diff --git a/.gitignore b/.gitignore old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/Dockerfile b/Dockerfile old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/LICENSE b/LICENSE old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/Makefile b/Makefile old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/README.md b/README.md old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/app.py b/app.py old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/app.yaml b/app.yaml old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/data/collectors.py b/data/collectors.py old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/data/csv/by_day/01-02-2020.csv b/data/csv/by_day/01-02-2020.csv new file mode 100755 index 00000000..9247a206 --- /dev/null +++ b/data/csv/by_day/01-02-2020.csv @@ -0,0 +1,8 @@ +suspects,refuses,cases,deaths,UF +1,0,0,0,CE +0,1,0,0,MG +1,1,0,0,PR +0,1,0,0,RJ +4,3,0,0,RS +2,2,0,0,SC +8,2,0,0,SP diff --git a/data/csv/by_day/01-02-2020.csv.orig b/data/csv/by_day/01-02-2020.csv.orig new file mode 100755 index 00000000..9247a206 --- /dev/null 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@@ -0,0 +1,8 @@ +suspects,refuses,cases,deaths,UF +1,0,0,0,CE +1,0,0,0,MG +1,1,0,0,PR +1,0,0,0,RJ +2,2,0,0,RS +0,2,0,0,SC +3,1,0,0,SP diff --git a/data/csv/by_day/31-01-2020.csv b/data/csv/by_day/31-01-2020.csv new file mode 100755 index 00000000..7b8f00c5 --- /dev/null +++ b/data/csv/by_day/31-01-2020.csv @@ -0,0 +1,8 @@ +suspects,refuses,cases,deaths,UF +1,0,0,0,CE +1,0,0,0,MG +1,1,0,0,PR +0,1,0,0,RJ +2,3,0,0,RS +1,2,0,0,SC +7,2,0,0,SP diff --git a/data/csv/by_day/31-01-2020.csv.orig b/data/csv/by_day/31-01-2020.csv.orig new file mode 100755 index 00000000..7b8f00c5 --- /dev/null +++ b/data/csv/by_day/31-01-2020.csv.orig @@ -0,0 +1,8 @@ +suspects,refuses,cases,deaths,UF +1,0,0,0,CE +1,0,0,0,MG +1,1,0,0,PR +0,1,0,0,RJ +2,3,0,0,RS +1,2,0,0,SC +7,2,0,0,SP diff --git a/data/csv/by_uf/AC.csv b/data/csv/by_uf/AC.csv new file mode 100755 index 00000000..a8c9dd90 --- /dev/null +++ b/data/csv/by_uf/AC.csv @@ -0,0 +1,10 @@ +date,suspects,refuses,cases,deaths +2020-03-10,3,0,0,0 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+2020-03-16,50,21,1,0 +2020-03-17,69,21,1,0 +2020-03-18,71,21,9,0 diff --git a/data/csv/by_uf/GO.csv b/data/csv/by_uf/GO.csv new file mode 100755 index 00000000..c7063a19 --- /dev/null +++ b/data/csv/by_uf/GO.csv @@ -0,0 +1,21 @@ +date,suspects,refuses,cases,deaths +2020-02-27,3,0,0,0 +2020-02-28,5,0,0,0 +2020-02-29,5,0,0,0 +2020-03-01,5,0,0,0 +2020-03-02,3,7,0,0 +2020-03-03,7,7,0,0 +2020-03-04,1,12,0,0 +2020-03-05,4,12,0,0 +2020-03-06,4,12,0,0 +2020-03-07,4,12,0,0 +2020-03-08,4,12,0,0 +2020-03-10,14,14,0,0 +2020-03-11,17,28,0,0 +2020-03-12,15,34,0,0 +2020-03-13,6,46,3,0 +2020-03-14,4,49,3,0 +2020-03-15,4,49,3,0 +2020-03-16,3,54,3,0 +2020-03-17,221,54,6,0 +2020-03-18,353,55,8,0 diff --git a/data/csv/by_uf/MA.csv b/data/csv/by_uf/MA.csv new file mode 100755 index 00000000..0e9bd04f --- /dev/null +++ b/data/csv/by_uf/MA.csv @@ -0,0 +1,17 @@ +date,suspects,refuses,cases,deaths +2020-03-02,1,1,0,0 +2020-03-03,1,1,0,0 +2020-03-04,0,2,0,0 +2020-03-05,0,2,0,0 +2020-03-06,0,2,0,0 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+2020-03-18,12,2,0,0 diff --git a/data/csv/by_uf/PR.csv b/data/csv/by_uf/PR.csv new file mode 100755 index 00000000..18583ca6 --- /dev/null +++ b/data/csv/by_uf/PR.csv @@ -0,0 +1,51 @@ +date,suspects,refuses,cases,deaths +2020-01-30,1,1,0,0 +2020-01-31,1,1,0,0 +2020-02-01,1,1,0,0 +2020-02-02,1,1,0,0 +2020-02-03,0,2,0,0 +2020-02-04,0,2,0,0 +2020-02-05,0,2,0,0 +2020-02-06,0,2,0,0 +2020-02-06,0,2,0,0 +2020-02-07,0,2,0,0 +2020-02-08,0,2,0,0 +2020-02-09,1,2,0,0 +2020-02-10,1,2,0,0 +2020-02-11,1,2,0,0 +2020-02-12,1,2,0,0 +2020-02-13,1,2,0,0 +2020-02-14,1,2,0,0 +2020-02-15,0,3,0,0 +2020-02-16,0,3,0,0 +2020-02-17,0,3,0,0 +2020-02-18,0,3,0,0 +2020-02-19,0,3,0,0 +2020-02-20,0,3,0,0 +2020-02-21,0,3,0,0 +2020-02-22,0,3,0,0 +2020-02-23,0,3,0,0 +2020-02-24,0,3,0,0 +2020-02-25,0,3,0,0 +2020-02-25,0,3,0,0 +2020-02-26,0,3,0,0 +2020-02-27,5,3,0,0 +2020-02-28,5,3,0,0 +2020-02-29,5,3,0,0 +2020-03-01,5,3,0,0 +2020-03-02,7,8,0,0 +2020-03-03,14,8,0,0 +2020-03-04,13,8,0,0 +2020-03-05,20,9,0,0 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+2020-02-24,1,7,0,0 +2020-02-25,0,8,0,0 +2020-02-25,0,8,0,0 +2020-02-26,2,8,0,0 +2020-02-27,9,8,0,0 +2020-02-28,19,8,0,0 +2020-02-29,19,8,0,0 +2020-03-01,19,8,0,0 +2020-03-02,42,27,0,0 +2020-03-03,62,29,0,0 +2020-03-04,55,52,0,0 +2020-03-05,79,58,1,0 +2020-03-06,111,67,1,0 +2020-03-07,111,67,2,0 +2020-03-08,110,67,3,0 +2020-03-10,119,85,8,0 +2020-03-11,87,133,13,0 +2020-03-12,76,146,16,0 +2020-03-13,76,147,16,0 +2020-03-14,76,147,22,0 +2020-03-15,95,147,24,0 +2020-03-16,96,153,31,0 +2020-03-17,859,194,33,0 +2020-03-18,1254,148,45,0 diff --git a/data/csv/by_uf/RN.csv b/data/csv/by_uf/RN.csv new file mode 100755 index 00000000..f6f40a15 --- /dev/null +++ b/data/csv/by_uf/RN.csv @@ -0,0 +1,21 @@ +date,suspects,refuses,cases,deaths +2020-02-27,4,0,0,0 +2020-02-28,3,2,0,0 +2020-02-29,3,2,0,0 +2020-03-01,3,2,0,0 +2020-03-02,2,6,0,0 +2020-03-03,2,6,0,0 +2020-03-04,5,6,0,0 +2020-03-05,4,8,0,0 +2020-03-06,7,8,0,0 +2020-03-07,4,11,0,0 +2020-03-08,9,13,0,0 +2020-03-10,15,13,0,0 +2020-03-11,13,14,0,0 +2020-03-12,13,15,0,0 +2020-03-13,12,15,1,0 +2020-03-14,12,15,1,0 +2020-03-15,14,15,1,0 +2020-03-16,14,15,1,0 +2020-03-17,72,21,1,0 +2020-03-18,108,22,1,0 diff --git a/data/csv/by_uf/RO.csv b/data/csv/by_uf/RO.csv new file mode 100755 index 00000000..5dccc6dc --- /dev/null +++ b/data/csv/by_uf/RO.csv @@ -0,0 +1,17 @@ +date,suspects,refuses,cases,deaths +2020-03-02,1,0,0,0 +2020-03-03,1,0,0,0 +2020-03-04,1,0,0,0 +2020-03-05,1,0,0,0 +2020-03-06,1,0,0,0 +2020-03-07,1,0,0,0 +2020-03-08,1,0,0,0 +2020-03-10,2,1,0,0 +2020-03-11,2,1,0,0 +2020-03-12,2,1,0,0 +2020-03-13,2,1,0,0 +2020-03-14,2,1,0,0 +2020-03-15,2,1,0,0 +2020-03-16,2,1,0,0 +2020-03-17,38,3,0,0 +2020-03-18,61,2,0,0 diff --git a/data/csv/by_uf/RR.csv b/data/csv/by_uf/RR.csv new file mode 100755 index 00000000..8c4f72be --- /dev/null +++ b/data/csv/by_uf/RR.csv @@ -0,0 +1,5 @@ +date,suspects,refuses,cases,deaths +2020-03-15,2,0,0,0 +2020-03-16,2,0,0,0 +2020-03-17,5,0,0,0 +2020-03-18,9,0,0,0 diff --git a/data/csv/by_uf/RS.csv b/data/csv/by_uf/RS.csv new file mode 100755 index 00000000..2f1fad51 --- /dev/null +++ b/data/csv/by_uf/RS.csv @@ -0,0 +1,51 @@ +date,suspects,refuses,cases,deaths +2020-01-30,2,2,0,0 +2020-01-31,2,3,0,0 +2020-02-01,4,3,0,0 +2020-02-02,4,3,0,0 +2020-02-03,4,3,0,0 +2020-02-04,4,3,0,0 +2020-02-05,5,3,0,0 +2020-02-06,3,5,0,0 +2020-02-06,3,5,0,0 +2020-02-07,2,6,0,0 +2020-02-08,3,6,0,0 +2020-02-09,3,6,0,0 +2020-02-10,1,8,0,0 +2020-02-11,1,8,0,0 +2020-02-12,1,8,0,0 +2020-02-13,2,8,0,0 +2020-02-14,2,8,0,0 +2020-02-15,1,9,0,0 +2020-02-16,1,9,0,0 +2020-02-17,1,9,0,0 +2020-02-18,1,9,0,0 +2020-02-19,1,9,0,0 +2020-02-20,0,10,0,0 +2020-02-21,0,10,0,0 +2020-02-22,0,10,0,0 +2020-02-23,0,10,0,0 +2020-02-24,0,10,0,0 +2020-02-25,0,10,0,0 +2020-02-25,0,10,0,0 +2020-02-26,0,10,0,0 +2020-02-27,24,10,0,0 +2020-02-28,27,10,0,0 +2020-02-29,27,10,0,0 +2020-03-01,27,10,0,0 +2020-03-02,73,10,0,0 +2020-03-03,82,20,0,0 +2020-03-04,98,20,0,0 +2020-03-05,104,25,0,0 +2020-03-06,112,41,0,0 +2020-03-07,88,75,0,0 +2020-03-08,88,75,0,0 +2020-03-10,70,129,1,0 +2020-03-11,67,159,2,0 +2020-03-12,81,183,4,0 +2020-03-13,81,203,4,0 +2020-03-14,80,203,6,0 +2020-03-15,66,217,6,0 +2020-03-16,119,218,6,0 +2020-03-17,300,217,10,0 +2020-03-18,416,330,19,0 diff --git a/data/csv/by_uf/SC.csv b/data/csv/by_uf/SC.csv new file mode 100755 index 00000000..9c35bc2e --- /dev/null +++ b/data/csv/by_uf/SC.csv @@ -0,0 +1,51 @@ +date,suspects,refuses,cases,deaths +2020-01-30,0,2,0,0 +2020-01-31,1,2,0,0 +2020-02-01,2,2,0,0 +2020-02-02,2,2,0,0 +2020-02-03,2,2,0,0 +2020-02-04,2,2,0,0 +2020-02-05,1,3,0,0 +2020-02-06,1,3,0,0 +2020-02-06,1,3,0,0 +2020-02-07,1,3,0,0 +2020-02-08,1,3,0,0 +2020-02-09,1,3,0,0 +2020-02-10,0,4,0,0 +2020-02-11,0,4,0,0 +2020-02-12,0,4,0,0 +2020-02-13,0,4,0,0 +2020-02-14,0,4,0,0 +2020-02-15,0,4,0,0 +2020-02-16,0,4,0,0 +2020-02-17,0,4,0,0 +2020-02-18,0,4,0,0 +2020-02-19,0,4,0,0 +2020-02-20,0,4,0,0 +2020-02-21,0,4,0,0 +2020-02-22,0,4,0,0 +2020-02-23,0,4,0,0 +2020-02-24,0,4,0,0 +2020-02-25,0,4,0,0 +2020-02-25,0,4,0,0 +2020-02-26,2,4,0,0 +2020-02-27,8,4,0,0 +2020-02-28,9,4,0,0 +2020-02-29,9,4,0,0 +2020-03-01,9,4,0,0 +2020-03-02,36,4,0,0 +2020-03-03,43,4,0,0 +2020-03-04,46,4,0,0 +2020-03-05,54,4,0,0 +2020-03-06,59,10,0,0 +2020-03-07,44,25,0,0 +2020-03-08,44,26,0,0 +2020-03-10,42,28,0,0 +2020-03-11,47,32,0,0 +2020-03-12,73,34,0,0 +2020-03-13,77,34,2,0 +2020-03-14,85,39,4,0 +2020-03-15,102,41,6,0 +2020-03-16,109,44,7,0 +2020-03-17,220,55,7,0 +2020-03-18,346,47,10,0 diff --git a/data/csv/by_uf/SE.csv b/data/csv/by_uf/SE.csv new file mode 100755 index 00000000..76d9a22f --- /dev/null +++ b/data/csv/by_uf/SE.csv @@ -0,0 +1,17 @@ +date,suspects,refuses,cases,deaths +2020-03-02,1,0,0,0 +2020-03-03,1,0,0,0 +2020-03-04,1,0,0,0 +2020-03-05,2,0,0,0 +2020-03-06,3,1,0,0 +2020-03-07,1,1,0,0 +2020-03-08,1,1,0,0 +2020-03-10,2,3,0,0 +2020-03-11,2,3,0,0 +2020-03-12,2,3,0,0 +2020-03-13,2,3,0,0 +2020-03-14,4,3,0,0 +2020-03-15,1,11,1,0 +2020-03-16,1,11,1,0 +2020-03-17,7,12,4,0 +2020-03-18,15,11,5,0 diff --git a/data/csv/by_uf/SP.csv b/data/csv/by_uf/SP.csv new file mode 100755 index 00000000..2ec3f525 --- /dev/null +++ b/data/csv/by_uf/SP.csv @@ -0,0 +1,51 @@ +date,suspects,refuses,cases,deaths +2020-01-30,3,1,0,0 +2020-01-31,7,2,0,0 +2020-02-01,8,2,0,0 +2020-02-02,8,2,0,0 +2020-02-03,7,3,0,0 +2020-02-04,6,5,0,0 +2020-02-05,4,9,0,0 +2020-02-06,3,10,0,0 +2020-02-06,3,10,0,0 +2020-02-07,3,11,0,0 +2020-02-08,2,13,0,0 +2020-02-09,3,13,0,0 +2020-02-10,3,13,0,0 +2020-02-11,3,14,0,0 +2020-02-12,6,14,0,0 +2020-02-13,3,17,0,0 +2020-02-14,1,20,0,0 +2020-02-15,2,20,0,0 +2020-02-16,2,20,0,0 +2020-02-17,2,20,0,0 +2020-02-18,4,20,0,0 +2020-02-19,1,23,0,0 +2020-02-20,1,24,0,0 +2020-02-21,0,25,0,0 +2020-02-22,0,25,0,0 +2020-02-23,1,25,0,0 +2020-02-24,3,26,0,0 +2020-02-25,4,26,0,0 +2020-02-25,4,26,0,0 +2020-02-26,11,28,1,0 +2020-02-27,55,28,1,0 +2020-02-28,66,30,1,0 +2020-02-29,91,38,2,0 +2020-03-01,136,48,2,0 +2020-03-02,163,48,2,0 +2020-03-03,130,104,2,0 +2020-03-04,135,131,3,0 +2020-03-05,182,159,6,0 +2020-03-06,222,189,10,0 +2020-03-07,184,246,13,0 +2020-03-08,176,258,16,0 +2020-03-10,302,289,19,0 +2020-03-11,263,320,30,0 +2020-03-12,704,471,42,0 +2020-03-13,753,529,56,0 +2020-03-14,752,545,65,0 +2020-03-15,1125,551,136,0 +2020-03-16,1177,623,152,0 +2020-03-17,5047,709,164,1 +2020-03-18,5334,596,240,4 diff --git a/data/csv/by_uf/TO.csv b/data/csv/by_uf/TO.csv new file mode 100755 index 00000000..7af59caf --- /dev/null +++ b/data/csv/by_uf/TO.csv @@ -0,0 +1,7 @@ +date,suspects,refuses,cases,deaths +2020-03-13,2,0,0,0 +2020-03-14,2,0,0,0 +2020-03-15,3,0,0,0 +2020-03-16,3,0,0,0 +2020-03-17,11,0,0,0 +2020-03-18,13,0,0,0 diff --git a/data/csv/covid_19/by_city/by_city.csv b/data/csv/covid_19/by_city/by_city.csv old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/data/csv/covid_19/by_uf/by_uf.csv b/data/csv/covid_19/by_uf/by_uf.csv old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/data/csv/population/by_city/by_city.csv b/data/csv/population/by_city/by_city.csv old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/data/csv/population/by_uf/by_uf.csv b/data/csv/population/by_uf/by_uf.csv old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/data/data_app.py b/data/data_app.py old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/data/data_params.py b/data/data_params.py old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/figures/seir-bayes-1.png b/figures/seir-bayes-1.png old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/help.mk b/help.mk old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/models/.~seir_bayes.py b/models/.~seir_bayes.py new file mode 100755 index 00000000..52277c08 --- /dev/null +++ b/models/.~seir_bayes.py @@ -0,0 +1,213 @@ +import pandas as pd +import numpy as np +import numpy.random as npr +from scipy.integrate import odeint +from scipy.stats import norm +import matplotlib.pyplot as plt +import dask.bag as db + + + +def make_lognormal_params_95_ci(lb, ub): + mean = (ub*lb)**(1/2) + std = (ub/lb)**(1/4) + return mean, std + + +def run_SEIR_BAYES_model( + N: 'population size', + E0: 'init. exposed population', + I0: 'init. infected population', + R0: 'init. removed population', + R0__params: 'repr. rate mean and std', + gamma_inv_params: 'removal rate mean and std', + alpha_inv_params: 'incubation rate mean and std', + t_max: 'numer of days to run', + runs: 'number of runs' + ): + + S0 = N - (I0 + R0 + E0) + t_space = np.arange(0, t_max) + + size = (t_max, runs) + + S = np.zeros(size) + E = np.zeros(size) + I = np.zeros(size) + R = np.zeros(size) + + S[0, ], E[0, ], I[0, ], R[0, ] = S0, E0, I0, R0 + + R0_ = npr.lognormal(*map(np.log, R0__params), runs) + gamma = 1/npr.lognormal(*map(np.log, gamma_inv_params), runs) + alpha = 1/npr.lognormal(*map(np.log, alpha_inv_params), runs) + beta = R0_*gamma + + for t in t_space[1:]: + SE = npr.binomial(S[t-1, ].astype('int'), 1 - np.exp(-beta*I[t-1, ]/N)) + EI = npr.binomial(E[t-1, ].astype('int'), 1 - np.exp(-alpha)) + IR = npr.binomial(I[t-1, ].astype('int'), 1 - np.exp(-gamma)) + + dS = 0 - SE + dE = SE - EI + dI = EI - IR + dR = IR - 0 + + S[t, ] = S[t-1, ] + dS + E[t, ] = E[t-1, ] + dE + I[t, ] = I[t-1, ] + dI + R[t, ] = R[t-1, ] + dR + + return S, E, I, R, t_space + + +def seir_bayes_plot(N, E0, I0, R0, + R0__params, + gamma_inv_params, + alpha_inv_params, + t_max, runs, S, E, I, R, t_space): + S0 = N - (I0 + R0 + E0) + # plot + algorithm_text = ( + f"for {runs} runs, do:\n" + f"\t$S_0={S0}$\n\t$E_0={E0}$\n\t$I_0={I0}$\n\t$R_0={R0}$\n" + "\t$\\gamma \\sim LogNormal(\mu={:.04}, \\sigma={:.04})$\n" + "\t$\\alpha \\sim LogNormal(\mu={:.04}, \\sigma={:.04})$\n" + "\t$R0 \\sim LogNormal(\mu={:.04}, \\sigma={:.04})$\n" + f"\t$\\beta = \\gamma R0$\n" + f"\tSolve SEIR$(\\alpha, \\gamma, \\beta)$" + ).format(*gamma_inv_params, *alpha_inv_params, *R0__params) + + title = '(RESULTADO PRELIMINAR) Pessoas afetadas pelo COVID-19, segundo o modelo SEIR-Bayes' + plt.style.use('ggplot') + fig, ax = plt.subplots(figsize=(16,9)) + plt.plot(t_space, E.mean(axis=1), '--', t_space, I.mean(axis=1), '--', marker='o') + plt.title(title, fontsize=20) + plt.legend(['Expostas ($\mu \pm \sigma$)', + 'Infectadas ($\mu \pm \sigma$)'], + fontsize=20, loc='lower right') + plt.xlabel('t (Dias a partir de 17/Março/2020)', fontsize=20) + plt.ylabel('Pessoas', fontsize=20) + plt.fill_between(t_space, + I.mean(axis=1) + I.std(axis=1), + (I.mean(axis=1) - I.std(axis=1)).clip(I0), + color='b', alpha=0.2) + plt.fill_between(t_space, + E.mean(axis=1) + E.std(axis=1), + (E.mean(axis=1) - E.std(axis=1)).clip(I0), + color='r', alpha=0.2) + plt.xticks(fontsize=20) + plt.yticks(fontsize=20) + props = dict(boxstyle='round', facecolor='wheat', alpha=0.5) + ax.text(0.05, 0.95, algorithm_text, + transform=ax.transAxes, fontsize=18, + verticalalignment='top', bbox=props) + plt.yscale('log') + return fig + + +def seir_bayes_interactive_plot(N, E0, I0, R0, + t_max, runs, S, E, I, R, t_space, + scale='log', show_uncertainty=True): + + from .visualization import prep_tidy_data_to_plot, make_combined_chart + source = prep_tidy_data_to_plot(E, I, t_space) + chart = make_combined_chart(source, + scale=scale, + show_uncertainty=show_uncertainty) + return chart + +def seir_bayes_df_pop( + R0__params: 'repr. rate upper and lower limits' = (1.96, 2.55), + gamma_inv_params: 'removal rate upper and lower limits' = (10, 16), + alpha_inv_params: 'incubation rate upper and lower limits' = (4.1, 7), + t_max: 'numer of days to run' = 30, + runs: 'number of runs' = 1000, + date: 'load SEIR(0) for this date' = 'latest' + ): + + def estimate_removed_and_exposed(df): + return (df + .sort_values('date') + .assign(removed_est=lambda df: df.cases.shift(1).fillna(0) + df.new_cases - df.cases) + .assign(exposed_est=lambda df: (df.cases + .shift(-int(alpha_inv_params[1])) + .fillna(method='ffill') + .fillna(0)))) + + population = pd.read_csv('data/csv/population/by_city/by_city.csv', index_col=['uf', 'city']) + covid19 = pd.read_csv('data/csv/covid_19/by_city/by_city.csv', parse_dates=['date']) + + + date = covid19['date'].max() if date == 'latest' else date + + # if this fails, something is wrong with the data + assert population.index.is_unique + assert covid19.index.is_unique + + SEIR_0 = ( + covid19 + .groupby(['uf', 'city'], group_keys=False) + .apply(estimate_removed_and_exposed) + [lambda df: df['date'] == date] + .set_index(['uf', 'city']) + .join(population, how='left') + .reset_index() + [['uf', 'city', 'estimated_population', 'exposed_est', 'cases', 'removed_est']] + .query("cases >= 5") + .to_dict(orient='records') + ) + + # In: SEIR_0[:2] + # Out: [{'uf': 'AC', + # 'city': 'Rio Branco', + # 'estimated_population': 407319.0, + # 'exposed_est': 0.0, + # 'cases': 4, + # 'removed_est': 0.0}, + # {'uf': 'AL', + # 'city': 'Maceió', + # 'estimated_population': 1018948.0, + # 'exposed_est': 3.0, + # 'cases': 4, + # 'removed_est': 0.0}] + + def run_model(params): + N = params['estimated_population'] + E0 = params['exposed_est'] + I0 = params['cases'] + R0 = params['removed_est'] + model_input = (N, E0, I0, R0, R0__params, + gamma_inv_params, alpha_inv_params, + t_max, runs) + try: + return {**params, 'results': run_SEIR_BAYES_model(*model_input), 'error': False} + except: + return {**params, 'results': model_input, 'error': True} + + return (db.from_sequence(SEIR_0) + .map(run_model) + .compute(scheduler='processes')) + + +if __name__ == '__main__': + N = 13_000_000 + E0, I0, R0 = 300, 250, 1 + R0__params = make_lognormal_params_95_ci(1.96, 2.55) + gamma_inv_params = make_lognormal_params_95_ci(10, 16) + alpha_inv_params = make_lognormal_params_95_ci(4.1, 7) + t_max = 30*6 + runs = 1_000 + S, E, I, R, t_space = run_SEIR_BAYES_model( + N, E0, I0, R0, + R0__params, + gamma_inv_params, + alpha_inv_params, + t_max, runs) + + fig = seir_bayes_plot(N, E0, I0, R0, + R0__params, + gamma_inv_params, + alpha_inv_params, + t_max, runs, S, E, I, R, t_space) + plt.show() diff --git a/models/seir_bayes.py b/models/seir_bayes.py old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/models/seir_graph.py b/models/seir_graph.py old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/models/seir_ode.py b/models/seir_ode.py old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/models/seir_sde.py b/models/seir_sde.py old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/models/visualization.py b/models/visualization.py old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/notebooks/.gitkeep b/notebooks/.gitkeep old mode 100644 new mode 100755 diff --git "a/notebooks/[issue_36]_Tunar_par\303\242metros_com_dados_hist\303\263rico.ipynb" "b/notebooks/[issue_36]_Tunar_par\303\242metros_com_dados_hist\303\263rico.ipynb" old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/notebooks/[issue_62]_Covid_Auto_Arima.ipynb b/notebooks/[issue_62]_Covid_Auto_Arima.ipynb old mode 100644 new mode 100755 diff --git a/notebooks/cnes_leitos.csv b/notebooks/cnes_leitos.csv new file mode 100755 index 00000000..168c8611 --- /dev/null +++ b/notebooks/cnes_leitos.csv @@ -0,0 +1,6990 @@ +CNES;IBGE;leito_sus_cirurgicos;leito_sus_clinicos;leito_sus_gineco_obs;leito_sus_isolamento;leito_sus_outrasespec;leito_sus_pediatricos;leito_sus_uci;leito_sus_uti +2516500;110001;0;0;0;0;0;0;0;0 +2679477;110001;6;21;8;2;0;8;0;0 +2494280;110002;0;0;0;1;0;30;0;0 +2494299;110002;16;21;27;0;2;1;0;0 +2515504;110002;0;0;0;0;0;0;0;0 +2515555;110002;0;0;0;0;0;0;0;0 +2515598;110002;5;5;0;1;0;4;0;7 +2515601;110002;0;0;0;0;0;0;0;0 +5082145;110002;5;0;0;0;1;0;0;0 +6663834;110002;0;0;0;0;0;0;0;0 +9502432;110002;1;4;0;0;1;0;0;0 +9521291;110002;0;10;0;0;0;0;0;0 +2808528;110003;0;4;2;0;1;2;0;0 +2496046;110004;1;1;19;0;0;15;0;0 +2516381;110004;0;0;0;0;0;0;0;0 +2784637;110004;0;0;0;0;0;0;0;0 +3651665;110004;0;0;0;0;0;0;0;0 +6599877;110004;72;32;3;0;0;45;0;27 +6625908;110004;0;0;0;0;0;0;0;0 +6926401;110004;0;0;0;0;0;0;0;0 +7648693;110004;0;0;0;0;0;0;0;0 +7704364;110004;40;59;0;0;0;0;0;0 +2334801;110005;5;20;8;2;0;7;0;0 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plt\n", + "import dask.bag as db" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 2, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "def make_lognormal_params_95_ci(lb, ub):\n", + " mean = (ub*lb)**(1/2)\n", + " std = (ub/lb)**(1/4)\n", + " return mean, std" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 3, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "def run_SEIR_BAYES_model(\n", + " N: 'population size',\n", + " E0: 'init. exposed population',\n", + " I0: 'init. infected population',\n", + " R0: 'init. removed population',\n", + " R0__params: 'repr. rate mean and std',\n", + " gamma_inv_params: 'removal rate mean and std',\n", + " alpha_inv_params: 'incubation rate mean and std',\n", + " t_max: 'numer of days to run',\n", + " runs: 'number of runs'\n", + " ):\n", + "\n", + " S0 = N - (I0 + R0 + E0)\n", + " t_space = np.arange(0, t_max)\n", + "\n", + " size = (t_max, runs)\n", + "\n", + " S = np.zeros(size)\n", + " E = np.zeros(size)\n", + " I = np.zeros(size)\n", + " R = np.zeros(size)\n", + " \n", + " S[0, ], E[0, ], I[0, ], R[0, ] = S0, E0, I0, R0\n", + "\n", + " R0_ = npr.lognormal(*map(np.log, R0__params), runs)\n", + " gamma = 1/npr.lognormal(*map(np.log, gamma_inv_params), runs)\n", + " alpha = 1/npr.lognormal(*map(np.log, alpha_inv_params), runs)\n", + " beta = R0_*gamma\n", + " \n", + " for t in t_space[1:]:\n", + " SE = npr.binomial(S[t-1, ].astype('int'), 1 - np.exp(-beta*I[t-1, ]/N))\n", + " EI = npr.binomial(E[t-1, ].astype('int'), 1 - np.exp(-alpha))\n", + " IR = npr.binomial(I[t-1, ].astype('int'), 1 - np.exp(-gamma))\n", + "\n", + " dS = 0 - SE\n", + " dE = SE - EI\n", + " dI = EI - IR\n", + " dR = IR - 0\n", + "\n", + " S[t, ] = S[t-1, ] + dS\n", + " E[t, ] = E[t-1, ] + dE\n", + " I[t, ] = I[t-1, ] + dI\n", + " R[t, ] = R[t-1, ] + dR\n", + " \n", + " return S, E, I, R, t_space" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 4, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "def seir_bayes_plot(N, E0, I0, R0,\n", + " R0__params,\n", + " gamma_inv_params,\n", + " alpha_inv_params,\n", + " t_max, runs, S, E, I, R, t_space):\n", + " S0 = N - (I0 + R0 + E0)\n", + " # plot\n", + " algorithm_text = (\n", + " f\"for {runs} runs, do:\\n\"\n", + " f\"\\t$S_0={S0}$\\n\\t$E_0={E0}$\\n\\t$I_0={I0}$\\n\\t$R_0={R0}$\\n\"\n", + " \"\\t$\\\\gamma \\\\sim LogNormal(\\mu={:.04}, \\\\sigma={:.04})$\\n\"\n", + " \"\\t$\\\\alpha \\\\sim LogNormal(\\mu={:.04}, \\\\sigma={:.04})$\\n\"\n", + " \"\\t$R0 \\\\sim LogNormal(\\mu={:.04}, \\\\sigma={:.04})$\\n\"\n", + " f\"\\t$\\\\beta = \\\\gamma R0$\\n\"\n", + " f\"\\tSolve SEIR$(\\\\alpha, \\\\gamma, \\\\beta)$\"\n", + " ).format(*gamma_inv_params, *alpha_inv_params, *R0__params)\n", + "\n", + " title = '(RESULTADO PRELIMINAR) Pessoas afetadas pelo COVID-19, segundo o modelo SEIR-Bayes'\n", + " plt.style.use('ggplot')\n", + " fig, ax = plt.subplots(figsize=(16,9))\n", + " plt.plot(t_space, E.mean(axis=1), '--', t_space, I.mean(axis=1), '--', marker='o')\n", + " plt.title(title, fontsize=20)\n", + " plt.legend(['Expostas ($\\mu \\pm \\sigma$)',\n", + " 'Infectadas ($\\mu \\pm \\sigma$)'],\n", + " fontsize=20, loc='lower right')\n", + " plt.xlabel('t (Dias a partir de 17/Março/2020)', fontsize=20)\n", + " plt.ylabel('Pessoas', fontsize=20)\n", + " plt.fill_between(t_space,\n", + " I.mean(axis=1) + I.std(axis=1), \n", + " (I.mean(axis=1) - I.std(axis=1)).clip(I0),\n", + " color='b', alpha=0.2)\n", + " plt.fill_between(t_space, \n", + " E.mean(axis=1) + E.std(axis=1), \n", + " (E.mean(axis=1) - E.std(axis=1)).clip(I0),\n", + " color='r', alpha=0.2)\n", + " plt.xticks(fontsize=20)\n", + " plt.yticks(fontsize=20)\n", + " props = dict(boxstyle='round', facecolor='wheat', alpha=0.5)\n", + " ax.text(0.05, 0.95, algorithm_text,\n", + " transform=ax.transAxes, fontsize=18,\n", + " verticalalignment='top', bbox=props)\n", + " plt.yscale('log')\n", + " return fig" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 5, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "def seir_bayes_interactive_plot(N, E0, I0, R0,\n", + " t_max, runs, S, E, I, R, t_space,\n", + " scale='log', show_uncertainty=True):\n", + "\n", + " from .visualization import prep_tidy_data_to_plot, make_combined_chart\n", + " source = prep_tidy_data_to_plot(E, I, t_space)\n", + " chart = make_combined_chart(source, \n", + " scale=scale, \n", + " show_uncertainty=show_uncertainty)\n", + " return chart" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 6, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "def seir_bayes_df_pop(\n", + " R0__params: 'repr. rate upper and lower limits' = (1.96, 2.55),\n", + " gamma_inv_params: 'removal rate upper and lower limits' = (10, 16),\n", + " alpha_inv_params: 'incubation rate upper and lower limits' = (4.1, 7),\n", + " t_max: 'numer of days to run' = 30,\n", + " runs: 'number of runs' = 1000,\n", + " date: 'load SEIR(0) for this date' = 'latest' \n", + " ):\n", + "\n", + " def estimate_removed_and_exposed(df):\n", + " return (df\n", + " .sort_values('date')\n", + " .assign(removed_est=lambda df: df.cases.shift(1).fillna(0) + df.new_cases - df.cases)\n", + " .assign(exposed_est=lambda df: (df.cases\n", + " .shift(-int(alpha_inv_params[1]))\n", + " .fillna(method='ffill')\n", + " .fillna(0))))\n", + "\n", + " population = pd.read_csv('data/csv/population/by_city/by_city.csv', index_col=['uf', 'city'])\n", + " covid19 = pd.read_csv('data/csv/covid_19/by_city/by_city.csv', parse_dates=['date'])\n", + "\n", + "\n", + " date = covid19['date'].max() if date == 'latest' else date\n", + "\n", + " # if this fails, something is wrong with the data\n", + " assert population.index.is_unique\n", + " assert covid19.index.is_unique\n", + "\n", + " SEIR_0 = (\n", + " covid19\n", + " .groupby(['uf', 'city'], group_keys=False)\n", + " .apply(estimate_removed_and_exposed)\n", + " [lambda df: df['date'] == date]\n", + " .set_index(['uf', 'city'])\n", + " .join(population, how='left')\n", + " .reset_index()\n", + " [['uf', 'city', 'estimated_population', 'exposed_est', 'cases', 'removed_est']]\n", + " .query(\"cases >= 5\")\n", + " .to_dict(orient='records')\n", + " )\n", + "\n", + " # In: SEIR_0[:2]\n", + " # Out: [{'uf': 'AC',\n", + " # 'city': 'Rio Branco',\n", + " # 'estimated_population': 407319.0,\n", + " # 'exposed_est': 0.0,\n", + " # 'cases': 4,\n", + " # 'removed_est': 0.0},\n", + " # {'uf': 'AL',\n", + " # 'city': 'Maceió',\n", + " # 'estimated_population': 1018948.0,\n", + " # 'exposed_est': 3.0,\n", + " # 'cases': 4,\n", + " # 'removed_est': 0.0}]\n", + "\n", + " def run_model(params):\n", + " N = params['estimated_population']\n", + " E0 = params['exposed_est']\n", + " I0 = params['cases']\n", + " R0 = params['removed_est']\n", + " model_input = (N, E0, I0, R0, R0__params,\n", + " gamma_inv_params, alpha_inv_params,\n", + " t_max, runs)\n", + " try:\n", + " return {**params, 'results': run_SEIR_BAYES_model(*model_input), 'error': False}\n", 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"python", + "pygments_lexer": "ipython3", + "version": "3.6.3" + } + }, + "nbformat": 4, + "nbformat_minor": 2 +} diff --git a/notebooks/simulacao_leito_2_camaslimitadas.ipynb b/notebooks/simulacao_leito_2_camaslimitadas.ipynb new file mode 100755 index 00000000..75dd3f72 --- /dev/null +++ b/notebooks/simulacao_leito_2_camaslimitadas.ipynb @@ -0,0 +1,18676 @@ +{ + "cells": [ + { + "cell_type": "markdown", + "metadata": {}, + "source": [ + "# Simulacao leitos - camas limitadas" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 63, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "# Import required modules\n", + "\n", + "import simpy\n", + "import random\n", + "from random import expovariate, seed\n", + "import pandas as pd\n", + "import matplotlib.pyplot as plt" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 64, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class g:\n", + " \"\"\"g holds Global variables. No individual instance is required\"\"\"\n", + " \n", + " cases_arriving = 10\n", + " inter_arrival_time = 1/cases_arriving # Average time (days) between arrivals\n", + " los = 13 # Average length of stay in hospital (days)\n", + " sim_duration = 360 # Duration of simulation (days)\n", + " audit_interval = 1 # Interval between audits (days)\n", + " total_beds = 300\n", + " occupation_rate = 0.5\n", + " beds = int(total_beds * (1 - occupation_rate)) # bed capacity of hospital" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 65, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Hospital:\n", + " \"\"\"\n", + " Hospital class holds:\n", + " 1) Dictionary of patients present\n", + " 2) List of audit times\n", + " 3) List of beds occupied at each audit time\n", + " 4) Current total beds occupied\n", + " 5) Admissions to data\n", + "\n", + " Methods:\n", + "\n", + " __init__: Set up hospital instance\n", + "\n", + " audit: records number of beds occupied\n", + "\n", + " build_audit_report: builds audit report at end of run (calculate 5th, 50th\n", + " and 95th percentile bed occupancy.\n", + "\n", + " chart: plot beds occupied over time (at end of run)\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self):\n", + " \"\"\"\n", + " Constructor method for hospital class\"\n", + " Initialise object with attributes.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " self.patients = {} # Dictionary of patients present\n", + " self.patients_in_queue = {}\n", + " self.patients_in_beds = {}\n", + " self.audit_time = [] # List of audit times\n", + " self.audit_beds = [] # List of beds occupied at each audit time\n", + " self.audit_queue = []\n", + " self.bed_count = 0 # Current total beds occupied\n", + " self.queue_count = 0\n", + " self.admissions = 0 # Admissions to data\n", + " \n", + " return\n", + "\n", + " def audit(self, time):\n", + " \"\"\"\n", + " Audit method. When called appends current simulation time to audit_time\n", + " list, and appends current bed count to audit_beds.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " self.audit_time.append(time)\n", + " self.audit_beds.append(self.bed_count)\n", + " self.audit_queue.append(self.queue_count)\n", + " return\n", + "\n", + " def build_audit_report(self):\n", + " \"\"\"\n", + " This method is called at end of run. It creates a pandas DataFrame,\n", + " transfers audit times and bed counts to the DataFrame, and \n", + " calculates/stores 5th, 50th and 95th percentiles.\n", + " \"\"\"\n", + " self.audit_report = pd.DataFrame()\n", + "\n", + " self.audit_report['Time'] = self.audit_time\n", + "\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'] = self.audit_beds\n", + "\n", + " self.audit_report['Median_beds'] = \\\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'].quantile(0.5)\n", + "\n", + " self.audit_report['Beds_5_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'].quantile(0.05)\n", + "\n", + " self.audit_report['Beds_95_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'].quantile(0.95)\n", + "\n", + " self.audit_report['Queue'] = self.audit_queue\n", + "\n", + " self.audit_report['Median_queue'] = \\\n", + " self.audit_report['Queue'].quantile(0.5)\n", + "\n", + " self.audit_report['Median_queue'] = \\\n", + " self.audit_report['Queue'].quantile(0.5)\n", + "\n", + " self.audit_report['Queue_5_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Queue'].quantile(0.05)\n", + "\n", + " self.audit_report['Queue_95_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Queue'].quantile(0.95)\n", + "\n", + " return self.audit_report\n", + "\n", + " def chart(self):\n", + " \"\"\"\n", + " This method is called at end of run. It plots beds occupancy over the\n", + " model run, with 5%, 50% and 95% percentiles.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " # Plot occupied beds\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'],\n", + " color='k',\n", + " marker='o',\n", + " linestyle='solid',\n", + " markevery=1,\n", + " label='Occupied beds')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Beds_5_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " markevery=1,\n", + " label='5th percentile')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Median_beds'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashed',\n", + " label='Median')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Beds_95_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " label='95th percentile')\n", + "\n", + " plt.xlabel('Day')\n", + " plt.ylabel('Occupied beds')\n", + " plt.title(\n", + " 'Occupied beds (individual days with 5th, 50th and 95th ' +\n", + " 'percentiles)')\n", + " plt.legend()\n", + " plt.show()\n", + "\n", + " # Plot queue for beds\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Queue'],\n", + " color='k',\n", + " marker='o',\n", + " linestyle='solid',\n", + " markevery=1, label='Occupied beds')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Queue_5_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " markevery=1,\n", + " label='5th percentile')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Median_queue'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashed',\n", + " label='Median')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Queue_95_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " label='95th percentile')\n", + "\n", + " plt.xlabel('Day')\n", + " plt.ylabel('Queue for beds')\n", + " plt.title('Queue for beds (individual days with 5th, 50th and 95th' +\n", + " ' percentiles)')\n", + " plt.legend()\n", + " plt.show()\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 66, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Model:\n", + " \"\"\"\n", + " The main model class.\n", + "\n", + " The model class contains the model environment. The modelling environment\n", + " is set up, and patient arrival and audit processes initiated. Patient\n", + " arrival triggers a spell for that patient in hospital. Arrivals and audit\n", + " continue for the duration of the model run. The audit is then \n", + " summarised and bed occupancy (with 5th, 50th and 95th percentiles) plotted.\n", + "\n", + " Methods are:\n", + "\n", + " __init__: Set up model instance\n", + "\n", + " audit_beds: call for bed audit at regular intervals (after initial delay \n", + " for model warm-up)\n", + "\n", + " new_admission: trigger new admissions to hospital at regular intervals.\n", + " Call for patient generation with patient id and length of stay, then call\n", + " for patient spell in hospital.\n", + "\n", + " run: Controls the main model run. Initialises model and patient arrival and\n", + " audit processes. Instigates the run. At end of run calls for an audit\n", + " summary and bed occupancy plot.\n", + "\n", + " spell_gen: stores patient in hospital patient list and bed queue \n", + " dictionaries, waits for bed resource to become available, then removes \n", + " patient from bed queue dictionary and adds patient to hospital bed \n", + " dictionary and increments beds occupied. Waits for the patient length of\n", + " stay in the hospital and then decrements beds occupied and removes patient\n", + " from hospital patient dictionary and beds occupied dictionary.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self):\n", + " \"\"\"\n", + " Constructor class for new model.\n", + " \"\"\"\n", + " self.env = simpy.Environment()\n", + "\n", + " return\n", + "\n", + " def audit_beds(self, delay):\n", + " \"\"\"\n", + " Bed audit process. Begins by applying delay, then calls for audit at\n", + " intervals set in g.audit_interval\n", + "\n", + " :param delay: delay (days) at start of model run for model warm-up.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " # Delay first audit\n", + " yield self.env.timeout(delay)\n", + "\n", + " # Continually generate audit requests until end of model run\n", + " while True:\n", + " # Call audit (pass simulation time to hospital.audit)\n", + " self.hospital.audit(self.env.now)\n", + " # Delay until next call\n", + " yield self.env.timeout(g.audit_interval)\n", + "\n", + " return\n", + "\n", + " def new_admission(self, interarrival_time, los):\n", + " \"\"\"\n", + " New admissions to hospital.\n", + "\n", + " :param interarrival_time: average time (days) between arrivals\n", + " :param los: average length of stay (days)\n", + " \"\"\"\n", + " while True:\n", + " # Increment hospital admissions count\n", + " self.hospital.admissions += 1\n", + "\n", + " # Generate new patient object (from Patient class). Give patient id\n", + " # and set length of stay from inverse exponential distribution).\n", + " p = Patient(patient_id=self.hospital.admissions,\n", + " los=random.expovariate(1 / los))\n", + " print('Patient %d arriving %7.2f, admissions count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.admissions))\n", + "\n", + " # Add patient to hospital patient dictionary\n", + " self.hospital.patients[p.id] = p\n", + "\n", + " # Generate a patient spell in hospital (by calling spell method).\n", + " # This triggers a patient admission and allows the next arrival to\n", + " # be set before the paitent spell is finished\n", + " self.spell = self.spell_gen(p)\n", + " self.env.process(self.spell)\n", + "\n", + " # Set and call delay before looping back to new patient admission\n", + " next_admission = random.expovariate(1 / interarrival_time)\n", + " #print('Next patient in %f3.2' %next_admission)\n", + " yield self.env.timeout(next_admission)\n", + "\n", + " return\n", + "\n", + " def run(self):\n", + " \"\"\"\n", + " Controls the main model run. Initialises model and patient arrival and\n", + " audit processes. Instigates the run. At end of run calls for an audit\n", + " summary and bed occupancy plot\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " # Set up hospital (calling Hospital class)\n", + " self.hospital = Hospital()\n", + "\n", + " # Set up resources (beds)\n", + " self.resources = Resources(self.env, g.beds)\n", + "\n", + " # Set up starting processes: new admissions and bed audit (with delay)\n", + " self.env.process(self.new_admission(g.inter_arrival_time, g.los))\n", + " self.env.process(self.audit_beds(delay=20))\n", + "\n", + " # Start model run\n", + " self.env.run(until=g.sim_duration)\n", + "\n", + " # At end of run call for bed audit summary and bed occupancy plot\n", + " self.hospital.build_audit_report()\n", + " #self.hospital.chart()\n", + "\n", + " return\n", + "\n", + " def spell_gen(self, p):\n", + " \"\"\"\n", + " Patient hospital stay generator. Increment bed count, wait for patient\n", + " length of stay to complete, then decrement bed count and remove patient\n", + " from hospital patient dictionary\n", + "\n", + " :param p: patient object (contains length of stay for patient)\n", + " \"\"\"\n", + " # The following 'with' defines the required resources and automatically\n", + " # releases resources when no longer required\n", + "\n", + " with self.resources.beds.request() as req:\n", + " # Increment queue count\n", + " self.hospital.queue_count += 1\n", + " print('Patient %d arriving queue %7.2f, queue count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_count))\n", + "\n", + " # Add patient to dictionary of queuing patients. This is not used\n", + " # further in this model.\n", + " self.hospital.patients_in_queue[p.id] = p\n", + "\n", + " # Yield resource request. Sim continues after yield when resources\n", + " # are vailable (so there is no delay if resources are immediately\n", + " # available)\n", + " yield req\n", + "\n", + " # Resource now available. Remove from queue count and dictionary of\n", + " # queued objects\n", + " self.hospital.queue_count -= 1\n", + " del self.hospital.patients_in_queue[p.id]\n", + " print('Patient %d leaving queue %7.2f, queue count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_count))\n", + "\n", + " # Add to count of patients in beds and to dictionary of patients in\n", + " # beds\n", + " self.hospital.patients_in_beds[p.id] = p\n", + " self.hospital.bed_count += 1\n", + " print('Patient %d arriving bed %7.2f, bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_count))\n", + "\n", + " # Trigger length of stay delay\n", + " yield self.env.timeout(p.los)\n", + "\n", + " # Length of stay complete. Remove patient from counts and\n", + " # dictionaries\n", + " self.hospital.bed_count -= 1\n", + " print('Patient %d leaving bed %7.2f, bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_count))\n", + " del self.hospital.patients_in_beds[p.id]\n", + " del self.hospital.patients[p.id]\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 67, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Patient:\n", + " \"\"\"\n", + " Patient class. Contains patient id and length of stay (it could contain\n", + " other info about patient, such as priority or clinical group.\n", + "\n", + " The only method is __init__ for creating a patient (with assignment of\n", + " patient id and length of stay).\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self, patient_id, los):\n", + " \"\"\"\n", + " Contructor for new patient.\n", + "\n", + " :param patient_id: id of patient (set in self.new_admission)\n", + " :param los: length of stay (days, set in self.new_admission)\n", + " \"\"\"\n", + " self.id = patient_id\n", + " self.los = los\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 68, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Resources:\n", + " \"\"\"\n", + " Holds beds resources\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self, env, number_of_beds):\n", + " \"\"\" Constructor method to initialise beds resource)\"\"\"\n", + " self.beds = simpy.Resource(env, capacity=number_of_beds)\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 69, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "def main():\n", + " \"\"\"\n", + " Code entry point after: if __name__ == '__main__'\n", + " Creates model object, and runs model\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " model = Model()\n", + " model.run()\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 70, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "## Code entry point. Calls main method.\n", + "#if __name__ == '__main__':\n", + "# main()" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 71, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "model = Model()" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 72, + "metadata": {}, + "outputs": [ + { + "name": "stdout", + "output_type": "stream", + "text": [ + "Patient 1 arriving 0.00, admissions count 1\n", + "Patient 1 arriving queue 0.00, queue count 1\n", + "Patient 1 leaving queue 0.00, queue count 0\n", + "Patient 1 arriving bed 0.00, bed count 1\n", + "Patient 2 arriving 0.14, admissions count 2\n", + "Patient 2 arriving queue 0.14, queue count 1\n", + "Patient 2 leaving queue 0.14, queue count 0\n", + "Patient 2 arriving bed 0.14, bed count 2\n", + "Patient 3 arriving 0.15, admissions count 3\n", + "Patient 3 arriving queue 0.15, queue count 1\n", + "Patient 3 leaving queue 0.15, queue count 0\n", + "Patient 3 arriving bed 0.15, bed count 3\n", + "Patient 4 arriving 0.17, admissions count 4\n", + "Patient 4 arriving queue 0.17, queue count 1\n", + "Patient 4 leaving queue 0.17, queue count 0\n", + "Patient 4 arriving bed 0.17, bed count 4\n", + "Patient 5 arriving 0.27, admissions count 5\n", + "Patient 5 arriving queue 0.27, queue count 1\n", + "Patient 5 leaving queue 0.27, queue count 0\n", + "Patient 5 arriving bed 0.27, bed count 5\n", + "Patient 6 arriving 0.27, admissions count 6\n", + "Patient 6 arriving queue 0.27, queue count 1\n", + "Patient 6 leaving queue 0.27, queue count 0\n", + "Patient 6 arriving bed 0.27, bed count 6\n", + "Patient 7 arriving 0.30, admissions count 7\n", + "Patient 7 arriving queue 0.30, queue count 1\n", + "Patient 7 leaving queue 0.30, queue count 0\n", + "Patient 7 arriving bed 0.30, bed count 7\n", + "Patient 8 arriving 0.39, admissions count 8\n", + "Patient 8 arriving queue 0.39, queue count 1\n", + "Patient 8 leaving queue 0.39, queue count 0\n", + "Patient 8 arriving bed 0.39, bed count 8\n", + "Patient 9 arriving 0.49, admissions count 9\n", + "Patient 9 arriving queue 0.49, queue count 1\n", + "Patient 9 leaving queue 0.49, queue count 0\n", + "Patient 9 arriving bed 0.49, bed count 9\n", + "Patient 10 arriving 0.61, admissions count 10\n", + "Patient 10 arriving queue 0.61, queue count 1\n", + "Patient 10 leaving queue 0.61, queue count 0\n", + "Patient 10 arriving bed 0.61, bed count 10\n", + "Patient 11 arriving 0.61, admissions count 11\n", + "Patient 11 arriving queue 0.61, queue count 1\n", + "Patient 11 leaving queue 0.61, queue count 0\n", + "Patient 11 arriving bed 0.61, bed count 11\n", + "Patient 12 arriving 0.65, admissions count 12\n", + "Patient 12 arriving queue 0.65, queue count 1\n", + "Patient 12 leaving queue 0.65, queue count 0\n", + "Patient 12 arriving bed 0.65, bed count 12\n", + "Patient 13 arriving 0.66, admissions count 13\n", + "Patient 13 arriving queue 0.66, queue count 1\n", + "Patient 13 leaving queue 0.66, queue count 0\n", + "Patient 13 arriving bed 0.66, bed count 13\n", + "Patient 14 arriving 0.73, admissions count 14\n", + "Patient 14 arriving queue 0.73, queue count 1\n", + "Patient 14 leaving queue 0.73, queue count 0\n", + "Patient 14 arriving bed 0.73, bed count 14\n", + "Patient 15 arriving 1.05, admissions count 15\n", + "Patient 15 arriving queue 1.05, queue count 1\n", + "Patient 15 leaving queue 1.05, queue count 0\n", + "Patient 15 arriving bed 1.05, bed count 15\n", + "Patient 16 arriving 1.15, admissions count 16\n", + "Patient 16 arriving queue 1.15, queue count 1\n", + "Patient 16 leaving queue 1.15, queue count 0\n", + "Patient 16 arriving bed 1.15, bed count 16\n", + "Patient 17 arriving 1.21, admissions count 17\n", + "Patient 17 arriving queue 1.21, queue count 1\n", + "Patient 17 leaving queue 1.21, queue count 0\n", + "Patient 17 arriving bed 1.21, bed count 17\n", + "Patient 18 arriving 1.22, admissions count 18\n", + "Patient 18 arriving queue 1.22, queue count 1\n", + "Patient 18 leaving queue 1.22, queue count 0\n", + "Patient 18 arriving bed 1.22, bed count 18\n", + "Patient 19 arriving 1.29, admissions count 19\n", + "Patient 19 arriving queue 1.29, queue count 1\n", + "Patient 19 leaving queue 1.29, queue count 0\n", + "Patient 19 arriving bed 1.29, bed count 19\n", + "Patient 20 arriving 1.29, admissions count 20\n", + "Patient 20 arriving queue 1.29, queue count 1\n", + "Patient 20 leaving queue 1.29, queue count 0\n", + "Patient 20 arriving bed 1.29, bed count 20\n", + "Patient 21 arriving 1.79, admissions count 21\n", + "Patient 21 arriving queue 1.79, queue count 1\n", + "Patient 21 leaving queue 1.79, queue count 0\n", + "Patient 21 arriving bed 1.79, bed count 21\n", + "Patient 4 leaving bed 1.82, bed count 20\n", + "Patient 22 arriving 1.86, admissions count 22\n", + "Patient 22 arriving queue 1.86, queue count 1\n", + "Patient 22 leaving queue 1.86, queue count 0\n", + "Patient 22 arriving bed 1.86, bed count 21\n", + "Patient 23 arriving 1.94, admissions count 23\n", + "Patient 23 arriving queue 1.94, queue count 1\n", + "Patient 23 leaving queue 1.94, queue count 0\n", + "Patient 23 arriving bed 1.94, bed count 22\n", + "Patient 24 arriving 1.99, admissions count 24\n", + "Patient 24 arriving queue 1.99, queue count 1\n", + "Patient 24 leaving queue 1.99, queue count 0\n", + "Patient 24 arriving bed 1.99, bed count 23\n", + "Patient 16 leaving bed 2.00, bed count 22\n", + "Patient 25 arriving 2.12, admissions count 25\n", + "Patient 25 arriving queue 2.12, queue count 1\n", + "Patient 25 leaving queue 2.12, queue count 0\n", + "Patient 25 arriving bed 2.12, bed count 23\n", + "Patient 26 arriving 2.66, admissions count 26\n", + "Patient 26 arriving queue 2.66, queue count 1\n", + "Patient 26 leaving queue 2.66, queue count 0\n", + "Patient 26 arriving bed 2.66, bed count 24\n", + "Patient 27 arriving 2.70, admissions count 27\n", + "Patient 27 arriving queue 2.70, queue count 1\n", + "Patient 27 leaving queue 2.70, queue count 0\n", + "Patient 27 arriving bed 2.70, bed count 25\n", + "Patient 28 arriving 2.91, admissions count 28\n", + "Patient 28 arriving queue 2.91, queue count 1\n", + "Patient 28 leaving queue 2.91, queue count 0\n", + "Patient 28 arriving bed 2.91, bed count 26\n", + "Patient 29 arriving 3.01, admissions count 29\n", + "Patient 29 arriving queue 3.01, queue count 1\n", + "Patient 29 leaving queue 3.01, queue count 0\n", + "Patient 29 arriving bed 3.01, bed count 27\n", + "Patient 30 arriving 3.04, admissions count 30\n", + "Patient 30 arriving queue 3.04, queue count 1\n", + "Patient 30 leaving queue 3.04, queue count 0\n", + "Patient 30 arriving bed 3.04, bed count 28\n", + "Patient 31 arriving 3.04, admissions count 31\n", + "Patient 31 arriving queue 3.04, queue count 1\n", + "Patient 31 leaving queue 3.04, queue count 0\n", + "Patient 31 arriving bed 3.04, bed count 29\n", + "Patient 9 leaving bed 3.05, bed count 28\n", + "Patient 32 arriving 3.21, admissions count 32\n", + "Patient 32 arriving queue 3.21, queue count 1\n", + "Patient 32 leaving queue 3.21, queue count 0\n", + "Patient 32 arriving bed 3.21, bed count 29\n", + "Patient 13 leaving bed 3.66, bed count 28\n", + "Patient 33 arriving 3.69, admissions count 33\n", + "Patient 33 arriving queue 3.69, queue count 1\n", + "Patient 33 leaving queue 3.69, queue count 0\n", + "Patient 33 arriving bed 3.69, bed count 29\n", + "Patient 34 arriving 3.69, admissions count 34\n", + "Patient 34 arriving queue 3.69, queue count 1\n", + "Patient 34 leaving queue 3.69, queue count 0\n", + "Patient 34 arriving bed 3.69, bed count 30\n", + "Patient 35 arriving 3.78, admissions count 35\n", + "Patient 35 arriving queue 3.78, queue count 1\n", + "Patient 35 leaving queue 3.78, queue count 0\n", + "Patient 35 arriving bed 3.78, bed count 31\n", + "Patient 36 arriving 3.86, admissions count 36\n", + "Patient 36 arriving queue 3.86, queue count 1\n", + "Patient 36 leaving queue 3.86, queue count 0\n", + "Patient 36 arriving bed 3.86, bed count 32\n", + "Patient 37 arriving 3.93, admissions count 37\n", + "Patient 37 arriving queue 3.93, queue count 1\n", + "Patient 37 leaving queue 3.93, queue count 0\n", + "Patient 37 arriving bed 3.93, bed count 33\n", + "Patient 38 arriving 3.95, admissions count 38\n", + "Patient 38 arriving queue 3.95, queue count 1\n", + "Patient 38 leaving queue 3.95, queue count 0\n", + "Patient 38 arriving bed 3.95, bed count 34\n", + "Patient 32 leaving bed 4.01, bed count 33\n", + "Patient 30 leaving bed 4.01, bed count 32\n", + "Patient 39 arriving 4.03, admissions count 39\n", + "Patient 39 arriving queue 4.03, queue count 1\n", + "Patient 39 leaving queue 4.03, queue count 0\n", + "Patient 39 arriving bed 4.03, bed count 33\n", + "Patient 35 leaving bed 4.07, bed count 32\n", + "Patient 36 leaving bed 4.09, bed count 31\n", + "Patient 40 arriving 4.18, admissions count 40\n", + "Patient 40 arriving queue 4.18, queue count 1\n", + "Patient 40 leaving queue 4.18, queue count 0\n", + "Patient 40 arriving bed 4.18, bed count 32\n", + "Patient 41 arriving 4.20, admissions count 41\n", + "Patient 41 arriving queue 4.20, queue count 1\n", + "Patient 41 leaving queue 4.20, queue count 0\n", + "Patient 41 arriving bed 4.20, bed count 33\n", + "Patient 42 arriving 4.29, admissions count 42\n", + "Patient 42 arriving queue 4.29, queue count 1\n", + "Patient 42 leaving queue 4.29, queue count 0\n", + "Patient 42 arriving bed 4.29, bed count 34\n", + "Patient 43 arriving 4.40, admissions count 43\n", + "Patient 43 arriving queue 4.40, queue count 1\n", + "Patient 43 leaving queue 4.40, queue count 0\n", + "Patient 43 arriving bed 4.40, bed count 35\n", + "Patient 10 leaving bed 4.44, bed count 34\n", + "Patient 44 arriving 4.49, admissions count 44\n", + "Patient 44 arriving queue 4.49, queue count 1\n", + "Patient 44 leaving queue 4.49, queue count 0\n", + "Patient 44 arriving bed 4.49, bed count 35\n", + "Patient 45 arriving 4.50, admissions count 45\n", + "Patient 45 arriving queue 4.50, queue count 1\n", + "Patient 45 leaving queue 4.50, queue count 0\n", + "Patient 45 arriving bed 4.50, bed count 36\n", + "Patient 46 arriving 4.63, admissions count 46\n", + "Patient 46 arriving queue 4.63, queue count 1\n", + "Patient 46 leaving queue 4.63, queue count 0\n", + "Patient 46 arriving bed 4.63, bed count 37\n", + "Patient 47 arriving 4.69, admissions count 47\n", + "Patient 47 arriving queue 4.69, queue count 1\n", + "Patient 47 leaving queue 4.69, queue count 0\n", + "Patient 47 arriving bed 4.69, bed count 38\n", + "Patient 48 arriving 4.80, admissions count 48\n", + "Patient 48 arriving queue 4.80, queue count 1\n", + "Patient 48 leaving queue 4.80, queue count 0\n", + "Patient 48 arriving bed 4.80, bed count 39\n", + "Patient 49 arriving 4.88, admissions count 49\n", + "Patient 49 arriving queue 4.88, queue count 1\n", + "Patient 49 leaving queue 4.88, queue count 0\n", + "Patient 49 arriving bed 4.88, bed count 40\n", + "Patient 50 arriving 4.92, admissions count 50\n", + "Patient 50 arriving queue 4.92, queue count 1\n", + "Patient 50 leaving queue 4.92, queue count 0\n", + "Patient 50 arriving bed 4.92, bed count 41\n", + "Patient 51 arriving 5.00, admissions count 51\n", + "Patient 51 arriving queue 5.00, queue count 1\n", + "Patient 51 leaving queue 5.00, queue count 0\n", + "Patient 51 arriving bed 5.00, bed count 42\n", + "Patient 52 arriving 5.08, admissions count 52\n", + "Patient 52 arriving queue 5.08, queue count 1\n", + "Patient 52 leaving queue 5.08, queue count 0\n", + "Patient 52 arriving bed 5.08, bed count 43\n", + "Patient 53 arriving 5.14, admissions count 53\n", + "Patient 53 arriving queue 5.14, queue count 1\n", + "Patient 53 leaving queue 5.14, queue count 0\n", + "Patient 53 arriving bed 5.14, bed count 44\n", + "Patient 54 arriving 5.16, admissions count 54\n", + "Patient 54 arriving queue 5.16, queue count 1\n", + "Patient 54 leaving queue 5.16, queue count 0\n", + "Patient 54 arriving bed 5.16, bed count 45\n", + "Patient 55 arriving 5.60, admissions count 55\n", + "Patient 55 arriving queue 5.60, queue count 1\n", + "Patient 55 leaving queue 5.60, queue count 0\n", + "Patient 55 arriving bed 5.60, bed count 46\n", + "Patient 38 leaving bed 5.61, bed count 45\n", + "Patient 56 arriving 5.62, admissions count 56\n", + "Patient 56 arriving queue 5.62, queue count 1\n", + "Patient 56 leaving queue 5.62, queue count 0\n", + "Patient 56 arriving bed 5.62, bed count 46\n", + "Patient 57 arriving 5.80, admissions count 57\n", + "Patient 57 arriving queue 5.80, queue count 1\n", + "Patient 57 leaving queue 5.80, queue count 0\n", + "Patient 57 arriving bed 5.80, bed count 47\n" + ] + }, + { + "name": "stdout", + "output_type": "stream", + "text": [ + "Patient 58 arriving 5.81, admissions count 58\n", + "Patient 58 arriving queue 5.81, queue count 1\n", + "Patient 58 leaving queue 5.81, queue count 0\n", + "Patient 58 arriving bed 5.81, bed count 48\n", + "Patient 59 arriving 5.93, admissions count 59\n", + "Patient 59 arriving queue 5.93, queue count 1\n", + "Patient 59 leaving queue 5.93, queue count 0\n", + "Patient 59 arriving bed 5.93, bed count 49\n", + "Patient 60 arriving 6.01, admissions count 60\n", + "Patient 60 arriving queue 6.01, queue count 1\n", + "Patient 60 leaving queue 6.01, queue count 0\n", + "Patient 60 arriving bed 6.01, bed count 50\n", + "Patient 61 arriving 6.04, admissions count 61\n", + "Patient 61 arriving queue 6.04, queue count 1\n", + "Patient 61 leaving queue 6.04, queue count 0\n", + "Patient 61 arriving bed 6.04, bed count 51\n", + "Patient 62 arriving 6.08, admissions count 62\n", + "Patient 62 arriving queue 6.08, queue count 1\n", + "Patient 62 leaving queue 6.08, queue count 0\n", + "Patient 62 arriving bed 6.08, bed count 52\n", + "Patient 63 arriving 6.18, admissions count 63\n", + "Patient 63 arriving queue 6.18, queue count 1\n", + "Patient 63 leaving queue 6.18, queue count 0\n", + "Patient 63 arriving bed 6.18, bed count 53\n", + "Patient 64 arriving 6.25, admissions count 64\n", + "Patient 64 arriving queue 6.25, queue count 1\n", + "Patient 64 leaving queue 6.25, queue count 0\n", + "Patient 64 arriving bed 6.25, bed count 54\n", + "Patient 65 arriving 6.35, admissions count 65\n", + "Patient 65 arriving queue 6.35, queue count 1\n", + "Patient 65 leaving queue 6.35, queue count 0\n", + "Patient 65 arriving bed 6.35, bed count 55\n", + "Patient 8 leaving bed 6.36, bed count 54\n", + "Patient 66 arriving 6.38, admissions count 66\n", + "Patient 66 arriving queue 6.38, queue count 1\n", + "Patient 66 leaving queue 6.38, queue count 0\n", + "Patient 66 arriving bed 6.38, bed count 55\n", + "Patient 67 arriving 6.43, admissions count 67\n", + "Patient 67 arriving queue 6.43, queue count 1\n", + "Patient 67 leaving queue 6.43, queue count 0\n", + "Patient 67 arriving bed 6.43, bed count 56\n", + "Patient 68 arriving 6.46, admissions count 68\n", + "Patient 68 arriving queue 6.46, queue count 1\n", + "Patient 68 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No individual instance is required\"\"\"\n", + " \n", + " cases_arriving = 40\n", + " inter_arrival_time = 1/cases_arriving # Average time (days) between arrivals\n", + " los = 13 # Average length of stay in hospital (days)\n", + " los_uti = 5 # Average length of stay in hospital (days)\n", + " sim_duration = 360 # Duration of simulation (days)\n", + " audit_interval = 1 # Interval between audits (days)\n", + " total_beds = 300\n", + " total_beds_icu = 100\n", + " occupation_rate = 0.5\n", + " icu_occupation_rate = 0.8\n", + " icu_rate = 0.2\n", + " beds = int(total_beds * (1 - occupation_rate)) # bed capacity of hospital\n", + " icu_beds = int(total_beds_icu * (1 - icu_occupation_rate))" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 500, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Hospital:\n", + " \"\"\"\n", + " Hospital class holds:\n", + " 1) Dictionary of patients present\n", + " 2) List of audit times\n", + " 3) List of beds occupied at each audit time\n", + " 4) Current total beds occupied\n", + " 5) Current total icu beds occupied\n", + " 6) Admissions to data\n", + "\n", + " Methods:\n", + "\n", + " __init__: Set up hospital instance\n", + "\n", + " audit: records number of beds occupied\n", + "\n", + " build_audit_report: builds audit report at end of run (calculate 5th, 50th\n", + " and 95th percentile bed occupancy.\n", + "\n", + " chart: plot beds occupied over time (at end of run)\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self):\n", + " \"\"\"\n", + " Constructor method for hospital class\"\n", + " Initialise object with attributes.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " self.patients = {} # Dictionary of patients present\n", + " self.patients_in_queue = {}\n", + " self.patients_in_icu_queue = {}\n", + " \n", + " self.patients_in_beds = {}\n", + " self.patients_in_icu_beds = {}\n", + " \n", + " self.audit_time = [] # List of audit times\n", + " self.audit_beds = [] # List of beds occupied at each audit time\n", + " self.audit_icu_beds = [] # List of icu beds occupied at each audit time\n", + " self.audit_queue = []\n", + " self.audit_queue_icu = []\n", + " \n", + " self.bed_count = 0 # Current total beds occupied\n", + " self.bed_icu_count = 0\n", + " self.queue_count = 0\n", + " self.queue_count_icu = 0\n", + " self.admissions = 0 # Admissions to data\n", + " \n", + " return\n", + "\n", + " def audit(self, time):\n", + " \"\"\"\n", + " Audit method. When called appends current simulation time to audit_time\n", + " list, and appends current bed count to audit_beds.\n", + " \"\"\"\n", + " self.audit_time.append(time)\n", + " self.audit_beds.append(self.bed_count)\n", + " self.audit_icu_beds.append(self.bed_icu_count)\n", + " self.audit_queue.append(self.queue_count)\n", + " self.audit_queue_icu.append(self.queue_count_icu)\n", + " \n", + " return\n", + "\n", + " def build_audit_report(self):\n", + " \"\"\"\n", + " This method is called at end of run. It creates a pandas DataFrame,\n", + " transfers audit times and bed counts to the DataFrame, and \n", + " calculates/stores 5th, 50th and 95th percentiles.\n", + " \"\"\"\n", + " self.audit_report = pd.DataFrame()\n", + "\n", + " self.audit_report['Time'] = self.audit_time\n", + "\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'] = self.audit_beds\n", + " \n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'] = self.audit_icu_beds\n", + "\n", + " self.audit_report['Median_beds'] = \\\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'].quantile(0.5)\n", + " \n", + " self.audit_report['ICU_Median_beds'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'].quantile(0.5)\n", + "\n", + " self.audit_report['Beds_5_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'].quantile(0.05)\n", + "\n", + " self.audit_report['ICU_Beds_5_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'].quantile(0.05)\n", + " \n", + " self.audit_report['Beds_95_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'].quantile(0.95)\n", + " \n", + " self.audit_report['ICU_Beds_95_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'].quantile(0.95)\n", + "\n", + " self.audit_report['Queue'] = self.audit_queue\n", + "\n", + " self.audit_report['Median_queue'] = \\\n", + " self.audit_report['Queue'].quantile(0.5)\n", + "\n", + " self.audit_report['Queue_5_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Queue'].quantile(0.05)\n", + "\n", + " self.audit_report['Queue_95_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Queue'].quantile(0.95)\n", + " \n", + " self.audit_report['ICU_Queue'] = self.audit_queue_icu\n", + "\n", + " self.audit_report['ICU_Median_queue'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Queue'].quantile(0.5)\n", + "\n", + " self.audit_report['ICU_Queue_5_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Queue'].quantile(0.05)\n", + "\n", + " self.audit_report['ICU_Queue_95_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Queue'].quantile(0.95)\n", + "\n", + " return self.audit_report\n", + "\n", + " def chart(self):\n", + " \"\"\"\n", + " This method is called at end of run. It plots beds occupancy over the\n", + " model run, with 5%, 50% and 95% percentiles.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " # Plot occupied beds\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'],\n", + " color='k',\n", + " marker='o',\n", + " linestyle='solid',\n", + " markevery=1,\n", + " label='Occupied beds')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Beds_5_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " markevery=1,\n", + " label='5th percentile')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Median_beds'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashed',\n", + " label='Median')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Beds_95_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " label='95th percentile')\n", + "\n", + " plt.xlabel('Day')\n", + " plt.ylabel('Occupied beds')\n", + " plt.title(\n", + " 'Occupied beds (individual days with 5th, 50th and 95th ' +\n", + " 'percentiles)')\n", + " plt.legend()\n", + " plt.show()\n", + " \n", + " \n", + " # Plot occupied icu beds\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'],\n", + " color='k',\n", + " marker='o',\n", + " linestyle='solid',\n", + " markevery=1,\n", + " label='Occupied icu beds')\n", + " \n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Beds_5_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " markevery=1,\n", + " label='5th percentile')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Median_beds'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashed',\n", + " label='Median')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Beds_95_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " label='95th percentile')\n", + " \n", + " plt.xlabel('Day')\n", + " plt.ylabel('Occupied icu beds')\n", + " plt.title(\n", + " 'Occupied icu beds (individual days with 5th, 50th and 95th ' +\n", + " 'percentiles)')\n", + " plt.legend()\n", + " plt.show()\n", + " \n", + "\n", + " # Plot queue for beds\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Queue'],\n", + " color='k',\n", + " marker='o',\n", + " linestyle='solid',\n", + " markevery=1, label='Occupied beds')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Queue_5_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " markevery=1,\n", + " label='5th percentile')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Median_queue'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashed',\n", + " label='Median')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Queue_95_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " label='95th percentile')\n", + "\n", + " plt.xlabel('Day')\n", + " plt.ylabel('Queue for beds')\n", + " plt.title('Queue for beds (individual days with 5th, 50th and 95th' +\n", + " ' percentiles)')\n", + " plt.legend()\n", + " plt.show()\n", + " \n", + " \n", + " # Plot queue for icu beds\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Queue'],\n", + " color='k',\n", + " marker='o',\n", + " linestyle='solid',\n", + " markevery=1, label='ICU Occupied beds')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Queue_5_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " markevery=1,\n", + " label='5th percentile')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Median_queue'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashed',\n", + " label='Median')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Queue_95_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " label='95th percentile')\n", + "\n", + " plt.xlabel('Day')\n", + " plt.ylabel('ICU Queue for beds')\n", + " plt.title('ICU Queue for beds (individual days with 5th, 50th and 95th' +\n", + " ' percentiles)')\n", + " plt.legend()\n", + " plt.show()\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 501, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Model:\n", + " \"\"\"\n", + " The main model class.\n", + "\n", + " The model class contains the model environment. The modelling environment\n", + " is set up, and patient arrival and audit processes initiated. Patient\n", + " arrival triggers a spell for that patient in hospital. Arrivals and audit\n", + " continue for the duration of the model run. The audit is then \n", + " summarised and bed occupancy (with 5th, 50th and 95th percentiles) plotted.\n", + "\n", + " Methods are:\n", + "\n", + " __init__: Set up model instance\n", + "\n", + " audit_beds: call for bed audit at regular intervals (after initial delay \n", + " for model warm-up)\n", + "\n", + " new_admission: trigger new admissions to hospital at regular intervals.\n", + " Call for patient generation with patient id and length of stay, then call\n", + " for patient spell in hospital.\n", + "\n", + " run: Controls the main model run. Initialises model and patient arrival and\n", + " audit processes. Instigates the run. At end of run calls for an audit\n", + " summary and bed occupancy plot.\n", + "\n", + " spell_gen: stores patient in hospital patient list and bed queue \n", + " dictionaries, waits for bed resource to become available, then removes \n", + " patient from bed queue dictionary and adds patient to hospital bed \n", + " dictionary and increments beds occupied. Waits for the patient length of\n", + " stay in the hospital and then decrements beds occupied and removes patient\n", + " from hospital patient dictionary and beds occupied dictionary.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self):\n", + " \"\"\"\n", + " Constructor class for new model.\n", + " \"\"\"\n", + " self.env = simpy.Environment()\n", + "\n", + " return\n", + "\n", + " def audit_beds(self, delay):\n", + " \"\"\"\n", + " Bed audit process. Begins by applying delay, then calls for audit at\n", + " intervals set in g.audit_interval\n", + "\n", + " :param delay: delay (days) at start of model run for model warm-up.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " # Delay first audit\n", + " yield self.env.timeout(delay)\n", + "\n", + " # Continually generate audit requests until end of model run\n", + " while True:\n", + " # Call audit (pass simulation time to hospital.audit)\n", + " self.hospital.audit(self.env.now)\n", + " # Delay until next call\n", + " yield self.env.timeout(g.audit_interval)\n", + "\n", + " return\n", + "\n", + " def new_admission(self, interarrival_time, los, los_uti):\n", + " \"\"\"\n", + " New admissions to hospital.\n", + "\n", + " :param interarrival_time: average time (days) between arrivals\n", + " :param los: average length of stay (days)\n", + " \"\"\"\n", + " while True:\n", + " # Increment hospital admissions count\n", + " self.hospital.admissions += 1\n", + "\n", + " # Generate new patient object (from Patient class). Give patient id\n", + " # and set length of stay from inverse exponential distribution).\n", + " p = Patient(patient_id=self.hospital.admissions,\n", + " los=random.expovariate(1 / los),\n", + " los_uti=random.expovariate(1 / los_uti))\n", + " print('Patient %d arriving %7.2f, admissions count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.admissions))\n", + "\n", + " # Add patient to hospital patient dictionary\n", + " self.hospital.patients[p.id] = p\n", + "\n", + " # Generate a patient spell in hospital (by calling spell method).\n", + " # This triggers a patient admission and allows the next arrival to\n", + " # be set before the paitent spell is finished\n", + " self.spell = self.spell_gen(p)\n", + " self.env.process(self.spell)\n", + "\n", + " # Set and call delay before looping back to new patient admission\n", + " next_admission = random.expovariate(1 / interarrival_time)\n", + " #print('Next patient in %f3.2' %next_admission)\n", + " yield self.env.timeout(next_admission)\n", + "\n", + " return\n", + "\n", + " def spell_gen(self, p):\n", + " \"\"\"\n", + " Patient hospital stay generator. Increment bed count, wait for patient\n", + " length of stay to complete, then decrement bed count and remove patient\n", + " from hospital patient dictionary\n", + "\n", + " :param p: patient object (contains length of stay for patient)\n", + " \"\"\"\n", + " # The following 'with' defines the required resources and automatically\n", + " # releases resources when no longer required\n", + "\n", + " with self.resources.beds.request() as req:\n", + " # Increment queue count\n", + " self.hospital.queue_count += 1\n", + " print('Patient %d arriving queue %7.2f, queue count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_count))\n", + "\n", + " # Add patient to dictionary of queuing patients. This is not used\n", + " # further in this model.\n", + " self.hospital.patients_in_queue[p.id] = p\n", + "\n", + " # Yield resource request. Sim continues after yield when resources\n", + " # are vailable (so there is no delay if resources are immediately\n", + " # available)\n", + " yield req\n", + "\n", + " # Resource now available. Remove from queue count and dictionary of\n", + " # queued objects\n", + " self.hospital.queue_count -= 1\n", + " del self.hospital.patients_in_queue[p.id]\n", + " print('Patient %d leaving queue %7.2f, queue count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_count))\n", + "\n", + " # Add to count of patients in beds and to dictionary of patients in\n", + " # beds\n", + " self.hospital.patients_in_beds[p.id] = p\n", + " self.hospital.bed_count += 1\n", + " print('Patient %d arriving bed %7.2f, bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_count))\n", + "\n", + " # Trigger length of stay delay\n", + " yield self.env.timeout(p.los)\n", + "\n", + " # Length of stay complete. Remove patient from counts and\n", + " # dictionaries\n", + " self.hospital.bed_count -= 1\n", + " print('Patient %d leaving bed %7.2f, bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_count))\n", + " del self.hospital.patients_in_beds[p.id]\n", + " \n", + " is_icu = 1 if random.uniform(0, 1) > (1-g.icu_rate) else 0\n", + " \n", + " if is_icu == 1:\n", + " \n", + " with self.resources_icu.icu_beds.request() as icu_req:\n", + " \n", + " # Increment queue count\n", + " self.hospital.queue_count_icu += 1\n", + " print('Patient %d arriving queue %7.2f, queue count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_count))\n", + " \n", + " # Add patient to dictionary of icu queuing patients. This is not used\n", + " # further in this model.\n", + " self.hospital.patients_in_icu_queue[p.id] = p\n", + " \n", + " # Yield resource request. Sim continues after yield when resources\n", + " # are vailable (so there is no delay if resources are immediately\n", + " # available)\n", + " yield icu_req\n", + " \n", + " # Resource now available. Remove from queue count and dictionary of\n", + " # queued objects\n", + " self.hospital.queue_count_icu -= 1\n", + " del self.hospital.patients_in_icu_queue[p.id]\n", + " print('Patient %d leaving queue %7.2f, queue count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_count))\n", + " \n", + " # Add to count of patients in icu beds and to dictionary of patients in\n", + " # icu beds\n", + " self.hospital.patients_in_icu_beds[p.id] = p\n", + " self.hospital.bed_icu_count += 1\n", + " print('Patient %d arriving icu bed %7.2f, icu bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_icu_count))\n", + " \n", + " # Trigger length of stay delay\n", + " yield self.env.timeout(p.los_uti)\n", + " \n", + " # Length of stay complete. Remove patient from counts and\n", + " # dictionaries\n", + " self.hospital.bed_icu_count -= 1\n", + " print('Patient %d leaving icu bed %7.2f, icu bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_icu_count))\n", + " del self.hospital.patients_in_icu_beds[p.id]\n", + " del self.hospital.patients[p.id]\n", + "\n", + " return\n", + " \n", + " def run(self):\n", + " \"\"\"\n", + " Controls the main model run. Initialises model and patient arrival and\n", + " audit processes. Instigates the run. At end of run calls for an audit\n", + " summary and bed occupancy plot\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " # Set up hospital (calling Hospital class)\n", + " self.hospital = Hospital()\n", + "\n", + " # Set up resources (beds, icu_beds)\n", + " self.resources = Resources(self.env, g.beds)\n", + " self.resources_icu = Resources_ICU(self.env, g.icu_beds)\n", + "\n", + " # Set up starting processes: new admissions and bed audit (with delay)\n", + " self.env.process(self.new_admission(g.inter_arrival_time, g.los, g.los_uti))\n", + " self.env.process(self.audit_beds(delay=20))\n", + "\n", + " # Start model run\n", + " self.env.run(until=g.sim_duration)\n", + "\n", + " # At end of run call for bed audit summary and bed occupancy plot\n", + " self.hospital.build_audit_report()\n", + " #self.hospital.chart()\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 502, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Patient:\n", + " \"\"\"\n", + " Patient class. Contains patient id and length of stay (it could contain\n", + " other info about patient, such as priority or clinical group.\n", + "\n", + " The only method is __init__ for creating a patient (with assignment of\n", + " patient id and length of stay).\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self, patient_id, los, los_uti):\n", + " \"\"\"\n", + " Contructor for new patient.\n", + "\n", + " :param patient_id: id of patient (set in self.new_admission)\n", + " :param los: length of stay (days, set in self.new_admission)\n", + " \"\"\"\n", + " self.id = patient_id\n", + " self.los = los\n", + " self.los_uti = los_uti\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 503, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Resources:\n", + " \"\"\"\n", + " Holds beds resources\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self, env, number_of_beds):\n", + " \"\"\" Constructor method to initialise beds resource)\"\"\"\n", + " self.beds = simpy.Resource(env, capacity=number_of_beds)\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 504, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Resources_ICU:\n", + " \"\"\"\n", + " Holds icu beds resources\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self, env, number_of_icu_beds):\n", + " \"\"\" Constructor method to initialise icu beds resource)\"\"\"\n", + " self.icu_beds = simpy.Resource(env, capacity=number_of_icu_beds)\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 505, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "def main():\n", + " \"\"\"\n", + " Code entry point after: if __name__ == '__main__'\n", + " Creates model object, and runs model\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " model = Model()\n", + " model.run()\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 506, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "## Code entry point. Calls main method.\n", + "#if __name__ == '__main__':\n", + "# main()" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 507, + "metadata": {}, + "outputs": [ + { + "data": { + "text/plain": [ + "0.02545894804462391" + ] + }, + "execution_count": 507, + "metadata": {}, + "output_type": "execute_result" + } + ], + "source": [ + "(random.uniform(0, 1) * 10) / 300" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 522, + "metadata": {}, + "outputs": [ + { + "data": { + "text/plain": [ + "0.0010771008051166377" + ] + }, + "execution_count": 522, + "metadata": {}, + "output_type": "execute_result" + } + ], + "source": [ + "(random.uniform(0, 1) * 40)" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 508, + "metadata": {}, + "outputs": [ + { + "name": "stdout", + "output_type": "stream", + "text": [ + "1 1\n", + "1 2\n", + "1 3\n", + "0 3\n", + "1 4\n", + "1 5\n", + "1 6\n", + "1 7\n", + "1 8\n", + "1 9\n" + ] + } + ], + "source": [ + "jow = []\n", + "for i in 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count 150\n", + "Patient 827 arriving 20.64, admissions count 827\n", + "Patient 827 arriving queue 20.64, queue count 434\n", + "Patient 828 arriving 20.66, admissions count 828\n", + "Patient 828 arriving queue 20.66, queue count 435\n", + "Patient 829 arriving 20.68, admissions count 829\n", + "Patient 829 arriving queue 20.68, queue count 436\n", + "Patient 830 arriving 20.69, admissions count 830\n", + "Patient 830 arriving queue 20.69, queue count 437\n", + "Patient 831 arriving 20.75, admissions count 831\n", + "Patient 831 arriving queue 20.75, queue count 438\n", + "Patient 280 leaving bed 20.77, bed count 149\n", + "Patient 394 leaving queue 20.77, queue count 437\n", + "Patient 394 arriving bed 20.77, bed count 150\n", + "Patient 295 leaving bed 20.79, bed count 149\n", + "Patient 395 leaving queue 20.79, queue count 436\n", + "Patient 395 arriving bed 20.79, bed count 150\n", + "Patient 832 arriving 20.79, admissions count 832\n", + "Patient 832 arriving queue 20.79, queue count 437\n", + "Patient 833 arriving 20.81, admissions count 833\n", + "Patient 833 arriving queue 20.81, queue count 438\n", + "Patient 834 arriving 20.82, admissions count 834\n", + "Patient 834 arriving queue 20.82, queue count 439\n", + "Patient 835 arriving 20.82, admissions count 835\n", + "Patient 835 arriving queue 20.82, queue count 440\n", + "Patient 836 arriving 20.82, admissions count 836\n", + "Patient 836 arriving queue 20.82, queue count 441\n", + "Patient 837 arriving 20.82, admissions count 837\n", + "Patient 837 arriving queue 20.82, queue count 442\n", + "Patient 284 leaving bed 20.82, bed count 149\n", + "Patient 284 arriving queue 20.82, queue count 442\n", + "Patient 284 leaving queue 20.82, queue count 442\n", + "Patient 284 arriving icu bed 20.82, icu bed count 13\n", + "Patient 396 leaving queue 20.82, queue count 441\n", + "Patient 396 arriving bed 20.82, bed count 150\n", + "Patient 838 arriving 20.86, admissions count 838\n", + "Patient 838 arriving queue 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25.54, queue count 568\n", + "Patient 1015 arriving 25.55, admissions count 1015\n", + "Patient 1015 arriving queue 25.55, queue count 569\n", + "Patient 282 leaving bed 25.57, bed count 149\n", + "Patient 447 leaving queue 25.57, queue count 568\n", + "Patient 447 arriving bed 25.57, bed count 150\n", + "Patient 1016 arriving 25.57, admissions count 1016\n", + "Patient 1016 arriving queue 25.57, queue count 569\n", + "Patient 1017 arriving 25.59, admissions count 1017\n", + "Patient 1017 arriving queue 25.59, queue count 570\n", + "Patient 220 leaving icu bed 25.60, icu bed count 10\n", + "Patient 1018 arriving 25.63, admissions count 1018\n", + "Patient 1018 arriving queue 25.63, queue count 571\n", + "Patient 1019 arriving 25.63, admissions count 1019\n", + "Patient 1019 arriving queue 25.63, queue count 572\n", + "Patient 1020 arriving 25.66, admissions count 1020\n", + "Patient 1020 arriving queue 25.66, queue count 573\n", + "Patient 1021 arriving 25.67, admissions count 1021\n", 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1174\n", + "Patient 1174 arriving queue 30.55, queue count 669\n", + "Patient 371 leaving bed 30.57, bed count 149\n", + "Patient 371 arriving queue 30.57, queue count 669\n", + "Patient 371 leaving queue 30.57, queue count 669\n", + "Patient 371 arriving icu bed 30.57, icu bed count 8\n", + "Patient 506 leaving queue 30.57, queue count 668\n", + "Patient 506 arriving bed 30.57, bed count 150\n", + "Patient 1175 arriving 30.57, admissions count 1175\n", + "Patient 1175 arriving queue 30.57, queue count 669\n", + "Patient 1176 arriving 30.65, admissions count 1176\n", + "Patient 1176 arriving queue 30.65, queue count 670\n", + "Patient 1177 arriving 30.65, admissions count 1177\n", + "Patient 1177 arriving queue 30.65, queue count 671\n", + "Patient 299 leaving bed 30.65, bed count 149\n", + "Patient 507 leaving queue 30.65, queue count 670\n", + "Patient 507 arriving bed 30.65, bed count 150\n", + "Patient 1178 arriving 30.68, admissions count 1178\n", + "Patient 1178 arriving queue 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1685\n", + "Patient 1685 arriving queue 43.28, queue count 1032\n", + "Patient 613 leaving bed 43.28, bed count 149\n", + "Patient 613 arriving queue 43.28, queue count 1032\n", + "Patient 613 leaving queue 43.28, queue count 1032\n", + "Patient 613 arriving icu bed 43.28, icu bed count 12\n", + "Patient 654 leaving queue 43.28, queue count 1031\n", + "Patient 654 arriving bed 43.28, bed count 150\n", + "Patient 1686 arriving 43.29, admissions count 1686\n", + "Patient 1686 arriving queue 43.29, queue count 1032\n", + "Patient 1687 arriving 43.29, admissions count 1687\n", + "Patient 1687 arriving queue 43.29, queue count 1033\n", + "Patient 1688 arriving 43.31, admissions count 1688\n", + "Patient 1688 arriving queue 43.31, queue count 1034\n", + "Patient 618 leaving bed 43.33, bed count 149\n", + "Patient 618 arriving queue 43.33, queue count 1034\n", + "Patient 618 leaving queue 43.33, queue count 1034\n", + "Patient 618 arriving icu bed 43.33, icu bed count 13\n", + "Patient 655 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bed count 149\n", + "Patient 302 arriving queue 44.02, queue count 1045\n", + "Patient 302 leaving queue 44.02, queue count 1045\n", + "Patient 302 arriving icu bed 44.02, icu bed count 13\n", + "Patient 661 leaving queue 44.02, queue count 1044\n", + "Patient 661 arriving bed 44.02, bed count 150\n", + "Patient 431 leaving icu bed 44.03, icu bed count 12\n", + "Patient 1706 arriving 44.10, admissions count 1706\n", + "Patient 1706 arriving queue 44.10, queue count 1045\n", + "Patient 1707 arriving 44.10, admissions count 1707\n", + "Patient 1707 arriving queue 44.10, queue count 1046\n", + "Patient 1708 arriving 44.11, admissions count 1708\n", + "Patient 1708 arriving queue 44.11, queue count 1047\n", + "Patient 1709 arriving 44.14, admissions count 1709\n", + "Patient 1709 arriving queue 44.14, queue count 1048\n", + "Patient 1710 arriving 44.15, admissions count 1710\n", + "Patient 1710 arriving queue 44.15, queue count 1049\n", + "Patient 1711 arriving 44.18, admissions count 1711\n", + "Patient 1711 arriving queue 44.18, queue count 1050\n", + "Patient 309 leaving bed 44.18, bed count 149\n", + "Patient 662 leaving queue 44.18, queue count 1049\n", + "Patient 662 arriving bed 44.18, bed count 150\n", + "Patient 494 leaving bed 44.23, bed count 149\n", + "Patient 663 leaving queue 44.23, queue count 1048\n", + "Patient 663 arriving bed 44.23, bed count 150\n", + "Patient 1712 arriving 44.26, admissions count 1712\n", + "Patient 1712 arriving queue 44.26, queue count 1049\n", + "Patient 156 leaving bed 44.28, bed count 149\n", + "Patient 664 leaving queue 44.28, queue count 1048\n", + "Patient 664 arriving bed 44.28, bed count 150\n", + "Patient 347 leaving bed 44.31, bed count 149\n", + "Patient 665 leaving queue 44.31, queue count 1047\n", + "Patient 665 arriving bed 44.31, bed count 150\n", + "Patient 637 leaving icu bed 44.33, icu bed count 11\n", + "Patient 1713 arriving 44.36, admissions count 1713\n", + "Patient 1713 arriving queue 44.36, queue count 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1721 arriving 44.51, admissions count 1721\n", + "Patient 1721 arriving queue 44.51, queue count 1055\n", + "Patient 1722 arriving 44.56, admissions count 1722\n", + "Patient 1722 arriving queue 44.56, queue count 1056\n", + "Patient 1723 arriving 44.57, admissions count 1723\n", + "Patient 1723 arriving queue 44.57, queue count 1057\n", + "Patient 665 leaving bed 44.57, bed count 149\n", + "Patient 665 arriving queue 44.57, queue count 1057\n", + "Patient 665 leaving queue 44.57, queue count 1057\n", + "Patient 665 arriving icu bed 44.57, icu bed count 12\n", + "Patient 667 leaving queue 44.57, queue count 1056\n", + "Patient 667 arriving bed 44.57, bed count 150\n", + "Patient 1724 arriving 44.58, admissions count 1724\n", + "Patient 1724 arriving queue 44.58, queue count 1057\n", + "Patient 1725 arriving 44.58, admissions count 1725\n", + "Patient 1725 arriving queue 44.58, queue count 1058\n", + "Patient 1726 arriving 44.59, admissions count 1726\n", + "Patient 1726 arriving queue 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48.42, queue count 1168\n", + "Patient 580 leaving bed 48.47, bed count 149\n", + "Patient 711 leaving queue 48.47, queue count 1167\n", + "Patient 711 arriving bed 48.47, bed count 150\n", + "Patient 1879 arriving 48.47, admissions count 1879\n", + "Patient 1879 arriving queue 48.47, queue count 1168\n", + "Patient 1880 arriving 48.50, admissions count 1880\n", + "Patient 1880 arriving queue 48.50, queue count 1169\n", + "Patient 1881 arriving 48.54, admissions count 1881\n", + "Patient 1881 arriving queue 48.54, queue count 1170\n", + "Patient 1882 arriving 48.57, admissions count 1882\n", + "Patient 1882 arriving queue 48.57, queue count 1171\n", + "Patient 1883 arriving 48.58, admissions count 1883\n", + "Patient 1883 arriving queue 48.58, queue count 1172\n", + "Patient 1884 arriving 48.59, admissions count 1884\n", + "Patient 1884 arriving queue 48.59, queue count 1173\n", + "Patient 681 leaving bed 48.60, bed count 149\n", + "Patient 712 leaving queue 48.60, queue count 1172\n", 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+ "Patient 594 leaving queue 48.77, queue count 1172\n", + "Patient 594 arriving icu bed 48.77, icu bed count 13\n", + "Patient 716 leaving queue 48.77, queue count 1171\n", + "Patient 716 arriving bed 48.77, bed count 150\n", + "Patient 1888 arriving 48.78, admissions count 1888\n", + "Patient 1888 arriving queue 48.78, queue count 1172\n", + "Patient 1889 arriving 48.84, admissions count 1889\n", + "Patient 1889 arriving queue 48.84, queue count 1173\n", + "Patient 307 leaving bed 48.86, bed count 149\n", + "Patient 717 leaving queue 48.86, queue count 1172\n", + "Patient 717 arriving bed 48.86, bed count 150\n", + "Patient 1890 arriving 48.87, admissions count 1890\n", + "Patient 1890 arriving queue 48.87, queue count 1173\n", + "Patient 1891 arriving 48.89, admissions count 1891\n", + "Patient 1891 arriving queue 48.89, queue count 1174\n", + "Patient 660 leaving bed 48.91, bed count 149\n", + "Patient 718 leaving queue 48.91, queue count 1173\n", + "Patient 718 arriving bed 48.91, 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"Patient 2098 arriving queue 53.78, queue count 1325\n", + "Patient 2099 arriving 53.78, admissions count 2099\n", + "Patient 2099 arriving queue 53.78, queue count 1326\n", + "Patient 437 leaving icu bed 53.82, icu bed count 14\n", + "Patient 2100 arriving 53.82, admissions count 2100\n", + "Patient 2100 arriving queue 53.82, queue count 1327\n", + "Patient 2101 arriving 53.94, admissions count 2101\n", + "Patient 2101 arriving queue 53.94, queue count 1328\n", + "Patient 647 leaving bed 53.98, bed count 149\n", + "Patient 647 arriving queue 53.98, queue count 1328\n", + "Patient 647 leaving queue 53.98, queue count 1328\n", + "Patient 647 arriving icu bed 53.98, icu bed count 15\n", + "Patient 774 leaving queue 53.98, queue count 1327\n", + "Patient 774 arriving bed 53.98, bed count 150\n", + "Patient 697 leaving bed 53.99, bed count 149\n", + "Patient 775 leaving queue 53.99, queue count 1326\n", + "Patient 775 arriving bed 53.99, bed count 150\n", + "Patient 2102 arriving 54.00, admissions count 2102\n", + "Patient 2102 arriving queue 54.00, queue count 1327\n", + "Patient 2103 arriving 54.02, admissions count 2103\n", + "Patient 2103 arriving queue 54.02, queue count 1328\n", + "Patient 2104 arriving 54.09, admissions count 2104\n", + "Patient 2104 arriving queue 54.09, queue count 1329\n", + "Patient 746 leaving bed 54.16, bed count 149\n", + "Patient 746 arriving queue 54.16, queue count 1329\n", + "Patient 746 leaving queue 54.16, queue count 1329\n", + "Patient 746 arriving icu bed 54.16, icu bed count 16\n", + "Patient 776 leaving queue 54.16, queue count 1328\n", + "Patient 776 arriving bed 54.16, bed count 150\n", + "Patient 2105 arriving 54.17, admissions count 2105\n", + "Patient 2105 arriving queue 54.17, queue count 1329\n", + "Patient 2106 arriving 54.18, admissions count 2106\n", + "Patient 2106 arriving queue 54.18, queue count 1330\n", + "Patient 2107 arriving 54.20, admissions count 2107\n", + "Patient 2107 arriving queue 54.20, queue count 1331\n", + "Patient 2108 arriving 54.21, admissions count 2108\n", + "Patient 2108 arriving queue 54.21, queue count 1332\n", + "Patient 2109 arriving 54.22, admissions count 2109\n", + "Patient 2109 arriving queue 54.22, queue count 1333\n", + "Patient 2110 arriving 54.24, admissions count 2110\n", + "Patient 2110 arriving queue 54.24, queue count 1334\n", + "Patient 712 leaving bed 54.27, bed count 149\n", + "Patient 712 arriving queue 54.27, queue count 1334\n", + "Patient 712 leaving queue 54.27, queue count 1334\n", + "Patient 712 arriving icu bed 54.27, icu bed count 17\n", + "Patient 777 leaving queue 54.27, queue count 1333\n", + "Patient 777 arriving bed 54.27, bed count 150\n", + "Patient 767 leaving bed 54.29, bed count 149\n", + "Patient 778 leaving queue 54.29, queue count 1332\n", + "Patient 778 arriving bed 54.29, bed count 150\n", + "Patient 769 leaving bed 54.34, bed count 149\n", + "Patient 779 leaving queue 54.34, queue count 1331\n", + "Patient 779 arriving bed 54.34, bed count 150\n", + "Patient 678 leaving bed 54.43, bed count 149\n", + "Patient 780 leaving queue 54.43, queue count 1330\n", + "Patient 780 arriving bed 54.43, bed count 150\n", + "Patient 2111 arriving 54.44, admissions count 2111\n", + "Patient 2111 arriving queue 54.44, queue count 1331\n", + "Patient 2112 arriving 54.47, admissions count 2112\n", + "Patient 2112 arriving queue 54.47, queue count 1332\n", + "Patient 567 leaving bed 54.51, bed count 149\n", + "Patient 781 leaving queue 54.51, queue count 1331\n", + "Patient 781 arriving bed 54.51, bed count 150\n", + "Patient 2113 arriving 54.52, admissions count 2113\n", + "Patient 2113 arriving queue 54.52, queue count 1332\n", + "Patient 2114 arriving 54.52, admissions count 2114\n", + "Patient 2114 arriving queue 54.52, queue count 1333\n", + "Patient 647 leaving icu bed 54.53, icu bed count 16\n", + "Patient 2115 arriving 54.53, admissions count 2115\n", + "Patient 2115 arriving queue 54.53, queue count 1334\n", + "Patient 778 leaving bed 54.53, bed count 149\n", + "Patient 782 leaving queue 54.53, queue count 1333\n", + "Patient 782 arriving bed 54.53, bed count 150\n", + "Patient 2116 arriving 54.53, admissions count 2116\n", + "Patient 2116 arriving queue 54.53, queue count 1334\n", + "Patient 2117 arriving 54.57, admissions count 2117\n", + "Patient 2117 arriving queue 54.57, queue count 1335\n", + "Patient 2118 arriving 54.59, admissions count 2118\n", + "Patient 2118 arriving queue 54.59, queue count 1336\n", + "Patient 746 leaving icu bed 54.59, icu bed count 15\n", + "Patient 692 leaving bed 54.62, bed count 149\n", + "Patient 783 leaving queue 54.62, queue count 1335\n", + "Patient 783 arriving bed 54.62, bed count 150\n", + "Patient 2119 arriving 54.63, admissions count 2119\n", + "Patient 2119 arriving queue 54.63, queue count 1336\n", + "Patient 2120 arriving 54.63, admissions count 2120\n", + "Patient 2120 arriving queue 54.63, queue count 1337\n", + "Patient 2121 arriving 54.66, admissions count 2121\n", + "Patient 2121 arriving queue 54.66, queue count 1338\n", + "Patient 2122 arriving 54.67, admissions count 2122\n", + "Patient 2122 arriving queue 54.67, queue count 1339\n", + "Patient 2123 arriving 54.68, admissions count 2123\n", + "Patient 2123 arriving queue 54.68, queue count 1340\n", + "Patient 2124 arriving 54.69, admissions count 2124\n", + "Patient 2124 arriving queue 54.69, queue count 1341\n", + "Patient 714 leaving bed 54.73, bed count 149\n", + "Patient 714 arriving queue 54.73, queue count 1341\n", + "Patient 714 leaving queue 54.73, queue count 1341\n", + "Patient 714 arriving icu bed 54.73, icu bed count 16\n", + "Patient 784 leaving queue 54.73, queue count 1340\n", + "Patient 784 arriving bed 54.73, bed count 150\n", + "Patient 2125 arriving 54.75, admissions count 2125\n", + "Patient 2125 arriving queue 54.75, queue count 1341\n", + "Patient 2126 arriving 54.76, admissions count 2126\n", + "Patient 2126 arriving queue 54.76, queue count 1342\n", + "Patient 619 leaving icu bed 54.76, icu bed count 15\n", + "Patient 2127 arriving 54.77, admissions count 2127\n", + "Patient 2127 arriving queue 54.77, queue count 1343\n", + "Patient 2128 arriving 54.77, admissions count 2128\n", + "Patient 2128 arriving queue 54.77, queue count 1344\n", + "Patient 2129 arriving 54.78, admissions count 2129\n", + "Patient 2129 arriving queue 54.78, queue count 1345\n", + "Patient 2130 arriving 54.79, admissions count 2130\n", + "Patient 2130 arriving queue 54.79, queue count 1346\n", + "Patient 478 leaving bed 54.80, bed count 149\n", + "Patient 785 leaving queue 54.80, queue count 1345\n", + "Patient 785 arriving bed 54.80, bed count 150\n", + "Patient 2131 arriving 54.83, admissions count 2131\n", + "Patient 2131 arriving queue 54.83, queue count 1346\n", + "Patient 458 leaving bed 54.88, bed count 149\n", + "Patient 458 arriving queue 54.88, queue count 1346\n", + "Patient 458 leaving queue 54.88, queue count 1346\n", + "Patient 458 arriving icu bed 54.88, icu bed count 16\n", + "Patient 786 leaving queue 54.88, queue count 1345\n", + "Patient 786 arriving bed 54.88, bed count 150\n", + "Patient 624 leaving icu bed 54.92, icu bed count 15\n", + "Patient 2132 arriving 54.92, admissions count 2132\n", + "Patient 2132 arriving queue 54.92, queue count 1346\n", + "Patient 2133 arriving 54.92, admissions count 2133\n", + "Patient 2133 arriving queue 54.92, queue count 1347\n", + "Patient 2134 arriving 54.96, admissions count 2134\n", + "Patient 2134 arriving queue 54.96, queue count 1348\n", + "Patient 2135 arriving 54.96, admissions count 2135\n", + "Patient 2135 arriving queue 54.96, queue count 1349\n", + "Patient 688 leaving bed 54.96, bed count 149\n", + "Patient 787 leaving queue 54.96, queue count 1348\n", + "Patient 787 arriving bed 54.96, bed count 150\n", + "Patient 2136 arriving 54.98, admissions count 2136\n", + "Patient 2136 arriving queue 54.98, queue count 1349\n", + "Patient 2137 arriving 55.00, admissions count 2137\n", + "Patient 2137 arriving queue 55.00, queue count 1350\n", + "Patient 2138 arriving 55.07, admissions count 2138\n", + "Patient 2138 arriving queue 55.07, queue count 1351\n", + "Patient 2139 arriving 55.07, admissions count 2139\n", + "Patient 2139 arriving queue 55.07, queue count 1352\n", + "Patient 780 leaving bed 55.07, bed count 149\n", + "Patient 788 leaving queue 55.07, queue count 1351\n", + "Patient 788 arriving bed 55.07, bed count 150\n", + "Patient 2140 arriving 55.13, admissions count 2140\n", + "Patient 2140 arriving queue 55.13, queue count 1352\n", + "Patient 458 leaving icu bed 55.13, icu bed count 14\n", + "Patient 614 leaving icu bed 55.14, icu bed count 13\n", + "Patient 2141 arriving 55.16, admissions count 2141\n", + "Patient 2141 arriving queue 55.16, queue count 1353\n", + "Patient 673 leaving icu bed 55.20, icu bed count 12\n", + "Patient 2142 arriving 55.22, admissions count 2142\n", + "Patient 2142 arriving queue 55.22, queue count 1354\n", + "Patient 2143 arriving 55.24, admissions count 2143\n", + "Patient 2143 arriving queue 55.24, queue count 1355\n", + "Patient 2144 arriving 55.25, admissions count 2144\n", + "Patient 2144 arriving queue 55.25, queue count 1356\n", + "Patient 2145 arriving 55.26, admissions count 2145\n", + "Patient 2145 arriving queue 55.26, queue count 1357\n", + "Patient 2146 arriving 55.26, admissions count 2146\n", + "Patient 2146 arriving queue 55.26, queue count 1358\n", + "Patient 2147 arriving 55.28, admissions count 2147\n", + "Patient 2147 arriving queue 55.28, queue count 1359\n", + "Patient 2148 arriving 55.30, admissions count 2148\n", + "Patient 2148 arriving queue 55.30, queue count 1360\n", + "Patient 2149 arriving 55.31, admissions count 2149\n", + "Patient 2149 arriving queue 55.31, queue count 1361\n", + "Patient 2150 arriving 55.31, admissions count 2150\n", + "Patient 2150 arriving queue 55.31, queue count 1362\n", + "Patient 538 leaving bed 55.31, bed count 149\n", + "Patient 789 leaving queue 55.31, queue count 1361\n", + "Patient 789 arriving bed 55.31, bed count 150\n", + "Patient 2151 arriving 55.32, admissions count 2151\n", + "Patient 2151 arriving queue 55.32, queue count 1362\n", + "Patient 596 leaving bed 55.32, bed count 149\n", + "Patient 596 arriving queue 55.32, queue count 1362\n", + "Patient 596 leaving queue 55.32, queue count 1362\n", + "Patient 596 arriving icu bed 55.32, icu bed count 13\n", + "Patient 790 leaving queue 55.32, queue count 1361\n", + "Patient 790 arriving bed 55.32, bed count 150\n", + "Patient 2152 arriving 55.37, admissions count 2152\n", + "Patient 2152 arriving queue 55.37, queue count 1362\n", + "Patient 669 leaving icu bed 55.39, icu bed count 12\n", + "Patient 2153 arriving 55.40, admissions count 2153\n", + "Patient 2153 arriving queue 55.40, queue count 1363\n", + "Patient 2154 arriving 55.44, admissions count 2154\n", + "Patient 2154 arriving queue 55.44, queue count 1364\n", + "Patient 2155 arriving 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queue count 1477\n", + "Patient 2306 arriving 58.80, admissions count 2306\n", + "Patient 2306 arriving queue 58.80, queue count 1478\n", + "Patient 596 leaving icu bed 58.83, icu bed count 12\n", + "Patient 2307 arriving 58.84, admissions count 2307\n", + "Patient 2307 arriving queue 58.84, queue count 1479\n", + "Patient 2308 arriving 58.85, admissions count 2308\n", + "Patient 2308 arriving queue 58.85, queue count 1480\n", + "Patient 2309 arriving 58.85, admissions count 2309\n", + "Patient 2309 arriving queue 58.85, queue count 1481\n", + "Patient 2310 arriving 58.91, admissions count 2310\n", + "Patient 2310 arriving queue 58.91, queue count 1482\n", + "Patient 2311 arriving 58.92, admissions count 2311\n", + "Patient 2311 arriving queue 58.92, queue count 1483\n", + "Patient 2312 arriving 58.95, admissions count 2312\n", + "Patient 2312 arriving queue 58.95, queue count 1484\n", + "Patient 2313 arriving 58.96, admissions count 2313\n", + "Patient 2313 arriving queue 58.96, queue count 1485\n", + "Patient 2314 arriving 58.97, admissions count 2314\n", + "Patient 2314 arriving queue 58.97, queue count 1486\n", + "Patient 2315 arriving 59.02, admissions count 2315\n", + "Patient 2315 arriving queue 59.02, queue count 1487\n", + "Patient 2316 arriving 59.02, admissions count 2316\n", + "Patient 2316 arriving queue 59.02, queue count 1488\n", + "Patient 2317 arriving 59.04, admissions count 2317\n", + "Patient 2317 arriving queue 59.04, queue count 1489\n", + "Patient 519 leaving bed 59.05, bed count 149\n", + "Patient 829 leaving queue 59.05, queue count 1488\n", + "Patient 829 arriving bed 59.05, bed count 150\n", + "Patient 2318 arriving 59.06, admissions count 2318\n", + "Patient 2318 arriving queue 59.06, queue count 1489\n", + "Patient 2319 arriving 59.08, admissions count 2319\n", + "Patient 2319 arriving queue 59.08, queue count 1490\n", + "Patient 2320 arriving 59.08, admissions count 2320\n", + "Patient 2320 arriving queue 59.08, queue count 1491\n", + "Patient 2321 arriving 59.09, admissions count 2321\n", + "Patient 2321 arriving queue 59.09, queue count 1492\n", + "Patient 2322 arriving 59.11, admissions count 2322\n", + "Patient 2322 arriving queue 59.11, queue count 1493\n", + "Patient 2323 arriving 59.20, admissions count 2323\n", + "Patient 2323 arriving queue 59.20, queue count 1494\n", + "Patient 2324 arriving 59.22, admissions count 2324\n", + "Patient 2324 arriving queue 59.22, queue count 1495\n", + "Patient 2325 arriving 59.23, admissions count 2325\n", + "Patient 2325 arriving queue 59.23, queue count 1496\n", + "Patient 2326 arriving 59.24, admissions count 2326\n", + "Patient 2326 arriving queue 59.24, queue count 1497\n", + "Patient 663 leaving bed 59.27, bed count 149\n", + "Patient 830 leaving queue 59.27, queue count 1496\n", + "Patient 830 arriving bed 59.27, bed count 150\n", + "Patient 690 leaving bed 59.29, bed count 149\n", + "Patient 690 arriving queue 59.29, queue count 1496\n", + "Patient 690 leaving queue 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bed count 149\n", + "Patient 874 leaving queue 62.43, queue count 1583\n", + "Patient 874 arriving bed 62.43, bed count 150\n", + "Patient 2458 arriving 62.47, admissions count 2458\n", + "Patient 2458 arriving queue 62.47, queue count 1584\n", + "Patient 815 leaving bed 62.48, bed count 149\n", + "Patient 875 leaving queue 62.48, queue count 1583\n", + "Patient 875 arriving bed 62.48, bed count 150\n", + "Patient 2459 arriving 62.49, admissions count 2459\n", + "Patient 2459 arriving queue 62.49, queue count 1584\n", + "Patient 2460 arriving 62.49, admissions count 2460\n", + "Patient 2460 arriving queue 62.49, queue count 1585\n", + "Patient 801 leaving bed 62.52, bed count 149\n", + "Patient 876 leaving queue 62.52, queue count 1584\n", + "Patient 876 arriving bed 62.52, bed count 150\n", + "Patient 2461 arriving 62.52, admissions count 2461\n", + "Patient 2461 arriving queue 62.52, queue count 1585\n", + "Patient 2462 arriving 62.54, admissions count 2462\n", + "Patient 2462 arriving queue 62.54, queue count 1586\n", + "Patient 2463 arriving 62.56, admissions count 2463\n", + "Patient 2463 arriving queue 62.56, queue count 1587\n", + "Patient 768 leaving bed 62.59, bed count 149\n", + "Patient 877 leaving queue 62.59, queue count 1586\n", + "Patient 877 arriving bed 62.59, bed count 150\n", + "Patient 2464 arriving 62.68, admissions count 2464\n", + "Patient 2464 arriving queue 62.68, queue count 1587\n", + "Patient 2465 arriving 62.69, admissions count 2465\n", + "Patient 2465 arriving queue 62.69, queue count 1588\n", + "Patient 2466 arriving 62.69, admissions count 2466\n", + "Patient 2466 arriving queue 62.69, queue count 1589\n", + "Patient 2467 arriving 62.70, admissions count 2467\n", + "Patient 2467 arriving queue 62.70, queue count 1590\n", + "Patient 2468 arriving 62.73, admissions count 2468\n", + "Patient 2468 arriving queue 62.73, queue count 1591\n", + "Patient 2469 arriving 62.82, admissions count 2469\n", + "Patient 2469 arriving queue 62.82, queue count 1592\n", + "Patient 2470 arriving 62.84, admissions count 2470\n", + "Patient 2470 arriving queue 62.84, queue count 1593\n", + "Patient 751 leaving icu bed 62.84, icu bed count 14\n", + "Patient 2471 arriving 62.86, admissions count 2471\n", + "Patient 2471 arriving queue 62.86, queue count 1594\n", + "Patient 2472 arriving 62.88, admissions count 2472\n", + "Patient 2472 arriving queue 62.88, queue count 1595\n", + "Patient 2473 arriving 62.89, admissions count 2473\n", + "Patient 2473 arriving queue 62.89, queue count 1596\n", + "Patient 602 leaving bed 62.89, bed count 149\n", + "Patient 878 leaving queue 62.89, queue count 1595\n", + "Patient 878 arriving bed 62.89, bed count 150\n", + "Patient 2474 arriving 62.90, admissions count 2474\n", + "Patient 2474 arriving queue 62.90, queue count 1596\n", + "Patient 2475 arriving 62.90, admissions count 2475\n", + "Patient 2475 arriving queue 62.90, queue count 1597\n", + "Patient 598 leaving icu bed 62.96, icu bed 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2484\n", + "Patient 2484 arriving queue 63.04, queue count 1606\n", + "Patient 2485 arriving 63.06, admissions count 2485\n", + "Patient 2485 arriving queue 63.06, queue count 1607\n", + "Patient 2486 arriving 63.12, admissions count 2486\n", + "Patient 2486 arriving queue 63.12, queue count 1608\n", + "Patient 792 leaving bed 63.14, bed count 149\n", + "Patient 792 arriving queue 63.14, queue count 1608\n", + "Patient 792 leaving queue 63.14, queue count 1608\n", + "Patient 792 arriving icu bed 63.14, icu bed count 14\n", + "Patient 879 leaving queue 63.14, queue count 1607\n", + "Patient 879 arriving bed 63.14, bed count 150\n", + "Patient 2487 arriving 63.22, admissions count 2487\n", + "Patient 2487 arriving queue 63.22, queue count 1608\n", + "Patient 2488 arriving 63.23, admissions count 2488\n", + "Patient 2488 arriving queue 63.23, queue count 1609\n", + "Patient 2489 arriving 63.26, admissions count 2489\n", + "Patient 2489 arriving queue 63.26, queue count 1610\n", + "Patient 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count 1614\n", + "Patient 875 leaving bed 63.45, bed count 149\n", + "Patient 882 leaving queue 63.45, queue count 1613\n", + "Patient 882 arriving bed 63.45, bed count 150\n", + "Patient 2496 arriving 63.46, admissions count 2496\n", + "Patient 2496 arriving queue 63.46, queue count 1614\n", + "Patient 2497 arriving 63.46, admissions count 2497\n", + "Patient 2497 arriving queue 63.46, queue count 1615\n", + "Patient 2498 arriving 63.50, admissions count 2498\n", + "Patient 2498 arriving queue 63.50, queue count 1616\n", + "Patient 863 leaving bed 63.50, bed count 149\n", + "Patient 883 leaving queue 63.50, queue count 1615\n", + "Patient 883 arriving bed 63.50, bed count 150\n", + "Patient 883 leaving bed 63.51, bed count 149\n", + "Patient 884 leaving queue 63.51, queue count 1614\n", + "Patient 884 arriving bed 63.51, bed count 150\n", + "Patient 680 leaving bed 63.54, bed count 149\n", + "Patient 885 leaving queue 63.54, queue count 1613\n", + "Patient 885 arriving bed 63.54, bed count 150\n", + "Patient 2499 arriving 63.55, admissions count 2499\n", + "Patient 2499 arriving queue 63.55, queue count 1614\n", + "Patient 2500 arriving 63.55, admissions count 2500\n", + "Patient 2500 arriving queue 63.55, queue count 1615\n", + "Patient 2501 arriving 63.55, admissions count 2501\n", + "Patient 2501 arriving queue 63.55, queue count 1616\n", + "Patient 2502 arriving 63.57, admissions count 2502\n", + "Patient 2502 arriving queue 63.57, queue count 1617\n", + "Patient 2503 arriving 63.61, admissions count 2503\n", + "Patient 2503 arriving queue 63.61, queue count 1618\n", + "Patient 2504 arriving 63.62, admissions count 2504\n", + "Patient 2504 arriving queue 63.62, queue count 1619\n", + "Patient 2505 arriving 63.63, admissions count 2505\n", + "Patient 2505 arriving queue 63.63, queue count 1620\n", + "Patient 2506 arriving 63.65, admissions count 2506\n", + "Patient 2506 arriving queue 63.65, queue count 1621\n", + "Patient 803 leaving bed 63.66, bed count 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865 arriving icu bed 63.96, icu bed count 15\n", + "Patient 891 leaving queue 63.96, queue count 1624\n", + "Patient 891 arriving bed 63.96, bed count 150\n", + "Patient 806 leaving bed 63.96, bed count 149\n", + "Patient 806 arriving queue 63.96, queue count 1624\n", + "Patient 806 leaving queue 63.96, queue count 1624\n", + "Patient 806 arriving icu bed 63.96, icu bed count 16\n", + "Patient 892 leaving queue 63.96, queue count 1623\n", + "Patient 892 arriving bed 63.96, bed count 150\n", + "Patient 861 leaving bed 63.99, bed count 149\n", + "Patient 893 leaving queue 63.99, queue count 1622\n", + "Patient 893 arriving bed 63.99, bed count 150\n", + "Patient 2516 arriving 64.00, admissions count 2516\n", + "Patient 2516 arriving queue 64.00, queue count 1623\n", + "Patient 890 leaving bed 64.00, bed count 149\n", + "Patient 890 arriving queue 64.00, queue count 1623\n", + "Patient 890 leaving queue 64.00, queue count 1623\n", + "Patient 890 arriving icu bed 64.00, icu bed count 17\n", + "Patient 894 leaving queue 64.00, queue count 1622\n", + "Patient 894 arriving bed 64.00, bed count 150\n", + "Patient 2517 arriving 64.02, admissions count 2517\n", + "Patient 2517 arriving queue 64.02, queue count 1623\n", + "Patient 2518 arriving 64.02, admissions count 2518\n", + "Patient 2518 arriving queue 64.02, queue count 1624\n", + "Patient 2519 arriving 64.04, admissions count 2519\n", + "Patient 2519 arriving queue 64.04, queue count 1625\n", + "Patient 2520 arriving 64.05, admissions count 2520\n", + "Patient 2520 arriving queue 64.05, queue count 1626\n", + "Patient 838 leaving bed 64.07, bed count 149\n", + "Patient 895 leaving queue 64.07, queue count 1625\n", + "Patient 895 arriving bed 64.07, bed count 150\n", + "Patient 2521 arriving 64.08, admissions count 2521\n", + "Patient 2521 arriving queue 64.08, queue count 1626\n", + "Patient 2522 arriving 64.08, admissions count 2522\n", + "Patient 2522 arriving queue 64.08, queue count 1627\n", + "Patient 2523 arriving 64.08, admissions count 2523\n", + "Patient 2523 arriving queue 64.08, queue count 1628\n", + "Patient 2524 arriving 64.09, admissions count 2524\n", + "Patient 2524 arriving queue 64.09, queue count 1629\n", + "Patient 2525 arriving 64.10, admissions count 2525\n", + "Patient 2525 arriving queue 64.10, queue count 1630\n", + "Patient 2526 arriving 64.11, admissions count 2526\n", + "Patient 2526 arriving queue 64.11, queue count 1631\n", + "Patient 2527 arriving 64.11, admissions count 2527\n", + "Patient 2527 arriving queue 64.11, queue count 1632\n", + "Patient 2528 arriving 64.19, admissions count 2528\n", + "Patient 2528 arriving queue 64.19, queue count 1633\n", + "Patient 789 leaving bed 64.21, bed count 149\n", + "Patient 896 leaving queue 64.21, queue count 1632\n", + "Patient 896 arriving bed 64.21, bed count 150\n", + "Patient 865 leaving icu bed 64.23, icu bed count 16\n", + "Patient 2529 arriving 64.26, admissions count 2529\n", + "Patient 2529 arriving queue 64.26, queue count 1633\n", + "Patient 2530 arriving 64.28, admissions count 2530\n", + "Patient 2530 arriving queue 64.28, queue count 1634\n", + "Patient 667 leaving bed 64.30, bed count 149\n", + "Patient 897 leaving queue 64.30, queue count 1633\n", + "Patient 897 arriving bed 64.30, bed count 150\n", + "Patient 490 leaving icu bed 64.31, icu bed count 15\n", + "Patient 2531 arriving 64.36, admissions count 2531\n", + "Patient 2531 arriving queue 64.36, queue count 1634\n", + "Patient 2532 arriving 64.37, admissions count 2532\n", + "Patient 2532 arriving queue 64.37, queue count 1635\n", + "Patient 2533 arriving 64.37, admissions count 2533\n", + "Patient 2533 arriving queue 64.37, queue count 1636\n", + "Patient 814 leaving bed 64.46, bed count 149\n", + "Patient 898 leaving queue 64.46, queue count 1635\n", + "Patient 898 arriving bed 64.46, bed count 150\n", + "Patient 2534 arriving 64.46, admissions count 2534\n", + "Patient 2534 arriving queue 64.46, queue count 1636\n", + "Patient 792 leaving icu bed 64.49, icu bed count 14\n", + "Patient 237 leaving bed 64.49, bed count 149\n", + "Patient 899 leaving queue 64.49, queue count 1635\n", + "Patient 899 arriving bed 64.49, bed count 150\n", + "Patient 2535 arriving 64.51, admissions count 2535\n", + "Patient 2535 arriving queue 64.51, queue count 1636\n", + "Patient 762 leaving bed 64.54, bed count 149\n", + "Patient 900 leaving queue 64.54, queue count 1635\n", + "Patient 900 arriving bed 64.54, bed count 150\n", + "Patient 2536 arriving 64.55, admissions count 2536\n", + "Patient 2536 arriving queue 64.55, queue count 1636\n", + "Patient 2537 arriving 64.62, admissions count 2537\n", + "Patient 2537 arriving queue 64.62, queue count 1637\n", + "Patient 2538 arriving 64.62, admissions count 2538\n", + "Patient 2538 arriving queue 64.62, queue count 1638\n", + "Patient 2539 arriving 64.63, admissions count 2539\n", + "Patient 2539 arriving queue 64.63, queue count 1639\n", + "Patient 2540 arriving 64.66, admissions count 2540\n", + "Patient 2540 arriving queue 64.66, queue count 1640\n", + "Patient 2541 arriving 64.66, admissions count 2541\n", + "Patient 2541 arriving queue 64.66, queue count 1641\n", + "Patient 2542 arriving 64.68, admissions count 2542\n", + "Patient 2542 arriving queue 64.68, queue count 1642\n", + "Patient 329 leaving bed 64.72, bed count 149\n", + "Patient 901 leaving queue 64.72, queue count 1641\n", + "Patient 901 arriving bed 64.72, bed count 150\n", + "Patient 901 leaving bed 64.76, bed count 149\n", + "Patient 902 leaving queue 64.76, queue count 1640\n", + "Patient 902 arriving bed 64.76, bed count 150\n", + "Patient 2543 arriving 64.78, admissions count 2543\n", + "Patient 2543 arriving queue 64.78, queue count 1641\n", + "Patient 2544 arriving 64.79, admissions count 2544\n", + "Patient 2544 arriving queue 64.79, queue count 1642\n", + "Patient 2545 arriving 64.82, admissions count 2545\n", + "Patient 2545 arriving queue 64.82, queue count 1643\n", + "Patient 2546 arriving 64.84, admissions count 2546\n", + "Patient 2546 arriving queue 64.84, queue count 1644\n", + "Patient 849 leaving bed 64.87, bed count 149\n", + "Patient 849 arriving queue 64.87, queue count 1644\n", + "Patient 849 leaving queue 64.87, queue count 1644\n", + "Patient 849 arriving icu bed 64.87, icu bed count 15\n", + "Patient 903 leaving queue 64.87, queue count 1643\n", + "Patient 903 arriving bed 64.87, bed count 150\n", + "Patient 2547 arriving 64.95, admissions count 2547\n", + "Patient 2547 arriving queue 64.95, queue count 1644\n", + "Patient 2548 arriving 64.97, admissions count 2548\n", + "Patient 2548 arriving queue 64.97, queue count 1645\n", + "Patient 2549 arriving 64.98, admissions count 2549\n", + "Patient 2549 arriving queue 64.98, queue count 1646\n", + "Patient 2550 arriving 64.99, admissions count 2550\n", + "Patient 2550 arriving queue 64.99, queue count 1647\n", + "Patient 706 leaving bed 65.03, bed count 149\n", + "Patient 706 arriving queue 65.03, queue count 1647\n", + "Patient 706 leaving queue 65.03, queue count 1647\n", + "Patient 706 arriving icu bed 65.03, icu bed count 16\n", + "Patient 904 leaving queue 65.03, queue count 1646\n", + "Patient 904 arriving bed 65.03, bed count 150\n", + "Patient 2551 arriving 65.04, admissions count 2551\n", + "Patient 2551 arriving queue 65.04, queue count 1647\n", + "Patient 2552 arriving 65.09, admissions count 2552\n", + "Patient 2552 arriving queue 65.09, queue count 1648\n", + "Patient 2553 arriving 65.13, admissions count 2553\n", + "Patient 2553 arriving queue 65.13, queue count 1649\n", + "Patient 791 leaving bed 65.15, bed count 149\n", + "Patient 791 arriving queue 65.15, queue count 1649\n", + "Patient 791 leaving queue 65.15, queue count 1649\n", + "Patient 791 arriving icu bed 65.15, icu bed count 17\n", + "Patient 905 leaving queue 65.15, queue count 1648\n", + "Patient 905 arriving bed 65.15, bed count 150\n", + "Patient 2554 arriving 65.16, admissions count 2554\n", + "Patient 2554 arriving queue 65.16, queue count 1649\n", + "Patient 804 leaving bed 65.16, bed count 149\n", + "Patient 906 leaving queue 65.16, queue count 1648\n", + "Patient 906 arriving bed 65.16, bed count 150\n", + "Patient 706 leaving icu bed 65.22, icu bed count 16\n", + "Patient 2555 arriving 65.30, admissions count 2555\n", + "Patient 2555 arriving queue 65.30, queue count 1649\n", + "Patient 2556 arriving 65.33, admissions count 2556\n", + "Patient 2556 arriving queue 65.33, queue count 1650\n", + "Patient 2557 arriving 65.35, admissions count 2557\n", + "Patient 2557 arriving queue 65.35, queue count 1651\n", + "Patient 2558 arriving 65.36, admissions count 2558\n", + "Patient 2558 arriving queue 65.36, queue count 1652\n", + "Patient 2559 arriving 65.36, admissions count 2559\n", + "Patient 2559 arriving queue 65.36, queue count 1653\n", + "Patient 2560 arriving 65.40, admissions count 2560\n", + "Patient 2560 arriving queue 65.40, queue count 1654\n", + "Patient 858 leaving bed 65.40, bed count 149\n", + "Patient 907 leaving queue 65.40, queue count 1653\n", + "Patient 907 arriving bed 65.40, bed count 150\n", + "Patient 2561 arriving 65.41, admissions count 2561\n", + "Patient 2561 arriving queue 65.41, queue count 1654\n", + "Patient 2562 arriving 65.43, admissions count 2562\n", + "Patient 2562 arriving queue 65.43, queue count 1655\n", + "Patient 2563 arriving 65.44, admissions count 2563\n", + "Patient 2563 arriving queue 65.44, queue count 1656\n", + "Patient 891 leaving bed 65.49, bed count 149\n", + "Patient 891 arriving queue 65.49, queue count 1656\n", + "Patient 891 leaving queue 65.49, queue count 1656\n", + "Patient 891 arriving icu bed 65.49, icu bed count 17\n", + "Patient 908 leaving queue 65.49, queue count 1655\n", + "Patient 908 arriving bed 65.49, bed count 150\n", + "Patient 884 leaving bed 65.56, bed count 149\n", + "Patient 909 leaving queue 65.56, queue count 1654\n", + "Patient 909 arriving bed 65.56, bed count 150\n", + "Patient 656 leaving bed 65.62, bed count 149\n", + "Patient 910 leaving queue 65.62, queue count 1653\n", + "Patient 910 arriving bed 65.62, bed count 150\n", + "Patient 2564 arriving 65.62, admissions count 2564\n", + "Patient 2564 arriving queue 65.62, queue count 1654\n", + "Patient 2565 arriving 65.63, admissions count 2565\n", + "Patient 2565 arriving queue 65.63, queue count 1655\n", + "Patient 2566 arriving 65.63, admissions count 2566\n", + "Patient 2566 arriving queue 65.63, queue count 1656\n", + "Patient 833 leaving bed 65.65, bed count 149\n", + "Patient 833 arriving queue 65.65, queue count 1656\n", + "Patient 833 leaving queue 65.65, queue count 1656\n", + "Patient 833 arriving icu bed 65.65, icu bed count 18\n", + "Patient 911 leaving queue 65.65, queue count 1655\n", + "Patient 911 arriving bed 65.65, bed count 150\n", + "Patient 2567 arriving 65.66, admissions count 2567\n", + "Patient 2567 arriving queue 65.66, queue count 1656\n", + "Patient 2568 arriving 65.84, admissions count 2568\n", + "Patient 2568 arriving queue 65.84, queue count 1657\n", + "Patient 2569 arriving 65.84, admissions count 2569\n", + "Patient 2569 arriving queue 65.84, queue count 1658\n", + "Patient 640 leaving icu bed 65.85, icu bed count 17\n", + "Patient 2570 arriving 65.85, admissions count 2570\n", + "Patient 2570 arriving queue 65.85, queue count 1659\n", + "Patient 846 leaving bed 65.88, bed count 149\n", + "Patient 846 arriving queue 65.88, queue count 1659\n", + "Patient 846 leaving queue 65.88, queue count 1659\n", + "Patient 846 arriving icu bed 65.88, icu bed count 18\n", + "Patient 912 leaving queue 65.88, queue count 1658\n", + "Patient 912 arriving bed 65.88, bed count 150\n", + "Patient 2571 arriving 65.89, admissions count 2571\n", + "Patient 2571 arriving queue 65.89, queue count 1659\n", + "Patient 2572 arriving 65.91, admissions count 2572\n", + "Patient 2572 arriving queue 65.91, queue count 1660\n", + "Patient 2573 arriving 65.93, admissions count 2573\n", + "Patient 2573 arriving queue 65.93, queue count 1661\n", + "Patient 2574 arriving 65.94, admissions count 2574\n", + "Patient 2574 arriving queue 65.94, queue count 1662\n", + "Patient 2575 arriving 65.96, admissions count 2575\n", + "Patient 2575 arriving queue 65.96, queue count 1663\n", + "Patient 896 leaving bed 65.97, bed count 149\n", + "Patient 913 leaving queue 65.97, queue count 1662\n", + "Patient 913 arriving bed 65.97, bed count 150\n", + "Patient 456 leaving bed 65.98, bed count 149\n", + "Patient 914 leaving queue 65.98, queue count 1661\n", + "Patient 914 arriving bed 65.98, bed count 150\n", + "Patient 2576 arriving 65.99, admissions count 2576\n", + "Patient 2576 arriving queue 65.99, queue count 1662\n", + "Patient 2577 arriving 66.02, admissions count 2577\n", + "Patient 2577 arriving queue 66.02, queue count 1663\n", + "Patient 2578 arriving 66.05, admissions count 2578\n", + "Patient 2578 arriving queue 66.05, queue count 1664\n", + "Patient 2579 arriving 66.07, admissions count 2579\n", + "Patient 2579 arriving queue 66.07, queue count 1665\n", + "Patient 2580 arriving 66.07, admissions count 2580\n", + "Patient 2580 arriving queue 66.07, queue count 1666\n", + "Patient 2581 arriving 66.11, admissions count 2581\n", + "Patient 2581 arriving queue 66.11, queue count 1667\n", + "Patient 802 leaving bed 66.13, bed count 149\n", + "Patient 915 leaving queue 66.13, queue count 1666\n", + "Patient 915 arriving bed 66.13, bed count 150\n", + "Patient 2582 arriving 66.13, admissions count 2582\n", + "Patient 2582 arriving queue 66.13, queue count 1667\n", + "Patient 2583 arriving 66.16, admissions count 2583\n", + "Patient 2583 arriving queue 66.16, queue count 1668\n", + "Patient 711 leaving bed 66.18, bed count 149\n", + "Patient 916 leaving queue 66.18, queue count 1667\n", + "Patient 916 arriving bed 66.18, bed count 150\n", + "Patient 830 leaving bed 66.21, bed count 149\n", + "Patient 917 leaving queue 66.21, queue 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"Patient 2602 arriving 66.64, admissions count 2602\n", + "Patient 2602 arriving queue 66.64, queue count 1681\n", + "Patient 736 leaving icu bed 66.65, icu bed count 18\n", + "Patient 2603 arriving 66.65, admissions count 2603\n", + "Patient 2603 arriving queue 66.65, queue count 1682\n", + "Patient 2604 arriving 66.65, admissions count 2604\n", + "Patient 2604 arriving queue 66.65, queue count 1683\n", + "Patient 2605 arriving 66.67, admissions count 2605\n", + "Patient 2605 arriving queue 66.67, queue count 1684\n", + "Patient 542 leaving bed 66.74, bed count 149\n", + "Patient 922 leaving queue 66.74, queue count 1683\n", + "Patient 922 arriving bed 66.74, bed count 150\n", + "Patient 784 leaving bed 66.76, bed count 149\n", + "Patient 923 leaving queue 66.76, queue count 1682\n", + "Patient 923 arriving bed 66.76, bed count 150\n", + "Patient 912 leaving bed 66.82, bed count 149\n", + "Patient 912 arriving queue 66.82, queue count 1682\n", + "Patient 912 leaving queue 66.82, queue count 1682\n", + "Patient 912 arriving icu bed 66.82, icu bed count 19\n", + "Patient 924 leaving queue 66.82, queue count 1681\n", + "Patient 924 arriving bed 66.82, bed count 150\n", + "Patient 2606 arriving 66.84, admissions count 2606\n", + "Patient 2606 arriving queue 66.84, queue count 1682\n", + "Patient 2607 arriving 66.84, admissions count 2607\n", + "Patient 2607 arriving queue 66.84, queue count 1683\n", + "Patient 2608 arriving 66.85, admissions count 2608\n", + "Patient 2608 arriving queue 66.85, queue count 1684\n", + "Patient 2609 arriving 66.90, admissions count 2609\n", + "Patient 2609 arriving queue 66.90, queue count 1685\n", + "Patient 726 leaving bed 66.90, bed count 149\n", + "Patient 925 leaving queue 66.90, queue count 1684\n", + "Patient 925 arriving bed 66.90, bed count 150\n", + "Patient 338 leaving bed 66.91, bed count 149\n", + "Patient 926 leaving queue 66.91, queue count 1683\n", + "Patient 926 arriving bed 66.91, bed count 150\n", + "Patient 2610 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2629 arriving 67.32, admissions count 2629\n", + "Patient 2629 arriving queue 67.32, queue count 1700\n", + "Patient 2630 arriving 67.33, admissions count 2630\n", + "Patient 2630 arriving queue 67.33, queue count 1701\n", + "Patient 2631 arriving 67.34, admissions count 2631\n", + "Patient 2631 arriving queue 67.34, queue count 1702\n", + "Patient 2632 arriving 67.35, admissions count 2632\n", + "Patient 2632 arriving queue 67.35, queue count 1703\n", + "Patient 2633 arriving 67.35, admissions count 2633\n", + "Patient 2633 arriving queue 67.35, queue count 1704\n", + "Patient 2634 arriving 67.36, admissions count 2634\n", + "Patient 2634 arriving queue 67.36, queue count 1705\n", + "Patient 2635 arriving 67.36, admissions count 2635\n", + "Patient 2635 arriving queue 67.36, queue count 1706\n", + "Patient 791 leaving icu bed 67.37, icu bed count 17\n", + "Patient 2636 arriving 67.45, admissions count 2636\n", + "Patient 2636 arriving queue 67.45, queue count 1707\n", + "Patient 2637 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67.71, queue count 1713\n", + "Patient 914 leaving bed 67.74, bed count 149\n", + "Patient 931 leaving queue 67.74, queue count 1712\n", + "Patient 931 arriving bed 67.74, bed count 150\n", + "Patient 539 leaving bed 67.75, bed count 149\n", + "Patient 932 leaving queue 67.75, queue count 1711\n", + "Patient 932 arriving bed 67.75, bed count 150\n", + "Patient 2644 arriving 67.77, admissions count 2644\n", + "Patient 2644 arriving queue 67.77, queue count 1712\n", + "Patient 866 leaving bed 67.79, bed count 149\n", + "Patient 866 arriving queue 67.79, queue count 1712\n", + "Patient 866 leaving queue 67.79, queue count 1712\n", + "Patient 866 arriving icu bed 67.79, icu bed count 17\n", + "Patient 933 leaving queue 67.79, queue count 1711\n", + "Patient 933 arriving bed 67.79, bed count 150\n", + "Patient 2645 arriving 67.79, admissions count 2645\n", + "Patient 2645 arriving queue 67.79, queue count 1712\n", + "Patient 2646 arriving 67.80, admissions count 2646\n", + "Patient 2646 arriving queue 67.80, queue count 1713\n", + "Patient 2647 arriving 67.80, admissions count 2647\n", + "Patient 2647 arriving queue 67.80, queue count 1714\n", + "Patient 2648 arriving 67.83, admissions count 2648\n", + "Patient 2648 arriving queue 67.83, queue count 1715\n", + "Patient 2649 arriving 67.83, admissions count 2649\n", + "Patient 2649 arriving queue 67.83, queue count 1716\n", + "Patient 2650 arriving 67.86, admissions count 2650\n", + "Patient 2650 arriving queue 67.86, queue count 1717\n", + "Patient 2651 arriving 67.87, admissions count 2651\n", + "Patient 2651 arriving queue 67.87, queue count 1718\n", + "Patient 2652 arriving 67.92, admissions count 2652\n", + "Patient 2652 arriving queue 67.92, queue count 1719\n", + "Patient 926 leaving bed 67.92, bed count 149\n", + "Patient 934 leaving queue 67.92, queue count 1718\n", + "Patient 934 arriving bed 67.92, bed count 150\n", + "Patient 2653 arriving 67.93, admissions count 2653\n", + "Patient 2653 arriving queue 67.93, queue count 1719\n", + "Patient 2654 arriving 67.95, admissions count 2654\n", + "Patient 2654 arriving queue 67.95, queue count 1720\n", + "Patient 2655 arriving 67.97, admissions count 2655\n", + "Patient 2655 arriving queue 67.97, queue count 1721\n", + "Patient 2656 arriving 68.00, admissions count 2656\n", + "Patient 2656 arriving queue 68.00, queue count 1722\n", + "Patient 2657 arriving 68.06, admissions count 2657\n", + "Patient 2657 arriving queue 68.06, queue count 1723\n", + "Patient 805 leaving bed 68.07, bed count 149\n", + "Patient 935 leaving queue 68.07, queue count 1722\n", + "Patient 935 arriving bed 68.07, bed count 150\n", + "Patient 2658 arriving 68.08, admissions count 2658\n", + "Patient 2658 arriving queue 68.08, queue count 1723\n", + "Patient 2659 arriving 68.10, admissions count 2659\n", + "Patient 2659 arriving queue 68.10, queue count 1724\n", + "Patient 253 leaving bed 68.13, bed count 149\n", + "Patient 936 leaving queue 68.13, queue count 1723\n", 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68.21, bed count 150\n", + "Patient 2665 arriving 68.22, admissions count 2665\n", + "Patient 2665 arriving queue 68.22, queue count 1727\n", + "Patient 2666 arriving 68.23, admissions count 2666\n", + "Patient 2666 arriving queue 68.23, queue count 1728\n", + "Patient 2667 arriving 68.25, admissions count 2667\n", + "Patient 2667 arriving queue 68.25, queue count 1729\n", + "Patient 2668 arriving 68.30, admissions count 2668\n", + "Patient 2668 arriving queue 68.30, queue count 1730\n", + "Patient 2669 arriving 68.34, admissions count 2669\n", + "Patient 2669 arriving queue 68.34, queue count 1731\n", + "Patient 2670 arriving 68.36, admissions count 2670\n", + "Patient 2670 arriving queue 68.36, queue count 1732\n", + "Patient 849 leaving icu bed 68.39, icu bed count 15\n", + "Patient 880 leaving bed 68.40, bed count 149\n", + "Patient 939 leaving queue 68.40, queue count 1731\n", + "Patient 939 arriving bed 68.40, bed count 150\n", + "Patient 930 leaving bed 68.42, bed count 149\n", 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"Patient 2936 arriving queue 75.07, queue count 1919\n", + "Patient 2937 arriving 75.08, admissions count 2937\n", + "Patient 2937 arriving queue 75.08, queue count 1920\n", + "Patient 2938 arriving 75.10, admissions count 2938\n", + "Patient 2938 arriving queue 75.10, queue count 1921\n", + "Patient 670 leaving bed 75.12, bed count 149\n", + "Patient 1018 leaving queue 75.12, queue count 1920\n", + "Patient 1018 arriving bed 75.12, bed count 150\n", + "Patient 2939 arriving 75.15, admissions count 2939\n", + "Patient 2939 arriving queue 75.15, queue count 1921\n", + "Patient 2940 arriving 75.15, admissions count 2940\n", + "Patient 2940 arriving queue 75.15, queue count 1922\n", + "Patient 2941 arriving 75.15, admissions count 2941\n", + "Patient 2941 arriving queue 75.15, queue count 1923\n", + "Patient 700 leaving bed 75.16, bed count 149\n", + "Patient 1019 leaving queue 75.16, queue count 1922\n", + "Patient 1019 arriving bed 75.16, bed count 150\n", + "Patient 2942 arriving 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count 2085\n", + "Patient 3154 arriving 80.13, admissions count 3154\n", + "Patient 3154 arriving queue 80.13, queue count 2086\n", + "Patient 3155 arriving 80.15, admissions count 3155\n", + "Patient 3155 arriving queue 80.15, queue count 2087\n", + "Patient 3156 arriving 80.17, admissions count 3156\n", + "Patient 3156 arriving queue 80.17, queue count 2088\n", + "Patient 1031 leaving bed 80.18, bed count 149\n", + "Patient 1069 leaving queue 80.18, queue count 2087\n", + "Patient 1069 arriving bed 80.18, bed count 150\n", + "Patient 1003 leaving icu bed 80.19, icu bed count 8\n", + "Patient 3157 arriving 80.19, admissions count 3157\n", + "Patient 3157 arriving queue 80.19, queue count 2088\n", + "Patient 3158 arriving 80.21, admissions count 3158\n", + "Patient 3158 arriving queue 80.21, queue count 2089\n", + "Patient 3159 arriving 80.23, admissions count 3159\n", + "Patient 3159 arriving queue 80.23, queue count 2090\n", + "Patient 3160 arriving 80.24, admissions count 3160\n", + "Patient 3160 arriving queue 80.24, queue count 2091\n", + "Patient 1069 leaving bed 80.28, bed count 149\n", + "Patient 1070 leaving queue 80.28, queue count 2090\n", + "Patient 1070 arriving bed 80.28, bed count 150\n", + "Patient 3161 arriving 80.30, admissions count 3161\n", + "Patient 3161 arriving queue 80.30, queue count 2091\n", + "Patient 3162 arriving 80.31, admissions count 3162\n", + "Patient 3162 arriving queue 80.31, queue count 2092\n", + "Patient 3163 arriving 80.34, admissions count 3163\n", + "Patient 3163 arriving queue 80.34, queue count 2093\n", + "Patient 3164 arriving 80.36, admissions count 3164\n", + "Patient 3164 arriving queue 80.36, queue count 2094\n", + "Patient 3165 arriving 80.37, admissions count 3165\n", + "Patient 3165 arriving queue 80.37, queue count 2095\n", + "Patient 3166 arriving 80.39, admissions count 3166\n", + "Patient 3166 arriving queue 80.39, queue count 2096\n", + "Patient 3167 arriving 80.39, admissions count 3167\n", + "Patient 3167 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"Patient 3184 arriving queue 80.88, queue count 2106\n", + "Patient 3185 arriving 80.88, admissions count 3185\n", + "Patient 3185 arriving queue 80.88, queue count 2107\n", + "Patient 3186 arriving 80.88, admissions count 3186\n", + "Patient 3186 arriving queue 80.88, queue count 2108\n", + "Patient 3187 arriving 80.91, admissions count 3187\n", + "Patient 3187 arriving queue 80.91, queue count 2109\n", + "Patient 3188 arriving 80.93, admissions count 3188\n", + "Patient 3188 arriving queue 80.93, queue count 2110\n", + "Patient 3189 arriving 80.96, admissions count 3189\n", + "Patient 3189 arriving queue 80.96, queue count 2111\n", + "Patient 3190 arriving 80.97, admissions count 3190\n", + "Patient 3190 arriving queue 80.97, queue count 2112\n", + "Patient 3191 arriving 80.97, admissions count 3191\n", + "Patient 3191 arriving queue 80.97, queue count 2113\n", + "Patient 3192 arriving 80.97, admissions count 3192\n", + "Patient 3192 arriving queue 80.97, queue count 2114\n", + "Patient 3193 arriving 80.98, admissions count 3193\n", + "Patient 3193 arriving queue 80.98, queue count 2115\n", + "Patient 1050 leaving bed 80.99, bed count 149\n", + "Patient 1079 leaving queue 80.99, queue count 2114\n", + "Patient 1079 arriving bed 80.99, bed count 150\n", + "Patient 3194 arriving 81.00, admissions count 3194\n", + "Patient 3194 arriving queue 81.00, queue count 2115\n", + "Patient 3195 arriving 81.00, admissions count 3195\n", + "Patient 3195 arriving queue 81.00, queue count 2116\n", + "Patient 968 leaving bed 81.01, bed count 149\n", + "Patient 1080 leaving queue 81.01, queue count 2115\n", + "Patient 1080 arriving bed 81.01, bed count 150\n", + "Patient 3196 arriving 81.01, admissions count 3196\n", + "Patient 3196 arriving queue 81.01, queue count 2116\n", + "Patient 976 leaving bed 81.02, bed count 149\n", + "Patient 976 arriving queue 81.02, queue count 2116\n", + "Patient 976 leaving queue 81.02, queue count 2116\n", + "Patient 976 arriving icu bed 81.02, icu bed count 13\n", + "Patient 1081 leaving queue 81.02, queue count 2115\n", + "Patient 1081 arriving bed 81.02, bed count 150\n", + "Patient 879 leaving bed 81.04, bed count 149\n", + "Patient 1082 leaving queue 81.04, queue count 2114\n", + "Patient 1082 arriving bed 81.04, bed count 150\n", + "Patient 3197 arriving 81.08, admissions count 3197\n", + "Patient 3197 arriving queue 81.08, queue count 2115\n", + "Patient 972 leaving bed 81.13, bed count 149\n", + "Patient 1083 leaving queue 81.13, queue count 2114\n", + "Patient 1083 arriving bed 81.13, bed count 150\n", + "Patient 3198 arriving 81.16, admissions count 3198\n", + "Patient 3198 arriving queue 81.16, queue count 2115\n", + "Patient 928 leaving icu bed 81.18, icu bed count 12\n", + "Patient 872 leaving icu bed 81.18, icu bed count 11\n", + "Patient 1056 leaving bed 81.22, bed count 149\n", + "Patient 1084 leaving queue 81.22, queue count 2114\n", + "Patient 1084 arriving bed 81.22, bed count 150\n", + "Patient 3199 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"Patient 1088 leaving queue 81.41, queue count 2121\n", + "Patient 1088 arriving bed 81.41, bed count 150\n", + "Patient 3210 arriving 81.43, admissions count 3210\n", + "Patient 3210 arriving queue 81.43, queue count 2122\n", + "Patient 3211 arriving 81.43, admissions count 3211\n", + "Patient 3211 arriving queue 81.43, queue count 2123\n", + "Patient 3212 arriving 81.44, admissions count 3212\n", + "Patient 3212 arriving queue 81.44, queue count 2124\n", + "Patient 3213 arriving 81.47, admissions count 3213\n", + "Patient 3213 arriving queue 81.47, queue count 2125\n", + "Patient 3214 arriving 81.54, admissions count 3214\n", + "Patient 3214 arriving queue 81.54, queue count 2126\n", + "Patient 3215 arriving 81.58, admissions count 3215\n", + "Patient 3215 arriving queue 81.58, queue count 2127\n", + "Patient 3216 arriving 81.59, admissions count 3216\n", + "Patient 3216 arriving queue 81.59, queue count 2128\n", + "Patient 3217 arriving 81.60, admissions count 3217\n", + "Patient 3217 arriving queue 81.60, queue count 2129\n", + "Patient 3218 arriving 81.60, admissions count 3218\n", + "Patient 3218 arriving queue 81.60, queue count 2130\n", + "Patient 3219 arriving 81.64, admissions count 3219\n", + "Patient 3219 arriving queue 81.64, queue count 2131\n", + "Patient 3220 arriving 81.65, admissions count 3220\n", + "Patient 3220 arriving queue 81.65, queue count 2132\n", + "Patient 1024 leaving icu bed 81.66, icu bed count 11\n", + "Patient 3221 arriving 81.67, admissions count 3221\n", + "Patient 3221 arriving queue 81.67, queue count 2133\n", + "Patient 3222 arriving 81.67, admissions count 3222\n", + "Patient 3222 arriving queue 81.67, queue count 2134\n", + "Patient 3223 arriving 81.68, admissions count 3223\n", + "Patient 3223 arriving queue 81.68, queue count 2135\n", + "Patient 3224 arriving 81.68, admissions count 3224\n", + "Patient 3224 arriving queue 81.68, queue count 2136\n", + "Patient 3225 arriving 81.68, admissions count 3225\n", + "Patient 3225 arriving queue 81.68, queue count 2137\n", + "Patient 3226 arriving 81.71, admissions count 3226\n", + "Patient 3226 arriving queue 81.71, queue count 2138\n", + "Patient 3227 arriving 81.71, admissions count 3227\n", + "Patient 3227 arriving queue 81.71, queue count 2139\n", + "Patient 856 leaving bed 81.72, bed count 149\n", + "Patient 1089 leaving queue 81.72, queue count 2138\n", + "Patient 1089 arriving bed 81.72, bed count 150\n", + "Patient 3228 arriving 81.73, admissions count 3228\n", + "Patient 3228 arriving queue 81.73, queue count 2139\n", + "Patient 1018 leaving bed 81.74, bed count 149\n", + "Patient 1090 leaving queue 81.74, queue count 2138\n", + "Patient 1090 arriving bed 81.74, bed count 150\n", + "Patient 3229 arriving 81.77, admissions count 3229\n", + "Patient 3229 arriving queue 81.77, queue count 2139\n", + "Patient 3230 arriving 81.78, admissions count 3230\n", + "Patient 3230 arriving queue 81.78, queue count 2140\n", + "Patient 836 leaving bed 81.83, bed count 149\n", + "Patient 836 arriving queue 81.83, queue count 2140\n", + "Patient 836 leaving queue 81.83, queue count 2140\n", + "Patient 836 arriving icu bed 81.83, icu bed count 12\n", + "Patient 1091 leaving queue 81.83, queue count 2139\n", + "Patient 1091 arriving bed 81.83, bed count 150\n", + "Patient 904 leaving icu bed 81.84, icu bed count 11\n", + "Patient 3231 arriving 81.84, admissions count 3231\n", + "Patient 3231 arriving queue 81.84, queue count 2140\n", + "Patient 956 leaving icu bed 81.85, icu bed count 10\n", + "Patient 3232 arriving 81.96, admissions count 3232\n", + "Patient 3232 arriving queue 81.96, queue count 2141\n", + "Patient 3233 arriving 81.99, admissions count 3233\n", + "Patient 3233 arriving queue 81.99, queue count 2142\n", + "Patient 3234 arriving 82.02, admissions count 3234\n", + "Patient 3234 arriving queue 82.02, queue count 2143\n", + "Patient 710 leaving bed 82.06, bed count 149\n", + "Patient 1092 leaving queue 82.06, queue count 2142\n", + "Patient 1092 arriving bed 82.06, bed count 150\n", + "Patient 1091 leaving bed 82.07, bed count 149\n", + "Patient 1091 arriving queue 82.07, queue count 2142\n", + "Patient 1091 leaving queue 82.07, queue count 2142\n", + "Patient 1091 arriving icu bed 82.07, icu bed count 11\n", + "Patient 1093 leaving queue 82.07, queue count 2141\n", + "Patient 1093 arriving bed 82.07, bed count 150\n", + "Patient 3235 arriving 82.09, admissions count 3235\n", + "Patient 3235 arriving queue 82.09, queue count 2142\n", + "Patient 1081 leaving bed 82.10, bed count 149\n", + "Patient 1081 arriving queue 82.10, queue count 2142\n", + "Patient 1081 leaving queue 82.10, queue count 2142\n", + "Patient 1081 arriving icu bed 82.10, icu bed count 12\n", + "Patient 1094 leaving queue 82.10, queue count 2141\n", + "Patient 1094 arriving bed 82.10, bed count 150\n", + "Patient 3236 arriving 82.11, admissions count 3236\n", + "Patient 3236 arriving queue 82.11, queue count 2142\n", + "Patient 955 leaving bed 82.11, bed count 149\n", + "Patient 1095 leaving queue 82.11, queue count 2141\n", + "Patient 1095 arriving bed 82.11, bed count 150\n", + "Patient 3237 arriving 82.15, admissions count 3237\n", + "Patient 3237 arriving queue 82.15, queue count 2142\n", + "Patient 1077 leaving bed 82.15, bed count 149\n", + "Patient 1096 leaving queue 82.15, queue count 2141\n", + "Patient 1096 arriving bed 82.15, bed count 150\n", + "Patient 1008 leaving bed 82.17, bed count 149\n", + "Patient 1008 arriving queue 82.17, queue count 2141\n", + "Patient 1008 leaving queue 82.17, queue count 2141\n", + "Patient 1008 arriving icu bed 82.17, icu bed count 13\n", + "Patient 1097 leaving queue 82.17, queue count 2140\n", + "Patient 1097 arriving bed 82.17, bed count 150\n", + "Patient 3238 arriving 82.17, admissions count 3238\n", + "Patient 3238 arriving queue 82.17, queue count 2141\n", + "Patient 3239 arriving 82.19, admissions count 3239\n", + "Patient 3239 arriving queue 82.19, queue count 2142\n", + "Patient 3240 arriving 82.23, admissions count 3240\n", + "Patient 3240 arriving queue 82.23, queue count 2143\n", + "Patient 3241 arriving 82.24, admissions count 3241\n", + "Patient 3241 arriving queue 82.24, queue count 2144\n", + "Patient 3242 arriving 82.25, admissions count 3242\n", + "Patient 3242 arriving queue 82.25, queue count 2145\n", + "Patient 3243 arriving 82.25, admissions count 3243\n", + "Patient 3243 arriving queue 82.25, queue count 2146\n", + "Patient 944 leaving bed 82.27, bed count 149\n", + "Patient 1098 leaving queue 82.27, queue count 2145\n", + "Patient 1098 arriving bed 82.27, bed count 150\n", + "Patient 947 leaving bed 82.30, bed count 149\n", + "Patient 947 arriving queue 82.30, queue count 2145\n", + "Patient 947 leaving queue 82.30, queue count 2145\n", + "Patient 947 arriving icu bed 82.30, icu bed count 14\n", + "Patient 1099 leaving queue 82.30, queue count 2144\n", + "Patient 1099 arriving bed 82.30, bed count 150\n", + "Patient 1055 leaving bed 82.33, bed count 149\n", + "Patient 1055 arriving queue 82.33, queue count 2144\n", + "Patient 1055 leaving queue 82.33, queue count 2144\n", + "Patient 1055 arriving icu bed 82.33, icu bed count 15\n", + "Patient 1100 leaving queue 82.33, queue count 2143\n", + "Patient 1100 arriving bed 82.33, bed count 150\n", + "Patient 3244 arriving 82.33, admissions count 3244\n", + "Patient 3244 arriving queue 82.33, queue count 2144\n", + "Patient 3245 arriving 82.34, admissions count 3245\n", + "Patient 3245 arriving queue 82.34, queue count 2145\n", + "Patient 3246 arriving 82.35, admissions count 3246\n", + "Patient 3246 arriving queue 82.35, queue count 2146\n", + "Patient 3247 arriving 82.35, admissions count 3247\n", + "Patient 3247 arriving queue 82.35, queue count 2147\n", + "Patient 3248 arriving 82.38, admissions count 3248\n", + "Patient 3248 arriving queue 82.38, queue count 2148\n", + "Patient 3249 arriving 82.40, admissions count 3249\n", + "Patient 3249 arriving queue 82.40, 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1132 arriving bed 84.68, bed count 150\n", + "Patient 3341 arriving 84.74, admissions count 3341\n", + "Patient 3341 arriving queue 84.74, queue count 2209\n", + "Patient 3342 arriving 84.75, admissions count 3342\n", + "Patient 3342 arriving queue 84.75, queue count 2210\n", + "Patient 3343 arriving 84.75, admissions count 3343\n", + "Patient 3343 arriving queue 84.75, queue count 2211\n", + "Patient 3344 arriving 84.75, admissions count 3344\n", + "Patient 3344 arriving queue 84.75, queue count 2212\n", + "Patient 3345 arriving 84.77, admissions count 3345\n", + "Patient 3345 arriving queue 84.77, queue count 2213\n", + "Patient 3346 arriving 84.79, admissions count 3346\n", + "Patient 3346 arriving queue 84.79, queue count 2214\n", + "Patient 3347 arriving 84.80, admissions count 3347\n", + "Patient 3347 arriving queue 84.80, queue count 2215\n", + "Patient 3348 arriving 84.81, admissions count 3348\n", + "Patient 3348 arriving queue 84.81, queue count 2216\n", + "Patient 3349 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3353\n", + "Patient 3353 arriving queue 84.93, queue count 2218\n", + "Patient 3354 arriving 84.93, admissions count 3354\n", + "Patient 3354 arriving queue 84.93, queue count 2219\n", + "Patient 1074 leaving bed 84.98, bed count 149\n", + "Patient 1136 leaving queue 84.98, queue count 2218\n", + "Patient 1136 arriving bed 84.98, bed count 150\n", + "Patient 3355 arriving 84.98, admissions count 3355\n", + "Patient 3355 arriving queue 84.98, queue count 2219\n", + "Patient 1117 leaving bed 84.99, bed count 149\n", + "Patient 1137 leaving queue 84.99, queue count 2218\n", + "Patient 1137 arriving bed 84.99, bed count 150\n", + "Patient 3356 arriving 85.00, admissions count 3356\n", + "Patient 3356 arriving queue 85.00, queue count 2219\n", + "Patient 1091 leaving icu bed 85.01, icu bed count 9\n", + "Patient 3357 arriving 85.01, admissions count 3357\n", + "Patient 3357 arriving queue 85.01, queue count 2220\n", + "Patient 3358 arriving 85.03, admissions count 3358\n", + "Patient 3358 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queue count 2223\n", + "Patient 3363 arriving 85.16, admissions count 3363\n", + "Patient 3363 arriving queue 85.16, queue count 2224\n", + "Patient 3364 arriving 85.16, admissions count 3364\n", + "Patient 3364 arriving queue 85.16, queue count 2225\n", + "Patient 3365 arriving 85.19, admissions count 3365\n", + "Patient 3365 arriving queue 85.19, queue count 2226\n", + "Patient 758 leaving bed 85.22, bed count 149\n", + "Patient 1140 leaving queue 85.22, queue count 2225\n", + "Patient 1140 arriving bed 85.22, bed count 150\n", + "Patient 3366 arriving 85.26, admissions count 3366\n", + "Patient 3366 arriving queue 85.26, queue count 2226\n", + "Patient 3367 arriving 85.27, admissions count 3367\n", + "Patient 3367 arriving queue 85.27, queue count 2227\n", + "Patient 3368 arriving 85.27, admissions count 3368\n", + "Patient 3368 arriving queue 85.27, queue count 2228\n", + "Patient 3369 arriving 85.29, admissions count 3369\n", + "Patient 3369 arriving queue 85.29, queue count 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arriving bed 85.39, bed count 150\n", + "Patient 1059 leaving icu bed 85.40, icu bed count 10\n", + "Patient 3373 arriving 85.41, admissions count 3373\n", + "Patient 3373 arriving queue 85.41, queue count 2230\n", + "Patient 979 leaving bed 85.42, bed count 149\n", + "Patient 1144 leaving queue 85.42, queue count 2229\n", + "Patient 1144 arriving bed 85.42, bed count 150\n", + "Patient 888 leaving bed 85.43, bed count 149\n", + "Patient 1145 leaving queue 85.43, queue count 2228\n", + "Patient 1145 arriving bed 85.43, bed count 150\n", + "Patient 3374 arriving 85.44, admissions count 3374\n", + "Patient 3374 arriving queue 85.44, queue count 2229\n", + "Patient 783 leaving icu bed 85.45, icu bed count 9\n", + "Patient 824 leaving bed 85.48, bed count 149\n", + "Patient 1146 leaving queue 85.48, queue count 2228\n", + "Patient 1146 arriving bed 85.48, bed count 150\n", + "Patient 1097 leaving bed 85.49, bed count 149\n", + "Patient 1147 leaving queue 85.49, queue count 2227\n", + "Patient 1147 arriving bed 85.49, bed count 150\n", + "Patient 1037 leaving bed 85.55, bed count 149\n", + "Patient 1148 leaving queue 85.55, queue count 2226\n", + "Patient 1148 arriving bed 85.55, bed count 150\n", + "Patient 962 leaving bed 85.59, bed count 149\n", + "Patient 962 arriving queue 85.59, queue count 2226\n", + "Patient 962 leaving queue 85.59, queue count 2226\n", + "Patient 962 arriving icu bed 85.59, icu bed count 10\n", + "Patient 1149 leaving queue 85.59, queue count 2225\n", + "Patient 1149 arriving bed 85.59, bed count 150\n", + "Patient 3375 arriving 85.60, admissions count 3375\n", + "Patient 3375 arriving queue 85.60, queue count 2226\n", + "Patient 3376 arriving 85.62, admissions count 3376\n", + "Patient 3376 arriving queue 85.62, queue count 2227\n", + "Patient 3377 arriving 85.66, admissions count 3377\n", + "Patient 3377 arriving queue 85.66, queue count 2228\n", + "Patient 1093 leaving bed 85.66, bed count 149\n", + "Patient 1150 leaving queue 85.66, queue count 2227\n", + "Patient 1150 arriving bed 85.66, bed count 150\n", + "Patient 3378 arriving 85.70, admissions count 3378\n", + "Patient 3378 arriving queue 85.70, queue count 2228\n", + "Patient 3379 arriving 85.71, admissions count 3379\n", + "Patient 3379 arriving queue 85.71, queue count 2229\n", + "Patient 1098 leaving bed 85.71, bed count 149\n", + "Patient 1151 leaving queue 85.71, queue count 2228\n", + "Patient 1151 arriving bed 85.71, bed count 150\n", + "Patient 3380 arriving 85.73, admissions count 3380\n", + "Patient 3380 arriving queue 85.73, queue count 2229\n", + "Patient 3381 arriving 85.75, admissions count 3381\n", + "Patient 3381 arriving queue 85.75, queue count 2230\n", + "Patient 3382 arriving 85.76, admissions count 3382\n", + "Patient 3382 arriving queue 85.76, queue count 2231\n", + "Patient 3383 arriving 85.76, admissions count 3383\n", + "Patient 3383 arriving queue 85.76, queue count 2232\n", + "Patient 1146 leaving bed 85.76, bed count 149\n", + "Patient 1152 leaving queue 85.76, queue count 2231\n", + "Patient 1152 arriving bed 85.76, bed count 150\n", + "Patient 1033 leaving bed 85.76, bed count 149\n", + "Patient 1153 leaving queue 85.76, queue count 2230\n", + "Patient 1153 arriving bed 85.76, bed count 150\n", + "Patient 3384 arriving 85.77, admissions count 3384\n", + "Patient 3384 arriving queue 85.77, queue count 2231\n", + "Patient 3385 arriving 85.77, admissions count 3385\n", + "Patient 3385 arriving queue 85.77, queue count 2232\n", + "Patient 3386 arriving 85.78, admissions count 3386\n", + "Patient 3386 arriving queue 85.78, queue count 2233\n", + "Patient 3387 arriving 85.80, admissions count 3387\n", + "Patient 3387 arriving queue 85.80, queue count 2234\n", + "Patient 3388 arriving 85.81, admissions count 3388\n", + "Patient 3388 arriving queue 85.81, queue count 2235\n", + "Patient 3389 arriving 85.81, admissions count 3389\n", + "Patient 3389 arriving queue 85.81, queue count 2236\n", + "Patient 3390 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86.20, icu bed count 9\n", + "Patient 1155 leaving queue 86.20, queue count 2247\n", + "Patient 1155 arriving bed 86.20, bed count 150\n", + "Patient 3403 arriving 86.20, admissions count 3403\n", + "Patient 3403 arriving queue 86.20, queue count 2248\n", + "Patient 3404 arriving 86.22, admissions count 3404\n", + "Patient 3404 arriving queue 86.22, queue count 2249\n", + "Patient 3405 arriving 86.23, admissions count 3405\n", + "Patient 3405 arriving queue 86.23, queue count 2250\n", + "Patient 3406 arriving 86.30, admissions count 3406\n", + "Patient 3406 arriving queue 86.30, queue count 2251\n", + "Patient 1082 leaving bed 86.34, bed count 149\n", + "Patient 1156 leaving queue 86.34, queue count 2250\n", + "Patient 1156 arriving bed 86.34, bed count 150\n", + "Patient 3407 arriving 86.35, admissions count 3407\n", + "Patient 3407 arriving queue 86.35, queue count 2251\n", + "Patient 3408 arriving 86.35, admissions count 3408\n", + "Patient 3408 arriving queue 86.35, queue count 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admissions count 3444\n", + "Patient 3444 arriving queue 87.41, queue count 2275\n", + "Patient 3445 arriving 87.45, admissions count 3445\n", + "Patient 3445 arriving queue 87.45, queue count 2276\n", + "Patient 1123 leaving bed 87.47, bed count 149\n", + "Patient 1170 leaving queue 87.47, queue count 2275\n", + "Patient 1170 arriving bed 87.47, bed count 150\n", + "Patient 3446 arriving 87.47, admissions count 3446\n", + "Patient 3446 arriving queue 87.47, queue count 2276\n", + "Patient 127 leaving bed 87.50, bed count 149\n", + "Patient 1171 leaving queue 87.50, queue count 2275\n", + "Patient 1171 arriving bed 87.50, bed count 150\n", + "Patient 3447 arriving 87.50, admissions count 3447\n", + "Patient 3447 arriving queue 87.50, queue count 2276\n", + "Patient 3448 arriving 87.55, admissions count 3448\n", + "Patient 3448 arriving queue 87.55, queue count 2277\n", + "Patient 3449 arriving 87.56, admissions count 3449\n", + "Patient 3449 arriving queue 87.56, queue count 2278\n", + "Patient 3450 arriving 87.59, admissions count 3450\n", + "Patient 3450 arriving queue 87.59, queue count 2279\n", + "Patient 3451 arriving 87.60, admissions count 3451\n", + "Patient 3451 arriving queue 87.60, queue count 2280\n", + "Patient 859 leaving bed 87.61, bed count 149\n", + "Patient 1172 leaving queue 87.61, queue count 2279\n", + "Patient 1172 arriving bed 87.61, bed count 150\n", + "Patient 3452 arriving 87.61, admissions count 3452\n", + "Patient 3452 arriving queue 87.61, queue count 2280\n", + "Patient 3453 arriving 87.61, admissions count 3453\n", + "Patient 3453 arriving queue 87.61, queue count 2281\n", + "Patient 3454 arriving 87.63, admissions count 3454\n", + "Patient 3454 arriving queue 87.63, queue count 2282\n", + "Patient 3455 arriving 87.65, admissions count 3455\n", + "Patient 3455 arriving queue 87.65, queue count 2283\n", + "Patient 1119 leaving bed 87.65, bed count 149\n", + "Patient 1173 leaving queue 87.65, queue count 2282\n", + "Patient 1173 arriving bed 87.65, bed count 150\n", + "Patient 3456 arriving 87.74, admissions count 3456\n", + "Patient 3456 arriving queue 87.74, queue count 2283\n", + "Patient 876 leaving bed 87.76, bed count 149\n", + "Patient 876 arriving queue 87.76, queue count 2283\n", + "Patient 876 leaving queue 87.76, queue count 2283\n", + "Patient 876 arriving icu bed 87.76, icu bed count 14\n", + "Patient 1174 leaving queue 87.76, queue count 2282\n", + "Patient 1174 arriving bed 87.76, bed count 150\n", + "Patient 744 leaving bed 87.84, bed count 149\n", + "Patient 1175 leaving queue 87.84, queue count 2281\n", + "Patient 1175 arriving bed 87.84, bed count 150\n", + "Patient 3457 arriving 87.86, admissions count 3457\n", + "Patient 3457 arriving queue 87.86, queue count 2282\n", + "Patient 3458 arriving 87.88, admissions count 3458\n", + "Patient 3458 arriving queue 87.88, queue count 2283\n", + "Patient 3459 arriving 87.90, admissions count 3459\n", + "Patient 3459 arriving queue 87.90, queue count 2284\n", + "Patient 3460 arriving 87.90, admissions count 3460\n", + "Patient 3460 arriving queue 87.90, queue count 2285\n", + "Patient 3461 arriving 87.91, admissions count 3461\n", + "Patient 3461 arriving queue 87.91, queue count 2286\n", + "Patient 3462 arriving 87.94, admissions count 3462\n", + "Patient 3462 arriving queue 87.94, queue count 2287\n", + "Patient 3463 arriving 87.94, admissions count 3463\n", + "Patient 3463 arriving queue 87.94, queue count 2288\n", + "Patient 3464 arriving 87.96, admissions count 3464\n", + "Patient 3464 arriving queue 87.96, queue count 2289\n", + "Patient 3465 arriving 88.00, admissions count 3465\n", + "Patient 3465 arriving queue 88.00, queue count 2290\n", + "Patient 3466 arriving 88.02, admissions count 3466\n", + "Patient 3466 arriving queue 88.02, queue count 2291\n", + "Patient 3467 arriving 88.04, admissions count 3467\n", + "Patient 3467 arriving queue 88.04, queue count 2292\n", + "Patient 931 leaving bed 88.04, bed count 149\n", + "Patient 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count 150\n", + "Patient 1139 leaving bed 88.21, bed count 149\n", + "Patient 1139 arriving queue 88.21, queue count 2294\n", + "Patient 1139 leaving queue 88.21, queue count 2294\n", + "Patient 1139 arriving icu bed 88.21, icu bed count 15\n", + "Patient 1179 leaving queue 88.21, queue count 2293\n", + "Patient 1179 arriving bed 88.21, bed count 150\n", + "Patient 3473 arriving 88.25, admissions count 3473\n", + "Patient 3473 arriving queue 88.25, queue count 2294\n", + "Patient 3474 arriving 88.25, admissions count 3474\n", + "Patient 3474 arriving queue 88.25, queue count 2295\n", + "Patient 3475 arriving 88.30, admissions count 3475\n", + "Patient 3475 arriving queue 88.30, queue count 2296\n", + "Patient 3476 arriving 88.30, admissions count 3476\n", + "Patient 3476 arriving queue 88.30, queue count 2297\n", + "Patient 1032 leaving bed 88.30, bed count 149\n", + "Patient 1180 leaving queue 88.30, queue count 2296\n", + "Patient 1180 arriving bed 88.30, bed count 150\n", + "Patient 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When called appends current simulation time to audit_time\n", + " list, and appends current bed count to audit_beds.\n", + " \"\"\"\n", + " self.audit_time.append(time)\n", + " self.audit_beds.append(self.bed_count)\n", + " self.audit_icu_beds.append(self.bed_icu_count)\n", + " self.audit_queue.append(self.queue_count)\n", + " \n", + " return\n", + "\n", + " def build_audit_report(self):\n", + " \"\"\"\n", + " This method is called at end of run. It creates a pandas DataFrame,\n", + " transfers audit times and bed counts to the DataFrame, and \n", + " calculates/stores 5th, 50th and 95th percentiles.\n", + " \"\"\"\n", + " self.audit_report = pd.DataFrame()\n", + "\n", + " self.audit_report['Time'] = self.audit_time\n", + "\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'] = self.audit_beds\n", + " \n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'] = self.audit_icu_beds\n", + "\n", + " self.audit_report['Median_beds'] = \\\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'].quantile(0.5)\n", + " \n", + " self.audit_report['ICU_Median_beds'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'].quantile(0.5)\n", + "\n", + " self.audit_report['Beds_5_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'].quantile(0.05)\n", + "\n", + " self.audit_report['ICU_Beds_5_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'].quantile(0.05)\n", + " \n", + " self.audit_report['Beds_95_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'].quantile(0.95)\n", + " \n", + " self.audit_report['ICU_Beds_95_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'].quantile(0.95)\n", + "\n", + " self.audit_report['Queue'] = self.audit_queue\n", + "\n", + " self.audit_report['Median_queue'] = \\\n", + " self.audit_report['Queue'].quantile(0.5)\n", + "\n", + " self.audit_report['Queue_5_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Queue'].quantile(0.05)\n", + "\n", + " self.audit_report['Queue_95_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Queue'].quantile(0.95)\n", + "\n", + " return self.audit_report\n", + "\n", + " def chart(self):\n", + " \"\"\"\n", + " This method is called at end of run. It plots beds occupancy over the\n", + " model run, with 5%, 50% and 95% percentiles.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " # Plot occupied beds\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'],\n", + " color='k',\n", + " marker='o',\n", + " linestyle='solid',\n", + " markevery=1,\n", + " label='Occupied beds')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Beds_5_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " markevery=1,\n", + " label='5th percentile')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Median_beds'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashed',\n", + " label='Median')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Beds_95_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " label='95th percentile')\n", + "\n", + " plt.xlabel('Day')\n", + " plt.ylabel('Occupied beds')\n", + " plt.title(\n", + " 'Occupied beds (individual days with 5th, 50th and 95th ' +\n", + " 'percentiles)')\n", + " plt.legend()\n", + " plt.show()\n", + " \n", + " \n", + " # Plot occupied icu beds\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'],\n", + " color='k',\n", + " marker='o',\n", + " linestyle='solid',\n", + " markevery=1,\n", + " label='Occupied icu beds')\n", + " \n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Beds_5_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " markevery=1,\n", + " label='5th percentile')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Median_beds'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashed',\n", + " label='Median')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Beds_95_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " label='95th percentile')\n", + " \n", + " plt.xlabel('Day')\n", + " plt.ylabel('Occupied icu beds')\n", + " plt.title(\n", + " 'Occupied icu beds (individual days with 5th, 50th and 95th ' +\n", + " 'percentiles)')\n", + " plt.legend()\n", + " plt.show()\n", + " \n", + "\n", + " # Plot queue for beds\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Queue'],\n", + " color='k',\n", + " marker='o',\n", + " linestyle='solid',\n", + " markevery=1, label='Occupied beds')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Queue_5_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " markevery=1,\n", + " label='5th percentile')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Median_queue'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashed',\n", + " label='Median')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Queue_95_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " label='95th percentile')\n", + "\n", + " plt.xlabel('Day')\n", + " plt.ylabel('Queue for beds')\n", + " plt.title('Queue for beds (individual days with 5th, 50th and 95th' +\n", + " ' percentiles)')\n", + " plt.legend()\n", + " plt.show()\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 4, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Model:\n", + " \"\"\"\n", + " The main model class.\n", + "\n", + " The model class contains the model environment. The modelling environment\n", + " is set up, and patient arrival and audit processes initiated. Patient\n", + " arrival triggers a spell for that patient in hospital. Arrivals and audit\n", + " continue for the duration of the model run. The audit is then \n", + " summarised and bed occupancy (with 5th, 50th and 95th percentiles) plotted.\n", + "\n", + " Methods are:\n", + "\n", + " __init__: Set up model instance\n", + "\n", + " audit_beds: call for bed audit at regular intervals (after initial delay \n", + " for model warm-up)\n", + "\n", + " new_admission: trigger new admissions to hospital at regular intervals.\n", + " Call for patient generation with patient id and length of stay, then call\n", + " for patient spell in hospital.\n", + "\n", + " run: Controls the main model run. Initialises model and patient arrival and\n", + " audit processes. Instigates the run. At end of run calls for an audit\n", + " summary and bed occupancy plot.\n", + "\n", + " spell_gen: stores patient in hospital patient list and bed queue \n", + " dictionaries, waits for bed resource to become available, then removes \n", + " patient from bed queue dictionary and adds patient to hospital bed \n", + " dictionary and increments beds occupied. Waits for the patient length of\n", + " stay in the hospital and then decrements beds occupied and removes patient\n", + " from hospital patient dictionary and beds occupied dictionary.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self):\n", + " \"\"\"\n", + " Constructor class for new model.\n", + " \"\"\"\n", + " self.env = simpy.Environment()\n", + "\n", + " return\n", + "\n", + " def audit_beds(self, delay):\n", + " \"\"\"\n", + " Bed audit process. Begins by applying delay, then calls for audit at\n", + " intervals set in g.audit_interval\n", + "\n", + " :param delay: delay (days) at start of model run for model warm-up.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " # Delay first audit\n", + " yield self.env.timeout(delay)\n", + "\n", + " # Continually generate audit requests until end of model run\n", + " while True:\n", + " # Call audit (pass simulation time to hospital.audit)\n", + " self.hospital.audit(self.env.now)\n", + " # Delay until next call\n", + " yield self.env.timeout(g.audit_interval)\n", + "\n", + " return\n", + "\n", + " def new_admission(self, interarrival_time, los, los_uti):\n", + " \"\"\"\n", + " New admissions to hospital.\n", + "\n", + " :param interarrival_time: average time (days) between arrivals\n", + " :param los: average length of stay (days)\n", + " \"\"\"\n", + " while True:\n", + " # Increment hospital admissions count\n", + " self.hospital.admissions += 1\n", + "\n", + " # Generate new patient object (from Patient class). Give patient id\n", + " # and set length of stay from inverse exponential distribution).\n", + " p = Patient(patient_id=self.hospital.admissions,\n", + " los=random.expovariate(1 / los),\n", + " los_uti=random.expovariate(1 / los_uti))\n", + " print('Patient %d arriving %7.2f, admissions count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.admissions))\n", + "\n", + " # Add patient to hospital patient dictionary\n", + " self.hospital.patients[p.id] = p\n", + "\n", + " # Generate a patient spell in hospital (by calling spell method).\n", + " # This triggers a patient admission and allows the next arrival to\n", + " # be set before the paitent spell is finished\n", + " self.spell = self.spell_gen(p)\n", + " self.env.process(self.spell)\n", + "\n", + " # Set and call delay before looping back to new patient admission\n", + " next_admission = random.expovariate(1 / interarrival_time)\n", + " #print('Next patient in %f3.2' %next_admission)\n", + " yield self.env.timeout(next_admission)\n", + "\n", + " return\n", + "\n", + " def spell_gen(self, p):\n", + " \"\"\"\n", + " Patient hospital stay generator. Increment bed count, wait for patient\n", + " length of stay to complete, then decrement bed count and remove patient\n", + " from hospital patient dictionary\n", + "\n", + " :param p: patient object (contains length of stay for patient)\n", + " \"\"\"\n", + " # The following 'with' defines the required resources and automatically\n", + " # releases resources when no longer required\n", + " \n", + " # screening - bed or icu bed\n", + " is_icu = 1 if random.uniform(0, 1) > (1-g.icu_rate) else 0\n", + " \n", + " # bed\n", + " if is_icu == 0:\n", + " \n", + " with self.resources.beds.request() as req:\n", + " # Increment queue count\n", + " self.hospital.queue_count += 1\n", + " print('Patient %d arriving queue %7.2f, queue count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_count))\n", + "\n", + " # Add patient to dictionary of queuing patients. This is not used\n", + " # further in this model.\n", + " self.hospital.patients_in_queue[p.id] = p\n", + "\n", + " # Yield resource request. Sim continues after yield when resources\n", + " # are vailable (so there is no delay if resources are immediately\n", + " # available)\n", + " yield req\n", + "\n", + " # Resource now available. Remove from queue count and dictionary of\n", + " # queued objects\n", + " self.hospital.queue_count -= 1\n", + " del self.hospital.patients_in_queue[p.id]\n", + " print('Patient %d leaving queue %7.2f, queue count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_count))\n", + "\n", + " # Add to count of patients in beds and to dictionary of patients in\n", + " # beds\n", + " self.hospital.patients_in_beds[p.id] = p\n", + " self.hospital.bed_count += 1\n", + " print('Patient %d arriving bed %7.2f, bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_count))\n", + "\n", + " # Trigger length of stay delay\n", + " yield self.env.timeout(p.los)\n", + "\n", + " # Length of stay complete. Remove patient from counts and\n", + " # dictionaries\n", + " self.hospital.bed_count -= 1\n", + " print('Patient %d leaving bed %7.2f, bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_count))\n", + " del self.hospital.patients_in_beds[p.id]\n", + " \n", + " # needs icu\n", + " after_is_icu = 1 if random.uniform(0, 1) > (1-g.icu_after_bed) else 0\n", + " \n", + " if after_is_icu == 1:\n", + " \n", + " with self.resources_icu.icu_beds.request() as icu_req:\n", + " \n", + " # Increment queue count\n", + " self.hospital.bed_count += 1\n", + " print('Patient %d waiting icu %7.2f, bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_count))\n", + " \n", + " # Add patient to dictionary of icu queuing patients. This is not used\n", + " # further in this model.\n", + " self.hospital.patients_in_beds[p.id] = p\n", + " \n", + " # Yield resource request. Sim continues after yield when resources\n", + " # are vailable (so there is no delay if resources are immediately\n", + " # available)\n", + " yield icu_req\n", + " \n", + " # Resource now available. Remove from queue count and dictionary of\n", + " # queued objects\n", + " self.hospital.bed_count -= 1\n", + " del self.hospital.patients_in_beds[p.id]\n", + " print('Patient %d leaving bed %7.2f, queue bed %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_count))\n", + " \n", + " # Add to count of patients in icu beds and to dictionary of patients in\n", + " # icu beds\n", + " self.hospital.patients_in_icu_beds[p.id] = p\n", + " self.hospital.bed_icu_count += 1\n", + " print('Patient %d arriving icu bed %7.2f, icu bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_icu_count))\n", + " \n", + " # Trigger length of stay delay\n", + " yield self.env.timeout(p.los_uti)\n", + " \n", + " # Length of stay complete. Remove patient from counts and\n", + " # dictionaries\n", + " self.hospital.bed_icu_count -= 1\n", + " print('Patient %d leaving icu bed %7.2f, icu bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_icu_count))\n", + " del self.hospital.patients_in_icu_beds[p.id]\n", + " del self.hospital.patients[p.id]\n", + " \n", + " # icu bed\n", + " else:\n", + " \n", + " with self.resources_icu.icu_beds.request() as icu_req:\n", + " \n", + " # Increment queue count\n", + " self.hospital.queue_count += 1\n", + " print('Patient %d arriving queue %7.2f, queue count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_count))\n", + " \n", + " # Add patient to dictionary of icu queuing patients. This is not used\n", + " # further in this model.\n", + " self.hospital.patients_in_queue[p.id] = p\n", + " \n", + " # Yield resource request. Sim continues after yield when resources\n", + " # are vailable (so there is no delay if resources are immediately\n", + " # available)\n", + " yield icu_req\n", + " \n", + " # Resource now available. Remove from queue count and dictionary of\n", + " # queued objects\n", + " self.hospital.queue_count -= 1\n", + " del self.hospital.patients_in_queue[p.id]\n", + " print('Patient %d leaving queue %7.2f, queue count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_count))\n", + " \n", + " # Add to count of patients in icu beds and to dictionary of patients in\n", + " # icu beds\n", + " self.hospital.patients_in_icu_beds[p.id] = p\n", + " self.hospital.bed_icu_count += 1\n", + " print('Patient %d arriving icu bed %7.2f, icu bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_icu_count))\n", + " \n", + " # Trigger length of stay delay\n", + " yield self.env.timeout(p.los_uti)\n", + " \n", + " # Length of stay complete. Remove patient from counts and\n", + " # dictionaries\n", + " self.hospital.bed_icu_count -= 1\n", + " print('Patient %d leaving icu bed %7.2f, icu bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_icu_count))\n", + " del self.hospital.patients_in_icu_beds[p.id]\n", + " del self.hospital.patients[p.id]\n", + "\n", + " return\n", + " \n", + " def run(self):\n", + " \"\"\"\n", + " Controls the main model run. Initialises model and patient arrival and\n", + " audit processes. Instigates the run. At end of run calls for an audit\n", + " summary and bed occupancy plot\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " # Set up hospital (calling Hospital class)\n", + " self.hospital = Hospital()\n", + "\n", + " # Set up resources (beds, icu_beds)\n", + " self.resources = Resources(self.env, g.beds)\n", + " self.resources_icu = Resources_ICU(self.env, g.icu_beds)\n", + "\n", + " # Set up starting processes: new admissions and bed audit (with delay)\n", + " self.env.process(self.new_admission(g.inter_arrival_time, g.los, g.los_uti))\n", + " self.env.process(self.audit_beds(delay=20))\n", + "\n", + " # Start model run\n", + " self.env.run(until=g.sim_duration)\n", + "\n", + " # At end of run call for bed audit summary and bed occupancy plot\n", + " self.hospital.build_audit_report()\n", + " #self.hospital.chart()\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 5, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Patient:\n", + " \"\"\"\n", + " Patient class. Contains patient id and length of stay (it could contain\n", + " other info about patient, such as priority or clinical group.\n", + "\n", + " The only method is __init__ for creating a patient (with assignment of\n", + " patient id and length of stay).\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self, patient_id, los, los_uti):\n", + " \"\"\"\n", + " Contructor for new patient.\n", + "\n", + " :param patient_id: id of patient (set in self.new_admission)\n", + " :param los: length of stay (days, set in self.new_admission)\n", + " \"\"\"\n", + " self.id = patient_id\n", + " self.los = los\n", + " self.los_uti = los_uti\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 6, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Resources:\n", + " \"\"\"\n", + " Holds beds resources\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self, env, number_of_beds):\n", + " \"\"\" Constructor method to initialise beds resource)\"\"\"\n", + " self.beds = simpy.Resource(env, capacity=number_of_beds)\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 7, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Resources_ICU:\n", + " \"\"\"\n", + " Holds icu beds resources\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self, env, number_of_icu_beds):\n", + " \"\"\" Constructor method to initialise icu beds resource)\"\"\"\n", + " self.icu_beds = simpy.Resource(env, capacity=number_of_icu_beds)\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 8, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "def main():\n", + " \"\"\"\n", + " Code entry point after: if __name__ == '__main__'\n", + " Creates model object, and runs model\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " model = Model()\n", + " model.run()\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 9, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "## Code entry point. Calls main method.\n", + "#if __name__ == '__main__':\n", + "# main()" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 10, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "model = Model()" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 11, + "metadata": { + "scrolled": true + }, + "outputs": [ + { + "name": "stdout", + "output_type": "stream", + "text": [ + "Patient 1 arriving 0.00, admissions count 1\n", + "Patient 1 arriving queue 0.00, queue count 1\n", + "Patient 1 leaving queue 0.00, queue count 0\n", + "Patient 1 arriving bed 0.00, bed count 1\n", + "Patient 2 arriving 0.01, admissions count 2\n", + "Patient 2 arriving queue 0.01, queue count 1\n", + "Patient 2 leaving queue 0.01, queue count 0\n", + "Patient 2 arriving bed 0.01, bed count 2\n", + "Patient 3 arriving 0.02, admissions count 3\n", + "Patient 3 arriving queue 0.02, queue count 1\n", + "Patient 3 leaving queue 0.02, queue count 0\n", + "Patient 3 arriving bed 0.02, bed count 3\n", + "Patient 4 arriving 0.03, admissions count 4\n", + "Patient 4 arriving queue 0.03, queue count 1\n", + "Patient 4 leaving queue 0.03, queue count 0\n", + "Patient 4 arriving bed 0.03, bed count 4\n", + "Patient 5 arriving 0.04, admissions count 5\n", + "Patient 5 arriving queue 0.04, queue count 1\n", + "Patient 5 leaving queue 0.04, queue count 0\n", + "Patient 5 arriving bed 0.04, bed count 5\n", + "Patient 6 arriving 0.05, admissions count 6\n", + "Patient 6 arriving queue 0.05, queue count 1\n", + "Patient 6 leaving queue 0.05, queue count 0\n", + "Patient 6 arriving bed 0.05, bed count 6\n", + "Patient 7 arriving 0.08, admissions count 7\n", + "Patient 7 arriving queue 0.08, queue count 1\n", + "Patient 7 leaving queue 0.08, queue count 0\n", + "Patient 7 arriving icu bed 0.08, icu bed count 1\n", + "Patient 8 arriving 0.10, admissions count 8\n", + "Patient 8 arriving queue 0.10, queue count 1\n", + "Patient 8 leaving queue 0.10, queue count 0\n", + "Patient 8 arriving bed 0.10, bed count 7\n", + "Patient 9 arriving 0.10, admissions count 9\n", + "Patient 9 arriving queue 0.10, queue count 1\n", + "Patient 9 leaving queue 0.10, queue count 0\n", + "Patient 9 arriving bed 0.10, bed count 8\n", + "Patient 10 arriving 0.17, admissions count 10\n", + "Patient 10 arriving queue 0.17, queue count 1\n", + "Patient 10 leaving queue 0.17, queue count 0\n", + "Patient 10 arriving icu bed 0.17, icu bed count 2\n", + "Patient 11 arriving 0.24, admissions count 11\n", + "Patient 11 arriving queue 0.24, queue count 1\n", + "Patient 11 leaving queue 0.24, queue count 0\n", + "Patient 11 arriving bed 0.24, bed count 9\n", + "Patient 12 arriving 0.26, admissions count 12\n", + "Patient 12 arriving queue 0.26, queue count 1\n", + "Patient 12 leaving queue 0.26, queue count 0\n", + "Patient 12 arriving bed 0.26, bed count 10\n", + "Patient 13 arriving 0.29, admissions count 13\n", + "Patient 13 arriving queue 0.29, queue count 1\n", + "Patient 13 leaving queue 0.29, queue count 0\n", + "Patient 13 arriving bed 0.29, bed count 11\n", + "Patient 14 arriving 0.30, admissions count 14\n", + "Patient 14 arriving queue 0.30, queue count 1\n", + "Patient 14 leaving queue 0.30, queue count 0\n", + "Patient 14 arriving bed 0.30, bed count 12\n", + "Patient 15 arriving 0.34, admissions count 15\n", + "Patient 15 arriving queue 0.34, queue count 1\n", + "Patient 15 leaving queue 0.34, queue count 0\n", + "Patient 15 arriving bed 0.34, bed count 13\n", + "Patient 16 arriving 0.34, admissions count 16\n", + "Patient 16 arriving queue 0.34, queue count 1\n", + "Patient 16 leaving queue 0.34, queue count 0\n", + "Patient 16 arriving icu bed 0.34, icu bed count 3\n", + "Patient 17 arriving 0.34, admissions count 17\n", + "Patient 17 arriving queue 0.34, queue count 1\n", + "Patient 17 leaving queue 0.34, queue count 0\n", + "Patient 17 arriving bed 0.34, bed count 14\n", + "Patient 10 leaving icu bed 0.35, icu bed count 2\n", + "Patient 18 arriving 0.37, admissions count 18\n", + 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count 480\n", + "Patient 311 leaving bed 65.92, bed count 479\n", + "Patient 2673 leaving queue 65.92, queue count 5\n", + "Patient 2673 arriving bed 65.92, bed count 480\n", + "Patient 2373 leaving bed 65.94, bed count 479\n", + "Patient 2373 waiting icu 65.94, bed count 480\n", + "Patient 2373 leaving bed 65.94, queue bed 479\n", + "Patient 2373 arriving icu bed 65.94, icu bed count 38\n", + "Patient 2674 leaving queue 65.94, queue count 4\n", + "Patient 2674 arriving bed 65.94, bed count 480\n", + "Patient 2496 leaving bed 65.94, bed count 479\n", + "Patient 2677 leaving queue 65.94, queue count 3\n", + "Patient 2677 arriving bed 65.94, bed count 480\n", + "Patient 2681 arriving 65.98, admissions count 2681\n", + "Patient 2681 arriving queue 65.98, queue count 4\n", + "Patient 2340 leaving bed 66.00, bed count 479\n", + "Patient 2678 leaving queue 66.00, queue count 3\n", + "Patient 2678 arriving bed 66.00, bed count 480\n", + "Patient 2682 arriving 66.02, admissions count 2682\n", + "Patient 2682 arriving queue 66.02, queue count 4\n", + "Patient 2683 arriving 66.02, admissions count 2683\n", + "Patient 2683 arriving queue 66.02, queue count 5\n", + "Patient 2088 leaving bed 66.05, bed count 479\n", + "Patient 2088 waiting icu 66.05, bed count 480\n", + "Patient 2088 leaving bed 66.05, queue bed 479\n", + "Patient 2088 arriving icu bed 66.05, icu bed count 39\n", + "Patient 2679 leaving queue 66.05, queue count 4\n", + "Patient 2679 arriving bed 66.05, bed count 480\n", + "Patient 2684 arriving 66.07, admissions count 2684\n", + "Patient 2684 arriving queue 66.07, queue count 5\n", + "Patient 2362 leaving bed 66.10, bed count 479\n", + "Patient 2680 leaving queue 66.10, queue count 4\n", + "Patient 2680 arriving bed 66.10, bed count 480\n", + "Patient 2685 arriving 66.12, admissions count 2685\n", + "Patient 2685 arriving queue 66.12, queue count 5\n", + "Patient 2544 leaving bed 66.13, bed count 479\n", + "Patient 2681 leaving queue 66.13, queue count 4\n", + 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"Patient 2685 leaving queue 66.18, queue count 3\n", + "Patient 2685 arriving bed 66.18, bed count 480\n", + "Patient 2689 arriving 66.19, admissions count 2689\n", + "Patient 2689 arriving queue 66.19, queue count 4\n", + "Patient 2576 leaving bed 66.22, bed count 479\n", + "Patient 2686 leaving queue 66.22, queue count 3\n", + "Patient 2686 arriving bed 66.22, bed count 480\n", + "Patient 2690 arriving 66.22, admissions count 2690\n", + "Patient 2690 arriving queue 66.22, queue count 4\n", + "Patient 1580 leaving bed 66.24, bed count 479\n", + "Patient 2687 leaving queue 66.24, queue count 3\n", + "Patient 2687 arriving bed 66.24, bed count 480\n", + "Patient 2440 leaving bed 66.24, bed count 479\n", + "Patient 2688 leaving queue 66.24, queue count 2\n", + "Patient 2688 arriving bed 66.24, bed count 480\n", + "Patient 2588 leaving bed 66.29, bed count 479\n", + "Patient 2689 leaving queue 66.29, queue count 1\n", + "Patient 2689 arriving bed 66.29, bed count 480\n", + "Patient 2691 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"Patient 2698 arriving queue 66.45, queue count 3\n", + "Patient 1624 leaving bed 66.49, bed count 479\n", + "Patient 1624 waiting icu 66.49, bed count 480\n", + "Patient 1624 leaving bed 66.49, queue bed 479\n", + "Patient 1624 arriving icu bed 66.49, icu bed count 36\n", + "Patient 2696 leaving queue 66.49, queue count 2\n", + "Patient 2696 arriving bed 66.49, bed count 480\n", + "Patient 2025 leaving bed 66.50, bed count 479\n", + "Patient 2025 waiting icu 66.50, bed count 480\n", + "Patient 2025 leaving bed 66.50, queue bed 479\n", + "Patient 2025 arriving icu bed 66.50, icu bed count 37\n", + "Patient 2697 leaving queue 66.50, queue count 1\n", + "Patient 2697 arriving bed 66.50, bed count 480\n", + "Patient 2699 arriving 66.51, admissions count 2699\n", + "Patient 2699 arriving queue 66.51, queue count 2\n", + "Patient 2127 leaving bed 66.52, bed count 479\n", + "Patient 2698 leaving queue 66.52, queue count 1\n", + "Patient 2698 arriving bed 66.52, bed count 480\n", + "Patient 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arriving bed 70.79, bed count 480\n", + "Patient 2896 arriving 70.79, admissions count 2896\n", + "Patient 2896 arriving queue 70.79, queue count 23\n", + "Patient 2896 leaving queue 70.79, queue count 22\n", + "Patient 2896 arriving icu bed 70.79, icu bed count 45\n", + "Patient 2798 leaving bed 70.80, bed count 479\n", + "Patient 2873 leaving queue 70.80, queue count 21\n", + "Patient 2873 arriving bed 70.80, bed count 480\n", + "Patient 2897 arriving 70.81, admissions count 2897\n", + "Patient 2897 arriving queue 70.81, queue count 22\n", + "Patient 2898 arriving 70.83, admissions count 2898\n", + "Patient 2898 arriving queue 70.83, queue count 23\n", + "Patient 2899 arriving 70.83, admissions count 2899\n", + "Patient 2899 arriving queue 70.83, queue count 24\n", + "Patient 2332 leaving bed 70.84, bed count 479\n", + "Patient 2874 leaving queue 70.84, queue count 23\n", + "Patient 2874 arriving bed 70.84, bed count 480\n", + "Patient 2221 leaving bed 70.84, bed count 479\n", + "Patient 2875 leaving queue 70.84, queue count 22\n", + "Patient 2875 arriving bed 70.84, bed count 480\n", + "Patient 2900 arriving 70.85, admissions count 2900\n", + "Patient 2900 arriving queue 70.85, queue count 23\n", + "Patient 2900 leaving queue 70.85, queue count 22\n", + "Patient 2900 arriving icu bed 70.85, icu bed count 46\n", + "Patient 2704 leaving icu bed 70.85, icu bed count 45\n", + "Patient 2901 arriving 70.87, admissions count 2901\n", + "Patient 2901 arriving queue 70.87, queue count 23\n", + "Patient 1195 leaving bed 70.87, bed count 479\n", + "Patient 2876 leaving queue 70.87, queue count 22\n", + "Patient 2876 arriving bed 70.87, bed count 480\n", + "Patient 2902 arriving 70.88, admissions count 2902\n", + "Patient 2902 arriving queue 70.88, queue count 23\n", + "Patient 2167 leaving bed 70.90, bed count 479\n", + "Patient 2877 leaving queue 70.90, queue count 22\n", + "Patient 2877 arriving bed 70.90, bed count 480\n", + "Patient 2903 arriving 70.91, admissions count 2903\n", + "Patient 2903 arriving queue 70.91, queue count 23\n", + "Patient 1316 leaving bed 70.93, bed count 479\n", + "Patient 2878 leaving queue 70.93, queue count 22\n", + "Patient 2878 arriving bed 70.93, bed count 480\n", + "Patient 2904 arriving 70.93, admissions count 2904\n", + "Patient 2904 arriving queue 70.93, queue count 23\n", + "Patient 2585 leaving icu bed 70.95, icu bed count 44\n", + "Patient 2905 arriving 70.97, admissions count 2905\n", + "Patient 2905 arriving queue 70.97, queue count 24\n", + "Patient 2906 arriving 70.99, admissions count 2906\n", + "Patient 2906 arriving queue 70.99, queue count 25\n", + "Patient 2052 leaving icu bed 71.00, icu bed count 43\n", + "Patient 2907 arriving 71.03, admissions count 2907\n", + "Patient 2907 arriving queue 71.03, queue count 26\n", + "Patient 2850 leaving bed 71.04, bed count 479\n", + "Patient 2879 leaving queue 71.04, queue count 25\n", + "Patient 2879 arriving bed 71.04, bed count 480\n", + "Patient 2908 arriving 71.05, admissions count 2908\n", + "Patient 2908 arriving queue 71.05, queue count 26\n", + "Patient 2734 leaving icu bed 71.06, icu bed count 42\n", + "Patient 2780 leaving bed 71.09, bed count 479\n", + "Patient 2780 waiting icu 71.09, bed count 480\n", + "Patient 2780 leaving bed 71.09, queue bed 479\n", + "Patient 2780 arriving icu bed 71.09, icu bed count 43\n", + "Patient 2881 leaving queue 71.09, queue count 25\n", + "Patient 2881 arriving bed 71.09, bed count 480\n", + "Patient 2553 leaving bed 71.09, bed count 479\n", + "Patient 2882 leaving queue 71.09, queue count 24\n", + "Patient 2882 arriving bed 71.09, bed count 480\n", + "Patient 2909 arriving 71.12, admissions count 2909\n", + "Patient 2909 arriving queue 71.12, queue count 25\n", + "Patient 2783 leaving bed 71.12, bed count 479\n", + "Patient 2883 leaving queue 71.12, queue count 24\n", + "Patient 2883 arriving bed 71.12, bed count 480\n", + "Patient 2648 leaving bed 71.13, bed count 479\n", + "Patient 2884 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arriving bed 71.23, bed count 480\n", + "Patient 1298 leaving bed 71.24, bed count 479\n", + "Patient 1298 waiting icu 71.24, bed count 480\n", + "Patient 1298 leaving bed 71.24, queue bed 479\n", + "Patient 1298 arriving icu bed 71.24, icu bed count 43\n", + "Patient 2889 leaving queue 71.24, queue count 20\n", + "Patient 2889 arriving bed 71.24, bed count 480\n", + "Patient 1624 leaving icu bed 71.24, icu bed count 42\n", + "Patient 2912 arriving 71.27, admissions count 2912\n", + "Patient 2912 arriving queue 71.27, queue count 21\n", + "Patient 2913 arriving 71.29, admissions count 2913\n", + "Patient 2913 arriving queue 71.29, queue count 22\n", + "Patient 2914 arriving 71.29, admissions count 2914\n", + "Patient 2914 arriving queue 71.29, queue count 23\n", + "Patient 2597 leaving bed 71.29, bed count 479\n", + "Patient 2890 leaving queue 71.29, queue count 22\n", + "Patient 2890 arriving bed 71.29, bed count 480\n", + "Patient 2915 arriving 71.31, admissions count 2915\n", + "Patient 2915 arriving queue 71.31, queue count 23\n", + "Patient 2664 leaving bed 71.33, bed count 479\n", + "Patient 2891 leaving queue 71.33, queue count 22\n", + "Patient 2891 arriving bed 71.33, bed count 480\n", + "Patient 2916 arriving 71.33, admissions count 2916\n", + "Patient 2916 arriving queue 71.33, queue count 23\n", + "Patient 1477 leaving bed 71.33, bed count 479\n", + "Patient 1477 waiting icu 71.33, bed count 480\n", + "Patient 1477 leaving bed 71.33, queue bed 479\n", + "Patient 1477 arriving icu bed 71.33, icu bed count 43\n", + "Patient 2892 leaving queue 71.33, queue count 22\n", + "Patient 2892 arriving bed 71.33, bed count 480\n", + "Patient 2917 arriving 71.33, admissions count 2917\n", + "Patient 2917 arriving queue 71.33, queue count 23\n", + "Patient 2868 leaving bed 71.33, bed count 479\n", + "Patient 2893 leaving queue 71.33, queue count 22\n", + "Patient 2893 arriving bed 71.33, bed count 480\n", + "Patient 2860 leaving icu bed 71.34, icu bed count 42\n", 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admissions count 2920\n", + "Patient 2920 arriving queue 71.50, queue count 22\n", + "Patient 2071 leaving bed 71.51, bed count 479\n", + "Patient 2897 leaving queue 71.51, queue count 21\n", + "Patient 2897 arriving bed 71.51, bed count 480\n", + "Patient 2013 leaving icu bed 71.51, icu bed count 41\n", + "Patient 2921 arriving 71.53, admissions count 2921\n", + "Patient 2921 arriving queue 71.53, queue count 22\n", + "Patient 2641 leaving bed 71.56, bed count 479\n", + "Patient 2898 leaving queue 71.56, queue count 21\n", + "Patient 2898 arriving bed 71.56, bed count 480\n", + "Patient 2922 arriving 71.56, admissions count 2922\n", + "Patient 2922 arriving queue 71.56, queue count 22\n", + "Patient 2923 arriving 71.57, admissions count 2923\n", + "Patient 2923 arriving queue 71.57, queue count 23\n", + "Patient 2488 leaving bed 71.59, bed count 479\n", + "Patient 2899 leaving queue 71.59, queue count 22\n", + "Patient 2899 arriving bed 71.59, bed count 480\n", + "Patient 2924 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count 480\n", + "Patient 1298 leaving icu bed 73.82, icu bed count 29\n", + "Patient 2836 leaving bed 73.83, bed count 479\n", + "Patient 2968 leaving queue 73.83, queue count 46\n", + "Patient 2968 arriving bed 73.83, bed count 480\n", + "Patient 2596 leaving bed 73.83, bed count 479\n", + "Patient 2969 leaving queue 73.83, queue count 45\n", + "Patient 2969 arriving bed 73.83, bed count 480\n", + "Patient 3018 arriving 73.84, admissions count 3018\n", + "Patient 3018 arriving queue 73.84, queue count 46\n", + "Patient 2089 leaving bed 73.85, bed count 479\n", + "Patient 2970 leaving queue 73.85, queue count 45\n", + "Patient 2970 arriving bed 73.85, bed count 480\n", + "Patient 3019 arriving 73.87, admissions count 3019\n", + "Patient 3019 arriving queue 73.87, queue count 46\n", + "Patient 3020 arriving 73.87, admissions count 3020\n", + "Patient 3020 arriving queue 73.87, queue count 47\n", + "Patient 3021 arriving 73.87, admissions count 3021\n", + "Patient 3021 arriving queue 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count 479\n", + "Patient 3067 leaving queue 76.22, queue count 44\n", + "Patient 3067 arriving bed 76.22, bed count 480\n", + "Patient 2158 leaving bed 76.23, bed count 479\n", + "Patient 3068 leaving queue 76.23, queue count 43\n", + "Patient 3068 arriving bed 76.23, bed count 480\n", + "Patient 2983 leaving bed 76.24, bed count 479\n", + "Patient 3069 leaving queue 76.24, queue count 42\n", + "Patient 3069 arriving bed 76.24, bed count 480\n", + "Patient 3116 arriving 76.24, admissions count 3116\n", + "Patient 3116 arriving queue 76.24, queue count 43\n", + "Patient 3116 leaving queue 76.24, queue count 42\n", + "Patient 3116 arriving icu bed 76.24, icu bed count 33\n", + "Patient 3117 arriving 76.26, admissions count 3117\n", + "Patient 3117 arriving queue 76.26, queue count 43\n", + "Patient 2279 leaving bed 76.26, bed count 479\n", + "Patient 3070 leaving queue 76.26, queue count 42\n", + "Patient 3070 arriving bed 76.26, bed count 480\n", + "Patient 2467 leaving bed 76.28, bed count 479\n", + "Patient 3071 leaving queue 76.28, queue count 41\n", + "Patient 3071 arriving bed 76.28, bed count 480\n", + "Patient 3118 arriving 76.29, admissions count 3118\n", + "Patient 3118 arriving queue 76.29, queue count 42\n", + "Patient 3119 arriving 76.31, admissions count 3119\n", + "Patient 3119 arriving queue 76.31, queue count 43\n", + "Patient 3120 arriving 76.32, admissions count 3120\n", + "Patient 3120 arriving queue 76.32, queue count 44\n", + "Patient 3121 arriving 76.37, admissions count 3121\n", + "Patient 3121 arriving queue 76.37, queue count 45\n", + "Patient 3121 leaving queue 76.37, queue count 44\n", + "Patient 3121 arriving icu bed 76.37, icu bed count 34\n", + "Patient 2702 leaving bed 76.37, bed count 479\n", + "Patient 3072 leaving queue 76.37, queue count 43\n", + "Patient 3072 arriving bed 76.37, bed count 480\n", + "Patient 3122 arriving 76.38, admissions count 3122\n", + "Patient 3122 arriving queue 76.38, queue count 44\n", + "Patient 3123 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"Patient 3222 arriving queue 78.81, queue count 55\n", + "Patient 3223 arriving 78.84, admissions count 3223\n", + "Patient 3223 arriving queue 78.84, queue count 56\n", + "Patient 3223 leaving queue 78.84, queue count 55\n", + "Patient 3223 arriving icu bed 78.84, icu bed count 33\n", + "Patient 3224 arriving 78.84, admissions count 3224\n", + "Patient 3224 arriving queue 78.84, queue count 56\n", + "Patient 2226 leaving icu bed 78.84, icu bed count 32\n", + "Patient 3225 arriving 78.87, admissions count 3225\n", + "Patient 3225 arriving queue 78.87, queue count 57\n", + "Patient 2494 leaving bed 78.88, bed count 479\n", + "Patient 3161 leaving queue 78.88, queue count 56\n", + "Patient 3161 arriving bed 78.88, bed count 480\n", + "Patient 2603 leaving bed 78.89, bed count 479\n", + "Patient 3162 leaving queue 78.89, queue count 55\n", + "Patient 3162 arriving bed 78.89, bed count 480\n", + "Patient 3226 arriving 78.89, admissions count 3226\n", + "Patient 3226 arriving queue 78.89, 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"Patient 3167 arriving bed 79.05, bed count 480\n", + "Patient 3235 arriving 79.06, admissions count 3235\n", + "Patient 3235 arriving queue 79.06, queue count 58\n", + "Patient 3236 arriving 79.09, admissions count 3236\n", + "Patient 3236 arriving queue 79.09, queue count 59\n", + "Patient 2900 leaving icu bed 79.14, icu bed count 32\n", + "Patient 3237 arriving 79.17, admissions count 3237\n", + "Patient 3237 arriving queue 79.17, queue count 60\n", + "Patient 2918 leaving icu bed 79.18, icu bed count 31\n", + "Patient 3238 arriving 79.19, admissions count 3238\n", + "Patient 3238 arriving queue 79.19, queue count 61\n", + "Patient 778 leaving bed 79.19, bed count 479\n", + "Patient 3168 leaving queue 79.19, queue count 60\n", + "Patient 3168 arriving bed 79.19, bed count 480\n", + "Patient 3065 leaving bed 79.20, bed count 479\n", + "Patient 3170 leaving queue 79.20, queue count 59\n", + "Patient 3170 arriving bed 79.20, bed count 480\n", + "Patient 3239 arriving 79.20, admissions count 3239\n", + "Patient 3239 arriving queue 79.20, queue count 60\n", + "Patient 3240 arriving 79.22, admissions count 3240\n", + "Patient 3240 arriving queue 79.22, queue count 61\n", + "Patient 2236 leaving bed 79.25, bed count 479\n", + "Patient 3171 leaving queue 79.25, queue count 60\n", + "Patient 3171 arriving bed 79.25, bed count 480\n", + "Patient 3241 arriving 79.26, admissions count 3241\n", + "Patient 3241 arriving queue 79.26, queue count 61\n", + "Patient 3242 arriving 79.26, admissions count 3242\n", + "Patient 3242 arriving queue 79.26, queue count 62\n", + "Patient 3035 leaving bed 79.28, bed count 479\n", + "Patient 3172 leaving queue 79.28, queue count 61\n", + "Patient 3172 arriving bed 79.28, bed count 480\n", + "Patient 3243 arriving 79.28, admissions count 3243\n", + "Patient 3243 arriving queue 79.28, queue count 62\n", + "Patient 3244 arriving 79.29, admissions count 3244\n", + "Patient 3244 arriving queue 79.29, queue count 63\n", + "Patient 2545 leaving bed 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count 69\n", + "Patient 3296 leaving queue 80.38, queue count 68\n", + "Patient 3296 arriving icu bed 80.38, icu bed count 28\n", + "Patient 2972 leaving bed 80.39, bed count 479\n", + "Patient 3221 leaving queue 80.39, queue count 67\n", + "Patient 3221 arriving bed 80.39, bed count 480\n", + "Patient 3113 leaving bed 80.40, bed count 479\n", + "Patient 3222 leaving queue 80.40, queue count 66\n", + "Patient 3222 arriving bed 80.40, bed count 480\n", + "Patient 3297 arriving 80.40, admissions count 3297\n", + "Patient 3297 arriving queue 80.40, queue count 67\n", + "Patient 3297 leaving queue 80.40, queue count 66\n", + "Patient 3297 arriving icu bed 80.40, icu bed count 29\n", + "Patient 3298 arriving 80.41, admissions count 3298\n", + "Patient 3298 arriving queue 80.41, queue count 67\n", + "Patient 2892 leaving bed 80.44, bed count 479\n", + "Patient 3224 leaving queue 80.44, queue count 66\n", + "Patient 3224 arriving bed 80.44, bed count 480\n", + "Patient 3299 arriving 80.45, 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"Patient 3344 arriving 81.44, admissions count 3344\n", + "Patient 3344 arriving queue 81.44, queue count 63\n", + "Patient 3345 arriving 81.46, admissions count 3345\n", + "Patient 3345 arriving queue 81.46, queue count 64\n", + "Patient 3345 leaving queue 81.46, queue count 63\n", + "Patient 3345 arriving icu bed 81.46, icu bed count 32\n", + "Patient 3220 leaving bed 81.52, bed count 479\n", + "Patient 3274 leaving queue 81.52, queue count 62\n", + "Patient 3274 arriving bed 81.52, bed count 480\n", + "Patient 2451 leaving icu bed 81.52, icu bed count 31\n", + "Patient 3346 arriving 81.54, admissions count 3346\n", + "Patient 3346 arriving queue 81.54, queue count 63\n", + "Patient 3346 leaving queue 81.54, queue count 62\n", + "Patient 3346 arriving icu bed 81.54, icu bed count 32\n", + "Patient 3347 arriving 81.57, admissions count 3347\n", + "Patient 3347 arriving queue 81.57, queue count 63\n", + "Patient 3348 arriving 81.57, admissions count 3348\n", + "Patient 3348 arriving 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leaving queue 83.83, queue count 47\n", + "Patient 3374 arriving bed 83.83, bed count 480\n", + "Patient 3430 arriving 83.84, admissions count 3430\n", + "Patient 3430 arriving queue 83.84, queue count 48\n", + "Patient 3431 arriving 83.86, admissions count 3431\n", + "Patient 3431 arriving queue 83.86, queue count 49\n", + "Patient 3432 arriving 83.87, admissions count 3432\n", + "Patient 3432 arriving queue 83.87, queue count 50\n", + "Patient 3433 arriving 83.89, admissions count 3433\n", + "Patient 3433 arriving queue 83.89, queue count 51\n", + "Patient 3355 leaving bed 83.94, bed count 479\n", + "Patient 3375 leaving queue 83.94, queue count 50\n", + "Patient 3375 arriving bed 83.94, bed count 480\n", + "Patient 1807 leaving bed 83.95, bed count 479\n", + "Patient 3376 leaving queue 83.95, queue count 49\n", + "Patient 3376 arriving bed 83.95, bed count 480\n", + "Patient 3434 arriving 83.96, admissions count 3434\n", + "Patient 3434 arriving queue 83.96, queue count 50\n", + "Patient 3435 arriving 83.98, admissions count 3435\n", + "Patient 3435 arriving queue 83.98, queue count 51\n", + "Patient 3436 arriving 83.98, admissions count 3436\n", + "Patient 3436 arriving queue 83.98, queue count 52\n", + "Patient 2718 leaving bed 83.99, bed count 479\n", + "Patient 3377 leaving queue 83.99, queue count 51\n", + "Patient 3377 arriving bed 83.99, bed count 480\n", + "Patient 2989 leaving bed 84.03, bed count 479\n", + "Patient 3378 leaving queue 84.03, queue count 50\n", + "Patient 3378 arriving bed 84.03, bed count 480\n", + "Patient 2951 leaving bed 84.04, bed count 479\n", + "Patient 3379 leaving queue 84.04, queue count 49\n", + "Patient 3379 arriving bed 84.04, bed count 480\n", + "Patient 3437 arriving 84.04, admissions count 3437\n", + "Patient 3437 arriving queue 84.04, queue count 50\n", + "Patient 3437 leaving queue 84.04, queue count 49\n", + "Patient 3437 arriving icu bed 84.04, icu bed count 38\n", + "Patient 3066 leaving bed 84.05, bed count 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"Patient 3584 arriving queue 87.20, queue count 65\n", + "Patient 3584 leaving queue 87.20, queue count 64\n", + "Patient 3584 arriving icu bed 87.20, icu bed count 37\n", + "Patient 3237 leaving bed 87.21, bed count 479\n", + "Patient 3237 waiting icu 87.21, bed count 480\n", + "Patient 3237 leaving bed 87.21, queue bed 479\n", + "Patient 3237 arriving icu bed 87.21, icu bed count 38\n", + "Patient 3512 leaving queue 87.21, queue count 63\n", + "Patient 3512 arriving bed 87.21, bed count 480\n", + "Patient 3182 leaving bed 87.23, bed count 479\n", + "Patient 3513 leaving queue 87.23, queue count 62\n", + "Patient 3513 arriving bed 87.23, bed count 480\n", + "Patient 3585 arriving 87.24, admissions count 3585\n", + "Patient 3585 arriving queue 87.24, queue count 63\n", + "Patient 3586 arriving 87.26, admissions count 3586\n", + "Patient 3586 arriving queue 87.26, queue count 64\n", + "Patient 2943 leaving icu bed 87.28, icu bed count 37\n", + "Patient 3060 leaving bed 87.28, bed count 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count 61\n", + "Patient 3431 leaving bed 87.34, bed count 479\n", + "Patient 3519 leaving queue 87.34, queue count 60\n", + "Patient 3519 arriving bed 87.34, bed count 480\n", + "Patient 3589 arriving 87.34, admissions count 3589\n", + "Patient 3589 arriving queue 87.34, queue count 61\n", + "Patient 3589 leaving queue 87.34, queue count 60\n", + "Patient 3589 arriving icu bed 87.34, icu bed count 38\n", + "Patient 3590 arriving 87.35, admissions count 3590\n", + "Patient 3590 arriving queue 87.35, queue count 61\n", + "Patient 2925 leaving bed 87.35, bed count 479\n", + "Patient 3520 leaving queue 87.35, queue count 60\n", + "Patient 3520 arriving bed 87.35, bed count 480\n", + "Patient 3303 leaving bed 87.37, bed count 479\n", + "Patient 3521 leaving queue 87.37, queue count 59\n", + "Patient 3521 arriving bed 87.37, bed count 480\n", + "Patient 3591 arriving 87.39, admissions count 3591\n", + "Patient 3591 arriving queue 87.39, queue count 60\n", + "Patient 3591 leaving queue 87.39, queue count 59\n", + "Patient 3591 arriving icu bed 87.39, icu bed count 39\n", + "Patient 3592 arriving 87.41, admissions count 3592\n", + "Patient 3592 arriving queue 87.41, queue count 60\n", + "Patient 3593 arriving 87.42, admissions count 3593\n", + "Patient 3593 arriving queue 87.42, queue count 61\n", + "Patient 3554 leaving icu bed 87.43, icu bed count 38\n", + "Patient 2343 leaving bed 87.45, bed count 479\n", + "Patient 3522 leaving queue 87.45, queue count 60\n", + "Patient 3522 arriving bed 87.45, bed count 480\n", + "Patient 3594 arriving 87.46, admissions count 3594\n", + "Patient 3594 arriving queue 87.46, queue count 61\n", + "Patient 3307 leaving bed 87.46, bed count 479\n", + "Patient 3523 leaving queue 87.46, queue count 60\n", + "Patient 3523 arriving bed 87.46, bed count 480\n", + "Patient 3171 leaving bed 87.46, bed count 479\n", + "Patient 3524 leaving queue 87.46, queue count 59\n", + "Patient 3524 arriving bed 87.46, bed count 480\n", + "Patient 2631 leaving 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87.55, admissions count 3597\n", + "Patient 3597 arriving queue 87.55, queue count 57\n", + "Patient 3114 leaving icu bed 87.56, icu bed count 38\n", + "Patient 3598 arriving 87.58, admissions count 3598\n", + "Patient 3598 arriving queue 87.58, queue count 58\n", + "Patient 3599 arriving 87.60, admissions count 3599\n", + "Patient 3599 arriving queue 87.60, queue count 59\n", + "Patient 3469 leaving bed 87.60, bed count 479\n", + "Patient 3531 leaving queue 87.60, queue count 58\n", + "Patient 3531 arriving bed 87.60, bed count 480\n", + "Patient 3600 arriving 87.61, admissions count 3600\n", + "Patient 3600 arriving queue 87.61, queue count 59\n", + "Patient 3601 arriving 87.63, admissions count 3601\n", + "Patient 3601 arriving queue 87.63, queue count 60\n", + "Patient 3602 arriving 87.63, admissions count 3602\n", + "Patient 3602 arriving queue 87.63, queue count 61\n", + "Patient 3584 leaving icu bed 87.64, icu bed count 37\n", + "Patient 3603 arriving 87.66, admissions count 3603\n", + "Patient 3603 arriving queue 87.66, queue count 62\n", + "Patient 3132 leaving bed 87.66, bed count 479\n", + "Patient 3132 waiting icu 87.66, bed count 480\n", + "Patient 3132 leaving bed 87.66, queue bed 479\n", + "Patient 3132 arriving icu bed 87.66, icu bed count 38\n", + "Patient 3532 leaving queue 87.66, queue count 61\n", + "Patient 3532 arriving bed 87.66, bed count 480\n", + "Patient 3604 arriving 87.68, admissions count 3604\n", + "Patient 3604 arriving queue 87.68, queue count 62\n", + "Patient 3604 leaving queue 87.68, queue count 61\n", + "Patient 3604 arriving icu bed 87.68, icu bed count 39\n", + "Patient 3605 arriving 87.68, admissions count 3605\n", + "Patient 3605 arriving queue 87.68, queue count 62\n", + "Patient 3606 arriving 87.69, admissions count 3606\n", + "Patient 3606 arriving queue 87.69, queue count 63\n", + "Patient 3607 arriving 87.69, admissions count 3607\n", + "Patient 3607 arriving queue 87.69, queue count 64\n", + "Patient 3494 leaving bed 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bed 479\n", + "Patient 3498 arriving icu bed 87.75, icu bed count 40\n", + "Patient 3539 leaving queue 87.75, queue count 59\n", + "Patient 3539 arriving bed 87.75, bed count 480\n", + "Patient 3608 arriving 87.78, admissions count 3608\n", + "Patient 3608 arriving queue 87.78, queue count 60\n", + "Patient 3609 arriving 87.79, admissions count 3609\n", + "Patient 3609 arriving queue 87.79, queue count 61\n", + "Patient 3610 arriving 87.79, admissions count 3610\n", + "Patient 3610 arriving queue 87.79, queue count 62\n", + "Patient 3611 arriving 87.84, admissions count 3611\n", + "Patient 3611 arriving queue 87.84, queue count 63\n", + "Patient 3612 arriving 87.84, admissions count 3612\n", + "Patient 3612 arriving queue 87.84, queue count 64\n", + "Patient 3471 leaving bed 87.87, bed count 479\n", + "Patient 3540 leaving queue 87.87, queue count 63\n", + "Patient 3540 arriving bed 87.87, bed count 480\n", + "Patient 3448 leaving bed 87.87, bed count 479\n", + "Patient 3541 leaving 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"Patient 3759 arriving queue 91.16, queue count 61\n", + "Patient 3398 leaving bed 91.18, bed count 479\n", + "Patient 3690 leaving queue 91.18, queue count 60\n", + "Patient 3690 arriving bed 91.18, bed count 480\n", + "Patient 3760 arriving 91.19, admissions count 3760\n", + "Patient 3760 arriving queue 91.19, queue count 61\n", + "Patient 2290 leaving bed 91.24, bed count 479\n", + "Patient 3691 leaving queue 91.24, queue count 60\n", + "Patient 3691 arriving bed 91.24, bed count 480\n", + "Patient 3518 leaving bed 91.25, bed count 479\n", + "Patient 3518 waiting icu 91.25, bed count 480\n", + "Patient 3518 leaving bed 91.25, queue bed 479\n", + "Patient 3518 arriving icu bed 91.25, icu bed count 45\n", + "Patient 3692 leaving queue 91.25, queue count 59\n", + "Patient 3692 arriving bed 91.25, bed count 480\n", + "Patient 2924 leaving bed 91.25, bed count 479\n", + "Patient 2924 waiting icu 91.25, bed count 480\n", + "Patient 2924 leaving bed 91.25, queue bed 479\n", + "Patient 2924 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"Patient 4109 arriving queue 99.28, queue count 71\n", + "Patient 3658 leaving bed 99.28, bed count 479\n", + "Patient 4031 leaving queue 99.28, queue count 70\n", + "Patient 4031 arriving bed 99.28, bed count 480\n", + "Patient 4110 arriving 99.29, admissions count 4110\n", + "Patient 4110 arriving queue 99.29, queue count 71\n", + "Patient 2574 leaving bed 99.30, bed count 479\n", + "Patient 4034 leaving queue 99.30, queue count 70\n", + "Patient 4034 arriving bed 99.30, bed count 480\n", + "Patient 4111 arriving 99.30, admissions count 4111\n", + "Patient 4111 arriving queue 99.30, queue count 71\n", + "Patient 4112 arriving 99.34, admissions count 4112\n", + "Patient 4112 arriving queue 99.34, queue count 72\n", + "Patient 4113 arriving 99.38, admissions count 4113\n", + "Patient 4113 arriving queue 99.38, queue count 73\n", + "Patient 3991 leaving bed 99.39, bed count 479\n", + "Patient 4036 leaving queue 99.39, queue count 72\n", + "Patient 4036 arriving bed 99.39, bed count 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6908\n", + "Patient 6908 arriving queue 168.29, queue count 65\n", + "Patient 6909 arriving 168.30, admissions count 6909\n", + "Patient 6909 arriving queue 168.30, queue count 66\n", + "Patient 6910 arriving 168.31, admissions count 6910\n", + "Patient 6910 arriving queue 168.31, queue count 67\n", + "Patient 6911 arriving 168.31, admissions count 6911\n", + "Patient 6911 arriving queue 168.31, queue count 68\n", + "Patient 6912 arriving 168.33, admissions count 6912\n", + "Patient 6912 arriving queue 168.33, queue count 69\n", + "Patient 6913 arriving 168.34, admissions count 6913\n", + "Patient 6913 arriving queue 168.34, queue count 70\n", + "Patient 6913 leaving queue 168.34, queue count 69\n", + "Patient 6913 arriving icu bed 168.34, icu bed count 45\n", + "Patient 5038 leaving bed 168.34, bed count 479\n", + "Patient 6831 leaving queue 168.34, queue count 68\n", + "Patient 6831 arriving bed 168.34, bed count 480\n", + "Patient 5554 leaving bed 168.34, bed count 479\n", + 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7559\n", + "Patient 7559 arriving queue 185.55, queue count 7\n", + "Patient 7560 arriving 185.56, admissions count 7560\n", + "Patient 7560 arriving queue 185.56, queue count 8\n", + "Patient 7318 leaving bed 185.57, bed count 479\n", + "Patient 7552 leaving queue 185.57, queue count 7\n", + "Patient 7552 arriving bed 185.57, bed count 480\n", + "Patient 7561 arriving 185.63, admissions count 7561\n", + "Patient 7561 arriving queue 185.63, queue count 8\n", + "Patient 7349 leaving bed 185.64, bed count 479\n", + "Patient 7349 waiting icu 185.64, bed count 480\n", + "Patient 7349 leaving bed 185.64, queue bed 479\n", + "Patient 7349 arriving icu bed 185.64, icu bed count 27\n", + "Patient 7553 leaving queue 185.64, queue count 7\n", + "Patient 7553 arriving bed 185.64, bed count 480\n", + "Patient 7562 arriving 185.66, admissions count 7562\n", + "Patient 7562 arriving queue 185.66, queue count 8\n", + "Patient 7563 arriving 185.68, admissions count 7563\n", + "Patient 7563 arriving 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count 479\n", + "Patient 7420 waiting icu 186.73, bed count 480\n", + "Patient 7420 leaving bed 186.73, queue bed 479\n", + "Patient 7420 arriving icu bed 186.73, icu bed count 24\n", + "Patient 7588 leaving queue 186.73, queue count 12\n", + "Patient 7588 arriving bed 186.73, bed count 480\n", + "Patient 7473 leaving bed 186.74, bed count 479\n", + "Patient 7589 leaving queue 186.74, queue count 11\n", + "Patient 7589 arriving bed 186.74, bed count 480\n", + "Patient 6668 leaving bed 186.75, bed count 479\n", + "Patient 7590 leaving queue 186.75, queue count 10\n", + "Patient 7590 arriving bed 186.75, bed count 480\n", + "Patient 7064 leaving bed 186.76, bed count 479\n", + "Patient 7591 leaving queue 186.76, queue count 9\n", + "Patient 7591 arriving bed 186.76, bed count 480\n", + "Patient 7603 arriving 186.76, admissions count 7603\n", + "Patient 7603 arriving queue 186.76, queue count 10\n", + "Patient 7076 leaving bed 186.77, bed count 479\n", + "Patient 7593 leaving queue 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187.12, bed count 480\n", + "Patient 7615 arriving 187.13, admissions count 7615\n", + "Patient 7615 arriving queue 187.13, queue count 11\n", + "Patient 7616 arriving 187.14, admissions count 7616\n", + "Patient 7616 arriving queue 187.14, queue count 12\n", + "Patient 7617 arriving 187.15, admissions count 7617\n", + "Patient 7617 arriving queue 187.15, queue count 13\n", + "Patient 6772 leaving bed 187.15, bed count 479\n", + "Patient 7605 leaving queue 187.15, queue count 12\n", + "Patient 7605 arriving bed 187.15, bed count 480\n", + "Patient 7618 arriving 187.17, admissions count 7618\n", + "Patient 7618 arriving queue 187.17, queue count 13\n", + "Patient 7619 arriving 187.17, admissions count 7619\n", + "Patient 7619 arriving queue 187.17, queue count 14\n", + "Patient 7398 leaving bed 187.19, bed count 479\n", + "Patient 7606 leaving queue 187.19, queue count 13\n", + "Patient 7606 arriving bed 187.19, bed count 480\n", + "Patient 7534 leaving bed 187.20, bed count 479\n", + 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count 14\n", + "Patient 7627 arriving icu bed 187.27, icu bed count 24\n", + "Patient 7628 arriving 187.28, admissions count 7628\n", + "Patient 7628 arriving queue 187.28, queue count 15\n", + "Patient 7628 leaving queue 187.28, queue count 14\n", + "Patient 7628 arriving icu bed 187.28, icu bed count 25\n", + "Patient 7629 arriving 187.28, admissions count 7629\n", + "Patient 7629 arriving queue 187.28, queue count 15\n", + "Patient 7630 arriving 187.28, admissions count 7630\n", + "Patient 7630 arriving queue 187.28, queue count 16\n", + "Patient 6435 leaving bed 187.30, bed count 479\n", + "Patient 7612 leaving queue 187.30, queue count 15\n", + "Patient 7612 arriving bed 187.30, bed count 480\n", + "Patient 7040 leaving bed 187.34, bed count 479\n", + "Patient 7613 leaving queue 187.34, queue count 14\n", + "Patient 7613 arriving bed 187.34, bed count 480\n", + "Patient 7631 arriving 187.34, admissions count 7631\n", + "Patient 7631 arriving queue 187.34, queue count 15\n", + 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"Patient 9262 arriving queue 227.35, queue count 28\n", + "Patient 8953 leaving bed 227.36, bed count 479\n", + "Patient 9228 leaving queue 227.36, queue count 27\n", + "Patient 9228 arriving bed 227.36, bed count 480\n", + "Patient 8709 leaving bed 227.37, bed count 479\n", + "Patient 8709 waiting icu 227.37, bed count 480\n", + "Patient 8709 leaving bed 227.37, queue bed 479\n", + "Patient 8709 arriving icu bed 227.37, icu bed count 32\n", + "Patient 9229 leaving queue 227.37, queue count 26\n", + "Patient 9229 arriving bed 227.37, bed count 480\n", + "Patient 7587 leaving bed 227.40, bed count 479\n", + "Patient 9230 leaving queue 227.40, queue count 25\n", + "Patient 9230 arriving bed 227.40, bed count 480\n", + "Patient 9263 arriving 227.40, admissions count 9263\n", + "Patient 9263 arriving queue 227.40, queue count 26\n", + "Patient 9223 leaving icu bed 227.41, icu bed count 31\n", + "Patient 8456 leaving bed 227.44, bed count 479\n", + "Patient 9231 leaving queue 227.44, queue 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admissions count 9266\n", + "Patient 9266 arriving queue 227.54, queue count 24\n", + "Patient 9046 leaving bed 227.54, bed count 479\n", + "Patient 9237 leaving queue 227.54, queue count 23\n", + "Patient 9237 arriving bed 227.54, bed count 480\n", + "Patient 8539 leaving bed 227.56, bed count 479\n", + "Patient 9238 leaving queue 227.56, queue count 22\n", + "Patient 9238 arriving bed 227.56, bed count 480\n", + "Patient 8647 leaving bed 227.57, bed count 479\n", + "Patient 9239 leaving queue 227.57, queue count 21\n", + "Patient 9239 arriving bed 227.57, bed count 480\n", + "Patient 9123 leaving bed 227.58, bed count 479\n", + "Patient 9241 leaving queue 227.58, queue count 20\n", + "Patient 9241 arriving bed 227.58, bed count 480\n", + "Patient 9267 arriving 227.59, admissions count 9267\n", + "Patient 9267 arriving queue 227.59, queue count 21\n", + "Patient 9268 arriving 227.60, admissions count 9268\n", + "Patient 9268 arriving queue 227.60, queue count 22\n", + "Patient 8969 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count 24\n", + "Patient 9247 arriving bed 227.68, bed count 480\n", + "Patient 9274 arriving 227.69, admissions count 9274\n", + "Patient 9274 arriving queue 227.69, queue count 25\n", + "Patient 9139 leaving bed 227.69, bed count 479\n", + "Patient 9248 leaving queue 227.69, queue count 24\n", + "Patient 9248 arriving bed 227.69, bed count 480\n", + "Patient 8726 leaving icu bed 227.70, icu bed count 30\n", + "Patient 9234 leaving bed 227.71, bed count 479\n", + "Patient 9249 leaving queue 227.71, queue count 23\n", + "Patient 9249 arriving bed 227.71, bed count 480\n", + "Patient 9007 leaving bed 227.72, bed count 479\n", + "Patient 9250 leaving queue 227.72, queue count 22\n", + "Patient 9250 arriving bed 227.72, bed count 480\n", + "Patient 8559 leaving bed 227.74, bed count 479\n", + "Patient 9251 leaving queue 227.74, queue count 21\n", + "Patient 9251 arriving bed 227.74, bed count 480\n", + "Patient 9275 arriving 227.74, admissions count 9275\n", + "Patient 9275 arriving queue 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CNESIBGEleito_sus_cirurgicosleito_sus_clinicosleito_sus_gineco_obsleito_sus_isolamentoleito_sus_outrasespecleito_sus_pediatricosleito_sus_ucileito_sus_uti
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" + ], + "text/plain": [ + " CNES IBGE leito_sus_cirurgicos leito_sus_clinicos \\\n", + "0 2516500 110001 0 0 \n", + "1 2679477 110001 6 21 \n", + "2 2494280 110002 0 0 \n", + "3 2494299 110002 16 21 \n", + "4 2515504 110002 0 0 \n", + "\n", + " leito_sus_gineco_obs leito_sus_isolamento leito_sus_outrasespec \\\n", + "0 0 0 0 \n", + "1 8 2 0 \n", + "2 0 1 0 \n", + "3 27 0 2 \n", + "4 0 0 0 \n", + "\n", + " leito_sus_pediatricos leito_sus_uci leito_sus_uti \n", + "0 0 0 0 \n", + "1 8 0 0 \n", + "2 30 0 0 \n", + "3 1 0 0 \n", + "4 0 0 0 " + ] + }, + "execution_count": 21, + "metadata": {}, + "output_type": "execute_result" + } + ], + "source": [ + "beds_data.head()" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 22, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "beds_data['total_beds_uci'] = beds_data['leito_sus_uci'] + beds_data['leito_sus_uti']" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 23, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "normal_beds_sum = ['leito_sus_cirurgicos', 'leito_sus_clinicos', \n", + " 'leito_sus_isolamento', 'leito_sus_outrasespec',\n", + " 'leito_sus_pediatricos']" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 24, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "beds_data['total_beds'] = beds_data[normal_beds_sum].sum(axis=1)" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 25, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "beds_data_filtered = beds_data[beds_data['IBGE'] == 355030]" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 26, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "beds_simulation = beds_data_filtered[['total_beds', 'total_beds_uci']].sum(axis=0)" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 27, + "metadata": {}, + "outputs": [ + { + "data": { + "text/plain": [ + "(12222, 2444)" + ] + }, + "execution_count": 27, + "metadata": {}, + "output_type": "execute_result" + } + ], + "source": [ + "beds_simulation[0], int(beds_simulation[0]*(1-0.8))" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 28, + "metadata": {}, + "outputs": [ + { + "data": { + "text/plain": [ + "(2421, 484)" + ] + }, + "execution_count": 28, + "metadata": {}, + "output_type": "execute_result" + } + ], + "source": [ + "beds_simulation[1], int(beds_simulation[1]*(1-0.8))" + ] + }, + { + "cell_type": "markdown", + "metadata": {}, + "source": [ + "## infectados" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 29, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "covid_data = pd.read_csv('dados_covid.csv')" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 30, + "metadata": {}, + "outputs": [ + { + "data": { + "text/html": [ + "
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No individual instance is required\"\"\"\n", + " \n", + " has_covid = 1\n", + " covid_cases = covid_data\n", + " cases_arriving = 305\n", + " \n", + " inter_arrival_time = 1/cases_arriving # Average time (days) between arrivals\n", + " los = 8 # Average length of stay in hospital (days)\n", + " los_uti = 7 # Average length of stay in hospital (days)\n", + " \n", + " los_covid = 10 # Average length of stay in hospital (days)\n", + " los_covid_uti = 7\n", + " \n", + " sim_duration = covid_data.shape[0] # Duration of simulation (days)\n", + " audit_interval = 1 # Interval between audits (days)\n", + " \n", + " total_beds = 12222\n", + " total_beds_icu = 2421\n", + " occupation_rate = 0.8\n", + " icu_occupation_rate = 0.8\n", + " \n", + " icu_rate = 0.1\n", + " icu_after_bed = 0.08\n", + " \n", + " beds = int(total_beds * (1 - occupation_rate)) # beds available\n", + " icu_beds = int(total_beds_icu * (1 - icu_occupation_rate)) # icu beds available" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 33, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Hospital:\n", + " \"\"\"\n", + " Hospital class holds:\n", + " 1) Dictionary of patients present\n", + " 2) List of audit times\n", + " 3) List of beds occupied at each audit time\n", + " 4) Current total beds occupied\n", + " 5) Current total icu beds occupied\n", + " 6) Admissions to data\n", + "\n", + " Methods:\n", + "\n", + " __init__: Set up hospital instance\n", + "\n", + " audit: records number of beds occupied\n", + "\n", + " build_audit_report: builds audit report at end of run (calculate 5th, 50th\n", + " and 95th percentile bed occupancy.\n", + "\n", + " chart: plot beds occupied over time (at end of run)\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self):\n", + " \"\"\"\n", + " Constructor method for hospital class\"\n", + " Initialise object with attributes.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " self.patients = {} # Dictionary of patients present\n", + " self.patients_in_queue = {}\n", + " self.patients_in_icu_queue = {}\n", + " \n", + " self.patients_in_beds = {}\n", + " self.patients_in_icu_beds = {}\n", + " \n", + " self.audit_time = [] # List of audit times\n", + " self.audit_beds = [] # List of beds occupied at each audit time\n", + " self.audit_icu_beds = [] # List of icu beds occupied at each audit time\n", + " self.audit_queue = []\n", + " self.audit_icu_queue = []\n", + " \n", + " self.bed_count = 0 # Current total beds occupied\n", + " self.bed_icu_count = 0\n", + " self.queue_count = 0\n", + " self.queue_icu_count = 0\n", + " self.admissions = 0 # Admissions to data\n", + " \n", + " return\n", + "\n", + " def audit(self, time):\n", + " \"\"\"\n", + " Audit method. When called appends current simulation time to audit_time\n", + " list, and appends current bed count to audit_beds.\n", + " \"\"\"\n", + " self.audit_time.append(time)\n", + " self.audit_beds.append(self.bed_count)\n", + " self.audit_icu_beds.append(self.bed_icu_count)\n", + " self.audit_queue.append(self.queue_count)\n", + " self.audit_icu_queue.append(self.queue_icu_count)\n", + " \n", + " return\n", + "\n", + " def build_audit_report(self):\n", + " \"\"\"\n", + " This method is called at end of run. It creates a pandas DataFrame,\n", + " transfers audit times and bed counts to the DataFrame, and \n", + " calculates/stores 5th, 50th and 95th percentiles.\n", + " \"\"\"\n", + " self.audit_report = pd.DataFrame()\n", + "\n", + " self.audit_report['Time'] = self.audit_time\n", + "\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'] = self.audit_beds\n", + " \n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'] = self.audit_icu_beds\n", + "\n", + " self.audit_report['Median_beds'] = \\\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'].quantile(0.5)\n", + " \n", + " self.audit_report['ICU_Median_beds'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'].quantile(0.5)\n", + "\n", + " self.audit_report['Beds_5_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'].quantile(0.05)\n", + "\n", + " self.audit_report['ICU_Beds_5_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'].quantile(0.05)\n", + " \n", + " self.audit_report['Beds_95_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'].quantile(0.95)\n", + " \n", + " self.audit_report['ICU_Beds_95_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'].quantile(0.95)\n", + "\n", + " # queue\n", + " self.audit_report['Queue'] = self.audit_queue\n", + "\n", + " self.audit_report['Median_queue'] = \\\n", + " self.audit_report['Queue'].quantile(0.5)\n", + "\n", + " self.audit_report['Queue_5_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Queue'].quantile(0.05)\n", + "\n", + " self.audit_report['Queue_95_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['Queue'].quantile(0.95)\n", + " \n", + " # icu queue\n", + " self.audit_report['ICU_Queue'] = self.audit_icu_queue\n", + "\n", + " self.audit_report['ICU_Median_queue'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Queue'].quantile(0.5)\n", + "\n", + " self.audit_report['ICU_Queue_5_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Queue'].quantile(0.05)\n", + "\n", + " self.audit_report['ICU_Queue_95_percent'] = \\\n", + " self.audit_report['ICU_Queue'].quantile(0.95)\n", + "\n", + " return self.audit_report\n", + "\n", + " def chart(self):\n", + " \"\"\"\n", + " This method is called at end of run. It plots beds occupancy over the\n", + " model run, with 5%, 50% and 95% percentiles.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " # Plot occupied beds\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Occupied_beds'],\n", + " color='k',\n", + " marker='o',\n", + " linestyle='solid',\n", + " markevery=1,\n", + " label='Occupied beds')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Beds_5_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " markevery=1,\n", + " label='5th percentile')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Median_beds'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashed',\n", + " label='Median')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Beds_95_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " label='95th percentile')\n", + "\n", + " plt.xlabel('Day')\n", + " plt.ylabel('Occupied beds')\n", + " plt.title(\n", + " 'Occupied beds (individual days with 5th, 50th and 95th ' +\n", + " 'percentiles)')\n", + " plt.legend()\n", + " plt.show()\n", + " \n", + " \n", + " # Plot occupied icu beds\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Occupied_beds'],\n", + " color='k',\n", + " marker='o',\n", + " linestyle='solid',\n", + " markevery=1,\n", + " label='Occupied icu beds')\n", + " \n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Beds_5_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " markevery=1,\n", + " label='5th percentile')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Median_beds'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashed',\n", + " label='Median')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Beds_95_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " label='95th percentile')\n", + " \n", + " plt.xlabel('Day')\n", + " plt.ylabel('Occupied icu beds')\n", + " plt.title(\n", + " 'Occupied icu beds (individual days with 5th, 50th and 95th ' +\n", + " 'percentiles)')\n", + " plt.legend()\n", + " plt.show()\n", + " \n", + "\n", + " # Plot queue for beds\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Queue'],\n", + " color='k',\n", + " marker='o',\n", + " linestyle='solid',\n", + " markevery=1, label='Occupied beds')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Queue_5_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " markevery=1,\n", + " label='5th percentile')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Median_queue'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashed',\n", + " label='Median')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['Queue_95_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " label='95th percentile')\n", + "\n", + " plt.xlabel('Day')\n", + " plt.ylabel('Queue for beds')\n", + " plt.title('Queue for beds (individual days with 5th, 50th and 95th' +\n", + " ' percentiles)')\n", + " plt.legend()\n", + " plt.show()\n", + " \n", + " # Plot queue for beds\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Queue'],\n", + " color='k',\n", + " marker='o',\n", + " linestyle='solid',\n", + " markevery=1, label='Occupied ICU beds')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Queue_5_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " markevery=1,\n", + " label='5th percentile')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Median_queue'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashed',\n", + " label='Median')\n", + "\n", + " plt.plot(self.audit_report['Time'],\n", + " self.audit_report['ICU_Queue_95_percent'],\n", + " color='0.5',\n", + " linestyle='dashdot',\n", + " label='95th percentile')\n", + "\n", + " plt.xlabel('Day')\n", + " plt.ylabel('Queue for ICU bed')\n", + " plt.title('Queue for ICU bed (individual days with 5th, 50th and 95th' +\n", + " ' percentiles)')\n", + " plt.legend()\n", + " plt.show()\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 34, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Model:\n", + " \"\"\"\n", + " The main model class.\n", + "\n", + " The model class contains the model environment. The modelling environment\n", + " is set up, and patient arrival and audit processes initiated. Patient\n", + " arrival triggers a spell for that patient in hospital. Arrivals and audit\n", + " continue for the duration of the model run. The audit is then \n", + " summarised and bed occupancy (with 5th, 50th and 95th percentiles) plotted.\n", + "\n", + " Methods are:\n", + "\n", + " __init__: Set up model instance\n", + "\n", + " audit_beds: call for bed audit at regular intervals (after initial delay \n", + " for model warm-up)\n", + "\n", + " new_admission: trigger new admissions to hospital at regular intervals.\n", + " Call for patient generation with patient id and length of stay, then call\n", + " for patient spell in hospital.\n", + "\n", + " run: Controls the main model run. Initialises model and patient arrival and\n", + " audit processes. Instigates the run. At end of run calls for an audit\n", + " summary and bed occupancy plot.\n", + "\n", + " spell_gen: stores patient in hospital patient list and bed queue \n", + " dictionaries, waits for bed resource to become available, then removes \n", + " patient from bed queue dictionary and adds patient to hospital bed \n", + " dictionary and increments beds occupied. Waits for the patient length of\n", + " stay in the hospital and then decrements beds occupied and removes patient\n", + " from hospital patient dictionary and beds occupied dictionary.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self):\n", + " \"\"\"\n", + " Constructor class for new model.\n", + " \"\"\"\n", + " self.env = simpy.Environment()\n", + "\n", + " return\n", + "\n", + " def audit_beds(self, delay):\n", + " \"\"\"\n", + " Bed audit process. Begins by applying delay, then calls for audit at\n", + " intervals set in g.audit_interval\n", + "\n", + " :param delay: delay (days) at start of model run for model warm-up.\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " # Delay first audit\n", + " yield self.env.timeout(delay)\n", + "\n", + " # Continually generate audit requests until end of model run\n", + " while True:\n", + " # Call audit (pass simulation time to hospital.audit)\n", + " self.hospital.audit(self.env.now)\n", + " # Delay until next call\n", + " yield self.env.timeout(g.audit_interval)\n", + "\n", + " return\n", + "\n", + " def new_admission(self, interarrival_time, los, los_uti):\n", + " \"\"\"\n", + " New admissions to hospital.\n", + "\n", + " :param interarrival_time: average time (days) between arrivals\n", + " :param los: average length of stay (days)\n", + " \"\"\"\n", + " while True:\n", + " # Increment hospital admissions count\n", + " self.hospital.admissions += 1\n", + " \n", + " # Generate new patient object (from Patient class). Give patient id\n", + " # and set length of stay from inverse exponential distribution).\n", + " \n", + " if g.has_covid == 1:\n", + " p = Patient(patient_id=self.hospital.admissions,\n", + " los=random.expovariate(1 / ((los + g.los_covid)/2) ),\n", + " los_uti=random.expovariate(1 / ((los_uti + g.los_covid_uti)/2) ))\n", + " else:\n", + " p = Patient(patient_id=self.hospital.admissions,\n", + " los=random.expovariate(1 / los),\n", + " los_uti=random.expovariate(1 / los_uti))\n", + " \n", + " #print('Patient %d arriving %7.2f, admissions count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.admissions))\n", + "\n", + " # Add patient to hospital patient dictionary\n", + " self.hospital.patients[p.id] = p\n", + "\n", + " # Generate a patient spell in hospital (by calling spell method).\n", + " # This triggers a patient admission and allows the next arrival to\n", + " # be set before the paitent spell is finished\n", + " self.spell = self.spell_gen(p)\n", + " self.env.process(self.spell)\n", + "\n", + " # Set and call delay before looping back to new patient admission\n", + " \n", + " if g.has_covid == 1:\n", + " inter_arrival_covid = 1 / g.covid_cases['hospitalizados'][math.floor(self.env.now)]\n", + " next_admission = random.expovariate(1 / ((interarrival_time + inter_arrival_covid)/2) )\n", + " else:\n", + " next_admission = random.expovariate(1 / interarrival_time)\n", + " \n", + " \n", + " #next_admission = random.expovariate(1 / interarrival_time)\n", + " \n", + " yield self.env.timeout(next_admission)\n", + "\n", + " return\n", + "\n", + " def spell_gen(self, p):\n", + " \"\"\"\n", + " Patient hospital stay generator. Increment bed count, wait for patient\n", + " length of stay to complete, then decrement bed count and remove patient\n", + " from hospital patient dictionary\n", + "\n", + " :param p: patient object (contains length of stay for patient)\n", + " \"\"\"\n", + " # The following 'with' defines the required resources and automatically\n", + " # releases resources when no longer required\n", + " \n", + " # screening - bed or icu bed\n", + " is_icu = 1 if random.uniform(0, 1) > (1-g.icu_rate) else 0\n", + " \n", + " # bed\n", + " if is_icu == 0:\n", + " \n", + " with self.resources.beds.request() as req:\n", + " # Increment queue count\n", + " self.hospital.queue_count += 1\n", + " #print('Patient %d arriving queue %7.2f, queue count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_count))\n", + "\n", + " # Add patient to dictionary of queuing patients. This is not used\n", + " # further in this model.\n", + " self.hospital.patients_in_queue[p.id] = p\n", + "\n", + " # Yield resource request. Sim continues after yield when resources\n", + " # are vailable (so there is no delay if resources are immediately\n", + " # available)\n", + " yield req\n", + "\n", + " # Resource now available. Remove from queue count and dictionary of\n", + " # queued objects\n", + " self.hospital.queue_count -= 1\n", + " del self.hospital.patients_in_queue[p.id]\n", + " #print('Patient %d leaving queue %7.2f, queue count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_count))\n", + "\n", + " # Add to count of patients in beds and to dictionary of patients in\n", + " # beds\n", + " self.hospital.patients_in_beds[p.id] = p\n", + " self.hospital.bed_count += 1\n", + " #print('Patient %d arriving bed %7.2f, bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_count))\n", + "\n", + " # Trigger length of stay delay\n", + " yield self.env.timeout(p.los)\n", + " \n", + " # needs icu\n", + " after_is_icu = 1 if random.uniform(0, 1) > (1-g.icu_after_bed) else 0\n", + " \n", + " if after_is_icu == 1:\n", + " \n", + " with self.resources_icu.icu_beds.request() as icu_req:\n", + " \n", + " # Increment queue count\n", + " self.hospital.queue_icu_count += 1\n", + " #print('Patient %d waiting in icu queue %7.2f, queue icu count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_icu_count))\n", + " \n", + " # Add patient to dictionary of icu queuing patients. This is not used\n", + " # further in this model.\n", + " self.hospital.patients_in_icu_queue[p.id] = p\n", + " \n", + " # Yield resource request. Sim continues after yield when resources\n", + " # are vailable (so there is no delay if resources are immediately\n", + " # available)\n", + " yield icu_req\n", + " \n", + " # Resource now available. Remove from queue count and dictionary of\n", + " # queued objects\n", + " self.hospital.bed_count -= 1\n", + " del self.hospital.patients_in_beds[p.id]\n", + " #print('Patient %d leaving bed %7.2f, queue bed %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_count))\n", + " \n", + " # Increment queue count\n", + " self.hospital.queue_icu_count -= 1\n", + " del self.hospital.patients_in_icu_queue[p.id]\n", + " #print('Patient %d leaving icu queue %7.2f, queue icu count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_icu_count))\n", + " \n", + " # Add to count of patients in icu beds and to dictionary of patients in\n", + " # icu beds\n", + " self.hospital.patients_in_icu_beds[p.id] = p\n", + " self.hospital.bed_icu_count += 1\n", + " #print('Patient %d arriving icu bed %7.2f, icu bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_icu_count))\n", + " \n", + " # Trigger length of stay delay\n", + " yield self.env.timeout(p.los_uti)\n", + " \n", + " # Length of stay complete. Remove patient from counts and\n", + " # dictionaries\n", + " self.hospital.bed_icu_count -= 1\n", + " #print('Patient %d leaving icu bed %7.2f, icu bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_icu_count))\n", + " del self.hospital.patients_in_icu_beds[p.id]\n", + " del self.hospital.patients[p.id]\n", + " \n", + " else:\n", + " \n", + " # Length of stay complete. Remove patient from counts and\n", + " # dictionaries\n", + " self.hospital.bed_count -= 1\n", + " #print('Patient %d leaving bed %7.2f, bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_count))\n", + " del self.hospital.patients_in_beds[p.id]\n", + " \n", + " # icu bed\n", + " else:\n", + " \n", + " with self.resources_icu.icu_beds.request() as icu_req:\n", + " \n", + " # Increment queue count\n", + " self.hospital.queue_icu_count += 1\n", + " #print('Patient %d arriving icu queue %7.2f, queue icu count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_icu_count))\n", + " \n", + " # Add patient to dictionary of icu queuing patients. This is not used\n", + " # further in this model.\n", + " self.hospital.patients_in_icu_queue[p.id] = p\n", + " \n", + " # Yield resource request. Sim continues after yield when resources\n", + " # are vailable (so there is no delay if resources are immediately\n", + " # available)\n", + " yield icu_req\n", + " \n", + " # Resource now available. Remove from queue count and dictionary of\n", + " # queued objects\n", + " self.hospital.queue_icu_count -= 1\n", + " del self.hospital.patients_in_icu_queue[p.id]\n", + " #print('Patient %d leaving icu queue %7.2f, icu queue count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.queue_icu_count))\n", + " \n", + " # Add to count of patients in icu beds and to dictionary of patients in\n", + " # icu beds\n", + " self.hospital.patients_in_icu_beds[p.id] = p\n", + " self.hospital.bed_icu_count += 1\n", + " #print('Patient %d arriving icu bed %7.2f, icu bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_icu_count))\n", + " \n", + " # Trigger length of stay delay\n", + " yield self.env.timeout(p.los_uti)\n", + " \n", + " # Length of stay complete. Remove patient from counts and\n", + " # dictionaries\n", + " self.hospital.bed_icu_count -= 1\n", + " #print('Patient %d leaving icu bed %7.2f, icu bed count %d' %(p.id,self.env.now,self.hospital.bed_icu_count))\n", + " del self.hospital.patients_in_icu_beds[p.id]\n", + " del self.hospital.patients[p.id]\n", + "\n", + " return\n", + " \n", + " def run(self):\n", + " \"\"\"\n", + " Controls the main model run. Initialises model and patient arrival and\n", + " audit processes. Instigates the run. At end of run calls for an audit\n", + " summary and bed occupancy plot\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " # Set up hospital (calling Hospital class)\n", + " self.hospital = Hospital()\n", + "\n", + " # Set up resources (beds, icu_beds)\n", + " self.resources = Resources(self.env, g.beds)\n", + " self.resources_icu = Resources_ICU(self.env, g.icu_beds)\n", + "\n", + " # Set up starting processes: new admissions and bed audit (with delay)\n", + " self.env.process(self.new_admission(g.inter_arrival_time, g.los, g.los_uti))\n", + " self.env.process(self.audit_beds(delay=20))\n", + "\n", + " # Start model run\n", + " self.env.run(until=g.sim_duration)\n", + "\n", + " # At end of run call for bed audit summary and bed occupancy plot\n", + " self.hospital.build_audit_report()\n", + " #self.hospital.chart()\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 35, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Patient:\n", + " \"\"\"\n", + " Patient class. Contains patient id and length of stay (it could contain\n", + " other info about patient, such as priority or clinical group.\n", + "\n", + " The only method is __init__ for creating a patient (with assignment of\n", + " patient id and length of stay).\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self, patient_id, los, los_uti):\n", + " \"\"\"\n", + " Contructor for new patient.\n", + "\n", + " :param patient_id: id of patient (set in self.new_admission)\n", + " :param los: length of stay (days, set in self.new_admission)\n", + " \"\"\"\n", + " self.id = patient_id\n", + " self.los = los\n", + " self.los_uti = los_uti\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 36, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Resources:\n", + " \"\"\"\n", + " Holds beds resources\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self, env, number_of_beds):\n", + " \"\"\" Constructor method to initialise beds resource)\"\"\"\n", + " self.beds = simpy.Resource(env, capacity=number_of_beds)\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 37, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "class Resources_ICU:\n", + " \"\"\"\n", + " Holds icu beds resources\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " def __init__(self, env, number_of_icu_beds):\n", + " \"\"\" Constructor method to initialise icu beds resource)\"\"\"\n", + " self.icu_beds = simpy.Resource(env, capacity=number_of_icu_beds)\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 38, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "def main():\n", + " \"\"\"\n", + " Code entry point after: if __name__ == '__main__'\n", + " Creates model object, and runs model\n", + " \"\"\"\n", + "\n", + " model = Model()\n", + " model.run()\n", + "\n", + " return" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 39, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "## Code entry point. Calls main method.\n", + "#if __name__ == '__main__':\n", + "# main()" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 40, + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "model = Model()" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 41, + "metadata": { + "scrolled": true + }, + "outputs": [ + { + "name": "stdout", + "output_type": "stream", + "text": [ + "CPU times: user 39.9 s, sys: 184 ms, total: 40.1 s\n", + "Wall time: 40.1 s\n" + ] + } + ], + "source": [ + "%%time\n", + "seed(98989)\n", + "model.run()" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 42, + "metadata": {}, + "outputs": [ + { + "data": { + "text/html": [ + "
\n", + "\n", + "\n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + "
TimeOccupied_bedsICU_Occupied_bedsMedian_bedsICU_Median_bedsBeds_5_percentICU_Beds_5_percentBeds_95_percentICU_Beds_95_percentQueueMedian_queueQueue_5_percentQueue_95_percentICU_QueueICU_Median_queueICU_Queue_5_percentICU_Queue_95_percent
02018892252320.5484.02293.95358.82336.0484.0016757.098.2538951.60342.50.01232.15
12119792422320.5484.02293.95358.82336.0484.0016757.098.2538951.60342.50.01232.15
22220472492320.5484.02293.95358.82336.0484.0016757.098.2538951.60342.50.01232.15
32320832732320.5484.02293.95358.82336.0484.0016757.098.2538951.60342.50.01232.15
42421243012320.5484.02293.95358.82336.0484.0016757.098.2538951.60342.50.01232.15
\n", + "
" + ], + "text/plain": [ + " Time Occupied_beds ICU_Occupied_beds Median_beds ICU_Median_beds \\\n", + "0 20 1889 225 2320.5 484.0 \n", + "1 21 1979 242 2320.5 484.0 \n", + "2 22 2047 249 2320.5 484.0 \n", + "3 23 2083 273 2320.5 484.0 \n", + "4 24 2124 301 2320.5 484.0 \n", + "\n", + " Beds_5_percent ICU_Beds_5_percent Beds_95_percent ICU_Beds_95_percent \\\n", + "0 2293.95 358.8 2336.0 484.0 \n", + "1 2293.95 358.8 2336.0 484.0 \n", + "2 2293.95 358.8 2336.0 484.0 \n", + "3 2293.95 358.8 2336.0 484.0 \n", + "4 2293.95 358.8 2336.0 484.0 \n", + "\n", + " Queue Median_queue Queue_5_percent Queue_95_percent ICU_Queue \\\n", + "0 0 16757.0 98.25 38951.6 0 \n", + "1 0 16757.0 98.25 38951.6 0 \n", + "2 0 16757.0 98.25 38951.6 0 \n", + "3 0 16757.0 98.25 38951.6 0 \n", + "4 0 16757.0 98.25 38951.6 0 \n", + "\n", + " ICU_Median_queue ICU_Queue_5_percent ICU_Queue_95_percent \n", + "0 342.5 0.0 1232.15 \n", + "1 342.5 0.0 1232.15 \n", + "2 342.5 0.0 1232.15 \n", + "3 342.5 0.0 1232.15 \n", + "4 342.5 0.0 1232.15 " + ] + }, + "execution_count": 42, + "metadata": {}, + "output_type": "execute_result" + } + ], + "source": [ + "model.hospital.build_audit_report().head()" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 43, + "metadata": {}, + "outputs": [ + { + "data": { + "text/html": [ + "
\n", + "\n", + "\n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + " \n", + "
TimeOccupied_bedsICU_Occupied_bedsMedian_bedsICU_Median_bedsBeds_5_percentICU_Beds_5_percentBeds_95_percentICU_Beds_95_percentQueueMedian_queueQueue_5_percentQueue_95_percentICU_QueueICU_Median_queueICU_Queue_5_percentICU_Queue_95_percent
15517523244842320.5484.02293.95358.82336.0484.04024616757.098.2538951.61232342.50.01232.15
15617623254842320.5484.02293.95358.82336.0484.04051816757.098.2538951.61243342.50.01232.15
15717723284842320.5484.02293.95358.82336.0484.04086916757.098.2538951.61253342.50.01232.15
15817823314842320.5484.02293.95358.82336.0484.04116816757.098.2538951.61269342.50.01232.15
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