运行时配置是指包含本地文件的可重载配置。如果运行时未配置，则默认使用“null”，该程序会使用代码中内置的缺省值。
在配置参考的各个部分描述了可用的运行时配置。例如，以下是上游群集的运行时配置。
假定文件夹/srv/runtime/v1指向的是存放全局运行时配置的文件路径。以下是运行时的典型配置设置：
- symlink_root(根目录的符号链接):
/srv/runtime/current - subdirectory(子目录):
envoy - override_subdirectory(覆盖子目录):
envoy_override
其中/srv/runtime/current是链接到/srv/runtime/v1目录的符号链接。
运行时配置中的每个“.”表示新的目录层级，以symlink_root + subdirectory为目录根。例如，health_check.min_interval键展开之后具有以下完整文件路径（使用符号链接）：
/srv/runtime/current/envoy/health_check/min_interval
路径的末端部分是文件。文件内容为运行时配置值。在从文件中读取数值时，空格和换行将被忽略。
目录override_subdirectory与--service-cluster命令行选项配合一起使用。假设--service-cluster已被设置为my-cluster。Envoy将优先在以下完整路径中查找health_check.min_interval配置项：
/srv/runtime/current/envoy_override/my-cluster/health_check/min_interval
如果找到，该值将覆盖在主路径中查找到的任何值。这允许用户在全局默认值之外，自定义单个群集的运行时配置值。
以＃开头的行被视为注释。合理的注释可以帮助理解所提供值的背景/原因。另外在一个空文件增加注释也是有用的，预留文件的部署，以便在需要的时候可以使用。
有两个步骤来更新任何运行时值。首先，创建整个全新运行时配置或者拷贝/更新所需的运行时配置。其次，使用以下命令或者等效命令，将旧的符号链接根自动交换到新的配置目录下：
/srv/runtime:~$ ln -s /srv/runtime/v2 new && mv -Tf new current
关于如何部署文件系统数据，以及相关垃圾回收等问题，超出了本文档的范围。
文件系统在运行时会收集一些统计信息，以runtime.命名空间。
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
| load_error | Counter | 因错误而导致加载尝试总数 |
| override_dir_not_exists | Counter | 未使用覆盖目录的加载总数 |
| override_dir_exists | Counter | 使用覆盖目录的加载总数 |
| load_success | Counter | 成功加载的尝试总数 |
| num_keys | Gauge | 当前加载的键值数量 |