kNN을 이용해 이진분류 문제를 설명합니다.
scikit-learn을 이용하여 간단하게 knn으로 binary classification을 수행합니다. 상세코드에 대해 아래에서 설명합니다.
- 소스 다운로드 받기
git clone https://github.com/rickiepark/hg-mldl
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[Amazon SageMaker] - [Notebook instances]로 진입하여 [Create notebook instance]에서 먼저 instance를 생성합니다.
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생성한 instance를 실행후에 [Open jupyter]을 선택합니다.
- Jupyter nodebook에서 아래와 같이 [New] - [conda_python3]을 선택합니다.
- 아래 라이브러리는 기설치되어 있으나 설치되어 있지 않은 경우에 설치합니다.
pip install matplotlib
pip install scikit-learn
pip install numpy
- 도미(bream) 데이터 준비하기
bream_length = [25.4, 26.3, 26.5, 29.0, 29.0, 29.7, 29.7, 30.0, 30.0, 30.7, 31.0, 31.0, 31.5, 32.0, 32.0, 32.0, 33.0, 33.0, 33.5, 33.5, 34.0, 34.0, 34.5, 35.0, 35.0, 35.0, 35.0, 36.0, 36.0, 37.0, 38.5, 38.5, 39.5, 41.0, 41.0]
bream_weight = [242.0, 290.0, 340.0, 363.0, 430.0, 450.0, 500.0, 390.0, 450.0, 500.0, 475.0, 500.0, 500.0, 340.0, 600.0, 600.0, 700.0, 700.0, 610.0, 650.0, 575.0, 685.0, 620.0, 680.0, 700.0, 725.0, 720.0, 714.0, 850.0, 1000.0, 920.0, 955.0, 925.0, 975.0, 950.0]
아래와 같이 데이터 확인을 합니다.
import matplotlib.pyplot as plt
plt.scatter(bream_length, bream_weight)
plt.xlabel('length')
plt.ylabel('weight')
plt.show()
확인된 결과는 아래와 같습니다.
- 빙어 데이터 준비하기
smelt_length = [9.8, 10.5, 10.6, 11.0, 11.2, 11.3, 11.8, 11.8, 12.0, 12.2, 12.4, 13.0, 14.3, 15.0]
smelt_weight = [6.7, 7.5, 7.0, 9.7, 9.8, 8.7, 10.0, 9.9, 9.8, 12.2, 13.4, 12.2, 19.7, 19.9]
아래와 같이 데이터를 확인합니다.
plt.scatter(bream_length, bream_weight)
plt.scatter(smelt_length, smelt_weight)
plt.xlabel('length')
plt.ylabel('weight')
plt.show()
확인된 결과는 아래와 같습니다.
- 데이터 편집
지금 하는 학습방법은 지도학습이며 훈련을 위하여 데이터(Input)과 정답(Target)이 필요합니다. 아래와 scikit-learn에서 사용하기 위해 array로 저장하여 입력으로 사용합니다. 여기서 feature는 길이와 무게입니다.
length = bream_length+smelt_length
weight = bream_weight+smelt_weight
fish_data = [[l, w] for l, w in zip(length, weight)]
아래와 정답(Target)도 생성합니다.
fish_target = [1]*35 + [0]*14
print(fish_target)
- scikit-learn으로 training
from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier
kn = KNeighborsClassifier()
kn.fit(fish_data, fish_target)
kn.score(fish_data, fish_target)
test시 training과 같은 데이터를 사용했으므로 결과는 1이 나옯니다.
- 시험
아래와 같이 (30, 600)을 가지는 sample은 도미입니다.
plt.scatter(bream_length, bream_weight)
plt.scatter(smelt_length, smelt_weight)
plt.scatter(30, 600, marker='^')
plt.xlabel('length')
plt.ylabel('weight')
plt.show()
그래프에서 보면 아래와 같이 세모는 도미입니다.
이제 knn으로 값을 예측해보면 아래와 같이 1이 나오므로 도미로 예측되었음을 알 수 있습니다.
kn.predict([[30, 600]])
결과는 아래와 같습니다.
array([1])
KNN classifier의 경우에 default로 5개의 주위의 값을 가지고 예측을 하는데, 이 값은 아래와 같이 "n_neighbors"를 이용해 변경할 수 있습니다.
kn49 = KNeighborsClassifier(n_neighbors=49)
- fish_data, fish_target을 numpy array로 변경합니다.
import numpy as np
input_arr = np.array(fish_data)
target_arr = np.array(fish_target)
target_arr = np.array(fish_target)
- random index를 생성합니다.
np.random.seed(42)
index = np.arange(49)
np.random.shuffle(index)
print(index)
index가 아래와 같이 random하게 생성되었습니다.
[13 45 47 44 17 27 26 25 31 19 12 4 34 8 3 6 40 41 46 15 9 16 24 33
30 0 43 32 5 29 11 36 1 21 2 37 35 23 39 10 22 18 48 20 7 42 14 28
38]
- 앞에서 35개는 train으로 나머지는 test용으로 만듧니다.
train_input = input_arr[index[:35]]
train_target = target_arr[index[:35]]
test_input = input_arr[index[35:]]
test_target = target_arr[index[35:]]
이를 아래와 같이 그림으로 확인합니다.
import matplotlib.pyplot as plt
plt.scatter(train_input[:, 0], train_input[:, 1])
plt.scatter(test_input[:, 0], test_input[:, 1])
plt.xlabel('length')
plt.ylabel('weight')
plt.show()
결과는 아래와 같습니다.
- KNN으로 분석합니다.
kn = KNeighborsClassifier()
kn.fit(train_input, train_target)
kn.score(test_input, test_target)
이때 결과는 마찬가지로 1.0 입니다.
from sklearn.model_selection import train_test_split
train_input, test_input, train_target, test_target = train_test_split(
fish_data, fish_target, random_state=42)
이때 fish_target기준으로 비율을 맞출수도 있습니다.
from sklearn.model_selection import train_test_split
train_input, test_input, train_target, test_target = train_test_split(
fish_data, fish_target, stratify=fish_target, random_state=42)
kn = KNeighborsClassifier()
kn.fit(train_input, train_target)
kn.score(test_input, test_target)
아래와 같이 무게와 길이에 대한 scale을 맞추면 (25,150)이 도미가 아니라 빙어로 분류 될 수 있습니다.
plt.scatter(train_input[:,0], train_input[:,1])
plt.scatter(25, 150, marker='^')
plt.scatter(train_input[indexes,0], train_input[indexes,1], marker='D')
plt.xlim((0, 1000))
plt.xlabel('length')
plt.ylabel('weight')
plt.show()
z score(표준점수, standard score)를 사용하여 각 데이터가 원점에서 몇 표준편차만큼 떨어져 있는지 나타내서, 특성값의 크기와 상관없이 동일한 조건으로 비교할 수 있습니다.
아래와 같이 구현할 수 있습니다.
mean = np.mean(train_input, axis=0)
std = np.std(train_input, axis=0)
train_scaled = (train_input - mean) / std
new = ([25, 150] - mean) / std
plt.scatter(train_scaled[:,0], train_scaled[:,1])
plt.scatter(new[0], new[1], marker='^')
plt.xlabel('length')
plt.ylabel('weight')
plt.show()
결과적으로 아래와 같이 수상한 도미를 데이터 전처리를 통해 찾을 수 있습니다.