From a1cae40d7e5163289bbf68f6398a036a59eb0cae Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Fabian Engelniederhammer Date: Thu, 12 Oct 2023 17:10:42 +0200 Subject: [PATCH] feat: stick to the default of having config value keys in camel case --- src/silo/storage/reference_genomes.cpp | 4 ++-- testBaseData/exampleDataset/reference_genomes.json | 2 +- 2 files changed, 3 insertions(+), 3 deletions(-) diff --git a/src/silo/storage/reference_genomes.cpp b/src/silo/storage/reference_genomes.cpp index 5cc8d2061..dfff65f7c 100644 --- a/src/silo/storage/reference_genomes.cpp +++ b/src/silo/storage/reference_genomes.cpp @@ -22,7 +22,7 @@ struct nlohmann::adl_serializer { for (const auto& [name, sequence] : reference_genomes.raw_nucleotide_sequences) { nucleotide_sequences_json.push_back({{"name", name}, {"sequence", sequence}}); } - js_object["nucleotide_sequences"] = std::move(nucleotide_sequences_json); + js_object["nucleotideSequences"] = std::move(nucleotide_sequences_json); nlohmann::json aa_sequences_json; for (const auto& [name, sequence] : reference_genomes.raw_aa_sequences) { @@ -84,7 +84,7 @@ ReferenceGenomes readFromJson(const std::filesystem::path& reference_genomes_pat nlohmann::json reference_genomes_json; std::ifstream(reference_genomes_path) >> reference_genomes_json; - const nlohmann::json nuc_seq_json = reference_genomes_json["nucleotide_sequences"]; + const nlohmann::json nuc_seq_json = reference_genomes_json["nucleotideSequences"]; const nlohmann::json aa_seq_json = reference_genomes_json["genes"]; for (const auto& [key, value] : nuc_seq_json.items()) { diff --git a/testBaseData/exampleDataset/reference_genomes.json b/testBaseData/exampleDataset/reference_genomes.json index e391bf504..25456327a 100644 --- a/testBaseData/exampleDataset/reference_genomes.json +++ b/testBaseData/exampleDataset/reference_genomes.json @@ -1,5 +1,5 @@ { - "nucleotide_sequences": [ + "nucleotideSequences": [ { "name": "main", "sequence": 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