Estimar taxa de crescimento diário por estado

[hsteinshiromoto]

O objetivo deste issue é de estimar a variação diária de infectados por estado. Usando pymc3 similar ao feito por país neste site https://covid19dashboards.com/growth-bayes/

[gdmarmerola]

A ideia de estimar a posteriori do crescimento é bem interessante, mas nesse caso estamos assumindo taxas de crescimento fixas, quando na real elas devem variar no tempo (efeito lockdown, etc).

Tivemos bons resultados modelando elas no tempo: https://docs.google.com/document/d/1c8U-eZSZQwr8m3KifQBndBOv0WlDDJ9aD0VPYATe3cg/edit#heading=h.gkvqnzw9i612

A lib usada é a pygam, que permite tirar amostras de posteriori e definir distribuições que fazem sentido pras variáveis que estamos tentando modelar (e.g. Gamma para taxa de crescimento)

Não publiquei o código ainda pq ele n tá limpo (hehehe) mas posso tentar dar o gás se acharem que faz sentido

[hsteinshiromoto]

Sim seria ótimo publicar uma versão que leva em conta a dependência do tempo. Acho seria ainda mehor estimar os parâmetros da SDE Bayes que é descrita no arquivo seir_bayes.pdf.