135225044 -3038077 0.0022367048740411 -2576376 0.0021313773656773 -45634 0.0018870820325027 -712435 0.0018616099718066 -29466 0.0018419416717754 -46124 0.0018048620897493 -46125 0.0017984134667883 -488 0.00176004416017 -487 0.0016810485288971 -1318 0.0016585858255828 -1759399 0.0016440764239204 -1307 0.0016004407418839 -712357 0.0015721742779046 -1311 0.001535847035224 -68892 0.0015332675860396 -484 0.0014420195711407 -3077590 0.0013830146710471 -495 0.0013797903595666 -43675 0.0013634538480652 -1871109 0.0013573276562522 -28132 0.0012737105118572 -1156431 0.0012137383183195 -1328 0.0011554857575713 -33033 0.0009804056441787 -28131 0.0009526765654462 -684066 0.0008860407948486 -732 0.0008632556603862 -1334 0.0008349891964069 -860 0.0008179003455602 -2820817 0.0008005965406147 -2545799 0.0007640543438354 -2047 0.0007245027896742 -496 0.0007234280191807 -2382163 0.0007098859109625 -1338 0.0007018251322612 -1234680 0.0006919372437209 -327575 0.0006818344010819 -1583098 0.0006783951355027 -61592 0.0006660352748274 -1343 0.000657652064978 -2682456 0.0006296005550974 -76860 0.0005997219353779 -851 0.0005971424861934 -3098076 0.0005913387255285 -3059028 0.0005833854238765 -1308 0.0005757545533726 -1309 0.0005671563894246 -2490855 0.0005586657025258 -76857 0.000551679694318 -43768 0.0005451235943076 -2610896 0.0005107309385153 -28133 0.0005019178204686 -837 0.0004765532368218 -1017 0.0004693522745153 -3059030 0.0004580671843334 -3077723 0.0004547353958035 -2899133 0.0004521559466191 -544580 0.0004490391121879 -1655 0.0004370016826606 -1336 0.0004321652154398 -486 0.0004286184728113 -199 0.0004229221891957 -3098075 0.0004157212268892 -2708117 0.0004143240252476 -1785995 0.0004092726039281 -712150 0.0004057258612995 -409322 0.0004028239809671 -2682455 0.0004005669629307 -617123 0.0003959454498086 -2866570 0.0003816510022449 -718 0.0003815435251956 -75985 0.0003677864628787 -715 0.0003612303628683 -39778 0.0003581135284371 -357276 0.0003567163267955 -72 0.0003542443546605 -189834 0.0003522022907228 -483 0.0003312442660994 -739 0.0003182395431279 -1750 0.0003156600939435 -28135 0.0003045899578603 -706438 0.0003019030316266 -2789425 0.0002991086283435 -76859 0.000298356288998 -28124 0.0002898656020993 -712710 0.0002872861529149 -1018 0.0002814823922499 -714 0.0002801926676577 -33040 0.0002740664758447 -85404 0.0002737440446966 -1701811 0.0002663281282914 -78535 0.0002652533577979 -1566990 0.0002564402397512 -249188 0.0002485944151485 -485 0.0002412859757927 -820 0.0002345149216836 -1825069 0.0002338700593875 -1888195 0.0002333326741407 -109328 0.0002311831331537 -1316596 0.0002297859315121 -2718 0.0002236597396991 -1547448 0.0002218326298602 -1056807 0.0002218326298602 -12402 0.0002197905659225 -85402 0.0002169961626394 -82348 0.0002150615757511 -1314 0.0002131269888627 -46506 0.0002039914396679 -2841264 0.0002033465773718 -747 0.0002018418986809 -2937985 0.0001974353396575 -1335 0.0001941035511276 -1501662 0.0001907717625978 -371601 0.000186257726525 -539 0.000182281075699 -29394 0.0001814212593042 -738 0.0001797016265146 -1177574 0.0001781969478237 -3058373 0.0001716408478133 -28116 0.0001699212150237 -1345 0.0001698137379743 -1585976 0.0001688464445302 -155615 0.0001664819494445 -2770636 0.00015562676746 -204 0.0001542295658185 -111844 0.0001487482363016 -1917441 0.0001472435576107 -2021971 0.0001462762641665 -46503 0.0001445566313769 -2781599 0.0001438042920314 -1329 0.0001368182838236 -644007 0.0001359584674288 -197575 0.0001330565870963 -1349 0.0001321967707015 -1853278 0.0001304771379119 -1839799 0.0001292948903691 -315405 0.0001291874133197 -2598457 0.0001282201198756 -589437 0.0001275752575794 -2497989 0.0001272528264314 -254839 0.0001261780559379 -1852377 0.0001255331936418 -34085 0.000122846267408 -2030797 0.0001227387903587 -505 0.0001215565428158 -712122 0.0001212341116677 -39777 0.0001171499837924 -47735 0.0001171499837924 -285729 0.0001152153969041 -1340 0.0001129583788677 -1310 0.000112743424769 -158 0.000110271452634 -1656 0.0001096265903378 -730 0.0001057574165612 -2866573 0.0001048976001664 -69710 0.0001035003985248 -2840371 0.0001031779673768 -508451 0.0001011359034391 -143361 9.82340231067058e-05 -3028083 9.82340231067058e-05 -655307 9.737420671189874e-05 -2040624 9.683682146514434e-05 -400065 9.511718867553024e-05 -1326 9.46872804781267e-05 -461393 9.436484933007404e-05 -51049 9.40424181820214e-05 -1814128 9.361250998461787e-05 -29389 9.329007883656524e-05 -28129 9.318260178721436e-05 -2686210 9.318260178721436e-05 -492 9.006576735603879e-05 -1280 8.802370341837205e-05 -197614 8.673397882616147e-05 -2664091 8.555173128330176e-05 -1348 8.544425423395088e-05 -728 8.522930013524911e-05 -3020829 8.307975914823148e-05 -28901 8.297228209888061e-05 -248315 8.221994275342443e-05 -750 8.17900345560209e-05 -2572088 7.899563127289798e-05 -817 7.856572307549446e-05 -123824 7.802833782874005e-05 -1346 7.802833782874005e-05 -40542 7.7168521433933e-05 -1432056 7.684609028588035e-05 -157339 7.673861323652948e-05 -149016 7.609375094042419e-05 -28125 7.59862738910733e-05 -157687 7.566384274302066e-05 -2666100 7.54488886443189e-05 -361101 7.426664110145919e-05 -824 7.168719191703804e-05 -2709396 7.147223781833627e-05 -157688 7.050494437417833e-05 -230709 6.996755912742393e-05 -2912188 6.975260502872217e-05 -712471 6.964512797937128e-05 -47678 6.889278863391512e-05 -52773 6.771054109105541e-05 -554406 6.749558699235365e-05 -1735111 6.749558699235365e-05 -712116 6.738810994300277e-05 -2490633 6.72806328936519e-05 -28112 6.631333944949396e-05 -254785 6.534604600533602e-05 -58231 6.351893616637104e-05 -1032623 6.341145911702015e-05 -326522 6.115444108065164e-05 -194197 6.0294624685844586e-05 -1853276 5.986471648844106e-05 -2679995 5.868246894558136e-05 -716 5.814508369882696e-05 -818 5.782265255077431e-05 -1705617 5.707031320531813e-05 -2093824 5.707031320531813e-05 -1747 5.502824926765138e-05 -502 5.481329516894962e-05 -253 5.470581811959874e-05 -162156 5.4168432872844334e-05 -3028082 5.373852467544081e-05 -76123 5.373852467544081e-05 -1316593 5.2771231231282873e-05 -203 5.180393778712494e-05 -2173853 5.180393778712494e-05 -731 5.148150663907229e-05 -562 5.094412139231788e-05 -267212 5.072916729361612e-05 -1701814 5.072916729361612e-05 -1341 5.051421319491436e-05 -28118 5.019178204686171e-05 -1884263 5.008430499751083e-05 -28137 5.008430499751083e-05 -2563662 4.954691975075642e-05 -2004710 4.868710335594937e-05 -2827233 4.868710335594937e-05 -504 4.8472149257247606e-05 -114527 4.825719515854585e-05 -53419 4.750485581308967e-05 -470565 4.739737876373879e-05 -867595 4.718242466503703e-05 -28123 4.707494761568615e-05 -393921 4.696747056633527e-05 -246787 4.67525164676335e-05 -3028084 4.67525164676335e-05 -2487072 4.664503941828262e-05 -712411 4.6537562368931735e-05 -2911526 4.6322608270229976e-05 -328814 4.6215131220879097e-05 -2748316 4.6215131220879097e-05 -2713414 4.600017712217733e-05 -821 4.5785223023475565e-05 -1659 4.5677745974124686e-05 -157692 4.524783777672116e-05 -712362 4.524783777672116e-05 -150055 4.50328836780194e-05 -109472 4.3528204987107055e-05 -823 4.331325088840529e-05 -1598 4.299081974035265e-05 -666 4.26683885923e-05 -720 4.223848039489648e-05 -762 4.21310033455456e-05 -1811193 4.191604924684383e-05 -1659192 4.1701095148142064e-05 -1496 4.148614104944031e-05 -2955582 4.127118695073854e-05 -36874 4.094875580268589e-05 -120682 4.062632465463325e-05 -1796644 4.03038935065806e-05 -103810 4.03038935065806e-05 -753 3.987398530917708e-05 -2778911 3.912164596372091e-05 -28091 3.901416891437002e-05 -754 3.8046875470212094e-05 -1448274 3.793939842086121e-05 -1815583 3.729453612475592e-05 -1643513 3.718705907540504e-05 -640030 3.718705907540504e-05 -1931275 3.707958202605416e-05 -536441 3.643471972994887e-05 -165179 3.503751808838741e-05 -28128 3.460760989098388e-05 -1491 3.3855270545527706e-05 -1111760 3.3855270545527706e-05 -1352 3.3747793496176827e-05 -2583851 3.364031644682595e-05 -589436 3.353283939747506e-05 -1396 3.2350591854615366e-05 -2929799 3.21356377559136e-05 -254 3.202816070656272e-05 -2528037 3.192068365721184e-05 -1470200 3.15982525091592e-05 -51161 3.127582136110655e-05 -2767188 3.052348201565038e-05 -28127 3.0093573818246853e-05 -505341 2.998609676889597e-05 -2792859 2.934123447279068e-05 -328813 2.8911326275387155e-05 -493 2.858889512733451e-05 -1265445 2.8158986929930985e-05 -2936804 2.762160168317657e-05 -1179777 2.740664758447481e-05 -2912675 2.665430823901864e-05 -338188 2.665430823901864e-05 -322095 2.6331877090965997e-05 -1643512 2.611692299226423e-05 -1358 2.590196889356247e-05 -1117645 2.5579537745509824e-05 -1701828 2.5579537745509824e-05 -2133944 2.547206069615894e-05 -2917790 2.536458364680806e-05 -2594269 2.525710659745718e-05 -397865 2.5042152498755416e-05 -1493872 2.4934675449404533e-05 -2755405 2.4934675449404533e-05 -1609531 2.4612244301351888e-05 -573 2.407485905459748e-05 -157673 2.407485905459748e-05 -97481 2.39673820052466e-05 -216816 2.332251970914131e-05 -1539298 2.3215042659790428e-05 -1351 2.3107565610439548e-05 -2585118 2.2785134462386903e-05 -712361 2.2570180363685137e-05 -1871047 2.2570180363685137e-05 -52227 2.2570180363685137e-05 -59310 2.2140272166281613e-05 -1363 2.203279511693073e-05 -1382 2.203279511693073e-05 -2820270 2.192531806757985e-05 -2920939 2.1817841018228967e-05 -28188 2.1817841018228967e-05 -1392 2.1710363968878085e-05 -2479767 2.1602886919527205e-05 -250 2.149540987017632e-05 -69823 2.149540987017632e-05 +accession reads +GCF_000722765.2 2276719 +GCF_008253725.1 1368389 +GCF_004104465.2 741232 +GCF_012273215.1 625447 +GCF_016549395.1 522068 +GCF_037076355.1 358332 +GCF_024346585.1 268097 +GCF_000221985.1 259815 +GCF_009731465.1 236124 +GCF_003627155.1 229827 +GCF_900477945.1 194562 +GCF_008330025.1 167394 +GCF_024205685.1 142781 +GCF_032340315.1 104663 +GCF_026057735.1 103949 +GCF_002763695.1 92537 +GCF_002966695.1 88663 +GCF_001553685.1 77384 +GCF_900636505.1 57600 +GCF_940796315.1 54854 +GCF_900475505.1 54313 +GCF_002998595.1 44708 +GCF_029011355.1 38758 +GCF_002355895.1 36995 +GCF_000001405.40 33458 +GCF_019334725.1 31313 +GCF_019334745.1 30325 +GCF_946902905.1 30111 +GCF_009730295.1 28787 +GCF_013394695.1 27637 +GCF_017753665.1 26282 +GCF_005696695.1 26263 +GCF_900637555.1 26223 +GCF_020735385.1 26215 +GCF_002302595.1 25088 +GCF_946902045.1 24906 +GCF_002094955.1 22599 +GCF_026810185.1 22371 +GCF_037963785.1 22118 +GCF_029691405.1 21083 +GCF_006228325.1 19178 +GCF_002005185.1 18916 +GCF_013267415.1 18739 +GCF_018127745.1 17340 +GCF_900478185.1 16943 +GCF_019931005.1 16678 +GCF_016887735.2 15934 +GCF_001683375.1 15921 +GCF_013267835.1 15377 +GCF_001587175.1 15350 +GCF_032163505.1 14906 +GCF_001274535.1 14588 +GCF_021497965.1 13833 +GCF_020097435.1 13643 +GCF_019552345.1 13508 +GCF_005221285.1 13147 +GCF_001548235.1 12794 +GCF_032342915.1 12755 +GCF_014596425.2 12506 +GCF_000479315.1 11503 +GCF_008330925.1 11126 +GCF_003351545.1 10956 +GCF_020735905.1 10742 +GCF_027474965.1 9835 +GCF_002763715.1 9295 +GCF_037911965.1 8897 +GCF_018127725.1 8271 +GCF_001262035.1 8012 +GCF_017798005.1 7444 +GCF_009730375.1 7124 +GCF_013267735.1 6739 +GCF_003627135.1 6597 +GCF_019334785.1 6483 +GCF_002302615.1 6361 +GCF_030408675.1 6200 +GCF_002356055.1 5840 +GCF_013393365.1 5783 +GCF_034134805.1 5749 +GCF_021222645.1 5689 +GCF_900636445.1 5646 +GCF_011801285.1 5589 +GCF_030644365.1 5399 +GCF_030008055.1 5177 +GCF_035666155.1 5160 +GCF_011612265.2 5079 +GCF_019551945.1 5061 +GCF_008831345.1 5045 +GCF_018127845.1 4933 +GCF_008727815.1 4910 +GCF_003019755.1 4855 +GCF_037911955.1 4850 +GCF_023822465.1 4436 +GCF_002302415.1 4366 +GCF_030644385.1 4253 +GCF_016127875.1 4190 +GCF_016127855.1 4184 +GCF_027945475.1 4155 +GCF_032387735.1 4150 +GCF_900636745.1 4126 +GCF_001298465.1 3899 +GCF_002209445.1 3852 +GCF_034137685.1 3775 +GCF_018128305.1 3767 +GCF_005696855.1 3737 +GCF_003589745.1 3675 +GCF_018406505.1 3608 +GCF_003351565.1 3565 +GCF_920939465.1 3558 +GCF_013009555.1 3412 +GCF_003101015.1 3284 +GCF_020162275.1 3268 +GCF_900637515.1 3246 +GCF_015219785.1 3204 +GCF_016127115.1 2976 +GCF_900475315.1 2925 +GCF_900637655.1 2855 +GCF_016694895.1 2760 +GCF_037889265.1 2736 +GCF_020097375.1 2714 +GCF_038424135.1 2655 +GCF_003033925.1 2642 +GCF_020736165.1 2636 +GCF_024730685.1 2563 +GCF_900636365.1 2502 +GCF_011455695.1 2497 +GCF_003261035.1 2475 +GCF_016117815.1 2331 +GCF_900186995.1 2302 +GCF_007975365.1 2256 +GCF_001708305.1 2242 +GCF_037911825.1 2169 +GCF_001041795.1 2150 +GCF_001553915.1 2147 +GCF_002999135.1 2134 +GCF_007990365.1 2108 +GCF_032611355.1 2090 +GCF_023035175.1 2088 +GCF_900637305.1 2076 +GCF_019973735.1 2026 +GCF_900636465.1 2010 +GCF_004124015.1 1970 +GCF_020091485.1 1966 +GCF_001882175.1 1947 +GCF_900636525.1 1921 +GCF_010443215.1 1833 +GCF_018289135.1 1747 +GCF_001623565.1 1738 +GCF_943181435.1 1732 +GCF_002849795.1 1715 +GCF_007197715.1 1696 +GCF_000742795.1 1670 +GCF_900475025.1 1588 +GCF_030644325.1 1588 +GCF_029991125.1 1572 +GCF_022749515.1 1524 +GCF_019930845.1 1495 +GCF_036323475.1 1475 +GCF_003595525.1 1473 +GCF_014541205.1 1455 +GCF_018986875.1 1446 +GCF_900699785.1 1436 +GCF_009828705.1 1419 +GCF_000848885.1 1397 +GCF_018137985.1 1362 +GCF_900636575.1 1350 +GCF_002073815.2 1334 +GCF_021654515.1 1298 +GCF_029773625.1 1267 +GCF_019930905.1 1209 +GCF_000886415.1 1205 +GCF_951229915.1 1184 +GCF_900120245.1 1169 +GCF_016906085.1 1154 +GCF_027474865.2 1154 +GCF_024759225.1 1141 +GCF_005697565.1 1141 +GCF_001278845.1 1127 +GCF_014844995.1 1105 +GCF_035658435.1 1100 +GCF_002849775.1 1100 +GCF_009670965.2 1087 +GCF_014054985.1 1073 +GCF_900475365.1 1053 +GCF_900187245.1 1053 +GCF_002082765.1 1048 +GCF_024181205.1 1027 +GCF_037967965.1 1000 +GCF_032594935.1 988 +GCF_900637315.1 983 +GCF_900637975.1 978 +GCF_002243385.1 970 +GCF_916618745.1 968 +GCF_001598035.1 966 +GCF_018128205.1 951 +GCF_900187085.1 944 +GCF_017894345.1 940 +GCF_900475595.1 914 +GCF_027474505.1 914 +GCF_016127595.1 892 +GCF_000783815.2 879 +GCF_030644185.1 875 +GCF_004519515.1 862 +GCF_009792335.1 861 +GCF_017639855.1 822 +GCF_029774155.1 794 +GCF_024181625.1 763 +GCF_030517085.1 761 +GCF_900636885.1 756 +GCF_000521605.1 754 +GCF_029773605.1 740 +GCF_026811325.1 739 +GCF_902141225.1 715 +GCF_011455495.1 714 +GCF_025152665.1 701 +GCF_023161985.2 701 +GCF_007990545.2 699 +GCF_018289315.1 697 +GCF_001885145.1 692 +GCF_030219305.1 691 +GCF_038630745.1 682 +GCF_001190745.1 668 +GCF_900187285.1 664 +GCF_019774635.1 658 +GCF_007990525.1 651 +GCF_018127805.1 649 +GCF_028335765.1 643 +GCF_032452855.1 630 +GCF_024205305.1 629 +GCF_007990635.1 626 +GCF_002237445.1 626 +GCF_013394715.1 621 +GCF_017161265.1 618 +GCF_001262055.1 617 +GCF_036209505.1 601 +GCF_009684715.1 596 +GCF_017750945.1 578 +GCF_024760065.1 578 +GCF_032594915.1 570 +GCF_025914115.1 569 +GCF_963967315.1 560 +GCF_022404755.1 548 +GCF_003351945.1 546 +GCF_900187175.1 534 +GCF_001278825.1 529 +GCF_008369705.1 528 +GCF_014334035.1 522 +GCF_024181185.1 520 +GCF_013377275.1 513 +GCF_032451715.1 511 +GCF_001444445.1 507 +GCF_003390995.1 507 +GCF_900635785.1 501 +GCF_002998835.1 495 +GCF_018866345.1 489 +GCF_009867035.2 485 +GCF_003963555.1 483 +GCF_020736205.1 481 +GCF_963677685.1 478 +GCF_018127765.1 469 +GCF_016415165.1 466 +GCF_008803015.1 464 +GCF_900476255.1 460 +GCF_029339075.1 452 +GCF_036320655.1 449 +GCF_018128125.1 448 +GCF_024181325.1 446 +GCF_009671065.1 446 +GCF_907163105.1 445 +GCF_032595075.1 441 +GCF_001884675.1 438 +GCF_011058315.1 436 +GCF_963693435.1 434 +GCF_001189515.2 432 +GCF_963360645.1 431 +GCF_013394735.1 431 +GCF_024181165.1 427 +GCF_003860605.1 424 +GCF_030253495.1 419 +GCF_008728395.1 417 +GCF_018128245.1 415 +GCF_007990505.1 415 +GCF_020091405.1 413 +GCF_002998925.1 411 +GCF_014898075.1 402 +GCF_013377195.1 402 +GCF_900635775.1 400 +GCF_000803625.1 399 +GCF_011612705.1 399 +GCF_900636515.1 394 +GCF_037966635.1 392 +GCF_024652885.1 388 +GCF_001683335.1 388 +GCF_018866205.1 387 +GCF_009734245.1 384 +GCF_016127355.1 384 +GCF_033814055.1 380 +GCF_010587025.1 370 +GCF_020714665.1 370 +GCF_034270385.1 363 +GCF_030517065.1 362 +GCF_900638305.1 359 +GCF_024181085.1 356 +GCF_015356115.1 356 +GCF_002216145.1 356 +GCF_003086355.1 348 +GCF_001717585.1 347 +GCF_003860485.1 338 +GCF_001642085.1 334 +GCF_028743775.1 329 +GCF_002355215.1 327 +GCF_900186835.1 325 +GCF_002327085.1 316 +GCF_006088815.1 305 +GCF_900638345.1 302 +GCF_023611925.1 300 +GCF_022811665.1 297 +GCF_020735565.1 297 +GCF_001721905.1 294 +GCF_030848225.1 286 +GCF_023896015.1 280 +GCF_014353055.1 278 +GCF_022845675.1 278 +GCF_030517105.1 276 +GCF_016657085.1 274 +GCF_900638385.1 274 +GCF_000921895.1 274 +GCF_014623485.1 273 +GCF_020550085.1 273 +GCF_038269515.1 269 +GCF_002770595.1 268 +GCF_000327395.2 265 +GCF_026684175.1 263 +GCF_001921945.1 257 +GCF_008805035.1 249 +GCF_003265305.2 247 +GCF_005848555.1 247 +GCF_024181145.1 246 +GCF_023611905.1 245 +GCF_028463985.1 242 +GCF_014702245.1 241 +GCF_029866925.1 240 +GCF_026015965.1 239 +GCF_022845615.1 238 +GCF_014055025.1 236 +GCF_022354665.1 234 +GCF_963360665.1 231 +GCF_003815835.1 228 +GCF_037076375.1 226 +GCF_007362475.1 224 +GCF_000775995.1 221 +GCF_013377295.1 220 +GCF_963931395.1 219 +GCF_029636405.1 216 +GCF_034051595.1 215 +GCF_013874375.1 215 +GCF_022354445.1 215 +GCF_006542665.1 213 +GCF_900475675.1 213 +GCF_022488405.1 212 +GCF_928852565.1 211 +GCF_027594765.1 209 +GCF_020084865.1 202 diff --git a/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS056042.tsv b/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS056042.tsv index 230d2c1..07797c2 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS056042.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/buccal_mucosa/SRS056042.tsv @@ -1,160 +1,163 @@ -taxon seq_abundance -729 0.124738487780946 -28037 0.1068493809930579 -1303 0.0745294785262541 -43675 0.0530510538691777 -1313 0.0371738366131811 -544580 0.0356859741221544 -29466 0.0319629758853984 -712116 0.0306128041729663 -199 0.0298174059859395 -1302 0.0264459871158861 -9606 0.0222016354456168 -2819619 0.0156018356988074 -33053 0.0135150851610781 -1305 0.012839999304862 -2663009 0.0125378816741594 -28132 0.0125365448704837 -1379 0.0114858171814029 -2820817 0.0110673976309165 -76857 0.0109644637478895 -1655 0.0108535090428084 -1660 0.0107559223744841 -43768 0.0098375382492951 -28449 0.0098375382492951 -1433513 0.0092627126687547 -2682456 0.0087306648058359 -1017 0.0086624878183765 -1318 0.0086598142110251 -2789425 0.0076451802211875 -2047 0.0072428023148092 -652716 0.0069901464201065 -423477 0.0064380465020526 -2598453 0.0063404598337283 -1304 0.0062361891470256 -46124 0.0059581339824851 -29391 0.0057335509649717 -257758 0.0056092282231339 -1019 0.0052790377152421 -712633 0.0049341423669178 -3077584 0.0046707920428098 -47671 0.0046681184354584 -2682455 0.0044943339576206 -113107 0.0044569034547017 -1177574 0.0043218862834585 -726 0.0042884661915666 -470565 0.0041694906644315 -851 0.0041267129468099 -2972784 0.0037550815249721 -712623 0.0037283454514586 -727 0.0036468004272424 -45634 0.0035919914765397 -2708117 0.0034676687347019 -490 0.0034516270905938 -327575 0.0031909503738371 -2759692 0.0031909503738371 -2545799 0.0031815927481074 -172042 0.0031334678157831 -84135 0.0030960373128641 -39777 0.0030612804172966 -68892 0.0029810721967561 -2490855 0.0029503257122155 -39778 0.0029249264423777 -3038077 0.0028086245225939 -157687 0.0027792148417291 -706438 0.0025827047014048 -208479 0.0025746838793507 -461393 0.0025198749286481 -76859 0.0023661425059454 -860 0.002363468898594 -496 0.002149580310486 -712150 0.0020987817708103 -28116 0.0020894241450806 -28133 0.002046646427459 -2866570 0.0019985214951347 -1902136 0.0018260738209725 -1747 0.001803348158486 -732 0.0017445287967563 -1759399 0.0017204663305942 -712357 0.001700414275459 -2576376 0.0016950670607563 -739 0.001638921306378 -505 0.0015881227667023 -1018 0.001548018656432 -712362 0.0014998937241077 -821 0.0014597896138375 -3098076 0.0014250327182699 -2610896 0.0013515085161078 -1583098 0.0013354668719997 -554406 0.0012966995654051 -3059028 0.0012726370992429 -1656 0.0012472378294051 -539 0.0012298593816213 -488 0.0012031233081078 -155615 0.0011924288787024 -1328 0.0011710400198916 -589437 0.0011643560015132 -712435 0.0011269254985943 -1156431 0.001124251891243 -712310 0.0011001894250808 -3098075 0.0010667693331889 -1659 0.0010159707935132 -1343 0.0009932451310268 -818 0.0009558146281079 -1311 0.0009157105178376 -28131 0.0008622383708106 -824 0.0008007454017295 -735 0.0007980717943782 -1338 0.0007940613833511 -495 0.0007860405612971 -1316596 0.0007552940767565 -204 0.0007325684142701 -617123 0.0007325684142701 -712122 0.0007111795554593 -3077723 0.0007031587334052 -562 0.0006857802856214 -2899133 0.0006817698745944 -1234680 0.0006229505128647 -46125 0.0006095824761079 -487 0.0006069088687566 -2972775 0.0006015616540539 -114527 0.0006002248503782 -684066 0.0005841832062701 -285729 0.0005627943474593 -2382163 0.0005614575437836 -109328 0.0005534367217296 -1852377 0.0005320478629188 -3077590 0.0005026381820539 -1308 0.0005013013783782 -1307 0.0004972909673512 -2420310 0.0004839229305944 -39491 0.0004759021085404 -28135 0.0004598604644323 -157692 0.0004585236607566 -28129 0.0004491660350269 -3059030 0.0004291139798917 -157688 0.000419756354162 -2162637 0.0004144091394593 -214856 0.0004144091394593 -853 0.0003983674953512 -823 0.0003916834769728 -1056807 0.0003903466732972 -154046 0.0003903466732972 -47678 0.0003890098696215 -28137 0.0003863362622701 -1839799 0.0003849994585945 -1871109 0.0003836626549188 -267212 0.0003783154402161 -2841264 0.0003743050291891 -712538 0.0003676210108107 -69823 0.000366284207135 -712710 0.0003489057593512 -249188 0.0003355377225945 -1334 0.000320832882162 -502 0.0003194960784864 -484 0.0003141488637837 -3058373 0.0002914232012972 -1160721 0.0002900863976215 -1705617 0.0002807287718918 -713030 0.0002780551645404 -718 0.0002700343424864 +accession reads +GCF_004104465.2 93174 +GCF_000722765.2 77486 +GCF_016549395.1 47590 +GCF_001548235.1 40074 +GCF_027945475.1 26599 +GCF_008253725.1 26372 +GCF_002005185.1 23950 +GCF_013394715.1 22821 +GCF_001298465.1 22302 +GCF_026810185.1 20320 +GCF_000001405.40 17639 +GCF_012273215.1 13488 +GCF_024346585.1 11695 +GCF_037911965.1 11572 +GCF_019334725.1 10138 +GCF_900475505.1 9599 +GCF_020735905.1 9365 +GCF_002763695.1 9251 +GCF_016127855.1 8455 +GCF_017798005.1 8300 +GCF_005696695.1 7994 +GCF_024205685.1 7365 +GCF_011612265.2 7363 +GCF_003627155.1 6819 +GCF_013393365.1 6717 +GCF_032163505.1 6588 +GCF_002302415.1 6480 +GCF_016694895.1 5713 +GCF_013267735.1 5414 +GCF_026057735.1 4734 +GCF_009731465.1 4693 +GCF_037076355.1 4604 +GCF_019931005.1 4455 +GCF_002094955.1 4121 +GCF_002302595.1 3951 +GCF_020097435.1 3938 +GCF_000221985.1 3802 +GCF_037963785.1 3712 +GCF_001553685.1 3676 +GCF_001683375.1 3658 +GCF_900637555.1 3485 +GCF_900636505.1 3470 +GCF_032340315.1 3415 +GCF_018406505.1 3406 +GCF_002849795.1 3231 +GCF_900477945.1 3207 +GCF_018128125.1 3119 +GCF_946902905.1 2816 +GCF_013394695.1 2798 +GCF_002966695.1 2785 +GCF_900478185.1 2686 +GCF_037911955.1 2655 +GCF_002209445.1 2595 +GCF_017753665.1 2548 +GCF_002302615.1 2386 +GCF_940796315.1 2383 +GCF_009730375.1 2381 +GCF_019334745.1 2341 +GCF_002082765.1 2276 +GCF_021497965.1 2258 +GCF_030008055.1 2218 +GCF_900637515.1 2161 +GCF_007990545.2 2072 +GCF_009730295.1 1914 +GCF_030644185.1 1878 +GCF_029691405.1 1877 +GCF_024759225.1 1620 +GCF_018128305.1 1576 +GCF_018127845.1 1531 +GCF_920939465.1 1498 +GCF_003390995.1 1349 +GCF_002355895.1 1333 +GCF_001587175.1 1305 +GCF_001262035.1 1302 +GCF_001274535.1 1270 +GCF_016127115.1 1230 +GCF_002234575.2 1225 +GCF_006228325.1 1202 +GCF_014054985.1 1187 +GCF_003019755.1 1174 +GCF_020736165.1 1154 +GCF_018128245.1 1120 +GCF_034134805.1 1097 +GCF_008728395.1 1096 +GCF_008727815.1 1028 +GCF_029011355.1 991 +GCF_007990635.1 968 +GCF_030644365.1 942 +GCF_019930845.1 918 +GCF_013267835.1 886 +GCF_900637975.1 875 +GCF_000479315.1 870 +GCF_018127745.1 848 +GCF_037889265.1 829 +GCF_002998595.1 828 +GCF_034137685.1 814 +GCF_024760065.1 757 +GCF_030253495.1 750 +GCF_037911825.1 742 +GCF_019552345.1 729 +GCF_900636445.1 721 +GCF_021222645.1 720 +GCF_002763715.1 641 +GCF_001190745.1 599 +GCF_008330025.1 596 +GCF_002356055.1 584 +GCF_002999135.1 565 +GCF_012273195.1 557 +GCF_003589745.1 549 +GCF_900699785.1 548 +GCF_032387735.1 545 +GCF_009867035.2 536 +GCF_001278845.1 535 +GCF_003351545.1 533 +GCF_019334785.1 473 +GCF_013267415.1 467 +GCF_011801285.1 463 +GCF_946902045.1 450 +GCF_002998925.1 444 +GCF_018127725.1 437 +GCF_003627135.1 432 +GCF_019551945.1 426 +GCF_008330925.1 421 +GCF_003812445.1 419 +GCF_007990365.1 412 +GCF_900120245.1 397 +GCF_016887735.2 389 +GCF_037967965.1 376 +GCF_032342915.1 375 +GCF_018128205.1 360 +GCF_036323475.1 352 +GCF_007990505.1 342 +GCF_900637655.1 340 +GCF_030644385.1 329 +GCF_022846055.1 314 +GCF_007990525.1 313 +GCF_902388275.1 311 +GCF_002073815.2 310 +GCF_026015965.1 296 +GCF_032452855.1 291 +GCF_963360645.1 289 +GCF_018127765.1 286 +GCF_022749515.1 285 +GCF_014055025.1 284 +GCF_014596425.2 281 +GCF_001746855.1 279 +GCF_025149285.1 275 +GCF_034270385.1 267 +GCF_001189555.1 263 +GCF_003033925.1 261 +GCF_004115325.2 257 +GCF_900186995.1 248 +GCF_016127355.1 238 +GCF_005221285.1 231 +GCF_016696765.1 225 +GCF_030644325.1 217 +GCF_016127595.1 216 +GCF_005121165.3 213 +GCF_001278825.1 210 +GCF_004124015.1 204 +GCF_000723465.1 203 +GCF_001554015.1 201 diff --git a/mess/data/hmp_templates/gut/SRS1041031.tsv b/mess/data/hmp_templates/gut/SRS1041031.tsv index 6405ebe..d389657 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/gut/SRS1041031.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/gut/SRS1041031.tsv @@ -1,420 +1,413 @@ -taxon seq_abundance -820 0.1373141874188233 -47678 0.1325117970012004 -246787 0.1272061697011511 -821 0.0784326080527236 -239935 0.0518959852644093 -165179 0.021380248079659 -818 0.020454712287254 -28116 0.0193918047067499 -454154 0.0191760408326236 -562 0.0182945276595708 -46503 0.0166685548657617 -371601 0.0160992310150067 -823 0.01515099440202 -853 0.0132196213163675 -2714355 0.0117309142320566 -214851 0.0114801444196503 -328814 0.0104304966642523 -33025 0.0104079019222715 -2585118 0.0099799808464478 -301301 0.0099224862447878 -2093857 0.0093145497833238 -2714353 0.0089487907675974 -1680 0.0086969601691826 -1981510 0.0084545705662433 -418240 0.0077658022109326 -649756 0.0071869312861012 -1550024 0.0069785929140343 -2792859 0.0059679820837486 -1737424 0.0055132231219101 -2763672 0.0054557285202501 -169435 0.005434088485677 -292800 0.004725907746411 -1297617 0.0046741413891968 -2479767 0.0046435907521524 -410072 0.0044090509656759 -411483 0.0041026959664248 -88431 0.0040622800195014 -74426 0.0037837176136727 -2860051 0.0036731837115884 -44742 0.0036575901572636 -2528203 0.0036423148387414 -2785531 0.003350174372004 -1160721 0.0032006035448073 -39491 0.0031995427587989 -2518605 0.0030910243501306 -357276 0.0029418778373373 -328813 0.0029369982216983 -817 0.0027953832895653 -2755405 0.002789230730716 -2929495 0.0027288720068331 -28118 0.0026850615446826 -2929488 0.0024760867010106 -2929493 0.0022448353511604 -2929494 0.0021501071606025 -674529 0.0021096912136792 -1288121 0.0020849748996814 -328812 0.0020623801577006 -1496 0.0020167663593357 -39488 0.0020059463420491 -2715212 0.0019360405440898 -2929489 0.0019215077757735 -1681 0.0019102634440836 -2929492 0.0018592396370754 -454155 0.0018380239169056 -2929491 0.0018094887732773 -329854 0.0017631324247064 -2714358 0.0017183672551483 -28026 0.0016636306971103 -208479 0.0016510073436093 -214856 0.001606348252652 -2108523 0.0015054675032449 -39485 0.0014825545254616 -166486 0.0014505187880053 -39486 0.0013233305455877 -2763670 0.0013054032620442 -89014 0.0012687000661506 -2955234 0.0011940207311531 -40520 0.0011720624607774 -33038 0.0011659099019282 -29347 0.0010632258163066 -1472416 0.0010356453800859 -2955232 0.0010254618344045 -2929490 0.0010240828125934 -291644 0.0009664821323326 -556259 0.0008877718105028 -1217282 0.0008703749199636 -397865 0.0008459768417684 -2955233 0.0008424762479404 -154046 0.0008310197590488 -2610895 0.0008111830606901 -84112 0.0007702367207625 -46228 0.0007437170705503 -39496 0.0007289721450323 -53443 0.0007267444944145 -216816 0.0006973607219794 -291645 0.0006644763557163 -2162637 0.0006632034125061 -2707299 0.0006111188194894 -387661 0.0006101641120818 -46506 0.0006048601820393 -333367 0.0005695360079567 -1796613 0.0005495932309971 -626932 0.0005302869256427 -1522 0.0005213763231714 -290053 0.0005020700178169 -28111 0.0004902952931227 -53442 0.0004898709787193 -387090 0.0004784144898276 -1982626 0.0004771415466175 -1335613 0.0004747017387979 -1502 0.0004716254593733 -2650158 0.0004463787523713 -1501392 0.0004385289359085 -45851 0.0004241022461931 -2086584 0.0004069175128556 -9606 0.0004001284824013 -3079303 0.0003931272947453 -2763062 0.0003714872601721 -2763669 0.0003676684305416 -2364787 0.0003536660552296 -3028070 0.0003381785795056 -1352 0.0003294801342361 -2763667 0.0003252369902021 -338188 0.0003125075581003 -2972761 0.0003102799074824 -2831966 0.0003069914708561 -2086585 0.0003009449906078 -2955762 0.0002989294971916 -1307 0.0002967018465738 -2650157 0.0002866243794932 -446660 0.0002835481000686 -3079302 0.000283229864266 -538949 0.0002779259342236 -253239 0.0002761225980092 -544645 0.0002668937597353 -2780922 0.00025872570747 -33043 0.0002572406070581 -195 0.0002560737424487 -33039 0.0002559676638479 -1796616 0.0002511941268097 -168384 0.0002473752971792 -1308 0.0002416470527333 -2922859 0.0002384646947079 -3046383 0.0002341154720731 -1871021 0.0002333729218671 -2585119 0.0002312513498501 -626937 0.0002283872276272 -1042156 0.0002232954547865 -3030016 0.0002228711403831 -1547 0.0002197948609585 -197 0.0002193705465551 -3046382 0.0002113085728906 -1686 0.000210990337088 -3030017 0.0001970940403769 -1155388 0.0001967758045743 -1322 0.0001964575687718 -2041044 0.0001861679444894 -1472417 0.0001799093070394 -2841528 0.0001760904774088 -2025876 0.0001754540058037 -28113 0.0001751357700012 -162156 0.0001746053769969 -623 0.000166861639135 -487173 0.0001602847658824 -100886 0.0001557233860459 -1653434 0.0001543443642348 -1912897 0.0001524349494196 -1470347 0.0001478735695831 -1177574 0.0001445851329567 -28901 0.0001436304255491 -1264 0.0001432061111457 -1491 0.0001424635609398 -376805 0.0001412966963304 -89153 0.0001391751243135 -2068655 0.0001364170806914 -2922858 0.0001328104082625 -28119 0.0001328104082625 -2662363 0.0001277186354218 -3040764 0.0001237937271904 -1529 0.0001232633341862 -2507160 0.0001213539193709 -2877527 0.0001182776399463 -305719 0.0001071393868572 -1099853 0.0001042752646342 -2766537 0.0001031084000249 -2709410 0.0001024719284198 -1796635 0.0001020476140164 -2576756 0.000101623299613 -2666138 0.000100244277802 -2582419 9.981996339863957e-05 -2564099 9.897133459184986e-05 -2779518 9.886525599100114e-05 -33035 9.801662718421144e-05 -2507162 9.5576819364691e-05 -1736 9.483426915875002e-05 -2878202 9.133367533074247e-05 -1623 8.995465351970919e-05 -1805478 8.92121033137682e-05 -573 8.677229549424778e-05 -1685 8.666621689339907e-05 -3059030 8.560543088491193e-05 -927786 8.486288067897094e-05 -158 8.274130866199666e-05 -1304 8.168052265350952e-05 -1532 8.115012964926595e-05 -3070215 7.871032182974555e-05 -28132 7.775561442210712e-05 -2927224 7.552796380428413e-05 -28131 7.361854898900729e-05 -147206 7.308815598476372e-05 -1929477 7.245168437967144e-05 -1492 7.13908983711843e-05 -2966552 7.096658396778945e-05 -1280 7.06483481652433e-05 -2093856 7.011795516099974e-05 -1907662 6.948148355590745e-05 -1776384 6.852677614826903e-05 -287 6.619304692959733e-05 -1520 6.587481112705119e-05 -492670 6.311676750498464e-05 -84030 6.29046103032872e-05 -1396 6.29046103032872e-05 -1197717 6.184382429480007e-05 -2003188 6.163166709310265e-05 -29375 5.9934409479523225e-05 -1738647 5.834323046679252e-05 -1501 5.66459728532131e-05 -1423 5.653989425236439e-05 -3036945 5.611557984896953e-05 -97138 5.558518684472596e-05 -303 5.494871523963368e-05 -438033 5.4842636638784965e-05 -2144175 5.452440083623883e-05 -185007 5.303930042435684e-05 -105841 5.293322182350812e-05 -3045146 5.282714322265941e-05 -1318 5.208459301671841e-05 -1515 5.1554200012474846e-05 -638849 5.070557120568513e-05 -477666 5.0387335403139e-05 -1509 4.9963020999744135e-05 -43305 4.985694239889542e-05 -3070656 4.9644785197198e-05 -884684 4.900831359210572e-05 -1002546 4.837184198701343e-05 -1406 4.7735370381921154e-05 -2583452 4.73110559785263e-05 -1229621 4.720497737767758e-05 -1351 4.709889877682887e-05 -84032 4.699282017598016e-05 -831 4.699282017598016e-05 -36845 4.65685057725853e-05 -565560 4.65685057725853e-05 -1561 4.614419136919044e-05 -2690837 4.603811276834173e-05 -133926 4.508340536070331e-05 -2779519 4.4977326759854593e-05 -69823 4.4022619352216174e-05 -837 4.4022619352216174e-05 -29348 4.4022619352216174e-05 -2709390 4.359830494882132e-05 -2994078 4.338614774712389e-05 -39950 4.328006914627518e-05 -3070814 4.274967614203161e-05 -238834 4.2643597541182894e-05 -901 4.2007125936090616e-05 -1852373 4.179496873439319e-05 -3050072 4.105241852845219e-05 -1727145 4.073418272590605e-05 -2490855 4.03098683225112e-05 -3039116 3.999163251996505e-05 -615 3.999163251996505e-05 -56 3.9461239515721486e-05 -13690 3.871868930978049e-05 -712157 3.871868930978049e-05 -66219 3.861261070893178e-05 -2696063 3.861261070893178e-05 -33033 3.850653210808306e-05 -2934315 3.840045350723435e-05 -208962 3.840045350723435e-05 -3081750 3.829437490638564e-05 -2785025 3.7763981902142064e-05 -185008 3.765790330129335e-05 -905 3.7127510297049786e-05 -197614 3.702143169620107e-05 -36745 3.702143169620107e-05 -180282 3.670319589365493e-05 -1505 3.638496009110879e-05 -28125 3.627888149026007e-05 -3026968 3.627888149026007e-05 -2682776 3.627888149026007e-05 -40324 3.5748488486016506e-05 -712710 3.553633128431908e-05 -28446 3.532417408262165e-05 -1542 3.468770247752937e-05 -29341 3.4475545275831944e-05 -654 3.4475545275831944e-05 -3023090 3.4369466674983226e-05 -1216932 3.383907367073966e-05 -2955761 3.373299506989095e-05 -1513 3.362691646904224e-05 -622 3.362691646904224e-05 -352475 3.3414759267344806e-05 -371036 3.3202602065647376e-05 -3029274 3.3096523464798664e-05 -316 3.299044486394995e-05 -61624 3.288436626310124e-05 -1761012 3.288436626310124e-05 -3070996 3.235397325885767e-05 -1573823 3.235397325885767e-05 -617123 3.2141816057160245e-05 -971 3.1929658855462814e-05 -886478 3.18235802546141e-05 -384 3.1717501653765384e-05 -84110 3.139926585121925e-05 -3070997 3.129318725037053e-05 -46867 3.118710864952182e-05 -502558 3.1081030048673107e-05 -1660 3.0974951447824395e-05 -907 3.086887284697568e-05 -2930219 3.065671564527825e-05 -1884263 3.0550637044429534e-05 -3068894 3.0444558443580822e-05 -1359 3.033847984273211e-05 -89152 3.002024404018597e-05 -876 3.002024404018597e-05 -1689 2.9914165439337253e-05 -2855394 2.917161523339626e-05 -2613334 2.917161523339626e-05 -2894156 2.9065536632547546e-05 -1490 2.895945803169883e-05 -106590 2.885337943085012e-05 -1531429 2.8747300830001403e-05 -1744 2.864122222915269e-05 -980427 2.864122222915269e-05 -36835 2.8429065027455265e-05 -1260 2.832298642660655e-05 -2787628 2.821690782575784e-05 -143361 2.8110829224909123e-05 -1355477 2.779259342236298e-05 -1702221 2.779259342236298e-05 -377615 2.747435761981684e-05 -555319 2.747435761981684e-05 -2488810 2.747435761981684e-05 -182773 2.7368279018968127e-05 -1185412 2.7368279018968127e-05 -288965 2.7368279018968127e-05 -1679721 2.7368279018968127e-05 -2606626 2.71561218172707e-05 -632 2.71561218172707e-05 -1510 2.7050043216421984e-05 -1076 2.6943964615573276e-05 -1534 2.683788601472456e-05 -587753 2.683788601472456e-05 -169679 2.673180741387585e-05 -2576606 2.651965021217842e-05 -394958 2.609533580878356e-05 -621 2.609533580878356e-05 -712411 2.598925720793485e-05 -1275 2.5671021405388708e-05 -433286 2.545886420369128e-05 -1504 2.535278560284257e-05 -704125 2.514062840114514e-05 -1658665 2.5034549800296427e-05 -304207 2.5034549800296427e-05 -1556 2.492847119944771e-05 -2726954 2.492847119944771e-05 -236753 2.492847119944771e-05 -51515 2.492847119944771e-05 -3036126 2.4822392598599e-05 -1536773 2.4822392598599e-05 -79604 2.4716313997750285e-05 -28129 2.4716313997750285e-05 -282402 2.4716313997750285e-05 -49338 2.4610235396901573e-05 -2999062 2.4610235396901573e-05 -52227 2.4610235396901573e-05 -1716143 2.4504156796052854e-05 -114527 2.4398078195204143e-05 -85698 2.4398078195204143e-05 -2035858 2.418592099350672e-05 -94869 2.4079842392658004e-05 -1404 2.4079842392658004e-05 -1530123 2.397376379180929e-05 -44008 2.3761606590111865e-05 -2509458 2.3549449388414435e-05 -851 2.344337078756572e-05 -2931922 2.3337292186717008e-05 -1589 2.3337292186717008e-05 -1494 2.3231213585868293e-05 -1821960 2.3231213585868293e-05 -34073 2.312513498501958e-05 -1695218 2.3019056384170862e-05 -29362 2.280689918247344e-05 -29552 2.280689918247344e-05 -2483110 2.2700820581624724e-05 -2698458 2.259474198077601e-05 -2724150 2.259474198077601e-05 -2697030 2.2488663379927297e-05 -240139 2.2382584779078585e-05 -324057 2.227650617822987e-05 -2320868 2.195827037568373e-05 -1348613 2.195827037568373e-05 -135079 2.195827037568373e-05 -69 2.1852191774835016e-05 -2831968 2.1852191774835016e-05 -1393 2.1852191774835016e-05 -1871025 2.17461131739863e-05 -3029272 2.17461131739863e-05 -61645 2.1533955972288877e-05 -1493 2.1533955972288877e-05 -755731 2.1533955972288877e-05 -1517 2.142787737144016e-05 -433296 2.142787737144016e-05 -1603886 2.142787737144016e-05 -2068654 2.142787737144016e-05 -2918914 2.1321798770591447e-05 -839 2.1321798770591447e-05 -187327 2.121572016974273e-05 +accession reads +GCF_016117815.1 1326053 +GCF_032452855.1 1270159 +GCF_020091405.1 1205909 +GCF_008728395.1 752574 +GCF_004319565.1 489563 +GCF_032451715.1 266652 +GCF_024760065.1 204548 +GCF_027923645.1 180807 +GCF_009867035.2 176334 +GCF_018289315.1 157297 +GCF_018289135.1 145399 +GCF_902388275.1 142905 +GCF_963360645.1 138631 +GCF_024759225.1 134157 +GCF_022845635.1 98153 +GCF_005121165.3 94997 +GCF_006542665.1 94125 +GCF_018408575.1 91227 +GCF_028743455.1 87949 +GCF_002874775.1 83774 +GCF_020735365.1 80696 +GCF_963931595.1 80598 +GCF_003030905.1 75583 +GCF_018326305.1 75022 +GCF_025152575.1 68130 +GCF_000210695.1 67900 +GCF_900683755.1 61902 +GCF_003574015.1 51353 +GCF_020550085.1 50632 +GCF_014337175.1 48913 +GCF_018140635.1 44757 +GCF_004154955.1 42088 +GCF_000209835.1 39262 +GCF_022453685.1 39061 +GCF_025147905.1 37540 +GCF_023008345.1 36878 +GCF_023008285.1 36473 +GCF_003856815.1 35460 +GCF_004328515.1 34559 +GCF_001553605.1 34396 +GCF_015679285.1 30568 +GCF_000723465.1 29619 +GCF_023008305.1 29346 +GCF_008369705.1 28982 +GCF_022845675.1 27692 +GCF_033096525.1 26813 +GCF_002734145.1 25140 +GCF_025151715.1 25071 +GCF_013874375.1 23422 +GCF_013009555.1 23324 +GCF_005848555.1 22738 +GCF_900187175.1 21326 +GCF_023347255.1 20541 +GCF_016904155.1 20490 +GCF_036416795.1 20238 +GCF_002845845.1 20127 +GCF_014334055.1 19382 +GCF_020735725.1 19179 +GCF_023347275.1 18660 +GCF_025914295.1 18153 +GCF_020091425.1 17745 +GCF_034270385.1 16600 +GCF_020736365.1 16489 +GCF_021484885.1 16334 +GCF_023347235.1 16014 +GCF_023347335.1 15464 +GCF_022846055.1 15112 +GCF_018408705.1 14762 +GCF_023347535.1 14316 +GCF_012113595.1 14261 +GCF_023347295.1 13788 +GCF_020091345.1 13118 +GCF_025914115.1 13025 +GCF_022453915.1 12892 +GCF_023347355.1 12798 +GCF_020735745.1 12781 +GCF_020341675.1 12286 +GCF_002234575.2 11811 +GCF_025150245.1 11104 +GCF_019249725.2 10297 +GCF_014337155.1 10084 +GCF_033096465.1 9633 +GCF_020181455.1 9478 +GCF_032878895.1 9229 +GCF_034051595.1 8503 +GCF_033539415.1 8281 +GCF_023347315.1 7494 +GCF_029581355.1 7207 +GCF_025149285.1 7019 +GCF_008727735.1 6994 +GCF_021378605.1 6983 +GCF_036815185.2 6596 +GCF_928852565.1 6470 +GCF_963931395.1 5992 +GCF_025150745.1 5765 +GCF_902381825.1 5512 +GCF_011405655.1 5428 +GCF_025147085.1 5253 +GCF_020091485.1 5027 +GCF_020735865.1 4926 +GCF_014163495.1 4903 +GCF_025914175.1 4894 +GCF_020138415.1 4626 +GCF_022845735.1 4563 +GCF_016697125.1 4442 +GCF_015097455.1 4398 +GCF_024758225.1 4393 +GCF_018289295.1 4378 +GCF_033947525.1 4358 +GCF_024759285.1 4352 +GCF_000001405.40 4000 +GCF_026016425.1 3966 +GCF_014334015.1 3901 +GCF_016888945.1 3862 +GCF_009193295.2 3829 +GCF_016600925.1 3450 +GCF_032769475.1 3368 +GCF_900312975.1 3244 +GCF_902381675.1 3177 +GCF_001721905.1 2970 +GCF_014337195.1 2963 +GCF_014337215.1 2835 +GCF_025148445.1 2803 +GCF_900604345.1 2661 +GCF_963360665.1 2628 +GCF_020892095.1 2516 +GCF_004115325.2 2506 +GCF_033193315.1 2492 +GCF_016887735.2 2385 +GCF_012273195.1 2359 +GCF_016889065.1 2330 +GCF_023921805.1 2292 +GCF_016696745.1 2264 +GCF_002201475.1 2207 +GCF_011801285.1 2175 +GCF_014287515.2 2109 +GCF_009193325.2 2105 +GCF_902381755.1 2103 +GCF_018118585.1 2102 +GCF_029211325.2 2095 +GCF_900604385.1 2082 +GCF_006542685.1 2066 +GCF_000270305.1 2003 +GCF_016027135.1 1994 +GCF_015140235.1 1976 +GCF_018128945.1 1882 +GCF_003628755.1 1881 +GCF_900120345.1 1853 +GCF_018223625.1 1786 +GCF_025149915.1 1770 +GCF_005222505.1 1759 +GCF_000210595.1 1716 +GCF_001940165.2 1688 +GCF_001940225.2 1619 +GCF_002441855.2 1553 +GCF_000783815.2 1519 +GCF_963677685.1 1500 +GCF_928721695.1 1494 +GCF_025148785.1 1438 +GCF_036287215.1 1435 +GCF_032878955.1 1421 +GCF_022174665.1 1420 +GCF_002998535.1 1366 +GCF_002257605.1 1292 +GCF_002849795.1 1260 +GCF_023008365.1 1251 +GCF_022494435.1 1182 +GCF_003287895.1 1182 +GCF_022845755.1 1150 +GCF_009557455.1 1136 +GCF_004103735.1 1124 +GCF_001921945.1 1115 +GCF_029854705.2 1114 +GCF_018866245.1 1088 +GCF_002998435.1 1074 +GCF_025908335.1 1074 +GCF_025213355.1 1018 +GCF_014467055.1 1017 +GCF_027942055.1 1016 +GCF_022220465.1 1012 +GCF_009429085.1 986 +GCF_003175155.1 972 +GCF_020215665.1 918 +GCF_007164725.1 901 +GCF_005601135.1 892 +GCF_019355395.1 859 +GCF_014303955.1 854 +GCF_035986805.1 798 +GCF_013315815.1 797 +GCF_961514395.1 779 +GCF_024498295.1 768 +GCF_020911725.1 754 +GCF_030644385.1 750 +GCF_017357045.1 745 +GCF_900683775.1 737 +GCF_024181625.1 735 +GCF_022404755.1 726 +GCF_026684175.1 716 +GCF_039134705.1 714 +GCF_900199375.1 709 +GCF_014131715.1 700 +GCF_020099295.1 690 +GCF_015159595.1 675 +GCF_900143685.1 667 +GCF_002763715.1 665 +GCF_018406465.1 639 +GCF_003367905.1 630 +GCF_022845715.1 620 +GCF_029590315.1 608 +GCF_034355335.1 602 +GCF_010231335.1 600 +GCF_028622815.1 598 +GCF_900119915.1 581 +GCF_900010805.1 571 +GCF_004135895.1 569 +GCF_016406145.1 566 +GCF_037039345.1 560 +GCF_030389005.1 555 +GCF_016906045.1 550 +GCF_963664915.1 549 +GCF_001701045.1 545 +GCF_003991565.1 540 +GCF_900105025.1 536 +GCF_004803915.1 528 +GCF_025149625.1 518 +GCF_030863805.1 516 +GCF_023497905.1 516 +GCF_900128725.1 516 +GCF_963931465.1 512 +GCF_030013905.1 510 +GCF_022845775.1 496 +GCF_032163505.1 494 +GCF_026410065.1 493 +GCF_020181435.1 486 +GCF_001865535.1 484 +GCF_030296935.1 480 +GCF_015689475.1 480 +GCF_025151995.1 479 +GCF_029919115.1 462 +GCF_001991075.2 458 +GCF_026723765.1 456 +GCF_003966955.1 453 +GCF_002896855.1 450 +GCF_029590275.1 448 +GCF_026015965.1 444 +GCF_963556055.2 444 +GCF_020735905.1 442 +GCF_963666085.1 439 +GCF_002910725.2 438 +GCF_002094955.1 434 +GCF_000364165.2 433 +GCF_008935055.1 430 +GCF_022846135.1 430 +GCF_037018265.1 423 +GCF_000210715.1 423 +GCF_023822465.1 411 +GCF_004103755.1 410 +GCF_963931535.1 408 +GCF_025148965.1 407 +GCF_001717505.1 407 +GCF_033814055.1 406 +GCF_026314295.1 402 +GCF_009936295.1 401 +GCF_030908625.1 401 +GCF_900015215.1 400 +GCF_035905475.1 397 +GCF_016599855.1 396 +GCF_023744375.2 396 +GCF_030263895.1 393 +GCF_000953555.1 387 +GCF_027474965.1 382 +GCF_030908465.1 381 +GCF_963931665.1 375 +GCF_015277515.1 374 +GCF_027594565.1 374 +GCF_902381775.1 374 +GCF_016127875.1 371 +GCF_022354665.1 370 +GCF_951793255.1 370 +GCF_010537335.1 369 +GCF_014235165.1 366 +GCF_005280655.1 357 +GCF_963931295.1 352 +GCF_029689925.1 345 +GCF_014218355.1 335 +GCF_002777255.1 335 +GCF_030008055.1 333 +GCF_009931695.1 333 +GCF_033100115.1 330 +GCF_036417355.1 328 +GCF_016696765.1 322 +GCF_940670685.1 322 +GCF_022682305.1 321 +GCF_001858005.1 316 +GCF_900637175.1 313 +GCF_016127575.1 307 +GCF_029101585.1 307 +GCF_003033925.1 307 +GCF_038269515.1 307 +GCF_001890425.1 306 +GCF_029542585.1 304 +GCF_009834925.2 302 +GCF_002741375.1 300 +GCF_002074155.1 300 +GCF_028622835.1 300 +GCF_029025785.1 299 +GCF_017945865.1 298 +GCF_018128285.1 295 +GCF_001683335.1 293 +GCF_003614235.1 291 +GCF_016126935.1 290 +GCF_023115465.1 289 +GCF_000577895.1 289 +GCF_002003305.1 287 +GCF_030913655.1 284 +GCF_004801255.1 283 +GCF_033128185.1 281 +GCF_963667225.1 279 +GCF_900097245.1 278 +GCF_013267535.1 277 +GCF_024758805.1 276 +GCF_003006415.1 276 +GCF_000424065.1 276 +GCF_940677205.1 273 +GCF_032363495.1 271 +GCF_022869825.1 269 +GCF_005696695.1 268 +GCF_020923495.1 267 +GCF_963677565.1 267 +GCF_003589745.1 266 +GCF_900637575.1 266 +GCF_033060595.1 264 +GCF_003345215.1 264 +GCF_000270285.1 263 +GCF_004803695.1 263 +GCF_036250655.1 262 +GCF_019916025.1 262 +GCF_030219305.1 260 +GCF_004135735.1 260 +GCF_016584445.1 260 +GCF_022649565.1 259 +GCF_002327185.1 257 +GCF_000230835.1 256 +GCF_016694795.1 255 +GCF_026240615.1 255 +GCF_024399475.1 254 +GCF_900250055.1 254 +GCF_018732185.1 253 +GCF_963931375.1 251 +GCF_026240815.1 250 +GCF_030913705.1 250 +GCF_001717585.1 249 +GCF_005473905.2 248 +GCF_016591975.1 248 +GCF_019203185.1 247 +GCF_900070325.1 245 +GCF_001634325.1 240 +GCF_030166735.1 240 +GCF_018316795.1 239 +GCF_023168405.1 237 +GCF_001318225.1 237 +GCF_002998295.1 235 +GCF_032598785.1 234 +GCF_009913235.1 233 +GCF_018141425.1 233 +GCF_017671885.1 232 +GCF_002285495.1 231 +GCF_001653795.1 230 +GCF_037911825.1 227 +GCF_014720855.1 226 +GCF_002078375.4 225 +GCF_026222675.1 225 +GCF_001735765.2 224 +GCF_000966445.2 222 +GCF_013357625.1 221 +GCF_033582035.1 219 +GCF_015775755.1 219 +GCF_003254825.1 218 +GCF_014218335.1 218 +GCF_002003285.1 217 +GCF_030388745.1 217 +GCF_033096405.1 217 +GCF_017348895.1 217 +GCF_038396635.1 216 +GCF_018128205.1 216 +GCF_023988885.1 214 +GCF_900187165.1 213 +GCF_018336475.1 213 +GCF_019977655.1 213 +GCF_037977055.1 213 +GCF_029636405.1 213 +GCF_002224645.1 212 +GCF_014898175.1 211 +GCF_902386925.1 211 +GCF_900660745.1 211 +GCF_002006215.2 210 +GCF_015708635.1 209 +GCF_003718715.1 208 +GCF_007725005.1 207 +GCF_029101545.1 207 +GCF_002024615.2 206 +GCF_001643775.1 206 +GCF_001465275.1 205 +GCF_900120375.1 204 +GCF_001189515.2 203 +GCF_004135285.1 203 +GCF_013394535.1 203 +GCF_002998925.1 201 +GCF_024499075.1 201 +GCF_036323475.1 200 +GCF_010120715.1 200 +GCF_000023585.1 200 diff --git a/mess/data/hmp_templates/gut/SRS1041129.tsv b/mess/data/hmp_templates/gut/SRS1041129.tsv index cccf48a..4466190 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/gut/SRS1041129.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/gut/SRS1041129.tsv @@ -1,318 +1,322 @@ -taxon seq_abundance -821 0.1834794620524909 -328814 0.1251466782160931 -820 0.0886552735970219 -818 0.0639424294558331 -328813 0.061143179669013 -387661 0.0353903813558687 -817 0.0340723380245385 -823 0.0315133370399399 -338188 0.0246767834047929 -214856 0.0237241243141903 -2955562 0.022699812072048 -28118 0.015361780040373 -3073964 0.0153425788690453 -28116 0.0151484128780101 -371601 0.0150674869656829 -853 0.0135224014914345 -291645 0.0123720171682824 -357276 0.0116009730591643 -39485 0.0091787218801187 -2929488 0.0087353153188256 -2955560 0.0084204161090521 -2955561 0.0070717445678481 -46506 0.0063572736659588 -40545 0.0060845233688558 -39491 0.0059558286888353 -2929494 0.005435711106482 -169435 0.0043614758188878 -411483 0.0043478945025828 -2927224 0.0043136133869442 -301301 0.0042761476867927 -2929492 0.0038504436688211 -2714355 0.0038114793406636 -1288121 0.0037734516550098 -2650157 0.0036929940639344 -1160721 0.0035936162942825 -88431 0.0034896489763621 -292800 0.0030873610209852 -410072 0.0029229802615705 -2785531 0.0029210133123125 -2831966 0.0027723681469614 -674529 0.0026193207618425 -2929491 0.0025752985641645 -2093857 0.0025652764893739 -46503 0.0025496345595607 -33039 0.0024588739009436 -2162637 0.0023850664716452 -2929493 0.0022867190087474 -2714353 0.0022845647309887 -1550024 0.002248035673341 -2956060 0.0022412918473137 -2709390 0.002186966582094 -2929490 0.0021762888575509 -1099853 0.0021760078647997 -40520 0.0021032307422554 -2929495 0.0020972362302312 -2929489 0.0020606135083331 -2792859 0.0020308282767126 -214851 0.0020155610039009 -1472416 0.0018731913433251 -2585118 0.0018422821407001 -1297617 0.001571217800104 -649756 0.0015583857978021 -47678 0.0015338457642028 -165179 0.0014355919655555 -33038 0.0014343743303006 -1522 0.0013573823164892 -2860051 0.0013342472466456 -2086584 0.0011911282720669 -2946555 0.0011771722987604 -74426 0.0011079544177305 -46228 0.0010912821811631 -2528203 0.0010826650701282 -166486 0.0010066096988207 -1496 0.0009624938368923 -2972763 0.0009351438757817 -2714358 0.0008990831393858 -2878202 0.0008899040428487 -239935 0.0007998926982347 -2108523 0.0007945538359631 -376805 0.0007658925753472 -556259 0.000733203751965 -2763672 0.0007267409186889 -876 0.0007092257038681 -291644 0.0006789721509957 -39486 0.000661737928926 -2972761 0.0006316717045544 -2946593 0.0006132198472298 -1796613 0.0006120022119749 -208479 0.0006113465622222 -39496 0.0006111592337215 -2025876 0.0005694786423029 -2650158 0.0005197429253518 -89014 0.0004972635052609 -328812 0.0004812469184461 -29347 0.0004734727856647 -28111 0.0004657923171336 -418240 0.0004614837616162 -2707299 0.0004541779500866 -2610895 0.0004507123728226 -2479767 0.0004380676990215 -2564099 0.0004247673754677 -2715212 0.0004159629359321 -1982626 0.0003695991319946 -246787 0.0003640729412223 -1520 0.0003631362987185 -626937 0.0003428111563863 -2755405 0.0003296981613332 -3068329 0.0003274502193242 -538949 0.0003193950937916 -9606 0.0003161168450283 -28901 0.0003151802025245 -1352 0.0003122766107628 -446660 0.0003045961422317 -154046 0.0003014115577189 -33043 0.0002790258018783 -333367 0.000274998239112 -2364787 0.0002747172463609 -53443 0.0002738742681075 -39488 0.0002671304420802 -387090 0.0002627282223124 -1737424 0.000259168980798 -29348 0.0002550477537814 -454155 0.0002516758407677 -397865 0.0002422157514795 -2779518 0.0002372515462094 -2585119 0.000232942990692 -2583452 0.0002279787854219 -2763670 0.0002217969448969 -45851 0.0002177693821306 -1776384 0.000205499365331 -329854 0.000197350575548 -2763667 0.0001915433920246 -562 0.0001868601795056 -1871021 0.0001846122374965 -2068655 0.0001795543679761 -53442 0.0001785240612219 -2780922 0.0001685019864314 -1981510 0.0001641934309139 -3079303 0.0001625074744071 -1307 0.000161477167653 -3079302 0.000158760904392 -2518605 0.0001499564648564 -1796635 0.0001467718803435 -84112 0.0001414330180719 -454154 0.0001411520253208 -2086585 0.000140215382817 -2763062 0.0001385294263102 -2972764 0.0001319729287836 -2763669 0.0001306616292783 -1177574 0.000130567965028 -168384 0.0001273833805151 -1217282 0.0001240114675015 -1155388 0.0001236368104999 -3028070 0.0001234494819992 -84030 0.0001190472622314 -33035 0.0001185789409795 -1547 0.0001128654217064 -3030016 0.0001052786174257 -1501392 0.0001049976246746 -162156 0.0001022813614136 -28026 9.93777696518837e-05 -1264 9.816013439695958e-05 -253239 9.731715614355058e-05 -1502 9.328959337726312e-05 -884684 9.263394362461168e-05 -2709410 8.99176803636271e-05 -1322 8.916836636059687e-05 -544645 8.888737360946054e-05 -2093856 8.682676010112742e-05 -1912897 8.589011759733964e-05 -3046383 8.223721183256728e-05 -2173 8.13005693287795e-05 -1335613 8.13005693287795e-05 -3030017 8.027026257461295e-05 -3046382 7.998926982347661e-05 -2666138 7.61490355579467e-05 -290053 7.465040755188625e-05 -1491 7.427575055037114e-05 -2841528 7.324544379620457e-05 -2507162 7.202780854128046e-05 -28037 7.193414429090168e-05 -89153 7.174681579014412e-05 -28113 7.043551628484123e-05 -1280 7.024818778408367e-05 -1359 6.771925302385666e-05 -1532 6.640795351855376e-05 -1529 6.603329651703865e-05 -287 6.603329651703865e-05 -3036945 6.416001150946308e-05 -195 6.228672650188752e-05 -2877527 6.181840524999363e-05 -2576756 6.02261129935544e-05 -626932 5.966412749128173e-05 -282402 5.900847773863029e-05 -1653434 5.872748498749395e-05 -2202000 5.816549948522128e-05 -1796616 5.7416185482191056e-05 -28119 5.704152848067594e-05 -2041044 5.657320722878205e-05 -638849 5.423160096931259e-05 -2994078 5.329495846552481e-05 -1308 5.235831596173703e-05 -216816 5.132800920757047e-05 -2766537 5.123434495719169e-05 -197 5.123434495719169e-05 -1738647 4.917373144885857e-05 -2966552 4.842441744582834e-05 -1736 4.748777494204056e-05 -831 4.692578943976789e-05 -3070656 4.6551132438252777e-05 -197614 4.598914693598011e-05 -3045146 4.5239832932949885e-05 -1423 4.449051892991966e-05 -837 4.402219767802577e-05 -1404 4.374120492688943e-05 -1042156 4.355387642613188e-05 -2662363 4.121227016666242e-05 -927786 4.093127741552608e-05 -185007 4.027562766287464e-05 -3052090 3.924532090870808e-05 -1852373 3.868333540643541e-05 -3059030 3.8589671156056633e-05 -1313 3.755936440189007e-05 -573 3.606073639582962e-05 -3028804 3.5779743644693286e-05 -69710 3.5686079394314504e-05 -28131 3.559241514393573e-05 -2899121 3.446844413939039e-05 -100886 3.4187451388254055e-05 -1622 3.40001228874965e-05 -1311 3.3719130136360164e-05 -105841 3.3531801635602606e-05 -1561 3.325080888446627e-05 -36845 3.315714463408749e-05 -1805478 3.315714463408749e-05 -1685 3.287615188295116e-05 -1623 3.231416638067849e-05 -2490855 3.18458451287846e-05 -2003188 3.1471188127269484e-05 -1396 3.119019537613315e-05 -1513 3.090920262499682e-05 -158 3.072187412423926e-05 -84110 3.044088137310293e-05 -97138 3.0347217122724147e-05 -185008 3.0347217122724147e-05 -438033 3.006622437158781e-05 -1639 2.9972560121209035e-05 -2725268 2.959790311969392e-05 -66219 2.959790311969392e-05 -1197717 2.9504238869315143e-05 -729 2.9316910368557586e-05 -615 2.9316910368557586e-05 -51173 2.903591761742125e-05 -1406 2.8661260615906137e-05 -28123 2.8286603614391024e-05 -69823 2.8286603614391024e-05 -1303 2.819293936401225e-05 -3070681 2.809927511363347e-05 -371036 2.800561086325469e-05 -2478954 2.744362536098202e-05 -1216932 2.7256296860224463e-05 -3070215 2.6600647107573018e-05 -29375 2.650698285719424e-05 -2151 2.650698285719424e-05 -1358 2.6132325855679126e-05 -1702221 2.6132325855679126e-05 -1886 2.594499735492157e-05 -303 2.594499735492157e-05 -502558 2.547667610302768e-05 -1727145 2.547667610302768e-05 -238834 2.53830118526489e-05 -54914 2.5008354851133783e-05 -617123 2.4633697849618677e-05 -43305 2.425904084810356e-05 -704125 2.4165376597724783e-05 -28132 2.4165376597724783e-05 -487173 2.4165376597724783e-05 -1351 2.388438384658845e-05 -43765 2.388438384658845e-05 -2144175 2.379071959620967e-05 -2690837 2.369705534583089e-05 -1689 2.350972684507333e-05 -33033 2.3228734093937e-05 -28133 2.3041405593179443e-05 -1589 2.276041284204311e-05 -1229621 2.276041284204311e-05 -382 2.276041284204311e-05 -133926 2.266674859166433e-05 -712411 2.257308434128555e-05 -2734146 2.257308434128555e-05 -2934315 2.2011098839012885e-05 -2785025 2.1917434588634103e-05 -1624 2.1730106087876548e-05 -1716543 2.1730106087876548e-05 -1510 2.1542777587118997e-05 -1712675 2.144911333674021e-05 -114527 2.0980792084846324e-05 -29552 2.0887127834467545e-05 -36745 2.0887127834467545e-05 -1521 2.079346358408877e-05 -1686 2.0699799333709987e-05 -665099 2.0699799333709987e-05 -1501 2.0699799333709987e-05 -28129 2.0699799333709987e-05 -2507160 2.0512470832952432e-05 -1002546 2.0325142332194875e-05 -433296 2.0325142332194875e-05 -28251 2.0231478081816096e-05 -1428 2.013781383143732e-05 -28446 2.013781383143732e-05 -1348613 1.957582832916465e-05 -1590 1.938849982840709e-05 -51515 1.9201171327649534e-05 -1464 1.901384282689198e-05 -2925838 1.89201785765132e-05 -103816 1.8826514326134426e-05 -2507159 1.8732850075755647e-05 +accession reads +GCF_008728395.1 2019313 +GCF_016117815.1 917223 +GCF_024760065.1 694316 +GCF_022845675.1 655269 +GCF_020735865.1 365240 +GCF_008369705.1 363724 +GCF_963360645.1 336256 +GCF_963360665.1 262699 +GCF_022846055.1 253856 +GCF_902388275.1 204765 +GCF_900187175.1 175939 +GCF_018289135.1 172477 +GCF_031344955.1 165332 +GCF_024759225.1 164155 +GCF_025914175.1 139379 +GCF_013009555.1 100689 +GCF_020735745.1 97433 +GCF_022453685.1 74470 +GCF_033096525.1 73952 +GCF_020091485.1 67746 +GCF_016724805.1 64847 +GCF_023347355.1 58273 +GCF_002734145.1 56656 +GCF_010231335.1 46763 +GCF_020735725.1 39655 +GCF_028743455.1 39476 +GCF_009193325.2 39474 +GCF_000723465.1 38145 +GCF_023347235.1 37342 +GCF_023008345.1 33036 +GCF_025914115.1 32462 +GCF_023008305.1 32264 +GCF_020736365.1 32221 +GCF_018408575.1 32157 +GCF_023921805.1 30045 +GCF_005121165.3 29817 +GCF_023008285.1 27988 +GCF_015679285.1 27789 +GCF_023347295.1 27307 +GCF_016904155.1 26712 +GCF_023347535.1 25472 +GCF_030296935.1 23176 +GCF_018289315.1 22831 +GCF_900683755.1 22632 +GCF_025914295.1 21917 +GCF_032452855.1 21906 +GCF_023347275.1 21764 +GCF_025147905.1 21272 +GCF_003574015.1 20957 +GCF_018326305.1 20894 +GCF_032451715.1 20496 +GCF_032878895.1 20201 +GCF_011038705.2 20029 +GCF_006542665.1 18635 +GCF_000210695.1 17459 +GCF_023347315.1 17015 +GCF_020181455.1 16900 +GCF_928852565.1 16485 +GCF_023347335.1 16345 +GCF_023347255.1 16103 +GCF_025151715.1 15974 +GCF_020550085.1 15661 +GCF_004154955.1 15579 +GCF_036815185.2 15162 +GCF_025152575.1 14226 +GCF_022845735.1 13889 +GCF_034270385.1 12968 +GCF_026072915.1 12091 +GCF_003856815.1 11849 +GCF_900312975.1 11465 +GCF_963931595.1 10771 +GCF_014334055.1 10667 +GCF_004115325.2 10253 +GCF_024788145.1 9821 +GCF_004328515.1 9557 +GCF_020091345.1 8423 +GCF_036416795.1 8322 +GCF_022453915.1 7894 +GCF_004801255.1 7656 +GCF_027942055.1 7580 +GCF_020735365.1 7537 +GCF_018408705.1 7275 +GCF_014337175.1 6752 +GCF_024758225.1 6557 +GCF_027116535.1 6529 +GCF_014334015.1 6518 +GCF_004319565.1 6344 +GCF_018140635.1 6021 +GCF_016697125.1 5873 +GCF_025150745.1 5745 +GCF_025147085.1 5395 +GCF_002234575.2 5141 +GCF_009193295.2 4920 +GCF_011405655.1 4806 +GCF_008727735.1 4511 +GCF_018289295.1 4448 +GCF_033539415.1 4423 +GCF_005601135.1 4412 +GCF_012113595.1 4305 +GCF_002257605.1 4240 +GCF_033096465.1 4151 +GCF_025150245.1 4048 +GCF_000209835.1 4004 +GCF_900010805.1 3931 +GCF_015097455.1 3870 +GCF_020091425.1 3516 +GCF_000001405.40 3507 +GCF_018847615.1 3464 +GCF_005848555.1 3343 +GCF_000783815.2 3214 +GCF_001721905.1 3037 +GCF_020091405.1 2993 +GCF_902381825.1 2979 +GCF_025149285.1 2464 +GCF_013874375.1 2424 +GCF_006542685.1 2411 +GCF_003628755.1 2344 +GCF_009867035.2 2214 +GCF_010537335.1 2195 +GCF_963931395.1 2130 +GCF_022845775.1 2057 +GCF_016888945.1 1946 +GCF_900604385.1 1940 +GCF_002874775.1 1922 +GCF_014337215.1 1855 +GCF_033947525.1 1832 +GCF_025148445.1 1768 +GCF_016887735.2 1721 +GCF_029581355.1 1692 +GCF_032769475.1 1589 +GCF_902381675.1 1580 +GCF_012273195.1 1548 +GCF_015140235.1 1544 +GCF_900120345.1 1540 +GCF_025149915.1 1534 +GCF_033193315.1 1518 +GCF_021378605.1 1449 +GCF_027923645.1 1418 +GCF_024793605.1 1415 +GCF_002849795.1 1380 +GCF_015159595.1 1303 +GCF_900604345.1 1297 +GCF_000210595.1 1244 +GCF_014337195.1 1227 +GCF_018406465.1 1210 +GCF_022404755.1 1209 +GCF_016027135.1 1139 +GCF_018866245.1 1139 +GCF_020138415.1 1116 +GCF_020341675.1 1114 +GCF_020892095.1 1078 +GCF_029211325.2 1072 +GCF_023744375.2 1069 +GCF_002201475.1 1045 +GCF_014337155.1 1042 +GCF_014131715.1 1020 +GCF_005222505.1 1014 +GCF_021484885.1 988 +GCF_034051595.1 981 +GCF_019355395.1 944 +GCF_003175155.1 939 +GCF_018223625.1 937 +GCF_016889065.1 929 +GCF_002998535.1 925 +GCF_963677685.1 923 +GCF_016906045.1 900 +GCF_002813085.1 868 +GCF_018118585.1 852 +GCF_036287215.1 832 +GCF_018128945.1 813 +GCF_013315815.1 774 +GCF_001921945.1 768 +GCF_000722765.2 726 +GCF_003991565.1 726 +GCF_014287515.2 689 +GCF_002078375.4 678 +GCF_037039345.1 675 +GCF_022174665.1 671 +GCF_024399475.1 665 +GCF_022845755.1 656 +GCF_003173275.1 646 +GCF_019249725.2 643 +GCF_018127985.1 631 +GCF_001940165.2 625 +GCF_022023815.1 622 +GCF_027497435.1 601 +GCF_020911725.1 599 +GCF_016066915.1 597 +GCF_016600925.1 585 +GCF_024759285.1 582 +GCF_022846135.1 581 +GCF_003287895.1 577 +GCF_014467055.1 575 +GCF_014303955.1 571 +GCF_016696745.1 570 +GCF_034355335.1 570 +GCF_001865535.1 561 +GCF_026314295.1 552 +GCF_001991075.2 550 +GCF_002998435.1 545 +GCF_002441855.2 533 +GCF_024498295.1 511 +GCF_004103755.1 502 +GCF_023008365.1 488 +GCF_029590275.1 475 +GCF_963931465.1 475 +GCF_030013905.1 472 +GCF_001940225.2 464 +GCF_023822465.1 456 +GCF_022354665.1 455 +GCF_030908625.1 447 +GCF_025213355.1 447 +GCF_963664915.1 447 +GCF_020215665.1 439 +GCF_000270305.1 437 +GCF_900683775.1 432 +GCF_011801285.1 418 +GCF_035986805.1 405 +GCF_008253725.1 396 +GCF_900128725.1 384 +GCF_032878955.1 383 +GCF_009557455.1 378 +GCF_008935055.1 372 +GCF_004803915.1 367 +GCF_024181205.1 367 +GCF_037018265.1 361 +GCF_026015965.1 354 +GCF_030291935.1 348 +GCF_002763715.1 348 +GCF_902381775.1 346 +GCF_035905475.1 338 +GCF_030644385.1 337 +GCF_033405435.1 336 +GCF_020181435.1 326 +GCF_003367905.1 326 +GCF_003429245.1 326 +GCF_014163495.1 325 +GCF_009936295.1 322 +GCF_021054785.1 321 +GCF_024181625.1 320 +GCF_900637575.1 320 +GCF_025148785.1 312 +GCF_961514395.1 311 +GCF_004104465.2 302 +GCF_900199375.1 301 +GCF_017968825.1 297 +GCF_019552345.1 296 +GCF_030915445.1 293 +GCF_023497905.1 292 +GCF_018966805.1 292 +GCF_023115465.1 292 +GCF_016406145.1 289 +GCF_033128185.1 288 +GCF_038593265.1 287 +GCF_000299555.2 285 +GCF_014169355.1 282 +GCF_025151995.1 279 +GCF_963931665.1 278 +GCF_039134705.1 278 +GCF_001577385.1 277 +GCF_001701045.1 277 +GCF_001858005.1 276 +GCF_003966955.1 274 +GCF_039644985.1 274 +GCF_000577895.1 273 +GCF_000364165.2 272 +GCF_027594565.1 271 +GCF_026240615.1 268 +GCF_001189515.2 265 +GCF_030008055.1 264 +GCF_036418335.1 263 +GCF_900119915.1 263 +GCF_014692735.1 261 +GCF_001564455.1 259 +GCF_019977655.1 259 +GCF_013745115.1 258 +GCF_026723765.1 258 +GCF_928721695.1 258 +GCF_026625585.1 257 +GCF_021650975.2 257 +GCF_900105025.1 250 +GCF_905186165.1 249 +GCF_023161985.2 248 +GCF_000270285.1 248 +GCF_900637175.1 247 +GCF_018127845.1 246 +GCF_003589745.1 244 +GCF_026222675.1 242 +GCF_963931375.1 240 +GCF_014218355.1 239 +GCF_021537535.1 235 +GCF_940670685.1 230 +GCF_020735905.1 229 +GCF_900660745.1 229 +GCF_030166715.1 227 +GCF_030847745.1 226 +GCF_033814055.1 226 +GCF_016127615.1 224 +GCF_027594765.1 220 +GCF_963556055.2 219 +GCF_026240815.1 218 +GCF_035621135.1 218 +GCF_026684175.1 218 +GCF_017310035.1 216 +GCF_006351925.1 216 +GCF_018128205.1 215 +GCF_016549395.1 215 +GCF_002224645.1 213 +GCF_002504365.1 212 +GCF_028622815.1 210 +GCF_038593105.1 208 +GCF_023361095.1 207 +GCF_005280655.1 206 +GCF_036323475.1 206 +GCF_026802115.1 205 +GCF_900143685.1 204 +GCF_010669305.1 203 +GCF_016591975.1 202 +GCF_004103735.1 201 +GCF_030863805.1 201 +GCF_003667845.1 201 diff --git a/mess/data/hmp_templates/gut/SRS104912.tsv b/mess/data/hmp_templates/gut/SRS104912.tsv index 71a816c..a6bc01a 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/gut/SRS104912.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/gut/SRS104912.tsv @@ -1,778 +1,722 @@ -taxon seq_abundance -821 0.4740567276516932 -165179 0.0571536308533859 -46503 0.0333132208644484 -371601 0.0322509338877721 -817 0.021825975134016 -1160721 0.0216820538751415 -328814 0.0167394461407082 -357276 0.0149516139967049 -46506 0.0140000060160011 -544645 0.0128463220983997 -853 0.011696186078927 -820 0.0114934931162677 -418240 0.0111766503877274 -2518605 0.0111572912044597 -2929494 0.0095344363234427 -823 0.0092441257026477 -818 0.0088075799763725 -2714355 0.0080004331520845 -2093857 0.0076431752361646 -328813 0.0074501233010292 -28026 0.0052953922135822 -28116 0.0051395160805783 -2929488 0.004889697775383 -214856 0.0045872780240181 -2929492 0.0042693555003951 -28127 0.0041714797889741 -2929493 0.0039179593292096 -729 0.0036205529121572 -2093856 0.0033381864980417 -2929495 0.003302167619213 -28131 0.00309793209215 -52227 0.0030061495101239 -292800 0.0027765387986184 -28118 0.0026718758038206 -28132 0.0025578031661597 -2494234 0.0025279545449462 -2929491 0.0024731163803911 -2955382 0.0024637067375279 -77095 0.0024460443751044 -1470347 0.0024225202679465 -28129 0.0023840332860717 -1288121 0.0022640217754561 -2528203 0.0021370687250234 -166486 0.0021094568221954 -2691580 0.0020966535376439 -2913614 0.0020789911752204 -839 0.0019717058209361 -2913616 0.0018560134906512 -387661 0.0018385825128883 -2585118 0.0018197632271619 -301301 0.0017257439267504 -2913621 0.0016889537657197 -74426 0.0016838633031872 -2937774 0.0016772302762509 -2860051 0.0016169931362825 -2831966 0.0015986366198773 -1550024 0.0015984823634369 -2763670 0.0015692507679849 -39485 0.0015421016344781 -411483 0.0015093992691175 -39491 0.0014602685928565 -305719 0.0014502419242318 -28125 0.0014466168978829 -1297617 0.0014439945383964 -1177574 0.0014416035635705 -28111 0.0014392125887446 -712471 0.0013779727819138 -28135 0.0013568396495818 -2763672 0.0013392544153785 -2714353 0.001332158619121 -169435 0.0013145733849177 -282402 0.001304546716293 -2913620 0.0012741581975381 -33025 0.0012731555306757 -28128 0.001257884143078 -2606626 0.0012407616781959 -2929490 0.001215232237313 -2929489 0.0011948703871828 -674529 0.0011087181652307 -410072 0.0011067128315057 -214851 0.0010883563151005 -47678 0.0010806434930815 -291645 0.0010158557881219 -89014 0.0010068317863597 -2584944 0.0010052120937357 -2108523 0.0009836933203027 -2364787 0.0009795283964125 -76123 0.0009705815228704 -39496 0.0009560814174747 -589436 0.0009467489028317 -2801997 0.0009172859227192 -376805 0.0008740941194128 -2714358 0.0008679238617976 -246787 0.0008074553371687 -28137 0.000797428668544 -1472416 0.0007695082528352 -2972761 0.0007576305069259 -2785531 0.0007443644530533 -1642646 0.0007368830156948 -2162637 0.000734492040869 -47660 0.0007189892686108 -1496 0.0007068030098208 -40520 0.0007031008552516 -329854 0.0006856698774887 -28133 0.00068212197936 -1796646 0.0006730979775977 -1796613 0.0006714011567536 -2133944 0.0006681617715056 -9606 0.0006519648452657 -2585119 0.00063746473987 -162156 0.0006373876116498 -538949 0.0006356907908056 -2094151 0.0006339939699614 -397865 0.0006261268915021 -2650157 0.0006164087357581 -88431 0.0006131693505101 -2576606 0.000605379400271 -652716 0.0005934245261415 -291644 0.0005901851408935 -387090 0.0005874085249667 -33043 0.0005807754980304 -1852381 0.0005739110864335 -2610895 0.0005627274945059 -1686 0.0005511582614774 -39486 0.0005457592860641 -470565 0.0005351155916779 -28119 0.0005120542538411 -2859516 0.0005009477901338 -1737424 0.0004947775325186 -33038 0.0004866019411784 -29347 0.0004838253252516 -208479 0.0004826684019487 -454154 0.000462460808259 -239935 0.0004366228544953 -333367 0.0004321494177243 -216816 0.0004289871606965 -2792859 0.0004164923890257 -454155 0.0004116333111538 -2734146 0.0003923512561063 -589437 0.0003798564844355 -2763062 0.0003774655096096 -40545 0.0003741489961415 -1352 0.0003556382232959 -2715212 0.0003522445816075 -28113 0.000348388170598 -2762559 0.0003254810892016 -39488 0.0003248640634401 -53443 0.0003051192390714 -290053 0.0003034995464475 -154046 0.0002974064170524 -1502 0.0002926244674007 -2479767 0.000291544672318 -2650158 0.0002795126699684 -1522 0.0002676349240591 -168384 0.0002662466160957 -2086584 0.0002657838467746 -45851 0.000256605588572 -626932 0.0002564513321316 -2025876 0.0002562970756912 -649756 0.0002539832290855 -2956034 0.0002528263057826 -2931930 0.000248507125452 -2763669 0.0002484299972318 -2955726 0.0002479672279107 -221822 0.0002468103046078 -2755405 0.0002461161506261 -328812 0.0002389432261485 -712710 0.0002346240458178 -2662363 0.0002279138906613 -837 0.0002220521459269 -46228 0.0002126425030637 -2955725 0.000209943015357 -1871021 0.0002085547073936 -712435 0.0002069350147696 -1264 0.0002047754246043 -28112 0.0002040812706226 -53442 0.0001996078338516 -338188 0.0001976796283468 -57975 0.0001956742946219 -573 0.0001942088584383 -562 0.0001898896781076 -2878202 0.0001862646517587 -487173 0.0001834880358319 -2564099 0.0001712246488217 -28251 0.0001661341862891 -395631 0.0001648230065459 -3079302 0.0001587298771509 -2780922 0.0001585756207105 -2779518 0.0001561846458846 -2844245 0.000154719209701 -1099853 0.0001524824913155 -2841528 0.0001500143882694 -3046383 0.0001487032085262 -626937 0.000148626080306 -1912897 0.000147392028783 -847 0.000145772336159 -3046382 0.0001450781821773 -3093922 0.000143767002434 -556259 0.0001429957202321 -477666 0.0001411446429476 -3079303 0.0001383680270207 -2763667 0.0001377510012592 -3028070 0.0001374424883785 -1042156 0.0001307323332219 -1573823 0.0001306552050017 -1532905 0.0001278014608547 -351604 0.0001272615633134 -1322 0.000116540740707 -2955727 0.0001146125352022 -2735321 0.0001109875088533 -1982626 0.0001103704830918 -1351 0.0001082108929265 -28901 0.0001075938671649 -1501392 0.0001038145843756 -2775920 0.0001035831997151 -1642647 0.0001025805328526 -158836 9.864699362296162e-05 -28123 9.818422430182183e-05 -1776384 9.733581387973227e-05 -1796635 9.66416598980226e-05 -1529 9.602463413650293e-05 -2068655 9.56389930355531e-05 -2582419 9.471345439327356e-05 -2709410 9.355653109042412e-05 -1217282 9.324801820966428e-05 -34073 9.286237710871446e-05 -1532 9.21682231270048e-05 -1639118 9.185971024624496e-05 -33039 8.862032499826654e-05 -2086585 8.761765813579704e-05 -33035 8.676924771370745e-05 -393921 8.638360661275764e-05 -2041044 8.615222195218776e-05 -89153 8.568945263104798e-05 -2709390 8.329847780515915e-05 -1760811 8.283570848401938e-05 -303 8.167878518116995e-05 -2734262 8.144740052060007e-05 -253239 7.836227171300158e-05 -1796616 7.712822018996218e-05 -1685 7.697396374958225e-05 -195 7.651119442844248e-05 -1628156 7.581704044673282e-05 -3030016 7.427447604293358e-05 -1653434 7.412021960255366e-05 -2877527 7.40430913823637e-05 -2906798 7.373457850160385e-05 -180282 7.165211655647486e-05 -867595 6.995529571229569e-05 -1002546 6.987816749210574e-05 -322095 6.779570554697676e-05 -287 6.579037182203774e-05 -40324 6.571324360184777e-05 -84030 6.46334485191883e-05 -36874 6.247385835386937e-05 -2955559 5.908021666551103e-05 -2698458 5.908021666551103e-05 -2674997 5.877170378475118e-05 -2829812 5.807754980304152e-05 -82633 5.784616514247163e-05 -197 5.746052404152182e-05 -3030017 5.684349828000212e-05 -2507162 5.653498539924228e-05 -1705399 5.622647251848243e-05 -1660 5.537806209639285e-05 -1680 5.5069549215633e-05 -2682456 5.5069549215633e-05 -1307 5.44525234541133e-05 -1168034 5.422113879354341e-05 -1311 5.406688235316349e-05 -1243007 5.32184719310739e-05 -28124 5.314134371088394e-05 -233055 5.237006150898432e-05 -47671 5.206154862822447e-05 -39950 5.190729218784455e-05 -727 5.167590752727466e-05 -1017 5.144452286670477e-05 -28449 5.090462532537504e-05 -1358 5.067324066480515e-05 -2975727 5.021047134366538e-05 -2955383 4.9362060921575794e-05 -3070215 4.913067626100591e-05 -84112 4.897641982062598e-05 -2576756 4.835939405910629e-05 -654 4.835939405910629e-05 -2161821 4.81280093985364e-05 -3059030 4.7742368297586586e-05 -666 4.673970143511708e-05 -43305 4.643118855435723e-05 -645 4.604554745340742e-05 -587 4.581416279283753e-05 -1307839 4.5505649912077686e-05 -2735554 4.52742652515078e-05 -185007 4.488862415055799e-05 -1389922 4.4502983049608176e-05 -2766537 4.388595728808848e-05 -648 4.388595728808848e-05 -94624 4.357744440732863e-05 -3068894 4.319180330637882e-05 -28450 4.2883290425618975e-05 -665099 4.257477754485912e-05 -2735723 4.249764932466917e-05 -1190508 4.2343392884289234e-05 -358 4.226626466409928e-05 -43675 4.226626466409928e-05 -29375 4.1726367122769535e-05 -2613334 4.157211068238961e-05 -28188 4.141785424200969e-05 -119219 4.141785424200969e-05 -2932251 4.095508492086992e-05 -831 4.095508492086992e-05 -423477 4.072370026030003e-05 -94254 4.049231559973015e-05 -69823 4.033805915935022e-05 -907 4.026093093916026e-05 -1308 3.995241805840041e-05 -105219 3.933539229688071e-05 -496056 3.933539229688071e-05 -282217 3.8872622975740936e-05 -2583452 3.825559721422124e-05 -2694930 3.786995611327143e-05 -400092 3.786995611327143e-05 -1359 3.7638571452701546e-05 -1547 3.733005857194169e-05 -1416627 3.7252930351751735e-05 -2949635 3.702154569118185e-05 -384 3.694441747099188e-05 -2682455 3.679016103061196e-05 -638849 3.6713032810422e-05 -438033 3.663590459023204e-05 -2666138 3.617313526909226e-05 -886478 3.60960070489023e-05 -2932248 3.594175060852237e-05 -2842348 3.594175060852237e-05 -446660 3.594175060852237e-05 -197614 3.578749416814245e-05 -285 3.563323772776253e-05 -1004 3.563323772776253e-05 -2592049 3.555610950757256e-05 -2694929 3.5478981287382604e-05 -2010828 3.532472484700268e-05 -2859768 3.517046840662275e-05 -164759 3.509334018643279e-05 -564064 3.4861955525862905e-05 -1806508 3.478482730567294e-05 -388950 3.463057086529302e-05 -56 3.432205798453317e-05 -1335613 3.4244929764343206e-05 -2714924 3.416780154415325e-05 -185300 3.401354510377332e-05 -93218 3.393641688358336e-05 -1379910 3.355077578263355e-05 -164330 3.3473647562443585e-05 -2745947 3.339651934225363e-05 -615 3.32422629018737e-05 -114527 3.293375002111385e-05 -187304 3.277949358073393e-05 -2212991 3.270236536054396e-05 -2057025 3.270236536054396e-05 -2350 3.2625237140354e-05 -316 3.254810892016404e-05 -2144175 3.2470980699974075e-05 -2725414 3.239385247978412e-05 -2975866 3.231672425959415e-05 -2927224 3.223959603940419e-05 -2992805 3.216246781921423e-05 -1313 3.1853954938454377e-05 -2507160 3.1468313837504566e-05 -2201271 3.139118561731461e-05 -2785056 3.1236929176934685e-05 -946333 3.10055445163648e-05 -2027405 3.10055445163648e-05 -65741 3.0851288075984874e-05 -29466 3.077415985579491e-05 -1930273 3.0697031635604944e-05 -398053 3.0619903415414986e-05 -1019 3.0619903415414986e-05 -3064278 3.054277519522502e-05 -492670 3.046564697503506e-05 -375489 3.0388518754845095e-05 -1280 3.0388518754845095e-05 -563172 3.023426231446517e-05 -2994078 3.023426231446517e-05 -2027860 3.023426231446517e-05 -553814 3.008000587408525e-05 -570161 3.008000587408525e-05 -179636 3.008000587408525e-05 -94132 3.0002877653895287e-05 -889453 2.992574943370533e-05 -35841 2.992574943370533e-05 -2787628 2.969436477313544e-05 -13690 2.961723655294548e-05 -490 2.961723655294548e-05 -477976 2.9462980112565557e-05 -1623 2.9154467231805704e-05 -1385663 2.9077339011615743e-05 -28037 2.9000210791425778e-05 -76758 2.884595435104585e-05 -2714926 2.884595435104585e-05 -1987356 2.884595435104585e-05 -1229621 2.869169791066593e-05 -1736 2.8614569690475967e-05 -2966552 2.8614569690475967e-05 -3070656 2.8537441470286005e-05 -85698 2.838318502990608e-05 -3059028 2.822892858952616e-05 -2707299 2.792041570876631e-05 -36863 2.792041570876631e-05 -203 2.7843287488576345e-05 -1850246 2.7689031048196426e-05 -1463165 2.761190282800646e-05 -2035858 2.730338994724661e-05 -84110 2.722626172705665e-05 -1406 2.714913350686669e-05 -3003229 2.714913350686669e-05 -2728024 2.714913350686669e-05 -1980674 2.7072005286676723e-05 -1155388 2.699487706648676e-05 -105841 2.69177488462968e-05 -3036945 2.684062062610684e-05 -2708117 2.676349240591688e-05 -2979869 2.660923596553695e-05 -1805478 2.660923596553695e-05 -3037797 2.660923596553695e-05 -185008 2.660923596553695e-05 -1209493 2.653210774534699e-05 -332158 2.653210774534699e-05 -363952 2.653210774534699e-05 -2607656 2.6377851304967067e-05 -2035 2.6377851304967067e-05 -2929803 2.6300723084777105e-05 -60552 2.622359486458714e-05 -644 2.614646664439718e-05 -2596915 2.614646664439718e-05 -2175091 2.6069338424207217e-05 -2795000 2.6069338424207217e-05 -445710 2.5992210204017256e-05 -100886 2.591508198382729e-05 -2502979 2.583795376363733e-05 -2259595 2.583795376363733e-05 -1304 2.5683697323257407e-05 -901 2.560656910306744e-05 -3076558 2.552944088287748e-05 -2698672 2.537518444249756e-05 -2908645 2.537518444249756e-05 -2956035 2.537518444249756e-05 -2976983 2.52980562223076e-05 -147206 2.522092800211763e-05 -169760 2.522092800211763e-05 -2955578 2.514379978192767e-05 -2956255 2.514379978192767e-05 -240139 2.483528690116782e-05 -2782665 2.475815868097786e-05 -225991 2.4681030460787897e-05 -426737 2.4603902240597932e-05 -2003188 2.4603902240597932e-05 -352475 2.4603902240597932e-05 -1716143 2.4603902240597932e-05 -549 2.4603902240597932e-05 -198620 2.452677402040797e-05 -1234841 2.444964580021801e-05 -2980099 2.444964580021801e-05 -1436290 2.429538935983809e-05 -2696063 2.429538935983809e-05 -1303 2.4218261139648125e-05 -3003623 2.4141132919458163e-05 -253245 2.4141132919458163e-05 -2321403 2.40640046992682e-05 -2006110 2.40640046992682e-05 -516051 2.3832620038698317e-05 -1775881 2.3755491818508352e-05 -1906741 2.3678363598318387e-05 -172042 2.3678363598318387e-05 -1852373 2.3601235378128423e-05 -1193095 2.3601235378128423e-05 -2663009 2.3524107157938464e-05 -2602016 2.3446978937748503e-05 -2584466 2.3446978937748503e-05 -1795631 2.3446978937748503e-05 -2590900 2.336985071755854e-05 -404405 2.336985071755854e-05 -716 2.336985071755854e-05 -2972478 2.336985071755854e-05 -74829 2.336985071755854e-05 -726 2.3292722497368577e-05 -256839 2.3292722497368577e-05 -453304 2.3292722497368577e-05 -1396 2.3215594277178612e-05 -1423 2.3215594277178612e-05 -2986837 2.3138466056988654e-05 -1310165 2.3138466056988654e-05 -2109913 2.3138466056988654e-05 -80867 2.306133783679869e-05 -450367 2.298420961660873e-05 -84159 2.298420961660873e-05 -2820808 2.2829953176228804e-05 -587753 2.2752824956038843e-05 -1260 2.2752824956038843e-05 -2202828 2.267569673584888e-05 -658062 2.2521440295468955e-05 -1747 2.2521440295468955e-05 -1817405 2.2367183855089032e-05 -1736675 2.2367183855089032e-05 -1458492 2.229005563489907e-05 -1353891 2.229005563489907e-05 -1393 2.229005563489907e-05 -334542 2.229005563489907e-05 -95486 2.2135799194519144e-05 -3039116 2.2135799194519144e-05 -1796 2.2135799194519144e-05 -29459 2.2058670974329183e-05 -2841264 2.2058670974329183e-05 -2490855 2.2058670974329183e-05 -253 2.2058670974329183e-05 -87883 2.2058670974329183e-05 -2810516 2.2058670974329183e-05 -1408 2.190441453394926e-05 -738 2.190441453394926e-05 -2920382 2.190441453394926e-05 -1197717 2.1750158093569333e-05 -2975933 2.1750158093569333e-05 -3003259 2.1750158093569333e-05 -1850093 2.1750158093569333e-05 -884684 2.167302987337937e-05 -199 2.167302987337937e-05 -259 2.167302987337937e-05 -51197 2.167302987337937e-05 -2986829 2.167302987337937e-05 -931531 2.151877343299945e-05 -39778 2.151877343299945e-05 -1768242 2.151877343299945e-05 -76259 2.1441645212809487e-05 -1531429 2.136451699261952e-05 -323450 2.128738877242956e-05 -2604421 2.12102605522396e-05 -270918 2.12102605522396e-05 -3029053 2.12102605522396e-05 -2724150 2.12102605522396e-05 -2487892 2.12102605522396e-05 -55508 2.113313233204964e-05 -546 2.113313233204964e-05 -237610 2.113313233204964e-05 -1018 2.105600411185968e-05 -28077 2.105600411185968e-05 -2820710 2.105600411185968e-05 -518 2.105600411185968e-05 -1613 2.105600411185968e-05 -146939 2.105600411185968e-05 -204042 2.097887589166971e-05 -338565 2.097887589166971e-05 -2571750 2.097887589166971e-05 -2867020 2.097887589166971e-05 -2747268 2.090174767147975e-05 -28189 2.090174767147975e-05 -2714927 2.090174767147975e-05 -2690837 2.090174767147975e-05 -971 2.082461945128979e-05 -188932 2.082461945128979e-05 -2004710 2.0747491231099827e-05 -56459 2.0747491231099827e-05 -292 2.0747491231099827e-05 -876 2.0747491231099827e-05 -1564114 2.05932347907199e-05 -1191912 2.05932347907199e-05 -238 2.05932347907199e-05 -582 2.05932347907199e-05 -405212 2.05932347907199e-05 -1681 2.051610657052994e-05 -1134687 2.051610657052994e-05 -1491 2.051610657052994e-05 -1738647 2.051610657052994e-05 -2969621 2.0361850130150016e-05 -2678688 2.0361850130150016e-05 -2079536 2.0361850130150016e-05 -379895 2.028472190996005e-05 -2714932 2.028472190996005e-05 -158 2.028472190996005e-05 -899 2.028472190996005e-05 -79604 2.020759368977009e-05 -2745490 2.020759368977009e-05 -2764711 2.020759368977009e-05 -2996782 2.013046546958013e-05 -1804624 2.0053337249390167e-05 -3081750 2.0053337249390167e-05 -135079 1.9976209029200205e-05 -2496028 1.9976209029200205e-05 -2741301 1.9976209029200205e-05 -2885633 1.989908080901024e-05 -511 1.989908080901024e-05 -2547394 1.989908080901024e-05 -2764720 1.989908080901024e-05 -351745 1.989908080901024e-05 -1658672 1.982195258882028e-05 -2785025 1.974482436863032e-05 -1318 1.966769614844036e-05 -2849666 1.966769614844036e-05 -3078805 1.966769614844036e-05 -497967 1.966769614844036e-05 -453230 1.966769614844036e-05 -2937442 1.9590567928250395e-05 -2219225 1.9590567928250395e-05 -2999067 1.9590567928250395e-05 -84595 1.951343970806043e-05 -1592106 1.9436311487870468e-05 -1886807 1.9436311487870468e-05 -1305 1.9436311487870468e-05 -43768 1.9436311487870468e-05 -3046670 1.9436311487870468e-05 -1517 1.9359183267680507e-05 -433286 1.9359183267680507e-05 -2906456 1.9282055047490545e-05 -1581680 1.9282055047490545e-05 -2886932 1.9282055047490545e-05 -66219 1.9282055047490545e-05 -544580 1.9204926827300584e-05 -1575 1.9204926827300584e-05 -2956046 1.9204926827300584e-05 -2876190 1.912779860711062e-05 -2714925 1.912779860711062e-05 -1076 1.912779860711062e-05 -154 1.9050670386920657e-05 -631 1.9050670386920657e-05 -86173 1.9050670386920657e-05 -34085 1.9050670386920657e-05 -101571 1.8973542166730696e-05 -41170 1.8973542166730696e-05 -554 1.8973542166730696e-05 -3070997 1.8973542166730696e-05 -2507159 1.8973542166730696e-05 -28068 1.8819285726350773e-05 -2714952 1.8819285726350773e-05 -1355477 1.8819285726350773e-05 -2010992 1.8742157506160808e-05 -1490 1.8742157506160808e-05 -28025 1.8742157506160808e-05 -2654325 1.8665029285970847e-05 -1007105 1.8665029285970847e-05 -1689 1.8665029285970847e-05 -1622 1.8587901065780885e-05 -2962065 1.8587901065780885e-05 -391953 1.8587901065780885e-05 -2608999 1.8587901065780885e-05 -1842536 1.8587901065780885e-05 -1891094 1.8587901065780885e-05 -673273 1.8587901065780885e-05 -2726185 1.8587901065780885e-05 -1727145 1.8510772845590924e-05 -1884263 1.843364462540096e-05 -3028622 1.8356516405211e-05 -29581 1.8356516405211e-05 -45243 1.8356516405211e-05 -1484118 1.8356516405211e-05 -1909699 1.8356516405211e-05 -80679 1.827938818502104e-05 -2071710 1.827938818502104e-05 -1590 1.8202259964831078e-05 -995 1.8202259964831078e-05 -645292 1.804800352445115e-05 -3002903 1.804800352445115e-05 -354356 1.804800352445115e-05 -502558 1.804800352445115e-05 -76731 1.7970875304261186e-05 -215580 1.7970875304261186e-05 -119 1.7970875304261186e-05 -2944810 1.7893747084071225e-05 -617123 1.7893747084071225e-05 -3045146 1.7816618863881263e-05 -927786 1.7816618863881263e-05 -2599297 1.766236242350134e-05 -434010 1.7508105983121414e-05 -317 1.7508105983121414e-05 -1232428 1.7508105983121414e-05 -2853432 1.7508105983121414e-05 -703 1.7508105983121414e-05 -1536773 1.7430977762931453e-05 -2202825 1.735384954274149e-05 -53419 1.735384954274149e-05 -2681766 1.735384954274149e-05 -2976335 1.735384954274149e-05 -1216932 1.735384954274149e-05 -2908842 1.735384954274149e-05 -2853163 1.735384954274149e-05 -150829 1.735384954274149e-05 -656179 1.727672132255153e-05 -515361 1.727672132255153e-05 -2743470 1.727672132255153e-05 -190721 1.727672132255153e-05 -2806552 1.727672132255153e-05 -83655 1.727672132255153e-05 -1712675 1.727672132255153e-05 -28047 1.7199593102361565e-05 -2518599 1.7199593102361565e-05 -364410 1.7122464882171603e-05 -262209 1.7122464882171603e-05 -217203 1.7122464882171603e-05 -2744574 1.7122464882171603e-05 -188475 1.7045336661981642e-05 -2488560 1.7045336661981642e-05 -61435 1.7045336661981642e-05 -382 1.696820844179168e-05 -2074 1.696820844179168e-05 -2319843 1.696820844179168e-05 -225971 1.689108022160172e-05 -1653831 1.689108022160172e-05 -61645 1.689108022160172e-05 -1247 1.689108022160172e-05 -1127472 1.689108022160172e-05 -376175 1.6813952001411754e-05 -97138 1.6813952001411754e-05 -1096 1.6813952001411754e-05 -1597781 1.6813952001411754e-05 -1492737 1.6736823781221792e-05 -1972431 1.6736823781221792e-05 -3073561 1.6736823781221792e-05 -2016596 1.6736823781221792e-05 -2520506 1.6736823781221792e-05 -426117 1.6736823781221792e-05 -1807141 1.6736823781221792e-05 -2086471 1.6736823781221792e-05 -411486 1.665969556103183e-05 -33033 1.665969556103183e-05 -2716225 1.665969556103183e-05 -3039159 1.665969556103183e-05 -1679721 1.665969556103183e-05 -49338 1.665969556103183e-05 -106 1.665969556103183e-05 -133926 1.658256734084187e-05 -1356852 1.658256734084187e-05 -2588711 1.658256734084187e-05 -1492 1.658256734084187e-05 -1505 1.6505439120651908e-05 -60550 1.6505439120651908e-05 -1302659 1.6428310900461943e-05 -2779519 1.6428310900461943e-05 -2899220 1.635118268027198e-05 -553 1.635118268027198e-05 -1694 1.635118268027198e-05 -437900 1.627405446008202e-05 -713030 1.627405446008202e-05 -35814 1.627405446008202e-05 -69710 1.627405446008202e-05 -985 1.627405446008202e-05 -2982692 1.627405446008202e-05 -463025 1.619692623989206e-05 -833 1.619692623989206e-05 -470 1.619692623989206e-05 -2502784 1.6119798019702094e-05 -2584940 1.6119798019702094e-05 -2931400 1.6119798019702094e-05 -480520 1.6119798019702094e-05 -373 1.6119798019702094e-05 -61624 1.6119798019702094e-05 -218289 1.596554157932217e-05 -2933777 1.596554157932217e-05 -1851544 1.596554157932217e-05 -2060723 1.588841335913221e-05 -1981510 1.588841335913221e-05 -2267833 1.5811285138942248e-05 -1675036 1.5811285138942248e-05 -1584 1.5734156918752283e-05 -2047 1.5734156918752283e-05 -645517 1.565702869856232e-05 -190893 1.565702869856232e-05 -54571 1.565702869856232e-05 -399 1.565702869856232e-05 -106592 1.565702869856232e-05 -2530391 1.557990047837236e-05 -2838156 1.557990047837236e-05 -151783 1.557990047837236e-05 -2986949 1.557990047837236e-05 -1379909 1.55027722581824e-05 -1390395 1.55027722581824e-05 -993689 1.55027722581824e-05 -2992140 1.55027722581824e-05 -1751095 1.55027722581824e-05 -2955735 1.5425644037992437e-05 -1446467 1.5425644037992437e-05 +accession reads +GCF_008728395.1 6295601 +GCF_032451715.1 999650 +GCF_018289315.1 428093 +GCF_018289135.1 383329 +GCF_000723465.1 278031 +GCF_008369705.1 193339 +GCF_902388275.1 184509 +GCF_020091485.1 180161 +GCF_013009555.1 173355 +GCF_024760065.1 166328 +GCF_016889065.1 165364 +GCF_016117815.1 134306 +GCF_963360645.1 105101 +GCF_023347235.1 104751 +GCF_018408575.1 98092 +GCF_022845675.1 96163 +GCF_019249725.2 93856 +GCF_021484885.1 71399 +GCF_005121165.3 69477 +GCF_022846055.1 59072 +GCF_024759225.1 53749 +GCF_023347275.1 47817 +GCF_004104465.2 46764 +GCF_023347355.1 44663 +GCF_003574015.1 44422 +GCF_023347295.1 43840 +GCF_020735565.1 43287 +GCF_025147905.1 43106 +GCF_003991565.1 42270 +GCF_020735905.1 41883 +GCF_036815185.2 37843 +GCF_002763715.1 37614 +GCF_025151715.1 35336 +GCF_018128205.1 32463 +GCF_003609995.1 32047 +GCF_023008285.1 32032 +GCF_022453685.1 31538 +GCF_023347255.1 30851 +GCF_900187175.1 30173 +GCF_023347535.1 29561 +GCF_020735725.1 28833 +GCF_022024195.1 28469 +GCF_002734145.1 27358 +GCF_019551475.1 26603 +GCF_025914115.1 25923 +GCF_004328515.1 25288 +GCF_018389405.1 25117 +GCF_022024075.1 24533 +GCF_022024035.1 23362 +GCF_006542665.1 23334 +GCF_003856815.1 21900 +GCF_022024015.1 21385 +GCF_928852565.1 21221 +GCF_023204875.1 21085 +GCF_020735745.1 19620 +GCF_900683755.1 19555 +GCF_028743455.1 18987 +GCF_014337155.1 18927 +GCF_004803695.1 18018 +GCF_900637655.1 17590 +GCF_002849795.1 16977 +GCF_020735865.1 16971 +GCF_018289295.1 16919 +GCF_022845635.1 16450 +GCF_018127805.1 16439 +GCF_004154955.1 16332 +GCF_014337175.1 16221 +GCF_022024055.1 15827 +GCF_028743775.1 15785 +GCF_018127985.1 15380 +GCF_009676955.1 15329 +GCF_018326305.1 15127 +GCF_030219305.1 14908 +GCF_032452855.1 14690 +GCF_014334015.1 14204 +GCF_023008305.1 13695 +GCF_023921805.1 13456 +GCF_025914175.1 13202 +GCF_023347315.1 13009 +GCF_006337085.1 12843 +GCF_001444445.1 12682 +GCF_025914295.1 12564 +GCF_022453915.1 12406 +GCF_023347335.1 12159 +GCF_017347605.1 11796 +GCF_025150745.1 11539 +GCF_033096525.1 11476 +GCF_033096465.1 11395 +GCF_034270385.1 10535 +GCF_025152575.1 10066 +GCF_000209835.1 9901 +GCF_018127765.1 9900 +GCF_018408705.1 9789 +GCF_014334055.1 9669 +GCF_001465445.1 9626 +GCF_018140635.1 9264 +GCF_000001405.40 9053 +GCF_027942055.1 8798 +GCF_963931595.1 8754 +GCF_900604385.1 8569 +GCF_003265305.2 8364 +GCF_018127845.1 8298 +GCF_963931395.1 8160 +GCF_020341675.1 8005 +GCF_006542685.1 8002 +GCF_002201515.1 7994 +GCF_020736365.1 7978 +GCF_963677685.1 7876 +GCF_024758225.1 7870 +GCF_020091345.1 7831 +GCF_928721995.1 7499 +GCF_032878895.1 7396 +GCF_030759015.1 7066 +GCF_023008345.1 6975 +GCF_020091405.1 6974 +GCF_016888945.1 6851 +GCF_008727735.1 6843 +GCF_016904155.1 6703 +GCF_018128125.1 6494 +GCF_032163395.1 6361 +GCF_002998435.1 6271 +GCF_025149915.1 6071 +GCF_900095795.1 6027 +GCF_009193325.2 5974 +GCF_032878955.1 5912 +GCF_902381755.1 5903 +GCF_020735365.1 5730 +GCF_004319565.1 5649 +GCF_016697125.1 5612 +GCF_004803915.1 5507 +GCF_033539415.1 5271 +GCF_027923645.1 4849 +GCF_025150245.1 4843 +GCF_002234575.2 4802 +GCF_022220465.1 4768 +GCF_016724805.1 4690 +GCF_001721905.1 4685 +GCF_012113595.1 4607 +GCF_036416795.1 4242 +GCF_002998535.1 4147 +GCF_020138415.1 3792 +GCF_002257605.1 3636 +GCF_020550085.1 3549 +GCF_034051595.1 3388 +GCF_000210695.1 3366 +GCF_005848555.1 3276 +GCF_020181455.1 3232 +GCF_025142675.1 3194 +GCF_009867035.2 3057 +GCF_009193295.2 3031 +GCF_902381825.1 3027 +GCF_023744375.2 3009 +GCF_015679285.1 2966 +GCF_014287515.2 2937 +GCF_003033925.1 2915 +GCF_900312975.1 2897 +GCF_023822465.1 2849 +GCF_022354665.1 2830 +GCF_025148445.1 2805 +GCF_014163495.1 2788 +GCF_025149285.1 2753 +GCF_013874375.1 2684 +GCF_018127745.1 2598 +GCF_020091425.1 2530 +GCF_037992955.1 2503 +GCF_002346005.1 2452 +GCF_033947525.1 2424 +GCF_029581355.1 2378 +GCF_928721695.1 2341 +GCF_005601135.1 2175 +GCF_009557455.1 2011 +GCF_963360665.1 2006 +GCF_001940165.2 1967 +GCF_018118585.1 1953 +GCF_022845735.1 1944 +GCF_033193315.1 1927 +GCF_027116415.1 1922 +GCF_024722395.1 1920 +GCF_035609205.1 1854 +GCF_012273195.1 1853 +GCF_902381675.1 1852 +GCF_030296935.1 1843 +GCF_018128945.1 1833 +GCF_015140235.1 1828 +GCF_030296955.1 1776 +GCF_004115325.2 1752 +GCF_022174665.1 1744 +GCF_000210595.1 1731 +GCF_900120345.1 1722 +GCF_027943965.1 1662 +GCF_014337215.1 1653 +GCF_000270305.1 1649 +GCF_963666085.1 1640 +GCF_032769475.1 1606 +GCF_003060825.1 1603 +GCF_020892095.1 1582 +GCF_003020185.1 1564 +GCF_963677565.1 1538 +GCF_003287895.1 1532 +GCF_000783815.2 1503 +GCF_900015215.1 1441 +GCF_029919115.1 1432 +GCF_014337195.1 1425 +GCF_014844015.1 1371 +GCF_015097455.1 1351 +GCF_015159595.1 1330 +GCF_013137895.1 1313 +GCF_003175155.1 1297 +GCF_001940225.2 1274 +GCF_003628755.1 1274 +GCF_900095135.1 1263 +GCF_963931295.1 1188 +GCF_963677905.1 1177 +GCF_016406145.1 1155 +GCF_016600925.1 1149 +GCF_007164725.1 1127 +GCF_022845775.1 1125 +GCF_019355395.1 1116 +GCF_022845755.1 1115 +GCF_900476255.1 1101 +GCF_002201475.1 1058 +GCF_963667355.1 1044 +GCF_900604345.1 1013 +GCF_034355335.1 982 +GCF_022845615.1 964 +GCF_037039345.1 958 +GCF_029590315.1 951 +GCF_018866245.1 943 +GCF_005222505.1 930 +GCF_963664505.1 914 +GCF_004135895.1 909 +GCF_038396755.1 905 +GCF_035986805.1 899 +GCF_029211325.2 897 +GCF_002441855.2 889 +GCF_024759285.1 889 +GCF_030847745.1 881 +GCF_016696745.1 871 +GCF_026278345.1 869 +GCF_014131715.1 856 +GCF_014883935.1 839 +GCF_963921705.1 838 +GCF_900638305.1 829 +GCF_023008365.1 829 +GCF_020215665.1 826 +GCF_018406465.1 796 +GCF_023361095.1 790 +GCF_963556055.2 765 +GCF_022811645.1 763 +GCF_009913235.1 755 +GCF_025147085.1 741 +GCF_001634325.1 735 +GCF_003030905.1 728 +GCF_900250055.1 715 +GCF_036320655.1 712 +GCF_013393365.1 707 +GCF_001703595.1 706 +GCF_022267555.1 702 +GCF_020911725.1 699 +GCF_016887735.2 689 +GCF_024205685.1 683 +GCF_005696695.1 681 +GCF_036287215.1 671 +GCF_001717505.1 670 +GCF_900637555.1 664 +GCF_002302415.1 663 +GCF_020097375.1 658 +GCF_027941855.1 655 +GCF_016599855.1 649 +GCF_003029985.1 647 +GCF_012931585.1 642 +GCF_016906045.1 625 +GCF_027594765.1 613 +GCF_014303955.1 611 +GCF_002966695.1 608 +GCF_039134705.1 608 +GCF_020386615.1 603 +GCF_036511535.1 603 +GCF_900343095.1 603 +GCF_003367905.1 596 +GCF_026015965.1 594 +GCF_010320145.1 591 +GCF_021378605.1 587 +GCF_963692685.1 582 +GCF_019931045.1 581 +GCF_001443605.1 573 +GCF_009429085.1 567 +GCF_014467055.1 565 +GCF_963667135.1 564 +GCF_013357625.1 559 +GCF_024499075.1 558 +GCF_001548235.1 557 +GCF_030644385.1 552 +GCF_008935055.1 548 +GCF_003666425.1 545 +GCF_026625565.1 538 +GCF_033060595.1 530 +GCF_026057735.1 525 +GCF_023497905.1 525 +GCF_038983115.1 525 +GCF_024758805.1 522 +GCF_016126935.1 522 +GCF_002209445.1 509 +GCF_022921095.1 507 +GCF_029026905.1 503 +GCF_011801285.1 500 +GCF_000954135.1 493 +GCF_018732185.1 493 +GCF_036492835.1 491 +GCF_010092985.1 486 +GCF_018406505.1 485 +GCF_021537535.1 485 +GCF_009936295.1 485 +GCF_021222645.1 484 +GCF_026723765.1 483 +GCF_019552345.1 482 +GCF_000067205.1 477 +GCF_001611675.1 474 +GCF_020923495.1 474 +GCF_030863805.1 474 +GCF_026248825.1 473 +GCF_030408395.1 471 +GCF_022404755.1 464 +GCF_008253725.1 463 +GCF_901827165.1 462 +GCF_022846135.1 462 +GCF_023674465.1 460 +GCF_001865535.1 458 +GCF_000021765.1 458 +GCF_002005185.1 455 +GCF_002302565.1 455 +GCF_000973725.1 452 +GCF_901482695.1 450 +GCF_013315815.1 445 +GCF_016696765.1 444 +GCF_009689585.1 444 +GCF_000826965.5 440 +GCF_009931655.1 439 +GCF_022919215.1 439 +GCF_002078375.4 437 +GCF_963931375.1 436 +GCF_963667225.1 436 +GCF_007741535.1 436 +GCF_025151995.1 435 +GCF_036231985.1 434 +GCF_011305995.1 431 +GCF_004135735.1 430 +GCF_001890425.1 429 +GCF_008033235.1 428 +GCF_009685195.1 428 +GCF_003006415.1 428 +GCF_026278245.1 427 +GCF_005491705.1 427 +GCF_001643775.1 424 +GCF_004006395.2 422 +GCF_015353075.1 415 +GCF_020463795.1 412 +GCF_022807995.1 412 +GCF_023195795.1 405 +GCF_036091755.1 404 +GCF_017915135.1 400 +GCF_025859615.1 397 +GCF_005491205.1 397 +GCF_010231335.1 397 +GCF_001078055.1 394 +GCF_016027135.1 391 +GCF_013347265.1 389 +GCF_002998925.1 389 +GCF_030704305.1 388 +GCF_020882585.1 387 +GCF_002201795.1 386 +GCF_026278265.1 386 +GCF_963676855.1 385 +GCF_033096405.1 384 +GCF_900564155.1 383 +GCF_002831565.1 382 +GCF_007971025.1 380 +GCF_029590275.1 378 +GCF_026314295.1 376 +GCF_002302595.1 374 +GCF_003194085.1 372 +GCF_013154915.1 371 +GCF_004103735.1 371 +GCF_024498295.1 371 +GCF_001761325.1 369 +GCF_900143685.1 367 +GCF_004766125.1 366 +GCF_025244985.1 364 +GCF_014235165.1 364 +GCF_963662885.1 361 +GCF_900683775.1 360 +GCF_002157895.1 360 +GCF_027941915.1 358 +GCF_020181435.1 358 +GCF_000009985.1 358 +GCF_000470975.2 356 +GCF_011299555.1 355 +GCF_025639805.1 353 +GCF_017753665.1 352 +GCF_010537335.1 352 +GCF_024925425.1 352 +GCF_030644365.1 352 +GCF_963677645.1 351 +GCF_002157145.1 349 +GCF_009906935.1 346 +GCF_002763695.1 344 +GCF_011405655.1 344 +GCF_036346835.1 340 +GCF_005280655.1 338 +GCF_900637575.1 338 +GCF_951793255.1 337 +GCF_900199375.1 337 +GCF_027111275.1 337 +GCF_001641285.1 336 +GCF_022811725.1 335 +GCF_038396405.1 335 +GCF_018336475.1 331 +GCF_017569365.1 330 +GCF_011038705.2 330 +GCF_029025785.1 330 +GCF_032395985.1 329 +GCF_002874775.1 329 +GCF_001280305.1 327 +GCF_002859225.1 327 +GCF_034424315.1 326 +GCF_021049305.1 324 +GCF_000722765.2 323 +GCF_035917875.1 322 +GCF_018228625.1 320 +GCF_016549395.1 319 +GCF_001808185.1 319 +GCF_010233585.1 318 +GCF_900128725.1 316 +GCF_006496635.1 315 +GCF_024652905.1 313 +GCF_026230175.1 313 +GCF_002116905.1 312 +GCF_029855045.1 312 +GCF_963666255.1 309 +GCF_019334745.1 309 +GCF_034424625.1 308 +GCF_007725005.1 308 +GCF_002067135.1 308 +GCF_009676865.1 306 +GCF_000963865.1 305 +GCF_003096035.1 305 +GCF_019645875.1 305 +GCF_028622815.1 304 +GCF_000015185.1 304 +GCF_013265555.1 304 +GCF_020736205.1 303 +GCF_002257585.1 303 +GCF_018847975.1 303 +GCF_016117655.1 303 +GCF_027557445.1 303 +GCF_011068285.1 302 +GCF_001660485.1 302 +GCF_024741815.1 302 +GCF_001623525.1 301 +GCF_003325355.1 301 +GCF_021513235.1 299 +GCF_036972535.1 299 +GCF_006384225.1 299 +GCF_038269515.1 298 +GCF_900477945.1 298 +GCF_001858005.1 297 +GCF_014931035.1 297 +GCF_900106075.1 296 +GCF_003390995.1 296 +GCF_030506325.1 296 +GCF_014217645.1 295 +GCF_016924835.1 294 +GCF_001577265.1 294 +GCF_007923045.3 294 +GCF_012849055.1 292 +GCF_001971605.1 292 +GCF_963677005.1 292 +GCF_025947345.1 291 +GCF_003173735.1 290 +GCF_000742795.1 290 +GCF_014169355.1 289 +GCF_013267535.1 289 +GCF_003008575.1 289 +GCF_011612265.2 289 +GCF_900101765.1 288 +GCF_963931665.1 288 +GCF_963556035.2 287 +GCF_012516375.2 287 +GCF_036492245.1 286 +GCF_009026825.1 286 +GCF_016858125.1 285 +GCF_008728835.1 285 +GCF_018316915.2 285 +GCF_037018265.1 284 +GCF_000758685.1 283 +GCF_029542085.1 283 +GCF_022682305.1 283 +GCF_009931695.1 282 +GCF_003149515.1 280 +GCF_001298465.1 279 +GCF_027111095.2 277 +GCF_004104415.1 276 +GCF_019048385.1 276 +GCF_030388745.1 275 +GCF_025947185.1 275 +GCF_025141855.1 273 +GCF_016725925.1 273 +GCF_002094955.1 271 +GCF_020310005.1 271 +GCF_005145005.1 271 +GCF_900637515.1 271 +GCF_001022135.1 271 +GCF_034376865.1 270 +GCF_029223545.1 270 +GCF_900475375.1 269 +GCF_001402915.1 269 +GCF_001590605.1 269 +GCF_943733665.1 269 +GCF_000954115.1 268 +GCF_028993635.1 268 +GCF_029339075.1 268 +GCF_000424065.1 268 +GCF_030008055.1 268 +GCF_025148785.1 267 +GCF_002302475.1 267 +GCF_001477625.1 267 +GCF_907163105.1 266 +GCF_017792385.1 266 +GCF_001718915.1 266 +GCF_902381775.1 266 +GCF_014218335.1 266 +GCF_024400375.1 264 +GCF_900519125.1 264 +GCF_000209655.1 263 +GCF_038396765.1 263 +GCF_027945475.1 263 +GCF_003111765.1 263 +GCF_963666695.1 262 +GCF_900475505.1 262 +GCF_001989575.1 262 +GCF_001558895.2 262 +GCF_001921945.1 261 +GCF_002845845.1 260 +GCF_003945325.1 260 +GCF_003585765.1 260 +GCF_030064365.1 259 +GCF_004801255.1 259 +GCF_003667705.1 259 +GCF_963664915.1 258 +GCF_014334135.1 257 +GCF_026020075.1 257 +GCF_021165935.1 257 +GCF_019890935.1 256 +GCF_001701045.1 256 +GCF_032163505.1 255 +GCF_020150815.1 254 +GCF_946902905.1 254 +GCF_016132525.1 254 +GCF_020080045.1 253 +GCF_011305775.1 253 +GCF_025244865.1 253 +GCF_003589925.1 252 +GCF_030062155.1 252 +GCF_001483865.1 252 +GCF_036323495.1 251 +GCF_004355225.1 251 +GCF_032930845.1 251 +GCF_038725785.1 251 +GCF_016584445.1 250 +GCF_038593055.1 249 +GCF_026013705.1 249 +GCF_025947045.1 249 +GCF_022867795.2 249 +GCF_025149625.1 249 +GCF_000953015.1 249 +GCF_017639085.1 248 +GCF_001713475.1 248 +GCF_016446305.1 248 +GCF_000833025.1 247 +GCF_963931535.1 247 +GCF_037911825.1 247 +GCF_016894445.1 245 +GCF_900637175.1 245 +GCF_030644225.1 245 +GCF_013874595.1 245 +GCF_023272795.1 245 +GCF_020510565.1 244 +GCF_023573145.1 243 +GCF_022827545.1 242 +GCF_024610635.1 242 +GCF_011299335.1 242 +GCF_015291705.1 242 +GCF_013375035.1 240 +GCF_004103695.1 239 +GCF_009762795.1 239 +GCF_022869785.1 239 +GCF_014268885.2 238 +GCF_030534335.1 238 +GCF_900119915.1 238 +GCF_000953555.1 237 +GCF_023702755.1 236 +GCF_029689925.1 236 +GCF_010729895.1 236 +GCF_021432025.1 235 +GCF_009762775.1 235 +GCF_011305535.1 235 +GCF_016446285.1 235 +GCF_030908625.1 235 +GCF_009586235.1 234 +GCF_033405435.1 234 +GCF_030013905.1 233 +GCF_016592015.1 233 +GCF_024181625.1 233 +GCF_009670965.2 233 +GCF_019195435.1 232 +GCF_004355185.1 232 +GCF_018966805.1 232 +GCF_030064165.1 231 +GCF_003966955.1 231 +GCF_020181515.1 231 +GCF_002250075.1 231 +GCF_013393385.1 231 +GCF_023896015.1 231 +GCF_035621135.1 231 +GCF_025836975.1 230 +GCF_033100115.1 230 +GCF_024138855.1 229 +GCF_004103755.1 229 +GCF_014218355.1 228 +GCF_023016285.1 228 +GCF_017968825.1 227 +GCF_038595055.1 226 +GCF_021545845.1 226 +GCF_002356275.1 226 +GCF_038087665.1 225 +GCF_001889485.1 225 +GCF_014854595.1 225 +GCF_003952345.1 224 +GCF_000241955.1 224 +GCF_002007825.1 224 +GCF_029854435.1 224 +GCF_016591975.1 224 +GCF_900105125.1 223 +GCF_027474965.1 223 +GCF_008274625.1 223 +GCF_003173715.1 222 +GCF_009036245.1 221 +GCF_903969135.1 221 +GCF_016812035.1 221 +GCF_002197445.1 221 +GCF_016066915.1 220 +GCF_001718975.1 220 +GCF_900104535.1 220 +GCF_004193915.1 219 +GCF_038368255.1 219 +GCF_032762665.1 219 +GCF_025244685.1 219 +GCF_025725685.1 218 +GCF_963677195.1 217 +GCF_006351905.1 217 +GCF_001941825.1 217 +GCF_900089455.2 217 +GCF_900066015.1 217 +GCF_963677305.1 217 +GCF_020783315.1 217 +GCF_032926325.1 216 +GCF_900104945.1 216 +GCF_026810445.1 215 +GCF_030389005.1 215 +GCF_001029105.3 215 +GCF_018137945.1 214 +GCF_001554015.1 213 +GCF_000577895.1 213 +GCF_031326225.1 213 +GCF_027625455.1 213 +GCF_003589745.1 213 +GCF_017795745.1 213 +GCF_021052305.1 212 +GCF_001562275.1 212 +GCF_027359925.1 211 +GCF_030123025.1 211 +GCF_008000815.1 211 +GCF_902386745.1 211 +GCF_024496085.1 210 +GCF_900682675.2 210 +GCF_016134045.1 210 +GCF_027111315.2 210 +GCF_019916025.1 210 +GCF_037076525.1 210 +GCF_001761465.1 210 +GCF_033814055.1 209 +GCF_001543345.1 209 +GCF_029714405.1 209 +GCF_003971235.1 209 +GCF_001262075.1 209 +GCF_001605965.1 209 +GCF_021609985.1 209 +GCF_003441595.1 209 +GCF_017638545.1 209 +GCF_022701175.1 208 +GCF_000270285.1 207 +GCF_000758645.1 207 +GCF_900105025.1 207 +GCF_963931465.1 206 +GCF_013427035.1 206 +GCF_023547405.1 206 +GCF_000814825.1 206 +GCF_013267735.1 204 +GCF_000364165.2 204 +GCF_024181205.1 204 +GCF_011044175.1 203 +GCF_028596105.1 203 +GCF_002077135.1 203 +GCF_029542585.1 203 +GCF_001687545.1 202 +GCF_001676745.1 201 +GCF_026898155.1 201 +GCF_026684175.1 201 +GCF_003574965.1 201 +GCF_001913155.1 201 +GCF_014217805.1 200 diff --git a/mess/data/hmp_templates/gut/SRS105082.tsv b/mess/data/hmp_templates/gut/SRS105082.tsv index 223c15e..2bbfda4 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/gut/SRS105082.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/gut/SRS105082.tsv @@ -1,569 +1,500 @@ -taxon seq_abundance -165179 0.3729765991796779 -821 0.2035180034559418 -46503 0.0549057639388364 -46506 0.0411775518362459 -338188 0.0301311963039202 -2518605 0.0296157796616686 -818 0.0215411465466039 -47678 0.0185660099261981 -823 0.0129931768430476 -454154 0.0118231721028533 -371601 0.0102474319964352 -817 0.0099140777368817 -820 0.0096982574205891 -853 0.0077271525899995 -2929493 0.0065891986818273 -387090 0.006302064197347 -28116 0.0060081013065771 -357276 0.0058641926440225 -28118 0.0056753872101133 -328813 0.0056074445675312 -328814 0.0053018307085295 -562 0.0047839814465372 -214856 0.0044436707480762 -2650157 0.0042151325250691 -674529 0.003316300869653 -39485 0.003063308416621 -40545 0.0029752646530237 -2792859 0.0029716370621823 -39491 0.0028175711452718 -2585118 0.0026727662543916 -411483 0.002659066764273 -2763672 0.0025485746149984 -454155 0.0025002209629597 -2755405 0.0022833337081843 -2093857 0.0022105685036601 -2929489 0.0021755302438863 -2929490 0.0021291397586559 -410072 0.0019257812838419 -2929491 0.0018619783625729 -2494234 0.0017675756456183 -301301 0.001674453254843 -292800 0.0016543948113671 -2364787 0.0016065532898002 -39496 0.0015345989585229 -2714355 0.0015117237974525 -1288121 0.0014605961053587 -376805 0.0013700770444813 -214851 0.0013529633512179 -1550024 0.0012443916912122 -626932 0.0011840883281667 -387661 0.0011832774549198 -1472416 0.0011488366806963 -418240 0.0011421789845639 -77095 0.0011021474526907 -291645 0.0010567385508645 -2929495 0.0010187555408782 -162156 0.0010019832679292 -246787 0.0009175670951733 -2715212 0.0009155612508257 -74426 0.0009154332182078 -88431 0.0008972952640009 -1160721 0.0008950333544174 -2714353 0.0008869246219484 -2108523 0.0008848334225222 -1681 0.0008492403547374 -291644 0.0008442044050987 -169435 0.0008234204434546 -901 0.0007859922414794 -2585119 0.0007388335605414 -28111 0.0007221893202103 -2929488 0.0006934246587151 -397865 0.0006784448424172 -2714358 0.0006542893551675 -2584944 0.0006503203440116 -1680 0.0006379011800723 -1297617 0.0006168611531923 -2478954 0.0006141724682157 -556259 0.000613660337744 -2860051 0.000610630232453 -1796613 0.0006036311160061 -216816 0.0005843408682378 -2955232 0.0005764455234654 -538949 0.0005586489895729 -2162637 0.0005493452860033 -1501392 0.0005466139234874 -2610895 0.0005418340390846 -3073964 0.0005362859589743 -2785531 0.0005190015555536 -52227 0.0005186601352391 -2093856 0.0004943339378322 -2929494 0.0004901088614404 -2528203 0.0004689834794818 -1470347 0.0004502907172639 -2025876 0.0004491811012418 -329854 0.0004442305066818 -39488 0.0004341586074045 -2972761 0.0004290799802266 -39486 0.0004241720632059 -33038 0.0004150390697935 -2927224 0.0004063328517742 -28132 0.0004062901742348 -2650158 0.0004046257502017 -166486 0.0004012542245962 -40520 0.0004005287064279 -544645 0.0003943404632279 -2929492 0.000391182325319 -328812 0.0003590461382182 -290053 0.0003432127711341 -89014 0.0003090280621465 -28113 0.0003066807974844 -1852381 0.0002823972776168 -2479767 0.0002716425377106 -9606 0.0002664358779147 -28131 0.0002659664249823 -28119 0.000259052663614 -208479 0.000248468633865 -2955234 0.0002465054670568 -649756 0.0002287516107036 -1280 0.0002270018315919 -1686 0.0002221365921105 -2955740 0.000211893982676 -2922859 0.0002016940507808 -2955233 0.000198279847636 -729 0.0001949083220305 -47660 0.0001946095792553 -154046 0.0001942254814015 -29348 0.0001936706733905 -2780922 0.0001905125354815 -28127 0.0001887627563698 -305719 0.0001838548393491 -2662363 0.0001781360490815 -29347 0.0001768984004415 -1496 0.0001743804256222 -28125 0.000174209715465 -57975 0.000171051577556 -322095 0.0001696858962981 -623 0.0001591445440884 -46228 0.0001558583735615 -1177574 0.0001507370688442 -333367 0.000146298604756 -477666 0.0001459998619808 -2913614 0.0001456584416663 -28129 0.0001454877315091 -1099853 0.0001430551117684 -28128 0.0001366534808718 -28901 0.0001335380205022 -1217282 0.0001311054007615 -1522 0.0001248318024828 -2913621 0.0001230820233711 -2763062 0.000121417599338 -282402 0.0001177473309573 -2763670 0.0001128820914759 -2955741 0.000109041112938 -76123 0.0001069072359725 -839 0.0001029382248166 -28135 9.931063397527324e-05 -1737424 9.896921366079012e-05 -3068329 9.700604685251228e-05 -2709390 9.320774585388772e-05 -2606626 9.29516806180254e-05 -45851 8.911070208009047e-05 -1573823 8.7190212811123e-05 -2913616 8.505633584560359e-05 -3079303 8.369065458767117e-05 -1871021 8.181284285801409e-05 -837 7.908148034214925e-05 -589436 7.609405259042208e-05 -2913620 7.52831793435247e-05 -2922858 7.489908148973121e-05 -2576606 7.16982660414521e-05 -239935 7.148487834490016e-05 -2691580 7.09727478731755e-05 -33025 7.011919708696773e-05 -1502 6.802799766075871e-05 -2086584 6.469914959454844e-05 -1352 6.363221111178874e-05 -2094151 6.358953357247835e-05 -100886 6.183975446075243e-05 -1322 6.034604058488885e-05 -1243007 5.795609838350711e-05 -1982626 5.680380482212663e-05 -1685 5.659041712557469e-05 -2801997 5.616364173247081e-05 -28133 5.5566156182125375e-05 -168384 5.4541895238676056e-05 -2937774 5.364566691315791e-05 -847 5.356031183453713e-05 -1642646 5.309085890212286e-05 -33039 5.240801827315665e-05 -185300 5.172517764419044e-05 -2734146 5.134107979039695e-05 -2763667 5.121304717246578e-05 -89153 5.07862717793619e-05 -154288 5.065823916143074e-05 -28112 5.04448514648788e-05 -3028070 4.890846004970482e-05 -1796646 4.758545633108279e-05 -1642647 4.737206863453085e-05 -28137 4.737206863453085e-05 -1796635 4.557961198349455e-05 -1912897 4.557961198349455e-05 -2133944 4.5408901826252994e-05 -1168034 4.5024803972459504e-05 -106 4.468338365797639e-05 -33043 4.442731842211407e-05 -1796616 4.42992858041829e-05 -589437 4.425660826487252e-05 -3079302 4.336037993935436e-05 -2763669 4.182398852418039e-05 -84030 4.122650297383495e-05 -390884 4.062901742348952e-05 -573 4.058633988417913e-05 -867595 3.951940140141943e-05 -53442 3.811104260417662e-05 -28026 3.806836506486623e-05 -1628156 3.802568752555585e-05 -446660 3.781229982900391e-05 -1653434 3.691607150348575e-05 -2709410 3.5678422863484496e-05 -2010828 3.555039024555333e-05 -303 3.533700254900139e-05 -2027860 3.499558223451829e-05 -40324 3.4952904695207895e-05 -53443 3.478219453796634e-05 -2898187 3.478219453796634e-05 -36874 3.388596621244819e-05 -712710 3.358722343727548e-05 -258 3.3075092965550816e-05 -287 3.3075092965550816e-05 -2877527 3.286170526899888e-05 -2829812 3.217886464003267e-05 -626937 3.123995877520413e-05 -34073 3.1026571078652186e-05 -1532 3.055711814623792e-05 -2604421 3.0301052910375588e-05 -253 2.978892243865093e-05 -2932254 2.9746244899340546e-05 -1795355 2.9746244899340546e-05 -2767188 2.966088982071977e-05 -104663 2.966088982071977e-05 -84112 2.957553474209899e-05 -2956047 2.9276791966926276e-05 -3030016 2.910608180968472e-05 -82633 2.910608180968472e-05 -1173583 2.906340427037433e-05 -2728024 2.8807339034512003e-05 -3070215 2.867930641658084e-05 -1547 2.867930641658084e-05 -621 2.863662887727045e-05 -470565 2.8380563641408123e-05 -2068655 2.8295208562787347e-05 -1563479 2.812449840554579e-05 -3046382 2.765504547313152e-05 -1042156 2.7612367933821132e-05 -1355477 2.7569690394510742e-05 -1265445 2.7142915001406862e-05 -1760811 2.680149468692376e-05 -253239 2.6716139608302982e-05 -2041044 2.586258882209522e-05 -2583452 2.564920112554328e-05 -28251 2.539313588968095e-05 -652716 2.5350458350370563e-05 -570161 2.5265103271749787e-05 -2086585 2.513707065381862e-05 -2779518 2.453958510347319e-05 -2745947 2.445423002485241e-05 -3046383 2.4326197406921248e-05 -393921 2.4155487249679696e-05 -147206 2.402745463174853e-05 -1747 2.372871185657581e-05 -2878202 2.342996908140309e-05 -2844245 2.338729154209271e-05 -33035 2.330193646347193e-05 -682998 2.3259258924161543e-05 -1313 2.30458712276096e-05 -587753 2.30458712276096e-05 -240139 2.287516107036805e-05 -105219 2.287516107036805e-05 -712471 2.287516107036805e-05 -1310165 2.2832483531057663e-05 -2321403 2.2789805991747276e-05 -1355330 2.266177337381611e-05 -670 2.244838567726417e-05 -316 2.240570813795378e-05 -250 2.2277675520022617e-05 -2682456 2.193625520553951e-05 -354356 2.168018996967718e-05 -2707299 2.159483489105641e-05 -1004 2.1552157351746016e-05 -282217 2.150947981243563e-05 -2841528 2.1424124733814854e-05 -75659 2.1210737037262912e-05 -158836 2.1082704419331743e-05 -521520 2.104002688002136e-05 -2735554 2.0911994262090198e-05 -438033 2.0826639183469415e-05 -2975157 2.0826639183469415e-05 -682956 2.05278964082967e-05 -252970 2.035718625105515e-05 -2932253 2.0143798554503207e-05 -2714927 1.993041085795127e-05 -546 1.9759700700709717e-05 -2592345 1.9503635464847385e-05 -336820 1.9460957925537e-05 -946333 1.9290247768295443e-05 -29375 1.9247570228985057e-05 -1366 1.9247570228985057e-05 -712435 1.9247570228985057e-05 -469590 1.9247570228985057e-05 -622 1.916221515036428e-05 -927786 1.9076860071743505e-05 -1768242 1.894882745381234e-05 -1436290 1.894882745381234e-05 -1002546 1.8607407139329235e-05 -1776384 1.8607407139329235e-05 -3003258 1.8436696982087683e-05 -3030017 1.8351341903466904e-05 -2789740 1.8351341903466904e-05 -3003261 1.8223309285535745e-05 -28123 1.8180631746225352e-05 -2705471 1.805259912829419e-05 -1308 1.805259912829419e-05 -2527984 1.7967244049673414e-05 -2175091 1.7967244049673414e-05 -2697010 1.7839211431742248e-05 -28446 1.7711178813811082e-05 -76259 1.7625823735190306e-05 -285 1.758314619587992e-05 -1191459 1.732708096001759e-05 -2714932 1.7156370802776037e-05 -180282 1.7028338184844874e-05 -217203 1.6729595409672157e-05 -423477 1.664424033105138e-05 -2772483 1.664424033105138e-05 -2849093 1.664424033105138e-05 -2714926 1.6558885252430605e-05 -3003262 1.6345497555878663e-05 -164330 1.6217464937947497e-05 -477680 1.617478739863711e-05 -225991 1.613210985932672e-05 -2980099 1.613210985932672e-05 -2949635 1.6089432320016335e-05 -47671 1.596139970208517e-05 -119219 1.5876044623464393e-05 -2838156 1.5833367084154004e-05 -496057 1.5790689544843617e-05 -2686078 1.5748012005533228e-05 -2831966 1.570533446622284e-05 -3040764 1.566265692691245e-05 -358 1.5619979387602065e-05 -986 1.5534624308981286e-05 -185007 1.5534624308981286e-05 -2027405 1.5534624308981286e-05 -94624 1.544926923036051e-05 -1462 1.544926923036051e-05 -615 1.5406591691050124e-05 -43305 1.5193203994498182e-05 -2738125 1.5065171376567018e-05 -404405 1.502249383725663e-05 -2719912 1.502249383725663e-05 -1396 1.4894461219325466e-05 -1307 1.4851783680015078e-05 -2962065 1.47664286013943e-05 -3059030 1.4723751062083912e-05 -2944810 1.4638395983463136e-05 -197 1.455304090484236e-05 -1981510 1.4510363365531972e-05 -2341117 1.4510363365531972e-05 -126385 1.4467685826221584e-05 -2955725 1.4467685826221584e-05 -2202721 1.433965320829042e-05 -3074898 1.4211620590359256e-05 -28124 1.4168943051048868e-05 -1316596 1.4040910433117704e-05 -2487064 1.3998232893807316e-05 -208224 1.3998232893807316e-05 -105841 1.382752273656576e-05 -2966554 1.382752273656576e-05 -352475 1.3784845197255371e-05 -905 1.3699490118634595e-05 -85698 1.3699490118634595e-05 -907 1.3699490118634595e-05 -259 1.3656812579324207e-05 -2743470 1.361413504001382e-05 -2004710 1.361413504001382e-05 -2730360 1.3486102422082655e-05 -2855841 1.3358069804151491e-05 -496056 1.3230037186220327e-05 -1335613 1.3230037186220327e-05 -1727164 1.3144682107599551e-05 -1379910 1.3102004568289163e-05 -84110 1.3059327028978775e-05 -36863 1.3016649489668387e-05 -2490855 1.3016649489668387e-05 -463025 1.3016649489668387e-05 -94132 1.3016649489668387e-05 -2682455 1.3016649489668387e-05 -179636 1.2973971950358e-05 -261302 1.2973971950358e-05 -1463165 1.2803261793116446e-05 -1229621 1.2760584253806058e-05 -62322 1.271790671449567e-05 -648995 1.271790671449567e-05 -51288 1.271790671449567e-05 -29549 1.2675229175185282e-05 -1353891 1.2675229175185282e-05 -3081750 1.2632551635874894e-05 -426737 1.2632551635874894e-05 -2564099 1.2632551635874894e-05 -2681766 1.2589874096564506e-05 -1775881 1.250451901794373e-05 -2728022 1.250451901794373e-05 -1393 1.246184147863334e-05 -2690837 1.2419163939322952e-05 -2871165 1.2376486400012564e-05 -2714924 1.2376486400012564e-05 -2507162 1.2333808860702176e-05 -1134435 1.2291131321391788e-05 -2016596 1.2205776242771012e-05 -2734105 1.2120421164150236e-05 -93221 1.2077743624839848e-05 -1267217 1.203506608552946e-05 -1623 1.199238854621907e-05 -1736 1.199238854621907e-05 -2704465 1.1907033467598294e-05 -1149952 1.1864355928287906e-05 -3070814 1.1821678388977518e-05 -1619153 1.1821678388977518e-05 -1639118 1.1736323310356742e-05 -2766537 1.1608290692425578e-05 -3037797 1.1608290692425578e-05 -2109913 1.156561315311519e-05 -644 1.1352225456563248e-05 -651561 1.130954791725286e-05 -28454 1.1266870377942472e-05 -1141883 1.1224192838632084e-05 -1406 1.1181515299321696e-05 -2674997 1.1138837760011308e-05 -76761 1.109616022070092e-05 -2029983 1.109616022070092e-05 -2714952 1.105348268139053e-05 -1351 1.105348268139053e-05 -1486245 1.1010805142080144e-05 -94254 1.1010805142080144e-05 -1117645 1.1010805142080144e-05 -1332080 1.1010805142080144e-05 -2952571 1.0968127602769756e-05 -254955 1.0968127602769756e-05 -536441 1.0925450063459368e-05 -2706887 1.0925450063459368e-05 -1529 1.0925450063459368e-05 -238 1.088277252414898e-05 -2060723 1.084009498483859e-05 -889453 1.084009498483859e-05 -2496028 1.084009498483859e-05 -1658672 1.0797417445528204e-05 -1531429 1.0754739906217816e-05 -3039116 1.0754739906217816e-05 -2906443 1.0754739906217816e-05 -248906 1.0712062366907428e-05 -1176257 1.066938482759704e-05 -101571 1.066938482759704e-05 -2795000 1.062670728828665e-05 -831 1.062670728828665e-05 -75697 1.062670728828665e-05 -434010 1.058402974897626e-05 -60550 1.058402974897626e-05 -1411316 1.0498674670355483e-05 -1597 1.0455997131045095e-05 -1573825 1.0455997131045095e-05 -2725414 1.0455997131045095e-05 -555319 1.0413319591734707e-05 -1718 1.0327964513113931e-05 -343874 1.0285286973803543e-05 -881 1.0285286973803543e-05 -3039386 1.0285286973803543e-05 -542 1.0242609434493155e-05 -2764720 1.0242609434493155e-05 -2259595 1.0242609434493155e-05 -2714925 1.015725435587238e-05 -1264 1.015725435587238e-05 -61645 1.015725435587238e-05 -3036945 1.0114576816561991e-05 -2662364 1.0114576816561991e-05 -1397264 1.0114576816561991e-05 -238834 1.0071899277251603e-05 -29581 1.0071899277251603e-05 -93220 9.986544198630827e-06 -2734248 9.986544198630827e-06 -35554 9.986544198630827e-06 -185008 9.986544198630827e-06 -2831149 9.94386665932044e-06 -215221 9.858511580699663e-06 -2014 9.858511580699663e-06 -2760713 9.815834041389275e-06 -169430 9.773156502078887e-06 -488447 9.773156502078887e-06 -886478 9.773156502078887e-06 -2502781 9.773156502078887e-06 -1926868 9.687801423458111e-06 -206506 9.687801423458111e-06 -1940525 9.645123884147722e-06 -656179 9.645123884147722e-06 -281362 9.645123884147722e-06 -484770 9.645123884147722e-06 -2714940 9.645123884147722e-06 -544718 9.645123884147722e-06 -971 9.602446344837334e-06 -1805478 9.559768805526946e-06 -39778 9.559768805526946e-06 -2126553 9.559768805526946e-06 -2035858 9.559768805526946e-06 -376175 9.559768805526946e-06 -2072590 9.517091266216558e-06 -2975953 9.517091266216558e-06 -1860122 9.47441372690617e-06 -411153 9.47441372690617e-06 -661481 9.47441372690617e-06 -187327 9.389058648285394e-06 -69823 9.389058648285394e-06 -2488560 9.346381108975006e-06 -207745 9.303703569664618e-06 -2976335 9.26102603035423e-06 -2787628 9.26102603035423e-06 -1963862 9.218348491043842e-06 -2909339 9.218348491043842e-06 -2782609 9.218348491043842e-06 -656178 9.218348491043842e-06 -3069118 9.218348491043842e-06 -2735870 9.090315873112676e-06 -2698684 9.047638333802288e-06 -549 9.047638333802288e-06 -61624 9.0049607944919e-06 -391953 9.0049607944919e-06 -2694930 8.962283255181512e-06 -2696063 8.962283255181512e-06 -871694 8.962283255181512e-06 -1630135 8.919605715871124e-06 -3051176 8.919605715871124e-06 -2704140 8.919605715871124e-06 -520 8.876928176560736e-06 -384 8.876928176560736e-06 -215580 8.876928176560736e-06 -1658665 8.876928176560736e-06 -459526 8.834250637250348e-06 -984 8.834250637250348e-06 -2315862 8.834250637250348e-06 -436515 8.834250637250348e-06 -398049 8.79157309793996e-06 -661488 8.748895558629572e-06 -151783 8.748895558629572e-06 -36745 8.748895558629572e-06 -1379909 8.748895558629572e-06 -2607656 8.706218019319182e-06 -2867264 8.706218019319182e-06 -3003623 8.663540480008794e-06 -2716225 8.663540480008794e-06 -1907662 8.620862940698406e-06 -2003188 8.620862940698406e-06 -2971798 8.620862940698406e-06 -1550579 8.620862940698406e-06 -487173 8.578185401388018e-06 -192 8.578185401388018e-06 -2816950 8.578185401388018e-06 -2955578 8.578185401388018e-06 -2692134 8.53550786207763e-06 -2728021 8.53550786207763e-06 -1906741 8.53550786207763e-06 +accession reads +GCF_032451715.1 11096895 +GCF_008728395.1 4851383 +GCF_018289315.1 1274297 +GCF_020091485.1 961442 +GCF_963360665.1 702440 +GCF_024760065.1 498766 +GCF_032452855.1 441083 +GCF_963360645.1 289481 +GCF_027923645.1 275800 +GCF_018289135.1 225123 +GCF_019249725.2 197268 +GCF_016117815.1 189680 +GCF_902388275.1 163400 +GCF_023347275.1 151806 +GCF_008369705.1 145194 +GCF_900187175.1 139262 +GCF_016888945.1 134856 +GCF_022845675.1 130077 +GCF_013009555.1 125917 +GCF_009867035.2 114701 +GCF_024759225.1 113160 +GCF_022846055.1 102450 +GCF_009193325.2 98266 +GCF_002734145.1 93899 +GCF_022453685.1 84402 +GCF_025914295.1 71402 +GCF_020735745.1 71366 +GCF_016724805.1 69240 +GCF_006542665.1 61265 +GCF_014337175.1 59266 +GCF_020550085.1 53482 +GCF_025914115.1 47176 +GCF_023347535.1 42406 +GCF_013874375.1 42064 +GCF_003609995.1 40771 +GCF_023347335.1 40706 +GCF_023347315.1 40695 +GCF_014334015.1 39515 +GCF_017968825.1 38941 +GCF_023497905.1 37634 +GCF_028743455.1 36662 +GCF_023008285.1 36614 +GCF_020735865.1 36309 +GCF_032878955.1 36292 +GCF_003574015.1 35378 +GCF_025150745.1 34899 +GCF_020735725.1 33208 +GCF_005121165.3 33183 +GCF_023744375.2 32996 +GCF_018408575.1 32123 +GCF_033096525.1 31079 +GCF_900683755.1 27806 +GCF_928852565.1 27795 +GCF_014163495.1 27352 +GCF_025147905.1 27177 +GCF_016904155.1 26358 +GCF_963931395.1 23796 +GCF_963931595.1 22352 +GCF_963677685.1 22121 +GCF_020091345.1 22112 +GCF_002845845.1 21912 +GCF_025914175.1 21843 +GCF_023008345.1 21500 +GCF_003856815.1 21448 +GCF_025152575.1 21321 +GCF_036815185.2 21035 +GCF_000723465.1 20790 +GCF_018326305.1 20552 +GCF_022453915.1 20236 +GCF_012113595.1 20040 +GCF_022024195.1 19316 +GCF_951793255.1 18474 +GCF_023347255.1 17658 +GCF_020091405.1 16993 +GCF_025151715.1 16818 +GCF_006542685.1 16676 +GCF_018408705.1 15680 +GCF_006337085.1 15065 +GCF_018289295.1 14612 +GCF_905186165.1 14510 +GCF_900604385.1 14407 +GCF_004154955.1 13765 +GCF_034051595.1 13586 +GCF_016697125.1 13220 +GCF_023008305.1 12819 +GCF_003030905.1 12802 +GCF_031344955.1 12416 +GCF_008727735.1 12195 +GCF_004115325.2 11808 +GCF_023347355.1 11260 +GCF_022404755.1 10959 +GCF_015679285.1 10686 +GCF_024758225.1 10145 +GCF_020341675.1 9641 +GCF_004328515.1 9633 +GCF_025147085.1 9565 +GCF_010231335.1 9513 +GCF_023347235.1 9470 +GCF_025150245.1 9242 +GCF_020181455.1 8655 +GCF_002257605.1 8501 +GCF_009193295.2 8468 +GCF_020735365.1 8430 +GCF_018140635.1 8324 +GCF_014334055.1 7785 +GCF_032878895.1 7712 +GCF_023347295.1 7656 +GCF_020091425.1 7218 +GCF_928721995.1 6792 +GCF_002998535.1 6716 +GCF_020736365.1 6470 +GCF_000209835.1 5979 +GCF_002998435.1 5357 +GCF_003991565.1 5059 +GCF_902381755.1 5047 +GCF_033096465.1 4910 +GCF_000210695.1 4646 +GCF_002234575.2 4612 +GCF_004104465.2 4557 +GCF_036416795.1 4449 +GCF_000001405.40 4158 +GCF_001465445.1 4111 +GCF_009557455.1 4105 +GCF_034270385.1 4032 +GCF_015140235.1 3977 +GCF_003020185.1 3897 +GCF_022845615.1 3855 +GCF_005848555.1 3794 +GCF_033539415.1 3616 +GCF_002763715.1 3297 +GCF_022494435.1 3293 +GCF_918429265.1 3189 +GCF_002849795.1 3162 +GCF_025149285.1 3159 +GCF_963666085.1 3112 +GCF_030296935.1 3062 +GCF_026016425.1 2997 +GCF_016889065.1 2951 +GCF_020735905.1 2703 +GCF_018127985.1 2648 +GCF_029581355.1 2616 +GCF_024759285.1 2595 +GCF_028743775.1 2386 +GCF_018847615.1 2366 +GCF_000783815.2 2277 +GCF_022845735.1 2245 +GCF_018128205.1 2148 +GCF_902381825.1 2126 +GCF_022024075.1 2000 +GCF_963677565.1 1976 +GCF_020138415.1 1915 +GCF_000210595.1 1830 +GCF_009676955.1 1807 +GCF_026016405.1 1793 +GCF_004803915.1 1776 +GCF_963921705.1 1757 +GCF_012273195.1 1754 +GCF_004803695.1 1715 +GCF_019356055.1 1713 +GCF_032769475.1 1698 +GCF_900637655.1 1634 +GCF_001444445.1 1629 +GCF_025148445.1 1598 +GCF_018389405.1 1597 +GCF_023822465.1 1578 +GCF_026016385.1 1577 +GCF_014287515.2 1576 +GCF_001940165.2 1504 +GCF_022024015.1 1464 +GCF_001940225.2 1447 +GCF_004319565.1 1407 +GCF_025148785.1 1406 +GCF_036511535.1 1377 +GCF_030759015.1 1319 +GCF_963667135.1 1293 +GCF_009429085.1 1292 +GCF_027116415.1 1260 +GCF_001721905.1 1259 +GCF_900120345.1 1249 +GCF_015097455.1 1239 +GCF_900312975.1 1236 +GCF_018127845.1 1227 +GCF_013046825.1 1180 +GCF_900095795.1 1158 +GCF_023204875.1 1141 +GCF_029919115.1 1069 +GCF_019551475.1 1067 +GCF_963692685.1 1064 +GCF_020735565.1 1028 +GCF_033193315.1 959 +GCF_022024055.1 951 +GCF_016696745.1 940 +GCF_014337155.1 926 +GCF_002201515.1 922 +GCF_003287895.1 915 +GCF_020892095.1 908 +GCF_018127765.1 890 +GCF_900095135.1 889 +GCF_000739105.1 880 +GCF_016696765.1 877 +GCF_017569365.1 871 +GCF_036320655.1 870 +GCF_002201475.1 839 +GCF_022024035.1 836 +GCF_016599855.1 827 +GCF_019355395.1 827 +GCF_017347605.1 824 +GCF_030219305.1 813 +GCF_003265305.2 806 +GCF_019775695.1 801 +GCF_014337215.1 799 +GCF_900638305.1 797 +GCF_016406145.1 784 +GCF_014337195.1 783 +GCF_003033925.1 777 +GCF_022845755.1 776 +GCF_004151275.2 774 +GCF_016906045.1 766 +GCF_022267555.1 750 +GCF_014353055.1 744 +GCF_023008365.1 733 +GCF_022354665.1 727 +GCF_033947525.1 725 +GCF_016725645.1 710 +GCF_025149915.1 708 +GCF_020510565.1 707 +GCF_020215665.1 705 +GCF_016126935.1 705 +GCF_021484885.1 677 +GCF_012849055.1 667 +GCF_021378605.1 667 +GCF_037039345.1 661 +GCF_963664505.1 642 +GCF_029339075.1 625 +GCF_963667355.1 614 +GCF_025859615.1 610 +GCF_013394535.1 600 +GCF_900250055.1 598 +GCF_018406465.1 586 +GCF_008086345.1 584 +GCF_016027135.1 576 +GCF_003628755.1 574 +GCF_018866245.1 574 +GCF_024722395.1 574 +GCF_029211325.2 568 +GCF_018128125.1 560 +GCF_902381675.1 555 +GCF_024758805.1 552 +GCF_026625565.1 551 +GCF_000954135.1 550 +GCF_002441855.2 548 +GCF_900476255.1 548 +GCF_018128945.1 546 +GCF_030863805.1 540 +GCF_034424315.1 538 +GCF_003390995.1 535 +GCF_019931045.1 531 +GCF_027942055.1 528 +GCF_018118585.1 522 +GCF_003029985.1 518 +GCF_025149625.1 515 +GCF_900604345.1 513 +GCF_003076455.1 508 +GCF_000157055.1 505 +GCF_011405655.1 499 +GCF_005222505.1 494 +GCF_039134705.1 494 +GCF_010537335.1 491 +GCF_018127805.1 484 +GCF_000270305.1 484 +GCF_014131715.1 483 +GCF_037023725.1 479 +GCF_963666695.1 476 +GCF_003175155.1 476 +GCF_013393365.1 475 +GCF_019271175.1 470 +GCF_025151995.1 465 +GCF_901827165.1 462 +GCF_009689585.1 458 +GCF_008245145.1 456 +GCF_963931295.1 456 +GCF_004328965.1 455 +GCF_018127745.1 446 +GCF_022919335.1 440 +GCF_030388745.1 440 +GCF_027111335.1 439 +GCF_001477625.1 437 +GCF_901482695.1 437 +GCF_000021765.1 435 +GCF_010450915.1 424 +GCF_025309455.1 422 +GCF_015159595.1 419 +GCF_011038705.2 414 +GCF_009936295.1 402 +GCF_029590315.1 402 +GCF_963556055.2 402 +GCF_003096035.1 392 +GCF_011305775.1 390 +GCF_038396755.1 386 +GCF_026723765.1 385 +GCF_022845775.1 382 +GCF_001682195.2 377 +GCF_900637555.1 375 +GCF_026057735.1 371 +GCF_007971385.1 370 +GCF_900636675.1 368 +GCF_011299335.1 361 +GCF_025244985.1 359 +GCF_014838715.1 355 +GCF_011784865.1 354 +GCF_022174665.1 354 +GCF_013154915.1 352 +GCF_023674465.1 350 +GCF_027557445.1 347 +GCF_034355335.1 346 +GCF_020181435.1 343 +GCF_014069095.1 343 +GCF_016858125.1 341 +GCF_963677645.1 341 +GCF_002116905.1 338 +GCF_000067205.1 338 +GCF_003589925.1 337 +GCF_029026905.1 335 +GCF_008329825.1 333 +GCF_030644385.1 329 +GCF_031851795.1 328 +GCF_018323985.1 326 +GCF_907163105.1 325 +GCF_003260975.1 322 +GCF_017795745.1 321 +GCF_008033235.1 319 +GCF_949794895.1 319 +GCF_020097375.1 318 +GCF_025836975.1 317 +GCF_016132525.1 316 +GCF_019774515.1 315 +GCF_001865535.1 314 +GCF_013000985.1 313 +GCF_035986805.1 312 +GCF_004101785.1 311 +GCF_001676745.1 309 +GCF_003860265.1 309 +GCF_008935055.1 309 +GCF_030908465.1 308 +GCF_963311185.1 308 +GCF_012516375.2 307 +GCF_008253725.1 307 +GCF_001412655.1 305 +GCF_003666425.1 305 +GCF_023314415.1 302 +GCF_034424625.1 301 +GCF_022682305.1 300 +GCF_011801285.1 299 +GCF_018336895.1 298 +GCF_029223545.1 297 +GCF_963666255.1 297 +GCF_016887735.2 296 +GCF_011299555.1 296 +GCF_004141835.1 296 +GCF_003600625.1 295 +GCF_009762775.1 293 +GCF_036972535.1 292 +GCF_006496635.1 291 +GCF_961514395.1 291 +GCF_021049305.1 289 +GCF_019916025.1 288 +GCF_032363495.1 287 +GCF_021249385.1 286 +GCF_027941915.1 283 +GCF_036287215.1 283 +GCF_009884155.1 281 +GCF_900143685.1 281 +GCF_900519125.1 281 +GCF_018406505.1 281 +GCF_030008055.1 280 +GCF_003952345.1 278 +GCF_011305995.1 277 +GCF_034376865.1 277 +GCF_009936255.1 275 +GCF_014467055.1 273 +GCF_900637575.1 272 +GCF_026015965.1 272 +GCF_026278345.1 267 +GCF_030908385.1 267 +GCF_000815105.2 267 +GCF_035155065.1 266 +GCF_025908335.1 264 +GCF_009931695.1 264 +GCF_003860485.1 262 +GCF_017671885.1 261 +GCF_009177135.1 261 +GCF_005280655.1 259 +GCF_010119975.1 259 +GCF_020783335.1 258 +GCF_024496285.1 257 +GCF_013363755.1 257 +GCF_037018265.1 257 +GCF_010092425.1 257 +GCF_003008575.1 256 +GCF_003006415.1 256 +GCF_021432025.1 255 +GCF_010448835.1 254 +GCF_018255755.1 254 +GCF_027359675.1 253 +GCF_034274695.1 252 +GCF_002201795.1 252 +GCF_004355185.1 252 +GCF_011745145.1 251 +GCF_013488205.1 248 +GCF_030847745.1 248 +GCF_033814055.1 247 +GCF_036492835.1 247 +GCF_002770595.1 246 +GCF_029025785.1 244 +GCF_963678245.1 243 +GCF_963677905.1 243 +GCF_014334135.1 240 +GCF_001040905.1 240 +GCF_013265555.1 240 +GCF_013375035.1 239 +GCF_001718975.1 239 +GCF_022494515.1 238 +GCF_036322665.1 238 +GCF_036895565.1 236 +GCF_001447865.2 236 +GCF_023822005.2 236 +GCF_007970185.1 236 +GCF_963931465.1 234 +GCF_006352025.1 234 +GCF_018972185.1 233 +GCF_009557615.1 233 +GCF_018672515.1 233 +GCF_030553095.1 232 +GCF_022760175.1 232 +GCF_014169355.1 232 +GCF_006337165.1 231 +GCF_001971625.1 231 +GCF_023612075.1 230 +GCF_900475375.1 230 +GCF_021233455.1 228 +GCF_013127955.1 227 +GCF_027594565.1 227 +GCF_963665805.1 227 +GCF_001262075.1 226 +GCF_017945865.1 226 +GCF_014395225.1 225 +GCF_029834475.1 225 +GCF_003028855.1 223 +GCF_001941825.1 222 +GCF_013201155.1 221 +GCF_007556775.1 220 +GCF_003815675.1 220 +GCF_039545795.1 220 +GCF_001029105.3 220 +GCF_029855045.1 220 +GCF_011303555.1 218 +GCF_030168535.1 218 +GCF_023573145.1 218 +GCF_029542585.1 218 +GCF_023547405.1 217 +GCF_003555545.1 217 +GCF_025244685.1 216 +GCF_021899435.1 216 +GCF_019793795.1 216 +GCF_002557795.1 215 +GCF_029689925.1 215 +GCF_002356275.1 214 +GCF_020510685.1 214 +GCF_003074035.1 214 +GCF_019434355.1 214 +GCF_010983895.1 213 +GCF_001921945.1 212 +GCF_001078055.1 212 +GCF_963677005.1 211 +GCF_023101125.1 211 +GCF_025200795.1 211 +GCF_001632305.1 211 +GCF_029590275.1 210 +GCF_005144405.2 210 +GCF_002355595.1 210 +GCF_027947635.1 209 +GCF_024271895.1 208 +GCF_000767615.3 207 +GCF_001673705.2 206 +GCF_003815995.1 205 +GCF_002005185.1 205 +GCF_900637515.1 205 +GCF_037975265.1 204 +GCF_013315815.1 204 +GCF_011305535.1 204 +GCF_030323225.1 203 +GCF_002999135.1 203 +GCF_034262375.1 202 +GCF_001577755.1 202 +GCF_010092985.1 202 +GCF_033096405.1 201 +GCF_026013905.1 201 +GCF_021222645.1 200 +GCF_021654335.1 200 diff --git a/mess/data/hmp_templates/gut/SRS147088.tsv b/mess/data/hmp_templates/gut/SRS147088.tsv index 1e5fb2f..437af22 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/gut/SRS147088.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/gut/SRS147088.tsv @@ -1,313 +1,307 @@ -taxon seq_abundance -28116 0.1262941490362678 -28132 0.1055627592358198 -338188 0.1042604255011999 -820 0.0537503963456288 -2682456 0.0436018859607289 -246787 0.0263163186129063 -46503 0.0262967268940165 -1318 0.0242004129728113 -2682455 0.0234115885017233 -423477 0.0226856637597024 -39777 0.0186791572467448 -371601 0.0185647003627045 -729 0.0172837628473985 -490 0.0163704278470505 -821 0.0162477218182146 -39778 0.0140714943068011 -2650157 0.0139804959282736 -1304 0.0137876721686743 -496 0.0120491649029823 -29466 0.0117003807495894 -28449 0.0096783091315455 -732 0.0094499109350147 -387090 0.0077121770266473 -3059030 0.0076219520054444 -357276 0.0073275606505481 -46124 0.007136283605598 -817 0.0067470270855513 -823 0.0067392935123054 -2663009 0.0061744848795753 -488 0.0059061298879405 -2047 0.0056078717464212 -199 0.0054573248538999 -1660 0.0054426310647325 -1303 0.0052835772416406 -43675 0.0052227397987724 -556259 0.0050690994769526 -1305 0.0047280488968057 -114527 0.0043821003869364 -3098075 0.0043117248703982 -46125 0.0042939376519324 -712357 0.0042913597941838 -33025 0.0040456899507371 -1177574 0.0039704165044764 -1017 0.0035855423426024 -818 0.0035125889683155 -43768 0.0034045767286469 -2490855 0.0032470696202042 -454154 0.0032261889724401 -487 0.0027108752084842 -84135 0.0026139477571348 -674529 0.002552336956942 -544580 0.0025263005936806 -33053 0.0025247538790314 -61592 0.0025085133752149 -1056807 0.0024020478501955 -1019 0.0024002433497714 -1302 0.0023948298484993 -68892 0.0023620910550913 -1382 0.0023352813345053 -2715212 0.002324454331961 -2972775 0.0023236809746364 -3098076 0.002081362346263 -712623 0.0020442411946823 -495 0.0020006753987301 -505 0.0019542739592543 -2610896 0.0019091614486529 -2972784 0.0018934365163861 -46506 0.0017782062750213 -172042 0.0017361871937182 -2650158 0.0016588514612586 -2792859 0.0016170901657304 -47678 0.0015619240099092 -162156 0.0015325364315746 -860 0.0015000554239415 -2759692 0.0014997976381667 -28133 0.0014173061902098 -1871109 0.001403385758367 -292800 0.0013822473248281 -617123 0.0013294012409807 -39491 0.0013103250936406 -502 0.0012698527269868 -2841264 0.0012618613679659 -1796613 0.0011912280656528 -712116 0.0011538491282974 -28111 0.0011394131249049 -712633 0.0011017764017745 -589437 0.001095073971628 -291644 0.0010839891833088 -214851 0.0010808957540105 -3077590 0.0010783178962618 -28131 0.0010368143865085 -3059028 0.0010187693822679 -1655 0.0010040755931006 -2755405 0.0009788125871638 -853 0.0009759769436402 -39496 0.0009710790139178 -3077584 0.0009197796447196 -387661 0.0009164284296463 -2785531 0.0008751827056679 -2899133 0.0008483729850819 -484 0.0008362570536632 -113107 0.000784957684465 -33038 0.0007560856776801 -2528203 0.0007431963889368 -2545799 0.0007388140307641 -706438 0.0007223157411727 -1839799 0.0007166444541257 -76857 0.000668180728451 -327575 0.0006589004405558 -851 0.0006519402246345 -454155 0.0006439488656136 -684066 0.0006405976505404 -1852377 0.0006140457157293 -329854 0.0006055387851587 -589436 0.0006027031416352 -376805 0.0005983207834625 -1550024 0.0005941962110646 -1759399 0.0005864626378187 -28124 0.0005844003516197 -652716 0.000578213493023 -1750 0.0005717688486513 -712435 0.0005681598478032 -291645 0.0005676442762535 -301301 0.0005583639883583 -9606 0.0005575906310337 -315405 0.0005534660586359 -2162637 0.0005408345556675 -166486 0.0005400611983429 -109328 0.000526398552275 -28037 0.0005261407665002 -28113 0.0005178916217045 -328814 0.0005104158342334 -486 0.000493917544642 -2929488 0.0004745836115271 -2789425 0.0004725213253282 -1583098 0.0004696856818047 -290053 0.0004653033236319 -3058373 0.0004526718206635 -45634 0.0004436493185433 -1156431 0.0004390091745957 -328812 0.0004150350975332 -418240 0.0004132305971091 -2763672 0.0004101371678108 -1313 0.0004070437385124 -554406 0.0004070437385124 -208479 0.0004067859527375 -3077723 0.000405754809638 -39485 0.0004049814523134 -47671 0.0003887409484969 -2708117 0.0003830696614499 -539 0.0003761094455285 -485 0.0003745627308793 -76123 0.0003704381584815 -248315 0.0003609000848115 -1338 0.0003585800128377 -461393 0.0003565177266388 -28112 0.0003516197969163 -2610895 0.000336926007749 -712710 0.0003237789332309 -1297617 0.0003188810035084 -28135 0.0003147564311106 -282402 0.0003093429298384 -158 0.0003080540009641 -3038077 0.0003021249281422 -76859 0.0002995470703935 -470565 0.0002972269984197 -28137 0.0002964536410951 -2108523 0.0002851110670011 -1018 0.0002848532812262 -1308 0.0002812442803781 -1217282 0.0002804709230535 -477666 0.0002768619222054 -157687 0.0002747996360064 -727 0.0002722217782578 -28119 0.000266034919661 -712471 0.0002657771338861 -204 0.0002634570619124 -1234680 0.0002492788442948 -2572088 0.000246958772321 -28125 0.0002461854149964 -46228 0.0002428341999231 -483 0.0002410296994991 -649756 0.0002369051271012 -328813 0.0002366473413264 -655307 0.0002358739840018 -76860 0.000235358412452 -1316596 0.0002330383404782 -1472417 0.0002322649831536 -726 0.0002314916258291 -39486 0.000225820338782 -2763062 0.0002198912659601 -2576376 0.0002170556224366 -1379 0.0002149933362377 -216816 0.000212415478489 -2382163 0.0002098376207404 -2929492 0.0002077753345414 -1902136 0.0002070019772168 -1311 0.0002036507621436 -2937985 0.0002031351905939 -114528 0.0002002995470703 -712362 0.0001974639035468 -410072 0.0001956594031228 -1328 0.0001897303303009 -88431 0.0001879258298768 -2866570 0.0001858635436779 -29391 0.0001845746148036 -28129 0.0001827701143795 -1343 0.0001781299704319 -40542 0.0001776143988822 -52773 0.0001752943269084 -739 0.0001750365411335 -29347 0.0001747787553587 -2093824 0.000168334110987 -2718 0.0001660140390132 -2929494 0.0001572493226678 -2972761 0.0001557026080186 -53419 0.0001513202498459 -2598453 0.0001495157494219 -137732 0.0001464223201235 -154046 0.0001456489627989 -837 0.0001417821761759 -2844245 0.0001404932473016 -157688 0.0001355953175791 -2929493 0.0001343063887048 -2479767 0.0001340486029299 -1496 0.0001335330313802 -2820817 0.0001327596740556 -712150 0.0001325018882808 -1501392 0.0001309551736316 -2709390 0.0001304396020818 -155615 0.0001291506732075 -33033 0.0001278617443332 -203 0.0001216748857364 -1314 0.0001209015284118 -1307 0.0001203859568621 -45851 0.0001201281710872 -1288121 0.0001160035986894 -1796635 0.0001144568840402 -89014 0.000112910169391 -1656 0.0001105900974172 -39488 0.0001105900974172 -40520 0.0001093011685429 -714 0.0001074966681188 -1334 0.0001069810965691 -1099853 0.0001062077392445 -285729 0.0001049188103702 -53443 0.0001025987383964 -157692 0.0001018253810718 -712538 0.0001010520237472 -69710 9.924752332316798e-05 -2929489 9.847416599857188e-05 -2956064 9.770080867397575e-05 -713030 9.718523712424502e-05 -165179 9.434959360072592e-05 -2093857 9.409180782586056e-05 -2025876 9.022502120287998e-05 -169435 8.996723542801461e-05 -2929495 8.945166387828387e-05 -28128 8.816273500395702e-05 -824 8.713159190449553e-05 -28127 8.584266303016867e-05 -2955725 8.506930570557256e-05 -1853278 8.378037683124569e-05 -411483 8.249144795691884e-05 -2929490 8.223366218205346e-05 -28118 8.19758764071881e-05 -562 8.120251908259199e-05 -2929491 8.042916175799587e-05 -2086584 7.991359020826513e-05 -267212 7.862466133393827e-05 -1573823 7.862466133393827e-05 -1912897 7.785130400934215e-05 -1522 7.759351823447679e-05 -1322 7.682016090988068e-05 -492 7.604680358528456e-05 -397865 7.501566048582307e-05 -712361 7.501566048582307e-05 -1336 7.47578747109577e-05 -1532 7.398451738636158e-05 -29348 7.243780273716936e-05 -2819619 7.166444541257325e-05 -2714355 7.063330231311176e-05 -53442 7.063330231311176e-05 -2093856 6.985994498851564e-05 -1884263 6.882880188905415e-05 -84112 6.805544456445804e-05 -2956063 6.75398730147273e-05 -2666100 6.728208723986192e-05 -1433513 6.547758681580433e-05 -3068329 6.470422949120822e-05 -33035 6.39308721666121e-05 -157691 6.341530061688137e-05 -2801997 6.21263717425545e-05 -305719 6.21263717425545e-05 -1705617 6.21263717425545e-05 -33043 6.135301441795838e-05 -2518605 6.03218713184969e-05 -33039 6.006408554363153e-05 -3003601 5.929072821903542e-05 -1243007 5.903294244417005e-05 -58231 5.877515666930467e-05 -2583452 5.85173708944393e-05 -2866573 5.697065624524707e-05 -2714358 5.67128704703817e-05 -2936770 5.6455084695516335e-05 -2912188 5.593951314578559e-05 -2563662 5.439279849659336e-05 -2748316 5.3877226946862615e-05 -1796616 5.310386962226651e-05 -2913621 5.310386962226651e-05 -2420310 5.284608384740113e-05 -52227 5.233051229767039e-05 +accession reads +GCF_024759225.1 460932 +GCF_020735905.1 409519 +GCF_963360665.1 405413 +GCF_016117815.1 210286 +GCF_013393365.1 167451 +GCF_018289315.1 101649 +GCF_020091405.1 100976 +GCF_032163505.1 95005 +GCF_018406505.1 89979 +GCF_026057735.1 85926 +GCF_008728395.1 72563 +GCF_002082765.1 72089 +GCF_018289135.1 67404 +GCF_004104465.2 66933 +GCF_017753665.1 63391 +GCF_009193325.2 54430 +GCF_900637515.1 53786 +GCF_002005185.1 51199 +GCF_002094955.1 44723 +GCF_024205685.1 37481 +GCF_001262035.1 36663 +GCF_016888945.1 30272 +GCF_014334015.1 30038 +GCF_030644385.1 29606 +GCF_019931005.1 27552 +GCF_013009555.1 26283 +GCF_963360645.1 24976 +GCF_002763695.1 24689 +GCF_008369705.1 23303 +GCF_013267835.1 22663 +GCF_025914115.1 22347 +GCF_013267735.1 21730 +GCF_001298465.1 21151 +GCF_005696695.1 21084 +GCF_001548235.1 20477 +GCF_900475505.1 18344 +GCF_013267415.1 17169 +GCF_016549395.1 16996 +GCF_034137685.1 16920 +GCF_002998925.1 16729 +GCF_024760065.1 16702 +GCF_001274535.1 16595 +GCF_022845635.1 15703 +GCF_002849795.1 15496 +GCF_025147085.1 14232 +GCF_002302415.1 13899 +GCF_011612265.2 13203 +GCF_022404755.1 12931 +GCF_027923645.1 12582 +GCF_030008055.1 12572 +GCF_009730295.1 9956 +GCF_019334725.1 9816 +GCF_027945475.1 9756 +GCF_030408675.1 9730 +GCF_025914295.1 9584 +GCF_002302595.1 9296 +GCF_026810185.1 9262 +GCF_021497965.1 9211 +GCF_022749515.1 9112 +GCF_946902045.1 9036 +GCF_008330925.1 8860 +GCF_012113595.1 8756 +GCF_034134805.1 8230 +GCF_013394695.1 7955 +GCF_014054985.1 7551 +GCF_008727815.1 7510 +GCF_946902905.1 7377 +GCF_022453685.1 7360 +GCF_003351545.1 7143 +GCF_021222645.1 7132 +GCF_019334745.1 6727 +GCF_037967965.1 6353 +GCF_036323475.1 6138 +GCF_032452855.1 5861 +GCF_940796315.1 5815 +GCF_963677685.1 5753 +GCF_018127845.1 5572 +GCF_020550085.1 5475 +GCF_014596425.2 5463 +GCF_009193295.2 5339 +GCF_003589745.1 5151 +GCF_023008285.1 5046 +GCF_020091485.1 4894 +GCF_016127355.1 4891 +GCF_003019755.1 4829 +GCF_902388275.1 4821 +GCF_013394715.1 4435 +GCF_020091345.1 4315 +GCF_001553685.1 4307 +GCF_016697125.1 4282 +GCF_018289295.1 4250 +GCF_032342915.1 4209 +GCF_002763715.1 4017 +GCF_030644365.1 3922 +GCF_918429265.1 3855 +GCF_005696855.1 3850 +GCF_016127855.1 3792 +GCF_025150745.1 3611 +GCF_963931595.1 3582 +GCF_032340315.1 3577 +GCF_025151715.1 3542 +GCF_037911965.1 3306 +GCF_005221285.1 3221 +GCF_025914175.1 3163 +GCF_013874375.1 3147 +GCF_900636505.1 3093 +GCF_015679285.1 2885 +GCF_009730375.1 2856 +GCF_002073815.2 2791 +GCF_037911955.1 2754 +GCF_002302615.1 2552 +GCF_025152575.1 2542 +GCF_018127725.1 2479 +GCF_900120245.1 2376 +GCF_001587175.1 2300 +GCF_020097375.1 2256 +GCF_900683755.1 2219 +GCF_020341675.1 2210 +GCF_018127745.1 2193 +GCF_000001405.40 2171 +GCF_012273215.1 2100 +GCF_001683375.1 2032 +GCF_007990365.1 2031 +GCF_004328515.1 1994 +GCF_002998535.1 1991 +GCF_020181455.1 1903 +GCF_000722765.2 1886 +GCF_016694895.1 1841 +GCF_036416795.1 1838 +GCF_003351565.1 1791 +GCF_028743455.1 1784 +GCF_008253725.1 1769 +GCF_030644325.1 1753 +GCF_038630745.1 1732 +GCF_000479315.1 1703 +GCF_900478185.1 1696 +GCF_032387735.1 1618 +GCF_007990635.1 1575 +GCF_020735865.1 1560 +GCF_019551945.1 1539 +GCF_011801285.1 1534 +GCF_900637555.1 1528 +GCF_020735745.1 1489 +GCF_002209445.1 1484 +GCF_014337175.1 1466 +GCF_018128205.1 1446 +GCF_037889265.1 1441 +GCF_019930845.1 1439 +GCF_002356055.1 1424 +GCF_001444445.1 1408 +GCF_030644185.1 1376 +GCF_029581355.1 1372 +GCF_033096525.1 1359 +GCF_038424135.1 1346 +GCF_900187285.1 1326 +GCF_002234575.2 1318 +GCF_008727735.1 1269 +GCF_024181625.1 1266 +GCF_003033925.1 1256 +GCF_020091425.1 1229 +GCF_018127985.1 1213 +GCF_005697565.1 1209 +GCF_900637655.1 1207 +GCF_004154955.1 1189 +GCF_018866205.1 1157 +GCF_018128125.1 1149 +GCF_023744375.2 1116 +GCF_020736165.1 1104 +GCF_004115325.2 1076 +GCF_963967315.1 1073 +GCF_002966695.1 1060 +GCF_007990545.2 1055 +GCF_022453915.1 1050 +GCF_018127765.1 1046 +GCF_018127805.1 1034 +GCF_963666085.1 1034 +GCF_900699785.1 1019 +GCF_029691405.1 1012 +GCF_037966635.1 987 +GCF_002998435.1 984 +GCF_019334785.1 957 +GCF_030219305.1 930 +GCF_037963785.1 928 +GCF_900477945.1 907 +GCF_002237445.1 904 +GCF_000210695.1 904 +GCF_002999135.1 902 +GCF_022845675.1 900 +GCF_900475315.1 868 +GCF_006228325.1 853 +GCF_029011355.1 842 +GCF_018140635.1 828 +GCF_003627135.1 821 +GCF_024759285.1 819 +GCF_019552345.1 799 +GCF_032451715.1 796 +GCF_023347355.1 788 +GCF_000209835.1 772 +GCF_002355895.1 770 +GCF_034051595.1 765 +GCF_018128245.1 760 +GCF_003574015.1 749 +GCF_037911825.1 732 +GCF_943181435.1 726 +GCF_900636445.1 725 +GCF_920939465.1 710 +GCF_030644205.1 702 +GCF_016127115.1 678 +GCF_023008345.1 673 +GCF_034270385.1 666 +GCF_001262055.1 664 +GCF_001940165.2 651 +GCF_900637305.1 642 +GCF_014287515.2 618 +GCF_025150245.1 618 +GCF_020097435.1 608 +GCF_002243385.1 600 +GCF_016127875.1 587 +GCF_033539415.1 580 +GCF_016904155.1 579 +GCF_009731465.1 571 +GCF_023347295.1 557 +GCF_036417395.1 554 +GCF_023822465.1 552 +GCF_020735385.1 537 +GCF_023347235.1 529 +GCF_007990525.1 525 +GCF_004124015.1 515 +GCF_018128305.1 512 +GCF_017798005.1 510 +GCF_016887735.2 504 +GCF_025149285.1 495 +GCF_023347275.1 482 +GCF_000803625.1 479 +GCF_020736205.1 472 +GCF_027474965.1 471 +GCF_032878955.1 468 +GCF_002734145.1 456 +GCF_002257605.1 449 +GCF_020735725.1 419 +GCF_900637975.1 416 +GCF_024730685.1 412 +GCF_030296935.1 411 +GCF_963931395.1 402 +GCF_025148445.1 390 +GCF_023896015.1 390 +GCF_007990505.1 390 +GCF_024181205.1 378 +GCF_001189555.1 373 +GCF_018406465.1 373 +GCF_005848555.1 367 +GCF_001554015.1 363 +GCF_020735565.1 347 +GCF_011038705.2 340 +GCF_028743775.1 339 +GCF_016127595.1 337 +GCF_001190745.1 337 +GCF_023347255.1 336 +GCF_033096465.1 332 +GCF_023347335.1 331 +GCF_005121165.3 329 +GCF_902381825.1 328 +GCF_020736365.1 315 +GCF_963677565.1 299 +GCF_002216145.1 299 +GCF_023347315.1 296 +GCF_003991565.1 289 +GCF_018128225.1 286 +GCF_900636515.1 284 +GCF_001940225.2 280 +GCF_014055025.1 280 +GCF_024758225.1 279 +GCF_014334835.1 273 +GCF_023347535.1 270 +GCF_003287895.1 269 +GCF_023008305.1 267 +GCF_021378605.1 263 +GCF_024346585.1 259 +GCF_035666155.1 256 +GCF_018408575.1 251 +GCF_009867035.2 251 +GCF_022845735.1 248 +GCF_003627155.1 246 +GCF_033947525.1 246 +GCF_037076355.1 244 +GCF_024722395.1 244 +GCF_008327825.1 242 +GCF_009671065.1 241 +GCF_001278825.1 238 +GCF_017347605.1 235 +GCF_012273195.1 234 +GCF_027125355.1 230 +GCF_017161265.1 225 +GCF_902141215.1 224 +GCF_900187175.1 223 +GCF_003812445.1 221 +GCF_916618745.1 221 +GCF_033688205.1 220 +GCF_963667135.1 219 +GCF_028463985.1 218 +GCF_003175155.1 218 +GCF_034355335.1 214 +GCF_013394735.1 209 +GCF_019249725.2 208 +GCF_022024015.1 205 +GCF_024181185.1 203 diff --git a/mess/data/hmp_templates/throat/SRS014475.tsv b/mess/data/hmp_templates/throat/SRS014475.tsv index b40512c..b87f3ba 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/throat/SRS014475.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/throat/SRS014475.tsv @@ -1,108 +1,110 @@ -taxon seq_abundance -487 0.3984280677807678 -727 0.1934351985964626 -9606 0.083377688428791 -729 0.0325588037291662 -28132 0.0181747708217036 -1318 0.0142486494105254 -470565 0.0141225387558442 -1660 0.0110365368530569 -28037 0.0098217945175247 -3059028 0.0092728422559712 -2682456 0.0086237432980532 -43675 0.0083270123458621 -423477 0.0077873329265646 -1304 0.007466492584508 -39777 0.0066634644451409 -712623 0.0065855725701907 -2663009 0.006292550754902 -46124 0.0059791286866502 -1177574 0.0056879614398127 -1303 0.0056823977344591 -485 0.0048904970057992 -1313 0.0048738058897384 -2841264 0.004870096752836 -3098075 0.0047977685832395 -199 0.0047792228987275 -28449 0.0046642396547535 -84135 0.0045659475268402 -2682455 0.0044157274822935 -486 0.0041041599824928 -2972784 0.0037425191345099 -2610896 0.0033178229591865 -38284 0.003150911798579 -712633 0.0031434935247742 -2759692 0.003141638956323 -2899133 0.0030730199236288 -3098076 0.0029524729743012 -157687 0.0028245077511688 -39778 0.0028152349089128 -3077584 0.0028059620666568 -114527 0.0027707252660842 -28137 0.0026427600429518 -28133 0.0026205052215374 -28131 0.0025222130936241 -712362 0.0023794113228822 -655307 0.0023478836592119 -3059030 0.0022588643735545 -1379 0.0021735542247996 -68892 0.0020789712337887 -29466 0.0018397319035846 -652716 0.0017507126179273 -2490855 0.0017228940911594 -1759399 0.0015430009513936 -113107 0.0015355826775888 -2047 0.0015207461299792 -726 0.0014484179603827 -1311 0.0014391451181267 -483 0.0014224540020659 -1382 0.0014168902967124 -2819619 0.0013241618741526 -1305 0.0011646689873499 -172042 0.001146123302838 -267212 0.0011349958921308 -2937985 0.0011183047760701 -33053 0.0010719405647902 -860 0.0010663768594366 -712357 0.001031140058864 -495 0.0010070306689984 -712361 0.0010051761005472 -488 0.0009847758475841 -257758 0.0009792121422305 -1871109 0.0009792121422305 -1433513 0.0009198659517923 -28135 0.0009087385410851 -2598453 0.000897611130378 -2972775 0.0008642288982565 -851 0.0008586651929029 -33033 0.0008345558030374 -490 0.0008178646869766 -1156431 0.0007919007286599 -684066 0.000773355044148 -248315 0.0007696459072456 -1852377 0.0007306999697705 -3077590 0.0007177179906121 -45634 0.000706590579905 -617123 0.000678772053137 -43768 0.0006750629162347 -1747 0.0006324078418572 -544580 0.000630553273406 -505 0.0006286987049548 -52773 0.0005897527674797 -735 0.0005266974401391 -1302 0.0005174245978831 -28129 0.0005081517556272 -76857 0.0004988789133712 -2820817 0.0004951697764688 -3038077 0.0004673512497009 -484 0.0004654966812497 -496 0.0004580784074449 -539 0.0004562238389937 -29391 0.0004450964282866 -712310 0.0004321144491282 -1547448 0.000420987038421 -712435 0.0004098596277139 -40215 0.0003894593747507 -1839799 0.0003894593747507 -712710 0.00037276825869 -1902136 0.0003709136902388 +accession reads +GCF_008330925.1 214663 +GCF_002966695.1 104834 +GCF_000001405.40 48171 +GCF_004104465.2 17440 +GCF_020735905.1 9147 +GCF_018128125.1 7778 +GCF_032163505.1 7697 +GCF_005696695.1 5905 +GCF_000722765.2 5066 +GCF_030644365.1 5046 +GCF_013393365.1 4674 +GCF_001548235.1 4539 +GCF_026057735.1 4158 +GCF_002082765.1 3574 +GCF_013394695.1 3552 +GCF_021222645.1 3521 +GCF_002763695.1 3394 +GCF_002094955.1 3373 +GCF_002849795.1 3252 +GCF_019931005.1 3233 +GCF_016549395.1 3015 +GCF_038424135.1 2659 +GCF_034137685.1 2600 +GCF_001298465.1 2578 +GCF_024205685.1 2494 +GCF_008253725.1 2479 +GCF_009730295.1 2378 +GCF_018406505.1 2365 +GCF_003351565.1 2255 +GCF_012273215.1 2172 +GCF_946902905.1 2020 +GCF_008727815.1 1790 +GCF_940796315.1 1700 +GCF_001553685.1 1696 +GCF_030515895.1 1692 +GCF_034134805.1 1596 +GCF_032340315.1 1534 +GCF_018127845.1 1521 +GCF_007990545.2 1519 +GCF_900637515.1 1497 +GCF_018127765.1 1471 +GCF_002998925.1 1464 +GCF_002763715.1 1427 +GCF_018128245.1 1283 +GCF_002237445.1 1270 +GCF_030644385.1 1210 +GCF_002005185.1 1130 +GCF_021497965.1 1119 +GCF_963967315.1 1113 +GCF_030008055.1 928 +GCF_001587175.1 835 +GCF_013267735.1 818 +GCF_036323475.1 809 +GCF_900636505.1 808 +GCF_900477945.1 778 +GCF_019552345.1 775 +GCF_900475315.1 772 +GCF_024346585.1 683 +GCF_037911955.1 670 +GCF_943181435.1 640 +GCF_918429265.1 627 +GCF_003390995.1 624 +GCF_900475505.1 620 +GCF_019334745.1 620 +GCF_014055025.1 603 +GCF_019334725.1 599 +GCF_037076355.1 597 +GCF_001274535.1 556 +GCF_014596425.2 542 +GCF_018128225.1 540 +GCF_013267835.1 537 +GCF_003351545.1 534 +GCF_018866205.1 528 +GCF_900637655.1 498 +GCF_003627155.1 477 +GCF_027474965.1 474 +GCF_946902045.1 469 +GCF_009731465.1 449 +GCF_017753665.1 431 +GCF_000221985.1 418 +GCF_000479315.1 415 +GCF_900187285.1 411 +GCF_018127725.1 409 +GCF_032342915.1 397 +GCF_900120245.1 395 +GCF_900478185.1 381 +GCF_003019755.1 370 +GCF_003589745.1 368 +GCF_011612265.2 363 +GCF_018128205.1 342 +GCF_027945475.1 337 +GCF_014054985.1 329 +GCF_037967965.1 314 +GCF_037911965.1 312 +GCF_001262055.1 308 +GCF_008330025.1 284 +GCF_037889265.1 280 +GCF_026810185.1 277 +GCF_009867035.2 271 +GCF_017798005.1 267 +GCF_005221285.1 255 +GCF_019930845.1 251 +GCF_002998595.1 232 +GCF_019973735.1 226 +GCF_029691405.1 225 +GCF_018127745.1 219 +GCF_021491935.1 207 +GCF_003033925.1 201 +GCF_002073815.2 200 diff --git a/mess/data/hmp_templates/throat/SRS014689.tsv b/mess/data/hmp_templates/throat/SRS014689.tsv index 9cdd1ba..7c63f42 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/throat/SRS014689.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/throat/SRS014689.tsv @@ -1,324 +1,312 @@ -taxon seq_abundance -28132 0.1257646587922544 -2682456 0.0701570447949175 -39777 0.067965603861142 -1177574 0.0594272771001466 -1660 0.0578875026432649 -39778 0.0479733709935655 -2663009 0.0462388372887421 -1304 0.042868238760605 -199 0.0397852042227174 -2682455 0.038867323203335 -423477 0.0297124766753652 -1318 0.0274494352127044 -712623 0.0261391310106683 -3059028 0.0250410141771951 -860 0.0184906550417229 -43675 0.0162283397507546 -28133 0.0151543318174741 -470565 0.0147308284863793 -29466 0.0141291226219329 -114527 0.0107190203537211 -46124 0.010100322071669 -2899133 0.0098412240117674 -3098075 0.0084507504548739 -28131 0.0083297702508952 -2972784 0.0070939712645147 -712633 0.006547744917379 -1303 0.0064623471263352 -3098076 0.0063361384861702 -2841264 0.006334395674108 -9606 0.0062954728713874 -28037 0.0062713639711948 -2610896 0.0062617785048531 -1382 0.0061627286859894 -729 0.00588489539642 -3077584 0.0058175066633514 -68892 0.0046607151571203 -1852377 0.0045663128370888 -3059030 0.0042125219884788 -84135 0.00406133304209 -2759692 0.0035062474003053 -851 0.0034044381290099 -28135 0.0033438754098513 -1313 0.0028303267888803 -2490855 0.0027542239955012 -76857 0.0022177283490457 -1839799 0.0021987026507009 -52773 0.0021154833747348 -652716 0.0019920341870014 -589437 0.0018970509296159 -684066 0.0017779587720378 -76859 0.0015770996818787 -28129 0.0015027397005616 -712538 0.0014248940951203 -1583098 0.0013930877749866 -617123 0.0013869879327692 -113107 0.0013861165267382 -28125 0.0013821951995984 -157687 0.0011554843971845 -713030 0.0010684890284171 -28137 0.001059629733768 -712357 0.0010314542720971 -1308 0.0010183831816312 -248315 0.0009995027176249 -1379 0.0009607251492428 -2047 0.00083916400791 -1302 0.0008147646390403 -1156431 0.000810117140208 -2819619 0.0008005316738664 -2598453 0.0007964651123881 -1759399 0.0007642230892389 -589436 0.0007351762215369 -76123 0.0007241384118102 -28128 0.0006574758504341 -1433513 0.0006490522588006 -114528 0.0006351097623036 -315405 0.0005681567322506 -155615 0.0005059964353683 -2382163 0.0005032369829367 -1311 0.0004654760549241 -544580 0.0004582143379986 -33033 0.0004479026999644 -29391 0.0004253913774954 -1234680 0.0004221962220481 -39491 0.0004221962220481 -1305 0.000419582003955 -1338 0.000419291535278 -1747 0.0004178391918929 -181487 0.0004136273960761 -285729 0.0004036062267189 -1328 0.0004034609923804 -76860 0.0003931493543462 -1343 0.0003890827928679 -28124 0.0003866138091132 -257758 0.0003808044355728 -59561 0.0003610525655355 -131111 0.0003566955353802 -282402 0.0003553884263336 -1902136 0.0003549527233181 -2144175 0.0003462386630075 -1019 0.0003305533544484 -2420310 0.0003150132802279 -837 0.0003119633591192 -2093824 0.0003070253916098 -28127 0.000302813595793 -3038077 0.0002910496143737 -2576376 0.0002824807884017 -1307 0.0002798665703085 -137732 0.0002740571967681 -2806552 0.0002686835262432 -1336 0.0002604051689482 -69823 0.000251255405622 -1334 0.0002466079067897 -712471 0.0002450103290661 -1675036 0.0002346986910319 -45634 0.0002338272850008 -907 0.0002015852618517 -712435 0.000192580732864 -2133944 0.0001918545611715 -2801997 0.0001888046400628 -1232428 0.0001879332340317 -1884263 0.0001857547189541 -726 0.0001799453454137 -28112 0.0001776215959975 -712710 0.0001693432387025 -43768 0.0001671647236248 -77095 0.000162662459131 -2794089 0.0001612101157459 -1017 0.0001609196470689 -2709403 0.0001597577723608 -162156 0.0001533674614664 -204 0.0001487199626341 -712310 0.0001474128535875 -2763540 0.0001371012155533 -445930 0.0001353584034912 -2789425 0.000132744185398 -52227 0.0001320180137054 -165179 0.0001266443431806 -817 0.0001249015311184 -554406 0.0001214159069942 -712361 0.0001193826262551 -2708117 0.0001166231738234 -143361 0.0001156065334538 -1522 0.0001150255960998 -454154 0.0001140089557302 -727 0.0001134280183762 -1314 0.000110813800283 -172042 0.0001097971599134 -158 0.0001089257538824 -644007 0.0001060210671122 -1018 0.0001051496610811 -43765 0.0001012283339413 -859 9.977599055628236e-05 -3022127 9.396661701588748e-05 -712116 9.28047423078085e-05 -1718 9.17881019382394e-05 -109328 9.149763326121963e-05 -3003601 9.091669590718016e-05 -712362 9.048099289165052e-05 -28113 8.786677479847283e-05 -69710 8.714060310592347e-05 -1785996 8.568825972082475e-05 -39950 8.321927596615691e-05 -2583584 8.205740125807793e-05 -824 7.915271448788048e-05 -1661 7.900748014937062e-05 -34105 7.726466808725214e-05 -1785995 7.363380962450533e-05 -1624 7.334334094748558e-05 -2572088 7.014818550026839e-05 -2913621 6.985771682324865e-05 -2722820 6.913154513069929e-05 -2545799 6.898631079218941e-05 -46125 6.898631079218941e-05 -135079 6.811490476113018e-05 -84030 6.724349873007095e-05 -2518605 6.666256137603146e-05 -1309 6.651732703752158e-05 -1501662 6.579115534497222e-05 -33040 6.564592100646235e-05 -410072 6.564592100646235e-05 -208479 6.259599989775503e-05 -1352 6.245076555924515e-05 -322095 6.245076555924515e-05 -33035 6.201506254371554e-05 -66228 6.186982820520567e-05 -327575 6.172459386669579e-05 -1655 6.157935952818592e-05 -2913614 6.0998422174146425e-05 -2702 6.0707953497126686e-05 -712122 6.056271915861681e-05 -2691580 6.056271915861681e-05 -361101 6.041748482010694e-05 -28188 5.940084445053783e-05 -357276 5.8819907096498345e-05 -1351 5.794850106543911e-05 -818 5.693186069587e-05 -40542 5.678662635736013e-05 -2913616 5.635092334183051e-05 -1396 5.620568900332064e-05 -2057800 5.620568900332064e-05 -2744574 5.475334561822191e-05 -29347 5.4172408264182426e-05 -1335 5.388193958716268e-05 -2937774 5.373670524865281e-05 -39486 5.373670524865281e-05 -157691 5.315576789461332e-05 -157688 5.2284361863554085e-05 -52774 5.199389318653434e-05 -839 5.141295583249485e-05 -185007 5.1267721493984974e-05 -2079536 5.097725281696523e-05 -487173 5.097725281696523e-05 -2763672 5.068678413994548e-05 -675090 5.039631546292574e-05 -43305 5.025108112441587e-05 -154046 4.9960612447396125e-05 -454155 4.923444075484676e-05 -166486 4.908920641633689e-05 -699041 4.8943972077827015e-05 -706438 4.836303472378752e-05 -884684 4.821780038527765e-05 -301301 4.749162869272829e-05 -328813 4.720116001570855e-05 -1912897 4.7055925677198674e-05 -33038 4.69106913386888e-05 -562 4.632975398464931e-05 -28119 4.632975398464931e-05 -656366 4.632975398464931e-05 -28264 4.560358229209995e-05 -1496 4.5313113615080205e-05 -2913620 4.487741059955059e-05 -853 4.473217626104072e-05 -2081702 4.473217626104072e-05 -82348 4.458694192253084e-05 -820 4.4296473245511095e-05 -1755100 4.415123890700122e-05 -1280 4.386077022998148e-05 -3058373 4.342506721445186e-05 -3028070 4.342506721445186e-05 -1329 4.342506721445186e-05 -53419 4.327983287594199e-05 -28111 4.2989364198922246e-05 -103621 4.2989364198922246e-05 -53442 4.255366118339263e-05 -1340 4.182748949084326e-05 -2598457 4.182748949084326e-05 -2576606 4.182748949084326e-05 -2563662 4.16822551523334e-05 -2057743 4.16822551523334e-05 -84112 4.081084912127416e-05 -46507 4.0665614782764286e-05 -39485 4.052038044425441e-05 -999183 4.037514610574454e-05 -2094151 3.935850573617544e-05 -1573823 3.906803705915569e-05 -1406 3.84870997051162e-05 -203 3.84870997051162e-05 -45851 3.84870997051162e-05 -2733571 3.805139668958658e-05 -111015 3.805139668958658e-05 -147802 3.790616235107671e-05 -2763062 3.7760928012566834e-05 -168384 3.761569367405696e-05 -33039 3.761569367405696e-05 -505 3.747045933554709e-05 -376805 3.747045933554709e-05 -33007 3.747045933554709e-05 -831 3.732522499703722e-05 -649756 3.732522499703722e-05 -185008 3.703475632001748e-05 -1888195 3.68895219815076e-05 -861 3.674428764299773e-05 -29375 3.659905330448786e-05 -1260 3.630858462746811e-05 -33905 3.616335028895824e-05 -216816 3.616335028895824e-05 -29389 3.6018115950448366e-05 -66219 3.572764727342862e-05 -2718 3.572764727342862e-05 -1667168 3.529194425789901e-05 -1310 3.5146709919389136e-05 -418240 3.5146709919389136e-05 -573 3.471100690385952e-05 -52771 3.471100690385952e-05 -2583452 3.442053822683977e-05 -1502 3.42753038883299e-05 -3036302 3.398483521131015e-05 -397865 3.383960087280028e-05 -58231 3.383960087280028e-05 -88431 3.3694366534290407e-05 -3070215 3.3694366534290407e-05 -2861280 3.3694366534290407e-05 -39496 3.296819484174105e-05 -1643512 3.296819484174105e-05 -200 3.253249182621143e-05 -712411 3.253249182621143e-05 -1679721 3.238725748770156e-05 -46228 3.2242023149191684e-05 -28116 3.2242023149191684e-05 -47671 3.2242023149191684e-05 -2582419 3.1806320133662065e-05 -2811781 3.151585145664232e-05 -74426 3.151585145664232e-05 -40520 3.1225382779622574e-05 -747 3.1225382779622574e-05 -1243007 3.1225382779622574e-05 -2758572 3.10801484411127e-05 -1532 3.10801484411127e-05 -821 3.0934914102602835e-05 -89014 3.078967976409296e-05 -595468 3.078967976409296e-05 -46506 3.064444542558309e-05 -1659 3.064444542558309e-05 -1491 3.0353976748563343e-05 -1912795 3.0353976748563343e-05 -2820817 3.020874241005347e-05 -133926 3.020874241005347e-05 -157692 2.9918273733033724e-05 -2057798 2.9918273733033724e-05 -732 2.9482570717504102e-05 -712368 2.933733637899424e-05 -3077723 2.9192102040484363e-05 -3028082 2.904686770197449e-05 +accession reads +GCF_020735905.1 870439 +GCF_013393365.1 480410 +GCF_002082765.1 466475 +GCF_002849795.1 405890 +GCF_005696695.1 397396 +GCF_900637515.1 328409 +GCF_002763695.1 327247 +GCF_001298465.1 273900 +GCF_018406505.1 265954 +GCF_002094955.1 260299 +GCF_026057735.1 194495 +GCF_032163505.1 189946 +GCF_013394695.1 180465 +GCF_030644365.1 172226 +GCF_002005185.1 118493 +GCF_003019755.1 115541 +GCF_001548235.1 113726 +GCF_018127845.1 102726 +GCF_021222645.1 102556 +GCF_018128125.1 101175 +GCF_036323475.1 88313 +GCF_002998925.1 72177 +GCF_019931005.1 69251 +GCF_034137685.1 58555 +GCF_002763715.1 56648 +GCF_000001405.40 50185 +GCF_946902905.1 48944 +GCF_001553685.1 45195 +GCF_034134805.1 44025 +GCF_008727815.1 43350 +GCF_016549395.1 42790 +GCF_000722765.2 40969 +GCF_004104465.2 40096 +GCF_032340315.1 39882 +GCF_021497965.1 32229 +GCF_900120245.1 31371 +GCF_030644385.1 28748 +GCF_009730295.1 27397 +GCF_037911965.1 26396 +GCF_037911955.1 24139 +GCF_940796315.1 23985 +GCF_900637655.1 22834 +GCF_008253725.1 20799 +GCF_030008055.1 18750 +GCF_002073815.2 16306 +GCF_018128205.1 14419 +GCF_001262055.1 14207 +GCF_037889265.1 12617 +GCF_018127725.1 12238 +GCF_038630745.1 11658 +GCF_012273215.1 10541 +GCF_037966635.1 10346 +GCF_018866205.1 10039 +GCF_963967315.1 9762 +GCF_001189555.1 9674 +GCF_003589745.1 9506 +GCF_030219305.1 9496 +GCF_900636505.1 9403 +GCF_011801285.1 8976 +GCF_007990545.2 7937 +GCF_037967965.1 7747 +GCF_019551945.1 7698 +GCF_001554015.1 7208 +GCF_018127765.1 7095 +GCF_001274535.1 7057 +GCF_900187285.1 6572 +GCF_026810185.1 5774 +GCF_013267735.1 5746 +GCF_000479315.1 5367 +GCF_009731465.1 5352 +GCF_001587175.1 5294 +GCF_024346585.1 5253 +GCF_028743775.1 4513 +GCF_037911825.1 4425 +GCF_003627155.1 4337 +GCF_022453685.1 3962 +GCF_001444445.1 3932 +GCF_030644205.1 3902 +GCF_003627135.1 3403 +GCF_037076355.1 3217 +GCF_002243385.1 3133 +GCF_029011355.1 3118 +GCF_027945475.1 3103 +GCF_900636445.1 3075 +GCF_019552345.1 2999 +GCF_027474965.1 2950 +GCF_019334785.1 2934 +GCF_003390995.1 2890 +GCF_001683375.1 2854 +GCF_900475505.1 2854 +GCF_020097375.1 2664 +GCF_003367905.1 2547 +GCF_020097435.1 2524 +GCF_030246965.1 2462 +GCF_002355895.1 2429 +GCF_018127985.1 2408 +GCF_019380255.1 2385 +GCF_001746855.1 2366 +GCF_002302595.1 2278 +GCF_000221985.1 2240 +GCF_016127595.1 2201 +GCF_023822465.1 2082 +GCF_020735565.1 2053 +GCF_037963785.1 1955 +GCF_029691405.1 1880 +GCF_016887735.2 1877 +GCF_003812445.1 1841 +GCF_006228325.1 1807 +GCF_026015965.1 1797 +GCF_020735385.1 1747 +GCF_002356055.1 1726 +GCF_018127805.1 1673 +GCF_900478185.1 1568 +GCF_003315775.1 1522 +GCF_016127875.1 1518 +GCF_035666155.1 1402 +GCF_003006415.1 1348 +GCF_018127745.1 1325 +GCF_017347605.1 1306 +GCF_032451715.1 1303 +GCF_003265305.2 1282 +GCF_020181515.1 1271 +GCF_000803625.1 1268 +GCF_900477945.1 1260 +GCF_003033925.1 1160 +GCF_011612265.2 1155 +GCF_011038885.2 1133 +GCF_002302415.1 1108 +GCF_018986735.1 1080 +GCF_963677685.1 1050 +GCF_002998595.1 1040 +GCF_900699785.1 1022 +GCF_001717585.1 973 +GCF_016694895.1 941 +GCF_015711475.1 938 +GCF_031885465.1 934 +GCF_001683335.1 853 +GCF_902388275.1 845 +GCF_024181625.1 839 +GCF_007990635.1 834 +GCF_008369705.1 832 +GCF_022024195.1 828 +GCF_002966695.1 822 +GCF_018128225.1 809 +GCF_002209445.1 807 +GCF_004124015.1 799 +GCF_027923645.1 768 +GCF_019334745.1 721 +GCF_020736165.1 716 +GCF_000886415.1 710 +GCF_022845735.1 699 +GCF_016127615.1 683 +GCF_949152215.1 636 +GCF_013267415.1 631 +GCF_900106055.1 627 +GCF_013394715.1 627 +GCF_007990365.1 624 +GCF_037955985.1 623 +GCF_034270385.1 623 +GCF_018128245.1 611 +GCF_027125355.1 607 +GCF_001447865.2 604 +GCF_014250475.1 599 +GCF_002998535.1 590 +GCF_001553645.1 588 +GCF_024181205.1 586 +GCF_005697565.1 578 +GCF_001717505.1 576 +GCF_003971445.1 550 +GCF_001190745.1 540 +GCF_902141215.1 537 +GCF_014334035.1 537 +GCF_033096525.1 529 +GCF_002983685.1 518 +GCF_022024015.1 503 +GCF_013184985.2 479 +GCF_009730375.1 476 +GCF_019249725.2 472 +GCF_008831345.1 471 +GCF_001721905.1 470 +GCF_030062915.1 469 +GCF_003175155.1 466 +GCF_900636365.1 449 +GCF_018986875.1 444 +GCF_900636465.1 431 +GCF_029101545.1 430 +GCF_022845615.1 430 +GCF_002302615.1 426 +GCF_019551475.1 422 +GCF_001278845.1 414 +GCF_022024075.1 411 +GCF_000209835.1 406 +GCF_016127855.1 406 +GCF_002871995.2 404 +GCF_900636525.1 401 +GCF_900637625.1 401 +GCF_016812035.1 398 +GCF_902141225.1 393 +GCF_030758955.1 391 +GCF_002302565.1 390 +GCF_009867035.2 388 +GCF_024760065.1 387 +GCF_018389405.1 386 +GCF_037963285.1 386 +GCF_004102025.1 384 +GCF_022024035.1 384 +GCF_025151715.1 379 +GCF_012273195.1 378 +GCF_014595995.2 377 +GCF_013009555.1 373 +GCF_020736365.1 370 +GCF_001553915.1 369 +GCF_001940165.2 367 +GCF_007990525.1 366 +GCF_026684175.1 364 +GCF_008327825.1 360 +GCF_900637295.1 360 +GCF_014117265.1 358 +GCF_033539415.1 351 +GCF_030644225.1 349 +GCF_033814055.1 348 +GCF_016904155.1 347 +GCF_022845675.1 346 +GCF_016598775.1 343 +GCF_032611355.1 339 +GCF_023204875.1 338 +GCF_003111765.1 338 +GCF_928721695.1 329 +GCF_000739105.1 323 +GCF_016906045.1 320 +GCF_001294625.1 319 +GCF_006088775.1 314 +GCF_033106825.1 313 +GCF_022024055.1 307 +GCF_002999235.1 307 +GCF_016117815.1 306 +GCF_014337175.1 304 +GCF_008935055.1 303 +GCF_030644325.1 302 +GCF_018140635.1 294 +GCF_023008345.1 294 +GCF_963360645.1 292 +GCF_025149285.1 290 +GCF_002443115.1 287 +GCF_900636575.1 285 +GCF_014844995.1 285 +GCF_000210695.1 284 +GCF_027474505.1 282 +GCF_025150245.1 278 +GCF_018289295.1 275 +GCF_024759225.1 275 +GCF_024181185.1 274 +GCF_028743455.1 274 +GCF_020138415.1 273 +GCF_029636405.1 272 +GCF_011058695.1 271 +GCF_026723765.1 265 +GCF_002234575.2 264 +GCF_014131715.1 263 +GCF_020736205.1 263 +GCF_023347725.1 262 +GCF_016906085.1 262 +GCF_003287895.1 260 +GCF_014054985.1 258 +GCF_022404755.1 257 +GCF_963677565.1 255 +GCF_013267535.1 252 +GCF_030759015.1 251 +GCF_002998435.1 251 +GCF_029625435.1 251 +GCF_900637165.1 250 +GCF_902385935.1 249 +GCF_020892095.1 248 +GCF_900637305.1 248 +GCF_001553565.1 247 +GCF_004803915.1 246 +GCF_022354665.1 245 +GCF_014287515.2 243 +GCF_020735745.1 242 +GCF_001708305.1 237 +GCF_008728395.1 235 +GCF_949769255.1 235 +GCF_900475365.1 235 +GCF_001940225.2 231 +GCF_017161265.1 224 +GCF_025148445.1 222 +GCF_900637555.1 222 +GCF_001318225.1 219 +GCF_029011175.1 219 +GCF_014926385.1 218 +GCF_918429265.1 218 +GCF_902381815.1 218 +GCF_963931395.1 217 +GCF_001620005.1 217 +GCF_001189515.2 217 +GCF_037901015.1 215 +GCF_900128725.1 214 +GCF_032387735.1 214 +GCF_014069575.1 213 +GCF_037076525.1 212 +GCF_943169825.2 212 +GCF_001262035.1 212 +GCF_001856685.1 211 +GCF_006547145.1 211 +GCF_021378605.1 211 +GCF_030253495.1 210 +GCF_017798005.1 210 +GCF_963667135.1 207 +GCF_002871945.2 206 +GCF_005696855.1 201 +GCF_032594915.1 200 diff --git a/mess/data/hmp_templates/throat/SRS065335.tsv b/mess/data/hmp_templates/throat/SRS065335.tsv index c366aa3..c9a4ef3 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/throat/SRS065335.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/throat/SRS065335.tsv @@ -1,214 +1,212 @@ -taxon seq_abundance -28132 0.0929854095522143 -199 0.0923510035715366 -729 0.0728080961948098 -2663009 0.0660534075520115 -28449 0.0524697344748488 -1177574 0.0478349227590698 -470565 0.0368360314124386 -39777 0.0352838277191814 -157687 0.0339447239310748 -9606 0.0311535155700845 -28137 0.0227345122192108 -652716 0.0202298097849781 -28133 0.0187483428034515 -423477 0.0146883224811057 -33053 0.0146229243891284 -28131 0.0145561916422128 -712538 0.0130364645524546 -2972775 0.0130022084090379 -860 0.0128349316567694 -1304 0.0126196073267217 -1318 0.0107684409272826 -712633 0.009831068275608 -2682456 0.0093670532420548 -2682455 0.0093488129578978 -713030 0.0090743189255849 -1019 0.0085182127012882 -1017 0.0080292841088864 -43675 0.0069197409701695 -1871109 0.0069001660310743 -327575 0.0063854341098652 -2545799 0.0063445046917569 -589437 0.0061518694956605 -3077584 0.0061073809977168 -1280 0.0058738163835122 -712435 0.0058609147191085 -490 0.00530614314975 -712362 0.0051161772635302 -84135 0.0051028307141471 -488 0.0049764833799869 -2490855 0.0049738140701103 -487 0.0046303628659846 -249188 0.0046001106873828 -2841264 0.0045649647740073 -39778 0.0045480591447887 -3077590 0.0045244802408785 -2899133 0.0043104905657691 -484 0.0039794961410676 -29466 0.0039332281032061 -69823 0.0035043589830285 -712357 0.0034643193348791 -1660 0.0033041607422816 -712623 0.0032747983336388 -2955512 0.0032512194297286 -76857 0.0032405421902221 -2972784 0.0031035176165554 -851 0.0025558642068679 -2759692 0.0025327301879372 -712361 0.002516269443698 -1303 0.0023329768321698 -28037 0.002281370174555 -46124 0.0022675787401925 -3059030 0.0020233368864813 -68892 0.001855170364254 -1313 0.001829811920426 -617123 0.00175551612886 -28128 0.0017150315957312 -1583098 0.0017065787811219 -28135 0.0017052441261836 -157691 0.0014369784835828 -3059028 0.0014280807839941 -2708117 0.0014263012440763 -28129 0.0013858167109475 -76859 0.0013591236121813 -28125 0.0013124106893403 -204 0.0012358904728771 -1884263 0.0012283274282267 -837 0.001179834965468 -726 0.00115447652164 -589436 0.0010832949249301 -486 0.00105170809139 -727 0.001037471772048 -109328 0.0008977778885047 -1852377 0.0008871006489982 -485 0.000873754099615 -1018 0.0008657461699852 -495 0.0008439468059927 -2610896 0.000785221988707 -113107 0.0007767691740977 -3098076 0.0007727652092827 -1316596 0.000749631190352 -3098075 0.0007189341267708 -712368 0.0006788944786214 -735 0.0006757802837654 -712471 0.0006748905138065 -76123 0.0006682172391149 -483 0.0006584297695673 -28127 0.0006575399996085 -712710 0.0006441934502253 -1785996 0.0006210594312946 -40542 0.0006081577668909 -114527 0.0005965907574255 -2598453 0.0005650039238855 -135079 0.0005494329496052 -496 0.0005480982946668 -248315 0.0005467636397285 -282402 0.0005307477804688 -1379 0.0005254091607155 -712310 0.0005240745057772 -1328 0.0005098381864352 -2937985 0.0005058342216203 -285729 0.0004711331932242 -155615 0.0004591212987794 -1382 0.0004337628549514 -1156431 0.0004230856154449 -1759399 0.0003914987819049 -732 0.0003403370092696 -76860 0.0003390023543313 -1308 0.0003345535045369 -157688 0.0003278802298453 -684066 0.0003216518401332 -69710 0.0003167581053594 -2819619 0.0003140887954828 -1839799 0.0003043013259351 -1305 0.0002842815018605 -3058373 0.0002833917319016 -39491 0.0002820570769633 -2093824 0.0002691554125596 -257758 0.0002669309876624 -2836367 0.0002669309876624 -1705617 0.0002647065627652 -1433513 0.0002549190932176 -29391 0.0002460213936288 -2576376 0.0002446867386905 -52227 0.0002442418537111 -165179 0.0002415725438345 -554406 0.000241127658855 -1311 0.0002393481189373 -360422 0.0002344543841635 -33033 0.000234009499184 -2583584 0.0002282259944513 -322095 0.0002228873746981 -1302 0.0002219976047392 -162156 0.0002188834098832 -718 0.0002130999051505 -203 0.0002108754802533 -2801997 0.0002050919755206 -818 0.0002037573205823 -58231 0.0002001982407468 -1234680 0.0001997533557673 -2420310 0.0001966391609113 -28124 0.0001961942759319 -1902136 0.0001850721514459 -2382163 0.0001828477265487 -859 0.0001797335316927 -1316593 0.0001792886467132 -2820817 0.00017395002696 -1336 0.000169946062145 -137732 0.0001695011771656 -77095 0.0001623830174946 -2836366 0.000159713707618 -1056807 0.0001579341677002 -36874 0.0001530404329264 -172042 0.0001521506629675 -2133944 0.0001494813530909 -2563662 0.0001494813530909 -120682 0.0001481466981526 -28113 0.0001459222732554 -28123 0.000145477388276 -867595 0.0001423631934199 -817 0.000141473423461 -1343 0.0001401387685227 -1314 0.0001388041135844 -28112 0.0001365796886872 -2497989 0.00013435526379 -52773 0.000131241068934 -189834 0.0001290166440368 -2709396 0.0001272371041191 -1643513 0.0001245677942424 -2748316 0.0001236780242836 -1244531 0.0001187842895097 -1643512 0.0001178945195509 -72 0.0001178945195509 -305719 0.0001178945195509 -2691580 0.0001165598646126 -1853276 0.0001161149796331 -1334 0.0001152252096742 -2666100 0.0001130007847771 -715 0.0001125558997976 -823 0.0001121110148182 -45634 0.0001116661298387 -1032243 0.0001116661298387 -2913614 0.0001103314749004 -89014 0.0001085519349827 -739 0.0001072172800444 -1307 0.0001045479701677 -1853278 0.0001036582002089 -2913621 0.00010276843025 -3003601 0.0001023235452706 -1539298 9.920935041454382e-05 -492 9.742981049679416e-05 -3038077 9.654004053791932e-05 -2518605 9.654004053791932e-05 -43768 9.565027057904447e-05 -326522 9.476050062016966e-05 -539 9.476050062016966e-05 -2913616 9.387073066129484e-05 -544580 9.34258456818574e-05 -28119 9.298096070242e-05 -75985 9.298096070242e-05 -821 9.209119074354515e-05 -747 9.120142078467031e-05 -46506 9.03116508257955e-05 -839 8.897699588748325e-05 +accession reads +GCF_001298465.1 207551 +GCF_020735905.1 201097 +GCF_004104465.2 163220 +GCF_002763695.1 153880 +GCF_024205685.1 118281 +GCF_002849795.1 110240 +GCF_000001405.40 89931 +GCF_018128125.1 83603 +GCF_002082765.1 79095 +GCF_007990545.2 76226 +GCF_018127765.1 51859 +GCF_018127845.1 43574 +GCF_002763715.1 33468 +GCF_019334725.1 33420 +GCF_026057735.1 32716 +GCF_946902045.1 29381 +GCF_001189555.1 28929 +GCF_032163505.1 24844 +GCF_003019755.1 23507 +GCF_002094955.1 22249 +GCF_001553685.1 22247 +GCF_018406505.1 21061 +GCF_013393365.1 21050 +GCF_001554015.1 20003 +GCF_002302595.1 18940 +GCF_002302415.1 17978 +GCF_021222645.1 17269 +GCF_001548235.1 15790 +GCF_014596425.2 15558 +GCF_022404755.1 14073 +GCF_002302615.1 14036 +GCF_009730375.1 13976 +GCF_032340315.1 13700 +GCF_018127745.1 13151 +GCF_037911965.1 12624 +GCF_017753665.1 12135 +GCF_018128245.1 11496 +GCF_009730295.1 11308 +GCF_013267835.1 11174 +GCF_030008055.1 11058 +GCF_900186995.1 10368 +GCF_032342915.1 10187 +GCF_900637515.1 10157 +GCF_002005185.1 9369 +GCF_005221285.1 8990 +GCF_008330925.1 8499 +GCF_026015965.1 8434 +GCF_001274535.1 7774 +GCF_013394695.1 7437 +GCF_005696695.1 7386 +GCF_036323475.1 7236 +GCF_946902905.1 7018 +GCF_037911955.1 6601 +GCF_940796315.1 5706 +GCF_018128225.1 5579 +GCF_016549395.1 5429 +GCF_019931005.1 5070 +GCF_000722765.2 4813 +GCF_030644385.1 4510 +GCF_018128205.1 4303 +GCF_021497965.1 4229 +GCF_003589745.1 3907 +GCF_028743775.1 3887 +GCF_900637655.1 3865 +GCF_037889265.1 3649 +GCF_008253725.1 3613 +GCF_963967315.1 3423 +GCF_008327825.1 3217 +GCF_030644365.1 3199 +GCF_002209445.1 3139 +GCF_020736165.1 3045 +GCF_030219305.1 2781 +GCF_900699785.1 2779 +GCF_019551945.1 2694 +GCF_023822465.1 2631 +GCF_900477945.1 2604 +GCF_002966695.1 2469 +GCF_003351565.1 2365 +GCF_018866205.1 2066 +GCF_007990365.1 2009 +GCF_012273215.1 2008 +GCF_900120245.1 1997 +GCF_001717585.1 1988 +GCF_001683335.1 1975 +GCF_038424135.1 1909 +GCF_003351545.1 1866 +GCF_900636505.1 1805 +GCF_034134805.1 1794 +GCF_008727815.1 1786 +GCF_037967965.1 1696 +GCF_002999135.1 1673 +GCF_034137685.1 1665 +GCF_020735565.1 1556 +GCF_008330025.1 1531 +GCF_018127805.1 1524 +GCF_002240055.1 1519 +GCF_900475315.1 1465 +GCF_003033925.1 1437 +GCF_001553645.1 1392 +GCF_002998925.1 1311 +GCF_029011355.1 1308 +GCF_009731465.1 1258 +GCF_018127985.1 1222 +GCF_002998595.1 1198 +GCF_900187285.1 1161 +GCF_001444445.1 1149 +GCF_943181435.1 1119 +GCF_038630745.1 1115 +GCF_037911825.1 1099 +GCF_011801285.1 1088 +GCF_014250475.1 1011 +GCF_030644225.1 962 +GCF_001587175.1 899 +GCF_016127595.1 856 +GCF_032451715.1 839 +GCF_000479315.1 827 +GCF_002073815.2 821 +GCF_022453685.1 788 +GCF_001262035.1 762 +GCF_007990525.1 738 +GCF_018127725.1 720 +GCF_037966635.1 713 +GCF_024181205.1 691 +GCF_024346585.1 652 +GCF_037076355.1 648 +GCF_030644325.1 626 +GCF_900475505.1 625 +GCF_019552345.1 618 +GCF_902141215.1 609 +GCF_026810185.1 585 +GCF_006228325.1 578 +GCF_000221985.1 566 +GCF_003627155.1 561 +GCF_004124015.1 559 +GCF_016127875.1 545 +GCF_007990635.1 542 +GCF_001278825.1 541 +GCF_003812445.1 538 +GCF_024760065.1 511 +GCF_963677685.1 490 +GCF_900636745.1 475 +GCF_020736205.1 475 +GCF_027474965.1 469 +GCF_022845615.1 466 +GCF_017347605.1 463 +GCF_019334785.1 461 +GCF_020097435.1 451 +GCF_017161265.1 444 +GCF_003627135.1 435 +GCF_020097375.1 428 +GCF_002355895.1 415 +GCF_017798005.1 390 +GCF_037955985.1 381 +GCF_900636445.1 375 +GCF_002998835.1 370 +GCF_020735385.1 353 +GCF_022749515.1 349 +GCF_900638305.1 339 +GCF_022024195.1 338 +GCF_019334745.1 336 +GCF_003265305.2 329 +GCF_024181185.1 323 +GCF_024181165.1 322 +GCF_002998535.1 322 +GCF_018622975.1 321 +GCF_036320655.1 315 +GCF_951229915.1 301 +GCF_003101015.1 287 +GCF_001262055.1 286 +GCF_014898075.1 282 +GCF_024181085.1 281 +GCF_008369705.1 280 +GCF_037963785.1 279 +GCF_000803625.1 276 +GCF_001483985.1 268 +GCF_020162275.1 268 +GCF_019551475.1 259 +GCF_963360645.1 257 +GCF_024181145.1 256 +GCF_016887735.2 252 +GCF_004803835.1 251 +GCF_037076525.1 247 +GCF_002327085.1 247 +GCF_900478185.1 245 +GCF_023035175.1 245 +GCF_022024075.1 243 +GCF_009671065.1 242 +GCF_013394735.1 242 +GCF_016127115.1 242 +GCF_014334035.1 241 +GCF_022024015.1 236 +GCF_002216145.1 226 +GCF_001683375.1 223 +GCF_000775995.1 223 +GCF_019249725.2 221 +GCF_027125355.1 218 +GCF_011612265.2 215 +GCF_900636515.1 213 +GCF_900638345.1 211 +GCF_024181625.1 208 +GCF_020091485.1 208 +GCF_027945475.1 208 +GCF_022024035.1 207 +GCF_029691405.1 207 +GCF_010443215.1 207 +GCF_024759225.1 207 +GCF_008728395.1 205 +GCF_005697565.1 203 +GCF_002998435.1 203 +GCF_019930845.1 202 +GCF_018389405.1 200 diff --git a/mess/data/hmp_templates/throat/SRS143032.tsv b/mess/data/hmp_templates/throat/SRS143032.tsv index 5288cd7..de234e5 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/throat/SRS143032.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/throat/SRS143032.tsv @@ -1,38 +1,44 @@ -taxon seq_abundance -573 0.4898599072570389 -9606 0.2230184507620967 -28132 0.051629849928584 -1177574 0.0325529750141853 -470565 0.0278962609325167 -562 0.0198644074429161 -1304 0.017428437261539 -28116 0.0171838619421236 -821 0.0167827584182824 -39777 0.0129576004226261 -2682456 0.0121945254260502 -729 0.0109276252714786 -2682455 0.0069410475650081 -43675 0.0056252323465534 -423477 0.0049453129585787 -1318 0.0047056291455516 -39778 0.0045784499794556 -199 0.0045197519027959 -46124 0.0034729695356982 -1463165 0.0031452386076816 -28037 0.0030522999863037 -735 0.0028223991860533 -244366 0.0027930501477234 -29466 0.0023577060791641 -1313 0.0022011778747383 -371601 0.0021865033555733 -28131 0.0019125789978281 -1303 0.00187833845311 -712633 0.0014772349292688 -114527 0.00124244262263 -3077584 0.0012326596098534 -1280 0.0011886360523586 -589437 0.001178853039582 -652716 0.0011592870140288 -3098076 0.0010467823670977 -726 0.0010223248351562 -1660 0.0010174333287679 +accession reads +GCF_022354665.1 99583 +GCF_000001405.40 48584 +GCF_020735905.1 10586 +GCF_002849795.1 6682 +GCF_018128125.1 5710 +GCF_009867035.2 4722 +GCF_008728395.1 3553 +GCF_024759225.1 2817 +GCF_002082765.1 2642 +GCF_013393365.1 2475 +GCF_004104465.2 2192 +GCF_002094955.1 1930 +GCF_018406505.1 1403 +GCF_022404755.1 1362 +GCF_001548235.1 1177 +GCF_032163505.1 1031 +GCF_038630745.1 979 +GCF_026057735.1 968 +GCF_900637515.1 929 +GCF_001298465.1 925 +GCF_019931005.1 738 +GCF_014169355.1 724 +GCF_008253725.1 683 +GCF_002005185.1 650 +GCF_017639085.1 632 +GCF_000722765.2 585 +GCF_008330025.1 579 +GCF_918429265.1 558 +GCF_018289135.1 538 +GCF_025914115.1 537 +GCF_002763715.1 389 +GCF_001553685.1 308 +GCF_003812445.1 301 +GCF_032340315.1 293 +GCF_016549395.1 292 +GCF_011801285.1 262 +GCF_002998925.1 251 +GCF_000783815.2 235 +GCF_034134805.1 232 +GCF_900477945.1 216 +GCF_021497985.1 212 +GCF_005696695.1 211 +GCF_008727815.1 204 diff --git a/mess/data/hmp_templates/throat/SRS144378.tsv b/mess/data/hmp_templates/throat/SRS144378.tsv index a5d0363..aac2422 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/throat/SRS144378.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/throat/SRS144378.tsv @@ -1,117 +1,115 @@ -taxon seq_abundance -9606 0.1426730415656434 -1379 0.1294229046270386 -487 0.1133787955347399 -727 0.0756410637475743 -1328 0.0471472185540132 -562 0.0409987813525712 -28037 0.0377016394417151 -1304 0.0325128340134263 -1313 0.0270119359509483 -43675 0.0248421490656328 -28131 0.0157638626452716 -1318 0.0151651543266229 -851 0.0145600767705418 -732 0.0111440424276136 -39777 0.0110442577078388 -2682456 0.0106578573036045 -28132 0.0105538264255414 -1660 0.0100655182223882 -1303 0.009311825126217 -257758 0.0087131168075683 -729 0.0085666243466223 -1338 0.0081505008343701 -726 0.0079912698985592 -504 0.0078617620707664 -423477 0.0075581617531538 -2682455 0.0072736691478384 -486 0.0072142229318024 -1177574 0.0069042533767573 -2819619 0.0052928363063518 -3059028 0.0052015439031536 -485 0.0050677899170725 -3098076 0.0047556972828833 -33033 0.0046389279299553 -39778 0.0045540047641895 -84135 0.0043289583749103 -29391 0.0041909582305409 -1433513 0.0037260038979733 -2598453 0.0036559422862165 -1280 0.003575265278739 -2937985 0.0034011727889192 -1018 0.0032907726734237 -2610896 0.0032610495654056 -199 0.0030275108595498 -3077584 0.002942587693784 -712633 0.0028194491034236 -3059030 0.0028130798659912 -29466 0.0027791105996849 -46124 0.0027260336210813 -470565 0.0026135104264416 -157687 0.0026028950307209 -2663009 0.0025540642104056 -3098075 0.0024755102820722 -28449 0.0023651101665767 -483 0.0018959096757208 -735 0.0018300942222524 -2972784 0.0017876326393695 -712623 0.0017706480062163 -1382 0.0017579095313515 -623 0.0017005863944596 -2759692 0.0016008016746848 -76859 0.0015710785666668 -539 0.001471293846892 -2420310 0.0014628015303154 -113107 0.0014330784222974 -203 0.0014118476308559 -155615 0.0013417860190992 -158 0.001295078277928 -76860 0.0012738474864866 -2917790 0.0012568628533334 -76857 0.0012547397741893 -490 0.0012420012993244 -1343 0.0012335089827478 -68892 0.0011910473998649 -2490855 0.0011761858458559 -1747 0.0011676935292793 -114527 0.001133724262973 -684066 0.0011167396298199 -28133 0.0011167396298199 -1839799 0.0011124934715316 -1308 0.0010721549677928 -69710 0.001044554938919 -285729 0.0010339395431982 -2841264 0.0009787394854505 -1305 0.000912924031982 -28901 0.0008810778448198 -484 0.0008619701325226 -1302 0.0008598470533784 -1583098 0.000853477815946 -712435 0.0008322470245045 -197575 0.0007982777581982 -712310 0.0007239699881532 -76123 0.0007027391967117 -488 0.0006857545635586 -143361 0.0006730160886937 -495 0.0006454160598198 -712116 0.0006432929806757 -137732 0.000632677584955 -2899133 0.0006114467935135 -712538 0.0005944621603604 -58231 0.0005902160020721 -1852377 0.0005774775272072 -360422 0.0005774775272072 -2972775 0.0005626159731982 -1311 0.0005583698149099 -1156431 0.0005498774983333 -712357 0.0005477544191892 -10665 0.0005477544191892 -1902136 0.0005392621026126 -1334 0.0005328928651802 -505 0.000501046678018 -45634 0.0004776928074324 -544580 0.0004734466491441 -1307 0.00047132357 -2047 0.0004692004908558 -1759399 0.0004585850951351 -652716 0.000426738907973 +accession reads +GCF_000001405.40 80337 +GCF_012273215.1 68105 +GCF_008330925.1 52659 +GCF_002966695.1 35728 +GCF_029011355.1 24065 +GCF_009867035.2 20283 +GCF_000722765.2 16121 +GCF_030177875.1 14034 +GCF_008253725.1 12255 +GCF_001548235.1 11846 +GCF_002094955.1 11430 +GCF_002763715.1 7423 +GCF_032163505.1 7323 +GCF_037889265.1 6653 +GCF_037076355.1 6422 +GCF_001262035.1 5245 +GCF_002082765.1 5200 +GCF_013393365.1 5121 +GCF_020735905.1 4969 +GCF_005696695.1 4733 +GCF_022404755.1 4261 +GCF_016549395.1 4149 +GCF_004104465.2 4025 +GCF_900477945.1 3692 +GCF_026057735.1 3524 +GCF_018406505.1 3489 +GCF_003351565.1 3384 +GCF_002849795.1 3255 +GCF_000221985.1 3251 +GCF_027474965.1 2723 +GCF_030644365.1 2562 +GCF_002356055.1 2385 +GCF_038424135.1 2316 +GCF_034134805.1 2309 +GCF_024346585.1 2303 +GCF_900637515.1 2165 +GCF_003627155.1 1696 +GCF_037967965.1 1669 +GCF_918429265.1 1665 +GCF_943181435.1 1606 +GCF_009731465.1 1584 +GCF_008727815.1 1566 +GCF_020736165.1 1556 +GCF_009730295.1 1476 +GCF_032340315.1 1437 +GCF_001298465.1 1426 +GCF_020097435.1 1324 +GCF_030644385.1 1322 +GCF_037911955.1 1319 +GCF_001553685.1 1310 +GCF_019931005.1 1295 +GCF_002763695.1 1234 +GCF_018128125.1 1231 +GCF_007990545.2 1222 +GCF_034137685.1 1199 +GCF_002005185.1 1174 +GCF_024205685.1 1085 +GCF_011612705.1 1085 +GCF_900475315.1 886 +GCF_008330025.1 858 +GCF_946902905.1 848 +GCF_013394695.1 838 +GCF_003812445.1 836 +GCF_940796315.1 738 +GCF_002243405.1 735 +GCF_016127875.1 706 +GCF_900636505.1 706 +GCF_019930845.1 672 +GCF_020736205.1 663 +GCF_022494435.1 648 +GCF_024181625.1 645 +GCF_011801285.1 634 +GCF_900636445.1 625 +GCF_021222645.1 619 +GCF_002073815.2 586 +GCF_037911825.1 566 +GCF_003390995.1 565 +GCF_037966635.1 565 +GCF_021497965.1 561 +GCF_030008055.1 545 +GCF_017753665.1 539 +GCF_018127725.1 530 +GCF_036323475.1 530 +GCF_002998925.1 528 +GCF_018127845.1 527 +GCF_038630745.1 498 +GCF_037911965.1 488 +GCF_024181205.1 481 +GCF_900475505.1 431 +GCF_019930905.1 425 +GCF_005221285.1 397 +GCF_000783815.2 395 +GCF_026810185.1 389 +GCF_018127745.1 386 +GCF_002998595.1 340 +GCF_035666155.1 336 +GCF_001444445.1 332 +GCF_013394715.1 306 +GCF_020735385.1 288 +GCF_013267835.1 283 +GCF_017161265.1 274 +GCF_900120245.1 273 +GCF_001189555.1 271 +GCF_000479315.1 270 +GCF_946902045.1 266 +GCF_001274535.1 255 +GCF_019552345.1 252 +GCF_002355895.1 243 +GCF_027945475.1 223 +GCF_013267735.1 222 +GCF_001587175.1 221 +GCF_016887735.2 215 +GCF_900478185.1 214 +GCF_003351545.1 202 diff --git a/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS097885.tsv b/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS097885.tsv index 6906383..4544055 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS097885.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS097885.tsv @@ -1,22 +1,22 @@ -taxon seq_abundance -47770 0.941613083810027 -9606 0.0334033754242934 -1596 0.0046549080056927 -712116 0.0038388453699286 -2047 0.0037619699042407 -544580 0.0028059544976089 -2742601 0.001686332330667 -43768 0.0013403927350713 -1303 0.00113342032745 -29466 0.0011284924129828 -1587 0.0009914963907954 -2789425 0.0007007494372321 -1305 0.0006770954477897 -706438 0.0004040889863082 -1604 0.0003971899060542 -1633 0.0003045451140713 -729 0.0002730064614814 -172042 0.0002454101404652 -1655 0.0002217561510228 -1590 0.0002128859049819 -1302 0.0002050012418344 +accession reads +GCF_009933525.1 953935 +GCF_000001405.40 36276 +GCF_017498665.1 4918 +GCF_013394715.1 3889 +GCF_013267735.1 3818 +GCF_027945475.1 2829 +GCF_002849915.1 2252 +GCF_028607025.1 1709 +GCF_011612265.2 1360 +GCF_002005185.1 1157 +GCF_016549395.1 936 +GCF_016694895.1 710 +GCF_900475505.1 695 +GCF_023523445.1 485 +GCF_009362935.1 309 +GCF_004104465.2 277 +GCF_016127855.1 254 +GCF_019334745.1 249 +GCF_003390995.1 223 +GCF_016066915.1 216 +GCF_026810185.1 212 diff --git a/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS098585.tsv b/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS098585.tsv index 6b0e2c3..dff93c1 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS098585.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS098585.tsv @@ -1,138 +1,135 @@ -taxon seq_abundance -47770 0.6450486963231662 -165179 0.0457593994180239 -821 0.0446064450061478 -9606 0.039619624203569 -46503 0.0190611579664732 -823 0.0141365372064428 -28116 0.013016936440571 -729 0.011452019428048 -28037 0.0101872852295632 -454155 0.0082392520129376 -328814 0.0064814247235253 -2755405 0.0054330384991219 -2714355 0.0052897079662929 -338188 0.0043954696734227 -371601 0.0038014141945905 -328813 0.0037779764973984 -853 0.0037184808045259 -2929488 0.0037049590561459 -2929494 0.0033804370950236 -674529 0.0033606051973994 -2763672 0.0031956398671623 -46506 0.0031902311678103 -2528203 0.0031190166263418 -2792859 0.0031054948779617 -39491 0.0030550136840093 -726 0.0029495440466446 -292800 0.0029252048995604 -2518605 0.0028909498036642 -2742601 0.0028846396544201 -1303 0.0027521265202952 -2929492 0.0025889640898421 -2093857 0.0025321727466457 -1313 0.0024032654120888 -28118 0.0022842740263439 -817 0.0022680479282878 -1547448 0.0021679869902751 -820 0.0020733347516144 -43768 0.0020291637069061 -39485 0.0020003173103619 -818 0.0019597520652217 -1470347 0.0019525404660856 -626932 0.0019272998691094 -357276 0.0018191258820687 -2929493 0.0016893170976198 -1587 0.0015342677161947 -727 0.0015333662663027 -137732 0.0013539777377934 -2585119 0.0012394936015086 -410072 0.0012322820023726 -1379 0.0012088443051804 -544580 0.0011123891667357 -1433513 0.001001510830019 -461393 0.0009933977809909 -2819619 0.0009816789323948 -28132 0.0009807774825028 -2108523 0.0009762702330428 -29466 0.0008996469922222 -454154 0.0008960411926542 -2785531 0.000865391896326 -556259 0.0008536730477299 -2610895 0.0007995860542095 -1472416 0.0007914730051815 -2718 0.0007635280585293 -46228 0.0006959193166288 -712310 0.0006869048177088 -387090 0.0006102815768882 -267818 0.0005525887837998 -210 0.0005327568861757 -411483 0.0005273481868236 -1177574 0.0005228409373636 -166486 0.0005093191889835 -1305 0.0005021075898475 -74426 0.0004948959907114 -1550024 0.0004948959907114 -267212 0.0004939945408194 -257758 0.0004912901911434 -2929489 0.0004849800418993 -2598453 0.0004777684427633 -2585118 0.0004768669928713 -40545 0.0004624437945992 -824 0.0004561336453551 -1604 0.0004498234961111 -2929495 0.000439907547299 -487173 0.000429090148595 -652716 0.0004281886987029 -1660 0.0004263857989189 -1309 0.0004263857989189 -1633 0.0004227799993509 -2478954 0.0004146669503228 -2494234 0.0003948350526987 -301301 0.0003930321529147 -28135 0.0003578756071265 -1018 0.0003506640079904 -712116 0.0003461567585304 -2929490 0.0003443538587464 -169435 0.0003416495090703 -157687 0.0003407480591783 -39496 0.0003362408097183 -2929491 0.0003362408097183 -1304 0.0003245219611222 -214856 0.0003182118118782 -199 0.0003146060123101 -28111 0.0003091973129581 -33038 0.0003064929632821 -47678 0.000297478464362 -2682456 0.000294774114686 -1655 0.00028756251555 -2714358 0.0002794494665219 -88431 0.0002785480166299 -2789425 0.0002785480166299 -39777 0.0002722378673859 -2650158 0.0002713364174938 -418240 0.0002704349676018 -39486 0.0002659277181418 -2734150 0.0002632233684658 -162156 0.0002587161190058 -40520 0.0002551103194377 -1747 0.0002506030699777 -28131 0.0002478987203017 -1288121 0.0002415885710576 -2955579 0.0002361798717056 -1318 0.0002307711723536 -1302 0.0002217566734335 -1297617 0.0002208552235415 -712435 0.0002136436244054 -76857 0.0002100378248374 -208479 0.0002064320252694 -291644 0.0001983189762413 -43675 0.0001974175263493 -2714353 0.0001965160764573 -423477 0.0001838957779692 -712122 0.0001838957779692 -2650157 0.0001838957779692 -39488 0.0001829943280772 -1982626 0.0001820928781852 -214851 0.0001802899784012 -1796613 0.0001802899784012 +accession reads +GCF_009933525.1 714052 +GCF_032451715.1 62217 +GCF_008728395.1 50390 +GCF_000001405.40 46925 +GCF_022404755.1 20804 +GCF_018289315.1 20690 +GCF_963360645.1 15688 +GCF_024759225.1 14134 +GCF_004104465.2 12653 +GCF_000722765.2 10794 +GCF_902388275.1 8346 +GCF_918429265.1 6851 +GCF_018408575.1 5811 +GCF_013874375.1 5510 +GCF_963360665.1 4895 +GCF_003956025.1 4434 +GCF_022453685.1 4382 +GCF_022845675.1 4207 +GCF_018289135.1 3946 +GCF_014337175.1 3672 +GCF_025914295.1 3669 +GCF_004328515.1 3534 +GCF_020091485.1 3514 +GCF_020550085.1 3500 +GCF_900477945.1 3191 +GCF_023008285.1 3189 +GCF_028607025.1 3172 +GCF_016549395.1 2861 +GCF_002849915.1 2780 +GCF_008253725.1 2756 +GCF_024760065.1 2620 +GCF_900187175.1 2609 +GCF_023347235.1 2484 +GCF_016117815.1 2473 +GCF_023347355.1 2408 +GCF_019973735.1 2395 +GCF_011612265.2 2247 +GCF_020735745.1 2228 +GCF_014163495.1 2133 +GCF_008369705.1 2086 +GCF_013009555.1 2027 +GCF_023347295.1 1953 +GCF_003574015.1 1895 +GCF_002966695.1 1877 +GCF_023347275.1 1793 +GCF_012273215.1 1790 +GCF_020735385.1 1500 +GCF_006542685.1 1374 +GCF_005121165.3 1218 +GCF_027945475.1 1209 +GCF_003627155.1 1116 +GCF_030644185.1 1091 +GCF_022453915.1 1071 +GCF_019249725.2 1058 +GCF_024346585.1 1056 +GCF_002005185.1 1044 +GCF_020735905.1 1007 +GCF_027923645.1 982 +GCF_015679285.1 952 +GCF_002734145.1 886 +GCF_008727735.1 882 +GCF_023523445.1 855 +GCF_900637305.1 846 +GCF_025151715.1 811 +GCF_002998595.1 743 +GCF_032878895.1 734 +GCF_025147085.1 694 +GCF_016888945.1 668 +GCF_033096525.1 651 +GCF_034479775.1 613 +GCF_016755695.1 591 +GCF_037076355.1 578 +GCF_002849795.1 571 +GCF_014055025.1 548 +GCF_900475505.1 546 +GCF_003856815.1 544 +GCF_900683755.1 533 +GCF_006542665.1 527 +GCF_009731465.1 524 +GCF_016724805.1 516 +GCF_001190745.1 505 +GCF_000221985.1 488 +GCF_008831345.1 482 +GCF_014334015.1 473 +GCF_928721695.1 467 +GCF_036815185.2 467 +GCF_009362935.1 464 +GCF_905186165.1 459 +GCF_016904155.1 456 +GCF_005696695.1 443 +GCF_025914115.1 442 +GCF_003609995.1 438 +GCF_023347255.1 399 +GCF_020736165.1 391 +GCF_900637655.1 388 +GCF_023347335.1 384 +GCF_013394715.1 381 +GCF_028743455.1 376 +GCF_007990545.2 376 +GCF_025150745.1 370 +GCF_023008345.1 366 +GCF_022846055.1 352 +GCF_001298465.1 347 +GCF_018289295.1 337 +GCF_013393365.1 324 +GCF_032452855.1 322 +GCF_016127855.1 319 +GCF_001746855.1 313 +GCF_018408705.1 311 +GCF_016694895.1 305 +GCF_023347315.1 297 +GCF_023347535.1 295 +GCF_002082765.1 294 +GCF_023008305.1 289 +GCF_003390995.1 276 +GCF_025150245.1 273 +GCF_037911965.1 271 +GCF_963677685.1 269 +GCF_020735725.1 266 +GCF_002094955.1 264 +GCF_002763715.1 259 +GCF_026810185.1 255 +GCF_032878955.1 254 +GCF_032163505.1 247 +GCF_004154955.1 237 +GCF_018127745.1 232 +GCF_023744375.2 228 +GCF_009193295.2 228 +GCF_020091345.1 219 +GCF_001548235.1 219 +GCF_000783815.2 216 +GCF_001278845.1 203 +GCF_018326305.1 202 +GCF_015097455.1 201 diff --git a/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS142957.tsv b/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS142957.tsv index 230a65f..d096a1f 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS142957.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS142957.tsv @@ -1,35 +1,31 @@ -taxon seq_abundance -147802 0.6735046962004484 -109790 0.2674704693884808 -9606 0.0356286011301976 -47770 0.0052581566348459 -2057741 0.0038530594151851 -87541 0.0025521659916851 -562 0.0017251517364404 -1598 0.0015332844292237 -329 0.0014613341890174 -2082387 0.0006293578482412 -82135 0.0004589929116608 -88688 0.0004135071276223 -1587 0.0004101990706013 -2823693 0.0003920047569859 -2702 0.000388696699965 -2844245 0.0003217085452901 -1325120 0.0002960711033776 -69666 0.0002828388752936 -2842456 0.0002745687327412 -3014784 0.0002555474048706 -2010972 0.0002497583050839 -1679497 0.0002489312908286 -884684 0.0002472772623181 -155892 0.0002447962195524 -2748629 0.0002241208631713 -1747 0.0002026184925349 -3015996 0.0002026184925349 -29448 0.0001968293927482 -284016 0.0001943483499825 -3016000 0.0001869052216853 -3015177 0.000182770150409 -2782609 0.0001769810506223 -1404443 0.0001662298653041 -1351 0.0001654028510489 +accession reads +GCF_011058695.1 814462 +GCF_001936235.1 323736 +GCF_000001405.40 47200 +GCF_009933525.1 6163 +GCF_002831585.1 4519 +GCF_029011845.1 3076 +GCF_009867035.2 2376 +GCF_024652885.1 1870 +GCF_022404755.1 1782 +GCF_016466415.2 1718 +GCF_004136315.1 760 +GCF_002849915.1 690 +GCF_016026575.1 560 +GCF_023935105.1 471 +GCF_900637625.1 469 +GCF_018135625.1 465 +GCF_002749615.1 330 +GCF_021173085.1 322 +GCF_027359115.1 314 +GCF_015291625.1 308 +GCF_003856435.1 279 +GCF_003722335.1 274 +GCF_011045195.1 267 +GCF_003390995.1 247 +GCF_010977555.1 246 +GCF_027474405.1 234 +GCF_038963755.1 218 +GCF_027912495.1 216 +GCF_027286305.1 207 +GCF_033814055.1 203 diff --git a/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS143776.tsv b/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS143776.tsv index 16253ca..c09259e 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS143776.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS143776.tsv @@ -1,42 +1,46 @@ -taxon seq_abundance -47770 0.9730289389443968 -9606 0.0071835163585398 -95486 0.006210968467037 -863372 0.0020015420277832 -1774 0.0018840502145793 -2738126 0.0015338744367919 -2018067 0.0013961037875012 -40324 0.0012725492294878 -1587 0.0008849516820144 -2082188 0.0006018842174627 -1604 0.0003984686760972 -2976884 0.0003869703669758 -2954102 0.0003395137093294 -85698 0.0003117087072722 -1596 0.0003117087072722 -93064 0.0002282937011008 -1590 0.0002172135123111 -2107999 0.000151986740568 -303 0.0001450877550952 -2742601 0.0001390250102857 -28038 0.000121254896189 -2745514 0.0001145649708821 -2282124 0.0001049482032533 -217203 9.700391695126724e-05 -1353891 7.965192318627763e-05 -33959 7.338011821098018e-05 -1597 6.543583190893673e-05 -47883 6.35542904163475e-05 -528343 6.292710991881776e-05 -68895 5.6655304943520304e-05 -13690 5.540094394846082e-05 -267818 5.414658295340133e-05 -2605424 5.3310342290028335e-05 -1827300 5.289222195834184e-05 -2664899 5.14288007974391e-05 -82367 4.892007880732012e-05 -1415630 4.557511615382814e-05 -2954081 4.390263482708216e-05 -2732364 4.243921366617942e-05 -36809 4.223015350033617e-05 -1747 4.202109333449292e-05 +accession reads +GCF_009933525.1 4648402 +GCF_000001405.40 36907 +GCF_018228625.1 30034 +GCF_002849915.1 9616 +GCF_024930265.1 9504 +GCF_021729805.1 9055 +GCF_030687795.1 7166 +GCF_002591235.1 6702 +GCF_016126935.1 6095 +GCF_003609795.1 2896 +GCF_023523445.1 2315 +GCF_029201605.1 1583 +GCF_017498665.1 1556 +GCF_030687275.1 1256 +GCF_033096405.1 1204 +GCF_001922385.1 1094 +GCF_016066915.1 1040 +GCF_016406145.1 920 +GCF_009734365.1 706 +GCF_028607025.1 666 +GCF_014268375.2 631 +GCF_035621435.1 581 +GCF_004346925.1 469 +GCF_900636675.1 405 +GCF_038109155.1 343 +GCF_002082135.1 330 +GCF_021432025.1 324 +GCF_028747225.1 318 +GCF_004141835.1 306 +GCF_034348165.1 306 +GCF_000263675.1 281 +GCF_008801925.2 270 +GCF_014235165.1 266 +GCF_022404755.1 256 +GCF_023896015.1 240 +GCF_034479775.1 238 +GCF_008824185.1 235 +GCF_918429265.1 230 +GCF_002966775.1 222 +GCF_009827115.1 221 +GCF_002075105.1 210 +GCF_003076795.1 204 +GCF_000698295.1 203 +GCF_003390995.1 201 +GCF_900235815.1 200 diff --git a/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS146847.tsv b/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS146847.tsv index 01d89a5..2ec19cc 100644 --- a/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS146847.tsv +++ b/mess/data/hmp_templates/vagina/SRS146847.tsv @@ -1,39 +1,39 @@ -taxon seq_abundance -147802 0.778365364974763 -9606 0.0713580354740509 -47770 0.0373293175802364 -562 0.0212672443303079 -109790 0.0150379435136806 -1774 0.0117697440802624 -28037 0.0097736067539031 -1311 0.0092115327996213 -1313 0.0091326452270905 -1303 0.0072055345266956 -134821 0.0044670087945556 -2742601 0.0031231026482276 -1328 0.0027188038390073 -1596 0.0024187493220599 -257758 0.0016326910100567 -1280 0.0014523765585578 -46507 0.0013918021725073 -2819619 0.0012438879740121 -2598453 0.0011664091081337 -87541 0.0011523220416103 -1433513 0.0009635553501974 -3077584 0.0009100244974086 -28125 0.0007339361658667 -1747 0.0005648913675865 -623 0.0005282649946257 -1260 0.0004944560349697 -1870984 0.0004564209553566 -1379 0.0004521948353996 -29394 0.000449377422095 -884684 0.0004352903555716 -1633 0.0004268381156576 -1282 0.0004197945823959 -2420310 0.0003620376096502 -36809 0.0003437244231698 -2420308 0.0003169589967754 -712633 0.0003155502901231 -1334 0.0003042806369044 -1307 0.0003042806369044 +accession reads +GCF_011058695.1 555446 +GCF_000001405.40 53987 +GCF_009933525.1 26709 +GCF_009867035.2 15857 +GCF_001936235.1 10701 +GCF_021729805.1 8389 +GCF_008253725.1 7156 +GCF_019552345.1 6555 +GCF_000722765.2 6219 +GCF_016549395.1 4825 +GCF_006716515.1 3171 +GCF_028607025.1 2236 +GCF_022404755.1 2225 +GCF_029011355.1 1931 +GCF_017498665.1 1780 +GCF_037076355.1 1075 +GCF_023347725.1 991 +GCF_000221985.1 927 +GCF_029011845.1 806 +GCF_024346585.1 783 +GCF_009731465.1 765 +GCF_003627155.1 640 +GCF_012273215.1 595 +GCF_032340315.1 565 +GCF_918429265.1 533 +GCF_030219305.1 521 +GCF_003390995.1 402 +GCF_013267535.1 357 +GCF_007197715.1 318 +GCF_900128415.1 308 +GCF_009362935.1 305 +GCF_038070515.1 296 +GCF_022494435.1 295 +GCF_003812445.1 264 +GCF_003076795.1 242 +GCF_001553685.1 230 +GCF_003812685.1 229 +GCF_035666155.1 216 From 248e39b86ea7262e07fbd5f3ed7435de6e09e065 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: farchaab Date: Mon, 7 Oct 2024 16:42:26 +0200 Subject: [PATCH 2/5] changed hmp_template default to accession --- mess/__main__.py | 3 ++- 1 file changed, 2 insertions(+), 1 deletion(-) diff --git a/mess/__main__.py b/mess/__main__.py index ae2e42c..3b6fdee 100644 --- a/mess/__main__.py +++ b/mess/__main__.py @@ -460,12 +460,13 @@ def test(**kwargs): def hmp_template(site, sample, **kwargs): """Download and simulate healthy human microbiome templates""" # Config to add or update in configfile - if sample == None: + if sample is None: kwargs["input"] = snake_base(os.path.join("data", "hmp_templates", site)) else: kwargs["input"] = snake_base( os.path.join("data", "hmp_templates", site, f"{sample}.tsv") ) + kwargs["taxon"] = False merge_config = {"args": kwargs} run_snakemake( # Full path to Snakefile From 3799511f5c320d664d4decdb6d7fd684ad140df3 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: farchaab Date: Mon, 7 Oct 2024 17:11:15 +0200 Subject: [PATCH 3/5] updated assembly_finder args --- .../rules/download/assembly_finder.smk | 40 ++++++++++--------- 1 file changed, 22 insertions(+), 18 deletions(-) diff --git a/mess/workflow/rules/download/assembly_finder.smk b/mess/workflow/rules/download/assembly_finder.smk index 902f7f5..9b06676 100644 --- a/mess/workflow/rules/download/assembly_finder.smk +++ b/mess/workflow/rules/download/assembly_finder.smk @@ -23,31 +23,35 @@ rule get_unique_entries: af_args = "" if TAXON: af_args += "--taxon " -else: - af_args += "--accession " + if LIMIT: + af_args += f"--limit {LIMIT} " -if LIMIT: - af_args += f"--limit {LIMIT} " + if RANK and NRANK: + af_args += f"--rank {RANK} --nrank {NRANK}" -if RANK and NRANK: - af_args += f"--rank {RANK} --nrank {NRANK}" + if ASM_LVL: + af_args += f"--assembly-level {ASM_LVL} " + if INCLUDE: + f"--include {INCLUDE} " + if SOURCE: + f"--source {SOURCE} " + if REFERENCE: + f"--reference {REFERENCE} " + if ANNOTATED: + f"--annotated {ANNOTATED} " + if ATYPICAL: + f"--atypical {ATYPICAL} " + if MAG: + f"--mag {MAG}" -if ASM_LVL: - af_args += f"--assembly-level {ASM_LVL} " +else: + af_args += "--accession " if API_KEY: af_args += f"--api-key {API_KEY} " - -af_args += ( - f"--compressed {COMPRESSED} " - f"--include {INCLUDE} " - f"--source {SOURCE} " - f"--reference {REFERENCE} " - f"--annotated {ANNOTATED} " - f"--atypical {ATYPICAL} " - f"--mag {MAG}" -) +if COMPRESSED: + af_args += f"--compressed {COMPRESSED} " checkpoint download_assemblies: From e9ab8698f474b66a9eaa5984ae2031872c824572 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: farchaab Date: Tue, 8 Oct 2024 14:42:15 +0200 Subject: [PATCH 4/5] removed unnecessary contigs number --- mess/workflow/scripts/calculate_cov.py | 5 +---- 1 file changed, 1 insertion(+), 4 deletions(-) diff --git a/mess/workflow/scripts/calculate_cov.py b/mess/workflow/scripts/calculate_cov.py index 44bd867..4168a9c 100644 --- a/mess/workflow/scripts/calculate_cov.py +++ b/mess/workflow/scripts/calculate_cov.py @@ -165,7 +165,6 @@ def get_even_dist(table): "path", "tax_id", "total_sequence_length", - "number_of_contigs", "reads", "bases", "seq_abundance", @@ -179,7 +178,5 @@ def get_even_dist(table): df["tax_abundance"] = df["tax_abundance"].apply(lambda x: round(x, 3)) df["seq_abundance"] = df["seq_abundance"].apply(lambda x: round(x, 3)) -df = df.astype( - {"seed": int, "tax_id": int, "total_sequence_length": int, "number_of_contigs": int} -) +df = df.astype({"seed": int, "tax_id": int, "total_sequence_length": int}) df[cols].set_index(["samplename", "fasta"]).to_csv(snakemake.output[0], sep="\t") # type: ignore From 72dfab86b0de1fb84103e6c20a62ebaded29b828 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: farchaab Date: Fri, 11 Oct 2024 14:47:39 +0200 Subject: [PATCH 5/5] added back number_of_contigs --- mess/workflow/scripts/calculate_cov.py | 13 ++++++++----- 1 file changed, 8 insertions(+), 5 deletions(-) diff --git a/mess/workflow/scripts/calculate_cov.py b/mess/workflow/scripts/calculate_cov.py index 4168a9c..edb5711 100644 --- a/mess/workflow/scripts/calculate_cov.py +++ b/mess/workflow/scripts/calculate_cov.py @@ -93,7 +93,7 @@ def get_even_dist(table): df["tax_abundance"] = df["proportion"] / df["count"] df["genome_bases"] = df["total_sequence_length"] * df["tax_abundance"] df["sum_genome_bases"] = df.groupby("samplename")["genome_bases"].transform("sum") - df["cov_obtained"] = bases / (df["sum_genome_bases"] * p) + df["cov_obtained"] = bases / df["sum_genome_bases"] df["cov_sim"] = df["tax_abundance"] * df["cov_obtained"] df["sum_cov"] = df.groupby("samplename")["cov_sim"].transform("sum") df["bases"] = df["cov_sim"] * df["total_sequence_length"] @@ -117,7 +117,7 @@ def get_even_dist(table): df["sum_genome_bases"] = df.groupby("samplename")["genome_bases"].transform( "sum" ) - df["cov_obtained"] = bases / (df["sum_genome_bases"] * p) + df["cov_obtained"] = bases / df["sum_genome_bases"] df["cov_sim"] = df["tax_abundance"] * df["cov_obtained"] df["sum_cov"] = df.groupby("samplename")["cov_sim"].transform("sum") df["bases"] = df["cov_sim"] * df["total_sequence_length"] @@ -133,7 +133,7 @@ def get_even_dist(table): df["tax_abundance"] = df["cov_sim"] / df["sum_cov"] if "reads" in entry_df.columns: - df["bases"] = df["reads"] * (snakemake.params.read_len * p) + df["bases"] = df["reads"] * snakemake.params.read_len * p df["sum_bases"] = df.groupby("samplename")["bases"].transform("sum") df["seq_abundance"] = df["bases"] / df["sum_bases"] df["cov_sim"] = df["bases"] / df["total_sequence_length"] @@ -165,6 +165,7 @@ def get_even_dist(table): "path", "tax_id", "total_sequence_length", + "number_of_contigs", "reads", "bases", "seq_abundance", @@ -178,5 +179,7 @@ def get_even_dist(table): df["tax_abundance"] = df["tax_abundance"].apply(lambda x: round(x, 3)) df["seq_abundance"] = df["seq_abundance"].apply(lambda x: round(x, 3)) -df = df.astype({"seed": int, "tax_id": int, "total_sequence_length": int}) -df[cols].set_index(["samplename", "fasta"]).to_csv(snakemake.output[0], sep="\t") # type: ignore +df = df.astype( + {"seed": int, "tax_id": int, "total_sequence_length": int, "number_of_contigs": int} +) +df[cols].set_index(["samplename", "fasta"]).to_csv(snakemake.output[0], sep="\t") # type: ignore \ No newline at end of file