ClusterGVis 中的enrichCluster函数返回的geneRatio问题

[fxxx92]

首先非常非常感谢博主的贡献！！！

在使用ClusterGVis中的enrichCluster函数时，返回了一列数据为ratio，但其数值为大于1的数值，如下图：

然而在以前用enrichGO返回的数据中，仅包括GeneRatio与BgRatio两列，且均为分数形式，如下图：

在查阅文献时发现，除了这两个数据外还常用一个富集倍数（fold enrichment），其计算方法如下图，计算后多为大于1的数值：

综上所述，enrichCluster函数返回的ratio是否应为fold enrichment而非generatio呢？
另外再enrichGO函数中会同时设置pval与qval来获取GO结果，这导致我用enrichGO与enrichCluster函数返回的GO结果有一些不同，目前我是采用把enrichGO结果生成表格读取入R来进行画图，但ratio值的不匹配影响最后的图表呈现，因此想和博主探讨一下。

再次感谢您的分享！！！

[junjunlab]

enrichCluster返回结果中的ratio为generatio的100倍，意思就是一个百分比。