Skip to content

Latest commit

 

History

History
147 lines (75 loc) · 3.71 KB

readme.md

File metadata and controls

147 lines (75 loc) · 3.71 KB

Apunts introducció a la genòmica des de zero

Pablo Garcia

Repàs organització de la matèria.

Nivell subatòmic:

Neutrons, electrons i protons

Nivell atòmic:

L'àtom és la part més petita d'un element químic. No es pot descompondre en altres.

Pex. Hidrogen, Oxigen, Nitrogen, etc...

Nivell molecular:

Unió de 2 o més àtoms de diversos elements.

La unió rep el nom d'enllaç químic; pot ser simple, doble o triple.

Exemples: H20 (aigua), dioxígeno O2 (oxigen)

Biomolècules:

Mol.lècules que constitueixen els éssers vius.

Biomolècules orgàniques:

Es constitueixen bàsicament per Carboni i Hidrogen.

També solen tenir àtoms d'Oxigen, Nitrogen, Sofre o P(fòsfor).

Biomolècules inorgàniques:

Aigua (H2O), Diòxid Carboni (C02), Sals minerals (NaCl)

Macromol·lècules (ens interessen molt)

Únió de moltes mol·lècules orgàniques petites.

ADN, proteïnes, lípids, glúcids.

Orgànuls cel·lulars:

Ribosomes, aparell de Golgi, lisosomes.

Nivell cel·lular.

Cel:lula: estructura de matèria viva que es compòn d'una membrana, citoplasma i un material genètic que conté la informació sobre la seva estructura i funcionament.

Cel·lula

Unitat més petita d'ésser viu. Les agrupació de cel·lules formen organismes vivents.

Els organismes vivents es poden classificar pel número de cel·lules.

Cèl·lules proariotes. Organismes unicel·lulars sense nucli.

L'exemple més comú són els bacteris.

Cèl·lules eucariotes. Organismes pluricel·lulars. tenen nucli i n'hi ha de 2 tipus: l'animal i la vegetal.

Els animals i les plantes.

Nivell pluricel·lular.

Teixits.

Cel·lules semblants entre sí i especialitzades per a fer una mateixa funció.

Òrgans

Unitats estructurals dels éssers vius que fan actes concrets.

Exemples: Cervell, cor, fetge.

Aparell

Conjunt d'òrgans.

Aparell reproductor.

Nucleòtids

Dintre de les mol·lecules trobem els nucleòtids.

Estan formats per:

  • Una base nitrogenada (adenina, guanina, timina o citosina en el ADN; adenina, guanina, uracilo o citosina en el ARN)
  • Un grupo fosfato
  • Un azúcar (desoxirribosa en el ADN; ribosa en el ARN).

L'ADN y el ARN son polímers compostus per molts nucleòtids concatenats com les boles d'un collaret.

Direccionalitat ADN

Hi ha 2 nucleòtids que sempre hi són a l'ADN i defineixen la seva direccionalitat: de 5' a 3'.

Significa que el nucleòtidde l'extrem 5' es el primero y el nucleòtid de l'extrem 3' es el úlitm.

[adn-5p-3p.png]

L'ADN sempre forma una doble cadena (o hèlix) perquè aporta més estabilitat.

En anglès es parla de double strands (fils)

Estructura doble cadena de l'ADN

L'ADN té una de les cadenes originals (motlle) i l'altra cadena és la complementaria.

En general, la C complementa la G i la A complementa la T.

5' GATAGA ... 3' Strand1 (orig.)

||||||

3' CTATCT ... 5' Strand2 (compl.)

[adn-transcription.png]

Com es pot veure, per passar de la cadena complementària a la original, hem d'invertir la cadena i calcular

Fixeu-vos també com canvia l'ordre dels nucleòtids 3' i 5'.

En Biopython tenim el mètode reversecomplement.

Per tant, l'ADN está compost por dos cadenes complementàries que s'enrotllan entre sí y recorden a una escala de caragol.

Un parell de bases està compost per dos bases nitrogenades d'ADN complementàries que se emparellen.

Repassem el dobma

⚠ Pendent ⚠

Repassem l'estructura dels gens.

⚠ Pendent ⚠

Referència:

https://es.khanacademy.org/science/ap-biology/gene-expression-and-regulation/dna-and-rna-structure/a/nucleic-acids