diff --git a/lineage_notes.txt b/lineage_notes.txt index a46677a0..31e342f2 100644 --- a/lineage_notes.txt +++ b/lineage_notes.txt @@ -3225,6 +3225,8 @@ HV.1.4 Alias of XBB.1.9.2.5.1.6.1.4, S:A1078S, USA, from sars-cov-2-variants/lin HV.1.5 Alias of XBB.1.9.2.5.1.6.1.5, S:L1265F, USA/Canada, from sars-cov-2-variants/lineage-proposals#957 HV.1.6 Alias of XBB.1.9.2.5.1.6.1.6, ORF1a:T1794I, ORF1a:P2018S, Canada/USA HV.1.6.1 Alias of XBB.1.9.2.5.1.6.1.6.1, S:S704L, Canada, from sars-cov-2-variants/lineage-proposals#957 +KL.1 Alias of XBB.1.9.2.5.1.6.1.6.1.1, S:K444N, Canada +KL.1.1 Alias of XBB.1.9.2.5.1.6.1.6.1.1.1, S:H1101Y, Canada HV.1.7 Alias of XBB.1.9.2.5.1.6.1.7, S:S221L, Canada, from sars-cov-2-variants/lineage-proposals#957 HV.1.8 Alias of XBB.1.9.2.5.1.6.1.8, S:T208M, USA HV.1.9 Alias of XBB.1.9.2.5.1.6.1.9, S:N211I, S:T1117I, New Zealand diff --git a/lineages.csv b/lineages.csv index ec409b25..aec2e492 100644 --- a/lineages.csv +++ b/lineages.csv @@ -2500987,33 +2500987,6 @@ Canada/ON-PHL-23-38024/2023,HV.1.6.1 Canada/ON-PHL-23-38811/2023,HV.1.6.1 Canada/ON-PHL-23-38790/2023,HV.1.6.1 Canada/ON-PHL-23-38776/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-37013/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-35787/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-35992/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-40511/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-39032/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-41878/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-42734/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-39513/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-37115/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-36325/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-38783/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-42223/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-42224/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-39664/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-38241/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-42767/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-37406/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-37486/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-37493/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-KHS-07610-v1/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-KHS-23-07446-v1/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-KHS-23-07375-v1/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-37407/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-KHS-07482-v1/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-PHL-23-37484/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-KHS-23-07351-v1/2023,HV.1.6.1 -Canada/ON-KHS-23-07310-v1/2023,HV.1.6.1 USA/SD-SDPHL-2991/2023,HV.1.7 USA/CA-CDPH-500127709/2023,HV.1.7 Canada/AB-ABPHL-105482/2023,HV.1.7 @@ -2517950,3 +2517923,299 @@ Brazil/AC-44141-IEC/2023,KK.2 Brazil/AC-44560-IEC/2023,KK.2 Brazil/AC-43538-IEC/2023,KK.2 Brazil/AC-44129-IEC/2023,KK.2 +Canada/ON-PHL-23-43874/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-37013/2023,KL.1 +Ireland/D-BH-170039240/2024,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-35992/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-35787/2023,KL.1 +USA/IA-SHL-2379087/2023,KL.1 +USA/2379087/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47018/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48952/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-45323/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48876/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-43050/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-43485/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-45106/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44651/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46594/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46076/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46057/2023,KL.1 +USA/WV145635/2023,KL.1 +USA/MD-MDH-9327/2023,KL.1 +USA/WV-WVU-WV145635/2023,KL.1 +USA/NY-CDC-QDX90375869/2023,KL.1 +USA/MD-HP50266-PIDYKBYFED/2023,KL.1 +USA/VA_ATAMMC_001/2023,KL.1 +USA/DE-DHSS-B1325089/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44829/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-40511/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-41878/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47970/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46672/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-45745/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-08222-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-43246/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44009/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-43931/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-39032/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48800/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48856/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-45533/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09679-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50117/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09674-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47632/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49693/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49082/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49061/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48806/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48803/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50172/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46944/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49152/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49458/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49466/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49457/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46611/2023,KL.1 +USA/NY-CDC-QDX90479695/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-202400429/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50205/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09651-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47664/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49459/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49455/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49454/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49352/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49128/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46950/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09167-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-37406/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-37486/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-37493/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-23-07446-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-37484/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-23-07351-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-23-07310-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-07482-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-07610-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-23-07375-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-37407/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09853-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-42436/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44279/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44208/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49875/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49273/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-08453-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-08413-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09493-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44268/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44239/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44271/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-45535/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-45528/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-45530/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-45532/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-45531/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44207/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09289-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09020-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44366/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44234/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44276/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44277/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44278/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44371/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-43870/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-43867/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-08526-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-08747-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44253/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-08975-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09041-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09066-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09068-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09100-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09107-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09193-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46784/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09512-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46001/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09507-v1/2023,KL.1 +South_Korea/KDCA278449/2023,KL.1 +SouthKorea/KDCA278449/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-43940/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-42734/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-43318/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-39513/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49071/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49024/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48745/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46609/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50795/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50637/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50011/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-45488/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44399/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-44034/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-08961-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-45508/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50022/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49975/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48956/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48226/2023,KL.1 +USA/NY-CDC-QDX90376047/2023,KL.1 +USA/NY-CDC-QDX90257714/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47480/2023,KL.1 +USA/NY-CDC-QDX88030907/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-202400297/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-202400231/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46883/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47119/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47128/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46906/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47129/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47069/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47126/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47757/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47781/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47760/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47756/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48513/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47903/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47867/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48511/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48524/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48697/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47759/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46055/2023,KL.1 +USA/MI-CDC-QDX90322936/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48512/2023,KL.1 +England/CLIMB-CM7YKMGJ/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50401/2023,KL.1 +USA/TX-HMH-M-136350/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-09830-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-10052-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-10080-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46137/2023,KL.1 +USA/NY-NYULH-17511/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46503/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47167/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-45865/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48786/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48540/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48474/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50007/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46963/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48669/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49212/2023,KL.1 +Canada/ON-KHS-00116-v1/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50659/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-202400424/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50396/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49184/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47752/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47753/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47754/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47755/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47729/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46826/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-46836/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47381/2023,KL.1 +Switzerland/VD-CHUV-GEN18826/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49115/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49122/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-37115/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49126/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49127/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49134/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49139/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49144/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-47603/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48377/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48475/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48514/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48687/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48706/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-48740/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-49124/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-36325/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50297/2023,KL.1 +Japan/PG-582311/2023,KL.1 +Japan/PG-584553/2023,KL.1 +Japan/PG-583672/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50726/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-50252/2023,KL.1 +Japan/PG-583685/2023,KL.1 +USA/TX-TAMGHRC-SHS-103295/2023,KL.1 +USA/CA-HLX-STM-PWP7QQNCW/2023,KL.1 +USA/NV-SNPHL-788972/2023,KL.1 +Canada/ON-PHL-23-38783/2023,KL.1.1 +USA/SD-SDPHL-3172/2023,KL.1.1 +England/CLIMB-CM7YGPCQ/2023,KL.1.1 +Canada/BC-BCCDC-684234/2023,KL.1.1 +USA/CA-CDPH-500130256/2023,KL.1.1 +Canada/BC-BCCDC-678994/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-42224/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-42223/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-46982/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-50305/2023,KL.1.1 +USA/CA-CDPH-500129847/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-43969/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-43342/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-50672/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-202400713/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49226/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49220/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49207/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49206/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49497/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-48902/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49617/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-48909/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-48823/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49605/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49431/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49162/2023,KL.1.1 +USA/MI-UM-10054887500/2023,KL.1.1 +USA/MIS-L371671645/2023,KL.1.1 +USA/MI-UM-10054806699/2023,KL.1.1 +USA/MI-UM-10054659100/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49286/2023,KL.1.1 +USA/MIS-L371584023/2023,KL.1.1 +USA/MIS-L371584022/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-50785/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-50781/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-202400725/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-202400698/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-202400681/2024,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49282/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-48620/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49274/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49160/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-43558/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-39664/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-46941/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-50088/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-50471/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-50542/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-48410/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-48238/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-42767/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-50819/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-48414/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49320/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-38241/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-47860/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-44571/2023,KL.1.1 +Ireland/D-CHI-00005/2024,KL.1.1 +Canada/ON-KHS-09972-v1/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-202400018/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-50656/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-202400019/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-48995/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-50483/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-49094/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-48994/2023,KL.1.1 +Canada/ON-PHL-23-48682/2023,KL.1.1 diff --git a/pango_designation/alias_key.json b/pango_designation/alias_key.json index f6df7e1a..f47ea87e 100644 --- a/pango_designation/alias_key.json +++ b/pango_designation/alias_key.json @@ -233,6 +233,7 @@ "KH": "XBB.2.3.3.1.2.1.1.1.1", "KJ": "XBB.1.16.32", "KK": "XBB.1.5.102.1.1.8", + "KL": "XBB.1.9.2.5.1.6.1.6.1", "XA": ["B.1.1.7","B.1.177"], "XB": ["B.1.634","B.1.631"], "XC": ["AY.29","B.1.1.7"],